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当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 2461 - 2480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2461 2025-10-06
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 开发了一种结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序的平台,用于研究人类脂肪细胞中与代谢紊乱相关的候选基因 首次将CROP-Seq技术应用于脂肪生成和脂肪细胞生物学研究,能够同时评估多个候选基因的转录效应 研究基于SGBS细胞系,可能无法完全代表体内脂肪细胞的行为 识别与代谢疾病相关的脂肪生成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新型调节因子 人类前脂肪细胞SGBS细胞系 单细胞基因组学 代谢紊乱 CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 CROP-Seq 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA 微流控单细胞捕获
2462 2025-10-06
ZetaSuite: computational analysis of two-dimensional high-throughput data from multi-target screens and single-cell transcriptomics
2022-07-25, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发用于分析二维高通量数据的Zeta统计量和ZetaSuite软件包 提出新的Zeta统计量,专门用于分析二维高通量数据,并开发配套软件工具 NA 解决功能基因组学中二维高通量数据分析的挑战 二维RNAi筛选数据、癌症依赖性筛选数据、单细胞转录组数据 生物信息学 癌症 RNAi筛选、单细胞转录组学 统计模型 高通量功能数据、单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2463 2025-10-06
Single-cell analysis of the cellular heterogeneity and interactions in the injured mouse spinal cord
2021-08-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠脊髓损伤部位的细胞异质性和相互作用 发现新的细胞亚群,并通过受体-配体对表达值识别调控血管生成、胶质增生和纤维化过程中特定细胞相互作用的信号通路 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本验证 理解脊髓损伤后细胞异质性和相互作用的分子机制 小鼠脊髓损伤部位的所有细胞类型 单细胞组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量的小鼠脊髓损伤细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2464 2025-10-06
Multi-omics integrative analysis reveals novel genetic loci and candidate genes for ischemic stroke
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
研究论文 通过整合多组学数据识别缺血性脑卒中的新遗传位点和候选基因 首次整合三大GWAS数据库进行meta分析,发现124个新的IS相关位点,并开发基于大语言模型的智能助手StrokeGene 遗传研究的发现需要进一步功能验证,样本来源限于现有数据库 探索缺血性脑卒中的遗传基础和新致病机制 人类遗传数据和动物模型 生物信息学 缺血性脑卒中 GWAS meta分析, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 大语言模型 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 三大GWAS数据库(GWAS Catalog, MEGASTROKE, Open GWAS)的整合数据 NA 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 NA NA
2465 2025-10-06
Multi-omics insights of immune cells in the risk and prognosis of idiopathic membranous nephropathy
2025-Aug-10, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过多组学数据分析揭示了CD39调节性T细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的关键作用 首次通过孟德尔随机化分析确定CD39 Tregs与IMN的因果关系,并构建了107个复合机器学习模型识别MN 研究样本量有限,需要更大规模验证 探究免疫细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的作用机制 731种免疫细胞表型与特发性膜性肾病患者 生物信息学 肾脏疾病 多组学分析, 孟德尔随机化, 多重免疫荧光染色, 单细胞转录组分析, 流式细胞术 机器学习模型 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2466 2025-10-06
Mitochondrial metabolic reprogramming in colorectal cancer: mechanisms of resistance and future clinical interventions
2025-Aug-09, Cell death discovery IF:6.1Q1
综述 探讨结直肠癌中线粒体代谢重编程在治疗抵抗中的作用机制及潜在临床干预策略 系统阐述线粒体代谢重编程作为结直肠癌治疗抵抗的核心适应机制,并评估空间转录组学等新技术在个性化治疗中的转化价值 NA 分析线粒体代谢重编程导致结直肠癌治疗抵抗的机制并探索临床干预方向 结直肠癌细胞及其线粒体代谢机制 NA 结直肠癌 空间转录组学, 蛋白质组学, 患者来源类器官 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
2467 2025-10-06
Comprehensive multi-omics analysis reveals the core role of glycerophospholipid metabolism in the influence of short-chain fatty acids on the development of sepsis
2025-Aug-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过多组学分析揭示了短链脂肪酸通过甘油磷脂代谢途径影响脓毒症发展的核心机制 首次整合小鼠模型、非靶向代谢组学、人类转录组学、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,系统阐明短链脂肪酸通过调节甘油磷脂代谢影响脓毒症的分子机制 研究主要基于小鼠模型和公共数据库,需要进一步临床验证 探究短链脂肪酸在脓毒症发展中的作用机制 C57BL/6小鼠和人类脓毒症患者数据 生物信息学 脓毒症 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 SVM-RFE, LASSO回归 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞数据 60只C57BL/6小鼠,多个公共数据库数据集 NA 单细胞RNA测序, 代谢组学, 转录组学 NA NA
