单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39013 篇文献,本页显示第 2461 - 2480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2461 2026-04-01
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-31, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本研究介绍了一种可拆卸灌注芯片,用于在活体胶质母细胞瘤组织切片中进行单细胞水平的抗癌药物筛选 开发了一种新型微流控芯片,通过机械夹层而非化学附着的方式固定组织切片,实现了正压灌注和非破坏性组织解离,从而允许对厚组织切片进行并行培养、药物扰动以及下游单细胞RNA测序 这是一项概念验证工作,未来需要用于多种药物的筛选,并在更多新鲜人源胶质母细胞瘤切片上进行进一步验证 开发一种能够直接在人源肿瘤组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应的新方法 人源胶质母细胞瘤手术切除的新鲜组织切片 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,微流控技术 NA 单细胞RNA测序数据,荧光测定数据 来自人类患者和小鼠模型的胶质母细胞瘤组织切片 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2462 2026-04-01
Human Papillomavirus (HPV) Infected Epithelial Cells and FBLN1+ Fibroreticular Cells Govern the Immunogenic Tumor Microenvironment in HPV-Associated Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar-31, Clinical and experimental otorhinolaryngology IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了HPV相关口咽鳞状细胞癌中FBLN1+纤维网状细胞在塑造免疫原性肿瘤微环境中的关键作用 首次在HPV相关口咽鳞状细胞癌中鉴定出FBLN1+纤维网状细胞亚群,并通过空间定位分析揭示了其与肿瘤细胞和免疫细胞的密切关联,阐明了其通过表达SLIT2分子促进免疫细胞招募的机制 样本量相对较小(10个样本),未进行功能验证实验,研究结果需要在更大队列中验证 探究HPV相关口咽鳞状细胞癌预后较好的肿瘤微环境机制 口咽鳞状细胞癌患者组织样本(包括HPV阳性和阴性)及正常扁桃体组织 数字病理学 口咽鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 10个样本(2个非HPV相关OPSCC, 5个HPV相关OPSCC, 3个正常扁桃体) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2463 2026-04-01
scDenorm: a denormalisation tool for integrating single-cell transcriptomics data
2026-Mar-31, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为scDenorm的算法,用于将经过delta方法归一化的单细胞组学数据还原为原始计数,以解决数据整合中的偏差问题 开发了scDenorm算法,能够逆转归一化处理,恢复原始计数数据,从而减少批次效应和基因表达失真,提高数据整合的准确性 NA 解决单细胞转录组学数据整合中因不同归一化方法导致的偏差问题 单细胞组学数据 生物信息学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2464 2026-04-01
Spatial omics insights into tumor myeloid cells: roles in tumorigenesis, prognosis, and therapy
2026-Mar-31, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了空间组学技术在肿瘤相关髓系细胞研究中的应用,探讨了其在肿瘤发生、预后和治疗中的作用 整合了新兴的空间蛋白质组学和转录组学研究,识别了调控肿瘤发生、预后和治疗反应的重复性空间结构,并提出了将空间模式转化为机制理解的分析框架 NA 探讨肿瘤相关髓系细胞在肿瘤进化、临床结果和治疗反应中的空间组织作用 肿瘤相关髓系细胞,包括巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞、树突状细胞及其相关谱系 数字病理学 癌症 空间组学技术,包括空间蛋白质组学和转录组学 NA RNA和蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
2465 2026-04-01
Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study
2026-Mar-30, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个多模态预后模型,用于预测接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结局 结合了深度学习、常规影像组学、临床变量以及多组学分析(包括单细胞转录组数据),构建了一个具有生物学可解释性的融合模型,实现了比现有临床模型更精细的风险分层 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;模型的外部验证和临床应用仍需进一步前瞻性研究 开发并验证一个用于预测肝细胞癌患者接受TACE治疗后生存结局的多模态预后模型 肝细胞癌患者 计算机视觉 肝细胞癌 单细胞RNA测序,多组学分析 深度学习模型,常规影像组学模型,早期融合和晚期融合模型 图像,临床数据,转录组数据 1448名肝细胞癌患者(包括TACE队列1349人,随机试验生物标志物子集41人,单细胞RNA测序队列和TCGA队列50人) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2466 2026-04-01
