单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 24821 - 24840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24821 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Diversity of the Immunological Landscape following Central Nervous System Infection by a Murine Coronavirus
2020-11-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.01295-20
PMID:32999036
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠冠状病毒JHMV感染中枢神经系统后免疫细胞的异质性 | 揭示了感染不同阶段免疫细胞的独特分子特征和参与有效抗病毒宿主防御的途径，并识别了可能参与脱髓鞘和再髓鞘化的基因 | NA | 旨在更好地理解JHMV感染中枢神经系统后先天和适应性免疫反应以及慢性脱髓鞘阶段的分子途径 | 小鼠中枢神经系统感染JHMV后的免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从实验小鼠的大脑和脊髓中富集的CD45阳性细胞 |
| 24822 | 2024-08-09 |
Affinity-Restricted Memory B Cells Dominate Recall Responses to Heterologous Flaviviruses
2020-11-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.001
PMID:33010224
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研究论文 | 研究探讨了记忆B细胞（MBCs）在应对异源黄病毒时的回忆反应机制，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心（GCs）进行新的特异性塑造。 | 通过条件性删除激活诱导的胞苷脱氨酶（AID），研究了异源黄病毒挑战后的回忆反应，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心进行新的特异性塑造。 | 研究主要集中在记忆B细胞的回忆反应机制，未涉及其他免疫细胞类型或更广泛的免疫反应。 | 区分黄病毒感染和免疫接种中记忆B细胞对异源抗原的反应机制。 | 记忆B细胞（MBCs）对异源黄病毒的回忆反应机制。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因删除 | NA | RNA | 涉及多种黄病毒（西尼罗河病毒、日本脑炎病毒、寨卡病毒和登革病毒）的挑战。 |
| 24823 | 2024-08-09 |
Application of Single-Cell Sequencing to Immunotherapy
2020-Nov, The Urologic clinics of North America
DOI:10.1016/j.ucl.2020.07.005
PMID:33008498
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综述 | 本文通过单细胞视角探讨癌症免疫疗法，并讨论推动该领域发展的最先进技术 | 利用单细胞分析提高分辨率，有望发现并表征先前未被充分认识的细胞群，有助于理解癌症进展和治疗 | NA | 探讨单细胞分析在理解和开发针对泌尿系统和前列腺癌的免疫治疗策略中的潜力 | 泌尿系统和前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 24824 | 2024-08-09 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病中微生物移位是否是驱动“爬行脂肪”形成的关键因素 | 发现了与爬行脂肪相关的特定肠道细菌亚群，并确定了Clostridium innocuum作为该菌群的标志，以及其在黏膜和脂肪组织中的菌株变异 | NA | 研究克罗恩病中微生物移位与爬行脂肪形成的关系 | 克罗恩病患者的肠道微生物和爬行脂肪组织 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括克罗恩病患者的回肠手术切除标本和无菌小鼠 |
| 24825 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Cell Populations and Differential Gene Expression Patterns in Control and Aneurysmal Human Aortic Tissue
2020-10-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了控制组和动脉瘤人主动脉组织中动态的细胞群和差异基因表达模式 | 首次全面评估了升主动脉壁的细胞组成，并揭示了人动脉瘤组织中基因表达景观的改变 | NA | 旨在全面表征升主动脉壁的细胞组成，并识别人动脉瘤组织中每个细胞群的分子改变 | 升主动脉组织中的细胞群和基因表达模式 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11名研究参与者，包括8名动脉瘤患者和3名对照组受试者 |
| 24826 | 2024-08-09 |
Generation of cortical neurons through large-scale expanding neuroepithelial stem cell from human pluripotent stem cells
2020-10-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01939-6
PMID:33008480
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研究论文 | 本文开发了一种可扩展的悬浮培养系统，用于大规模生成来源于人类多能干细胞的神经上皮干细胞（NESC）及其衍生的皮质神经元。 | 本文创新性地使用小分子和生长因子的组合，优化了培养系统，实现了NESC的大规模生产，并展示了这些NESC-spheres向皮质神经元的高效分化潜力。 | NA | 研究目的是开发一种高效、低成本的培养系统，用于大规模生产高质量的NESC-spheres，并将其用于细胞疗法、疾病模型和药物筛选。 | 研究对象包括人类多能干细胞（hPSCs）、神经上皮干细胞（NESC）及其衍生的皮质神经元。 | 再生医学 | NA | 细胞免疫荧光染色、全局转录组和单细胞RNA测序分析 | NA | 细胞 | 大规模的NESC-spheres |
| 24827 | 2024-08-09 |
Identification of putative master regulators in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts using gene expression data and network inference