2468 2025-10-06
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-Aug-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究开发了靶向FAP1的CAR工程化细胞毒性调节T细胞,用于治疗特发性肺纤维化 结合CAR-T细胞的靶向杀伤优势和Treg细胞的免疫抑制功能,首次开发CAR-cTregs治疗肺纤维化 研究基于博来霉素诱导的肺纤维化模型,尚未在人体临床试验中验证 开发治疗特发性肺纤维化的新型细胞免疫疗法 FAP1+肺泡成纤维细胞和CAR工程化细胞毒性调节T细胞 细胞免疫治疗 特发性肺纤维化 单细胞转录组测序,CAR-T细胞工程 NA 基因表达数据,病理学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2469 2025-10-06
Regulation of cortical neurogenesis by MED13L via transcriptional priming and its implications for MED13L syndrome
2025-Aug-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了MED13L通过转录启动调控大脑皮层神经发生的分子机制 首次发现MED13L通过结合中介体复合物启动关键发育基因的转录激活,阐明了MED13L综合征的发育机制 研究基于小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 探究MED13L综合征的发育和分子机制 MED13L基因敲除小鼠模型 神经发育生物学 神经发育障碍 单细胞转录组学,免疫荧光,多组学分析 基因敲除动物模型 基因表达数据,蛋白质定位数据 MED13L敲除胚胎和成年小鼠 NA 单细胞RNA-seq,多组学分析 NA NA
2470 2025-10-06
A human NK cell progenitor that originates in the thymus and generates KIR+NKG2A- NK cells
2025-Aug-08, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究发现了人类胸腺来源的NK细胞前体细胞,能够生成KIR+NKG2A- NK细胞 首次鉴定出胸腺来源的cILC1前体细胞(thyILC1),揭示了胸腺依赖性NK细胞分化途径 NA 探索KIR+NKG2A- NK细胞的发育起源和分化途径 人类天然杀伤细胞(NK细胞)和先天淋巴样细胞(ILC) 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包括健康供体和22q11.2缺失综合征患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2471 2025-10-06
Rapid generation of functional vascular organoids via simultaneous transcription factor activation of endothelial and mural lineages
2025-Aug-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 开发了一种通过同时激活内皮和壁细胞谱系转录因子快速生成功能性血管类器官的方法 通过正交激活ETV2和NKX3.1转录因子,实现内皮细胞和壁细胞的高效共分化,5天内生成无需ECM包埋的功能性3D血管类器官 NA 建立快速生成功能性血管类器官的平台,用于血管建模、疾病研究和再生细胞治疗 诱导多能干细胞(iPSCs)、血管类器官、免疫缺陷小鼠 再生医学 血管疾病 单细胞RNA测序、多西环素诱导系统、修饰RNA系统 NA 基因表达数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2472 2025-10-06
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-Aug-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究揭示了细菌代谢物ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号通路触发肠道干细胞再生机制 首次发现细菌ADP-庚糖通过激活ALPK1-TIFA信号通路诱导肠道损伤后再生干细胞(revSCs)的形成 ALPK1-TIFA信号通路在生理环境中的具体功能仍需进一步研究 探究ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用机制 肠道上皮干细胞、潘氏细胞 细胞生物学 肠道损伤 单细胞转录组测序、谱系追踪 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2473 2025-10-06
Mendelian randomization analysis of inflammatory biomarkers and hepatocellular carcinoma risk: genetic causality and single-cell transcriptomics
2025-Aug-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组学验证炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞转录组学方法系统评估炎症生物标志物与肝细胞癌的因果关系 样本量有限(仅4个HCC样本),需要更大规模研究验证 探究炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 肝细胞癌患者和炎症生物标志物 生物信息学 肝细胞癌 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 MR Egger,加权中位数,逆方差加权,加权模式,简单模式 遗传数据,单细胞转录组数据 4个肝细胞癌样本(BT1306,BT1307,scrSOL004,scrSOL006) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2474 2025-10-06
Integrative multi-omics reveals a regulatory and exhausted T-cell landscape in CLL and identifies galectin-9 as an immunotherapy target
2025-Aug-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病中T细胞的调控和耗竭状态,并鉴定galectin-9作为免疫治疗靶点 首次整合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和组织成像技术,系统揭示CLL淋巴结中T细胞的独特特征,并发现galectin-9作为新的免疫治疗靶点 研究样本来源有限,主要基于患者样本和小鼠模型,需要进一步临床验证 探索慢性淋巴细胞白血病中T细胞耗竭的机制并寻找免疫治疗新靶点 CLL患者的血液、骨髓和淋巴结T细胞,以及CLL小鼠模型 单细胞多组学 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 组织成像, T细胞受体测序 predicTCR分类器 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 CLL患者多个组织部位样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学 NA NA