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了E3泛素连接酶RNF128通过稳定SCD1促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 首次发现RNF128通过K63连接泛素化稳定SCD1,阻断其自噬-溶酶体降解,从而驱动脂质积累,并验证了靶向RNF128的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外肝细胞实验,人类临床验证尚需进一步研究 探究RNF128在代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展中的作用机制及治疗靶点潜力 人类MASLD肝脏样本、高脂高胆固醇饮食诱导的小鼠模型、肝细胞 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA-seq、单细胞RNA测序、蛋白质组学、泛素化组学、GalNAc-ASO、shRNA-AAV NA 基因表达数据、蛋白质数据 未明确具体样本数量,包括人类肝脏样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
2467 2026-04-01
Targeting LAPTM5 enhances AML sensitivity to cytarabine through autophagy inhibition
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过分析急性髓系白血病(AML)患者的单细胞RNA测序数据,发现LAPTM5在阿糖胞苷(AraC)耐药细胞中高表达,并通过调控自噬流促进耐药性,靶向LAPTM5可增强AML对AraC的敏感性 首次揭示LAPTM5在AML阿糖胞苷耐药中的关键作用,通过调控自噬流和溶酶体生物合成介导耐药性,为克服AML耐药提供了新的治疗靶点 研究主要基于公开的单细胞RNA测序数据分析和体外/体内实验,临床样本验证和具体靶向药物的开发仍需进一步探索 探究LAPTM5在急性髓系白血病(AML)对阿糖胞苷(AraC)耐药中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 急性髓系白血病(AML)细胞,特别是阿糖胞苷(AraC)耐药细胞 NA 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2468 2026-04-01
The RASSF1C-HIF-1α axis drives macrophage lipid metabolism to promote pancreatic cancer
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了缺氧-RASSF1C-HIF-1α轴通过乳酸介导的免疫代谢重编程重塑肿瘤相关巨噬细胞功能,从而促进胰腺癌进展的分子机制 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,阐明了RASSF1C-HIF-1α轴通过乳酸介导的UFL1-IRF7 UFMylation调控巨噬细胞脂质代谢,进而驱动胰腺癌进展的新机制 研究样本量相对较小(20例PDAC组织芯片),且主要基于体外和动物模型验证,临床转化潜力需进一步大规模队列研究证实 探究胰腺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞代谢重编程的分子机制及其对肿瘤进展的影响 胰腺导管腺癌(PDAC)患者组织样本、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织图像数据 20例人类胰腺导管腺癌组织标本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2469 2026-04-01
Antagonistic SMAD2/3 control of TIMP-1, VEGF-A, and hypoxia signaling in myofibroblasts shapes histotype-specific angiogenesis in lung cancer
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤相关成纤维细胞通过SMAD2/3的拮抗调控TIMP-1、VEGF-A和缺氧信号,塑造了肺腺癌和鳞状细胞癌中组织类型特异性的血管生成模式 发现了TIMP-1在促进内皮细胞超分支方面的新功能,并阐明了SMAD2/3在调控肿瘤相关成纤维细胞血管生成因子产生中的关键作用 未明确说明样本量的具体数字,且研究主要聚焦于NSCLC的两种亚型,可能不适用于其他癌症类型 解析非小细胞肺癌中组织类型依赖的血管生成调控机制 非小细胞肺癌(包括肺腺癌和鳞状细胞癌)及其肿瘤相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 转录组学(包括bulk RNA-seq和scRNA-seq)、血管生成阵列、遗传扰动、体外和体内功能实验 NA 转录组数据、蛋白质阵列数据、功能实验数据 多个患者队列,但未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2470 2026-04-01
Cell neighborhood topology directs rare cell population identification
2026-Mar-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为RareQ的快速可扩展框架,用于通过单细胞组学数据评估每个细胞的k近邻邻域的紧密性来检测稀有细胞 提出了一种基于细胞邻域拓扑结构的新方法RareQ,该方法在准确度、灵敏度和效率方面优于现有方法,并能识别模态特异性和共享的稀有细胞 未在摘要中明确说明 开发一种高效识别稀有细胞的方法,以增强对组织结构和疾病机制的理解 单细胞组学数据和空间转录组学数据中的稀有细胞 数字病理学 NA 单细胞组学 NA 单细胞组学数据、空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2471 2026-04-01
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过AI引导的多组学分析,揭示了PM2.5暴露下NPC1基因调控SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 利用微调的单细胞转录组学基础模型,首次整合AI引导的转录组学、流行病学、GWAS、功能基因组学和体外验证,系统解码了环境暴露对健康的影响 机制研究主要在体外实验中进行,需要更多体内实验和临床数据进一步验证 阐明PM2.5暴露如何增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 PM2.5暴露与SARS-CoV-2感染的关联机制 机器学习 SARS-CoV-2感染 单细胞转录组学、全基因组关联研究(GWAS)、功能基因组学分析 基础模型(微调) 转录组数据、流行病学数据、遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2472 2026-04-01