2020-10-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73147-4
PMID:33004899
|
研究论文 | 本研究利用基因表达数据和网络推断方法，识别类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的潜在主调控因子 | 本研究首次识别了类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的五个特定主调控因子，并评估了它们的转录因子活性 | NA | 旨在表征类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子，这些因子可能解释其表型特征 | 类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子 | NA | 类风湿性关节炎 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织 |
| 24828 | 2024-08-09 |
Defining the First Part of the Oncogenic KRAS Journey
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.009
PMID:33007229
|
研究论文 | 本文通过分析类器官培养、患者样本和鼠模型结合单细胞RNA测序技术，探讨了致癌KRAS激活的早期事件 | 结合多种技术手段，如类器官培养、患者样本分析和单细胞RNA测序，以深入研究KRAS突变相关的早期致癌过程 | NA | 阐明致癌KRAS激活的早期事件 | KRAS突变在人类癌症中的早期致癌过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及类器官培养、患者样本和鼠模型 |
| 24829 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus RNA-Seq Is Not Suitable for Detection of Microglial Activation Genes in Humans
2020-09-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108189
PMID:32997994
|
研究论文 | 本文通过比较单细胞和单核RNA测序技术在人类大脑样本中的应用，探讨了单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的适用性 | 发现单核RNA测序技术在检测微胶质细胞激活基因方面存在低敏感性 | 单核RNA测序技术无法有效检测微胶质细胞在人类疾病中的细胞激活状态 | 评估单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的能力 | 微胶质细胞的激活基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | RNA | 四个人类受试者的大脑样本 |
| 24830 | 2024-08-09 |
Protocol for Isolation of Cardiac Interstitial Cells from Adult Murine Hearts for Unbiased Single Cell Profiling
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100077
PMID:33000003
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠心脏中高效分离高质量活核非心肌细胞的无偏单细胞RNA测序方法 | 使用基于液滴的技术进行单细胞分析，革新了对细胞状态和身份的研究 | NA | 开发一种高效的方法来分离心脏间质细胞，以进行无偏的单细胞RNA测序 | 成年小鼠心脏中的心脏间质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同小鼠品系的健康和受伤心脏样本 |
| 24831 | 2024-08-09 |
A semi-automatic cell type annotation method for single-cell RNA sequencing dataset
2020-Sep, Genomics & informatics
DOI:10.5808/GI.2020.18.3.e26
PMID:33017870
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研究论文 | 本文提出了一种半自动的细胞类型注释方法，用于单细胞RNA测序数据集 | 该方法通过计算用户提供的细胞类型特异性标记基因列表的归一化分数，实现了细胞类型的半自动注释 | NA | 开发一种高效的细胞类型注释方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35个t-SNE聚类 |
| 24832 | 2024-08-09 |
Landscape of transcript isoforms in single T cells infiltrating in non-small-cell lung cancer
2020-07-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2020.06.006
PMID:32998846
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研究论文 | 本文提出了一种名为IDEA的计算方法，用于全面检测和注释肿瘤浸润T细胞中的差异表达的转录本异构体，并应用于非小细胞肺癌的单细胞RNA测序数据集 | 首次在转录本异构体水平上分析肿瘤浸润T细胞，揭示了T细胞在肿瘤微环境中的分子特征 | NA | 旨在深入了解肿瘤浸润T细胞的分子机制 | 非小细胞肺癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算方法（IDEA） | 转录本异构体数据 | 12,346个T细胞 |
| 24833 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02047
PMID:33013865
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24834 | 2024-08-09 |
Novel Glial Cell Functions: Extensive Potency, Stem Cell-Like Properties, and Participation in Regeneration and Transdifferentiation
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00809
PMID:33015034
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综述 | 本文综述了胚胎期和成年期施万细胞的多潜能特性及其在再生和转分化中的作用 | 探讨了施万细胞在神经和非神经组织损伤修复中的潜在应用，以及在肿瘤发展调控中的可能作用 | NA | 深入了解施万细胞的生物学特性，以开发有效的治疗策略 | 施万细胞的多潜能特性和其在再生及转分化中的作用 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24835 | 2024-08-09 |