2475 2025-10-06
Multi-omics data reveal that SAA1 + fibroblasts exacerbate periodontitis by regulating macrophage inflammation and chemotaxis
2025-Aug-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学技术揭示了SAA1+成纤维细胞通过调节巨噬细胞炎症和趋化作用加剧牙周炎的机制 首次系统鉴定SAA1+成纤维细胞亚群在牙周炎中的关键作用,阐明其通过分泌趋化因子介导巨噬细胞浸润并促进炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,在人类临床样本中的验证仍需进一步开展 探究牙周微环境中细胞间相互作用的调控网络,寻找牙周炎治疗新靶点 牙周组织细胞、小鼠牙周炎模型、L929细胞、RAW264.7巨噬细胞 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 生物信息学分析, 动物实验, 细胞共培养 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 65,979个牙周组织细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
2476 2025-10-06
scTail: precise polyadenylation site detection and its alternative usage analysis from reads 1 preserved 3' scRNA-seq data
2025-Aug-07, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 开发了一种名为scTail的计算方法,利用3'单细胞RNA测序数据中的第一链reads精确检测polyA位点并分析其替代使用 首次利用3' scRNA-seq中常被忽略的第一链reads进行PAS检测,并结合第二链reads实现替代PAS使用的量化分析 NA 开发精确检测polyA位点及其替代使用的计算方法 3'单细胞RNA测序数据中的第一链和第二链reads 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序 计算方法 测序reads NA NA single-cell RNA-seq NA 3' scRNA-seq
2477 2025-10-06
A comparative study of manifold learning methods for scRNA-seq with a trajectory-aware metric
2025-Aug-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 比较四种降维方法在单细胞RNA测序数据上的表现,并引入新的轨迹感知评估指标 提出了新的轨迹感知嵌入评分(TAES),同时评估聚类准确性和发育轨迹保持能力 仅使用了三个基准数据集进行评估,可能无法代表所有单细胞RNA测序数据场景 比较不同流形学习方法在单细胞RNA测序数据分析中的性能 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 PCA, t-SNE, UMAP, Diffusion Maps 基因表达数据 三个基准数据集(PBMC3k, Pancreas, BAT) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2478 2025-10-06
Integrated bulk and single cell sequencing with experimental validation identifies type 2 diabetes biomarkers
2025-Aug-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合批量测序和单细胞测序技术结合实验验证,识别2型糖尿病生物标志物SLC2A2 首次结合批量测序、单细胞测序和实验验证综合识别T2D生物标志物,并分析免疫细胞浸润特征 仅使用GSE76895数据集,样本来源有限,需要更多独立队列验证 识别2型糖尿病生物标志物并分析胰岛免疫细胞浸润 2型糖尿病和非糖尿病患者胰岛样本 生物信息学 2型糖尿病 RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT算法 基因表达数据 GSE76895数据集中的T2D和ND胰岛样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
2479 2025-10-06
Multi-omics dissection of CPNE1 reveals its prognostic value and immune-regulatory function in liver cancer
2025-Aug-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了CPNE1在肝癌中的预后价值和免疫调节功能 首次系统阐明了CPNE1在肝癌中的预后价值,发现了SNHG6-hsa-miR-101-3p-CPNE1调控轴,并揭示了CPNE1通过MIF和PPIA-BSG信号通路调节肝癌免疫微环境的新机制 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于公共数据库,样本代表性可能存在局限 阐明CPNE1在肝细胞癌中的作用及其与免疫微环境的关系 肝细胞癌患者组织样本和免疫细胞 生物信息学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 基于TCGA和GEO数据库的肝癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
2480 2025-10-06
Integrative multiomics analysis reveals the subtypes and key mechanisms of platinum resistance in gastric cancer: identification of KLF9 as a promising therapeutic target
2025-Aug-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合多组学分析揭示了胃癌铂类耐药亚型及关键机制,鉴定KLF9作为潜在治疗靶点 首次使用相似性网络融合算法结合多组学数据对胃癌铂类耐药进行分子分型,并在单细胞和空间转录组层面验证耐药基因空间分布 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 阐明胃癌铂类耐药机制并寻找有效治疗靶点 胃腺癌患者及AGS胃癌细胞系 生物信息学 胃癌 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,机器学习 相似性网络融合算法,机器学习预测模型 基因表达数据,甲基化数据,体细胞突变数据,单细胞数据,空间转录组数据 胃腺癌患者队列 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
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