scLRTD : A Novel Low Rank Tensor Decomposition Method for Imputing Missing Values in Single-Cell Multi-Omics Sequencing Data
2022 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2020.3025804
PMID:32960767
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLRTD的新方法，利用低秩张量分解基于核范数来填补单细胞多组学测序数据中的缺失值 | scLRTD方法不同于一般的单类型单细胞数据填补方法，能够处理不同阶段、组织或条件的单细胞RNA测序数据 | NA | 开发有效的方法来填补单细胞数据分析中的缺失值 | 单细胞多组学测序数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | 低秩张量分解 | 测序数据 | 四组模拟数据和两组来自小鼠胚胎干细胞和肝细胞癌的真实单细胞RNA测序数据 |
| 24836 | 2024-08-09 |
Model-based autoencoders for imputing discrete single-cell RNA-seq data
2021-08, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2020.09.010
PMID:32971193
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研究论文 | 本文提出了一种基于零膨胀负二项（ZINB）模型的自编码器，用于填补离散的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的缺失值 | 该方法的创新点在于除了优化ZINB似然外，还通过使用Gumbel-Softmax分布显式建模导致缺失值的丢失事件，并对原始计数矩阵进行零膨胀重建优化 | NA | 提高离散scRNA-seq数据中缺失值的填补准确性，并增强下游分析的有效性 | 离散的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 自编码器 | 离散数据 | 大量 |
| 24837 | 2024-08-09 |
BP4RNAseq: a babysitter package for retrospective and newly generated RNA-seq data analyses using both alignment-based and alignment-free quantification method
2021-06-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa832
PMID:32976573
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研究论文 | 本文开发了一个名为BP4RNAseq的R包，用于回顾性和新产生的RNA-seq数据分析，结合了基于比对和无比对量化的先进工具 | BP4RNAseq包通过优化流程提高了RNA-seq分析的敏感性和准确性，仅需两个非技术参数即可输出六种格式的基因表达量化结果 | NA | 开发一个高度自动化的工具，简化RNA-seq数据分析流程 | RNA-seq数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 24838 | 2024-08-09 |
Genes influenced by MEF2C contribute to neurodevelopmental disease via gene expression changes that affect multiple types of cortical excitatory neurons
2021-05-31, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa213
PMID:32975584
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研究论文 | 研究探讨了MEF2C基因在神经发育过程中的作用及其对神经发育疾病的影响 | 首次揭示了MEF2C影响的基因在特定类型的皮层兴奋性神经元中的表达变化，以及这些变化与神经发育疾病之间的关联 | 研究主要基于小鼠模型和基因组关联研究数据，可能需要进一步的人类临床研究来验证结果 | 探究MEF2C基因在神经发育中的作用及其对神经发育疾病的影响机制 | MEF2C基因及其影响的基因在神经发育中的作用 | 神经科学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1055个基因在小鼠大脑中的差异表达 |
| 24839 | 2024-08-09 |
Cellular heterogeneity and microenvironmental control of skin cancer
2021-05, Journal of internal medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1111/joim.13177
PMID:32976658
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综述 | 本文综述了皮肤组织中突变细胞与其微环境之间的相互作用，探讨了维持组织稳态的关键机制以及可能导致肿瘤形成的因素 | 揭示了表皮（干细胞）及其微环境中的巨大细胞异质性和可塑性，以及这些细胞在预防癌症形成和恶性进展中的关键作用 | NA | 探讨皮肤组织中突变细胞与微环境的关系，以及如何影响肿瘤形成 | 皮肤组织中的突变细胞及其微环境 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 24840 | 2024-08-09 |
Sympathetic Input to Multiple Cell Types in Mouse and Human Colon Produces Region-Specific Responses
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.09.030
PMID:32980343
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研究论文 | 研究探讨了交感神经对小鼠和人结肠中多种细胞类型的区域特异性调节作用及其对结肠运动模式的影响 | 首次确定了交感神经对肠肌神经网络大规模活动的影响，并发现交感神经递质可以调节非神经细胞（如肠神经胶质和先天免疫细胞）的活动 | NA | 研究交感神经后节神经元如何调节结肠功能 | 小鼠和人的结肠 | NA | NA | 免疫组织化学、光遗传学（GCaMP钙成像、通道视紫红质）、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | 小鼠和人的结肠样本 |