Identification of rheumatoid arthritis manganese metabolism-related diagnostic biomarkers through bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Mar-30, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合批量与单细胞RNA测序分析,识别了与锰代谢相关的类风湿关节炎诊断生物标志物 首次系统性地探索了锰代谢失调与类风湿关节炎发病机制之间的联系,并通过机器学习算法筛选出高诊断准确性的锰代谢相关基因 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且锰代谢在自身免疫病中的具体机制仍需进一步实验阐明 识别类风湿关节炎中与锰代谢相关的诊断生物标志物,并探索其病理机制 类风湿关节炎患者的基因表达数据及单细胞转录组数据 生物信息学 类风湿关节炎 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习算法 LASSO, SVM, RF 基因表达数据 来自GEO数据库的类风湿关节炎患者数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2473 2026-04-01
Stromal NNMT Overexpression as an Independent Prognostic Biomarker in Lung Adenocarcinoma and Breast Carcinoma
2026-Mar-30, Carcinogenesis IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨了烟酰胺N-甲基转移酶(NNMT)在泛癌基质中的表达谱和预后意义,并在肺腺癌和乳腺癌中进行了重点验证 首次将NNMT作为基质特异性独立预后生物标志物在肺腺癌和乳腺癌中进行验证,并利用单细胞RNA测序数据揭示其在基质细胞(尤其是成纤维细胞)中的高表达 研究主要基于数据库分析和回顾性临床队列,需要进一步的前瞻性研究验证NNMT的临床实用性 评估NNMT在癌症基质中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 肺腺癌和乳腺癌患者,以及泛癌分析中的多种癌症类型 数字病理学 肺癌, 乳腺癌 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 数据库分析 Cox回归分析, 生存曲线分析 mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 来自独立临床队列的患者样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2474 2026-04-01
Local transcriptional covariation produces accurate estimates of cell phenotype
2026-Mar-30, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为Sceodesic的新方法,利用黎曼流形结构分析单细胞RNA测序数据中的局部基因共表达模式,以更准确地估计细胞表型 首次将微分几何中的对数欧几里得度量应用于基因共表达矩阵分析,能够发现局部(细胞状态层面)而非全局的基因共变模式 未明确说明方法对数据规模和质量的敏感性,也未与其他新兴的局部共变分析方法进行系统比较 开发一种数学框架来更准确地从scRNA-seq数据中表征细胞状态 单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 黎曼流形分析(基于对数欧几里得度量) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2475 2026-04-01
Tumor-infiltrating immature innate lymphoid cells in colorectal cancer are biased toward ILC1/tissue-resident NK cell differentiation
2026-Mar-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术分析了结直肠癌及其腹膜转移中的肿瘤浸润先天淋巴样细胞,揭示了其向ILC1/组织驻留NK细胞分化的偏向性 首次在结直肠癌及其腹膜转移中鉴定出两个未成熟的先天淋巴样细胞群体(早期NK和幼稚ILC),并证明幼稚ILC在体外可被诱导分化为ILC1/组织驻留NK样细胞 样本量相对较小(单细胞RNA测序仅11例患者),且研究主要基于转录组分析,功能验证实验有限 探究结直肠癌及其腹膜转移中肿瘤浸润先天淋巴样细胞的组成、分化和功能 结直肠癌患者、结直肠癌腹膜转移患者的肿瘤样本以及健康结肠组织 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,分化实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 单细胞RNA测序11例患者,流式细胞术8例患者,分化实验24例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2476 2026-04-01
Integrating spatial and single-cell transcriptomics analysis reveals MYCN-UBE2C-TFRC signaling endows ferroptosis resistance in neuroectodermal tumors
2026-Mar-26, Science China. Life sciences
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析,揭示了MYCN-UBE2C-TFRC信号轴赋予神经外胚层肿瘤铁死亡抵抗的机制 首次发现了MYCN通过调控UBE2C表达,进而介导TFRC的泛素化降解,从而减少铁流入并赋予肿瘤细胞铁死亡抵抗的新机制 NA 探究MYCN扩增肿瘤中铁死亡抵抗的分子机制 神经外胚层肿瘤 数字病理学 神经外胚层肿瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CUT&Tag, 深度覆盖质谱蛋白质组学 NA 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2477 2026-04-01
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过染色体报告系统探究细胞在受限条件下如何引发延迟但可遗传的染色体丢失,揭示了压缩对细胞分裂和染色体稳定性的影响 开发染色体报告系统(ChReporters)量化活细胞中罕见的可遗传染色体丢失,首次发现适度压缩可通过延长有丝分裂期诱导染色体错误分离,形成“有丝分裂记忆” 研究主要关注短期压缩效应,长期遗传稳定性变化未充分探讨;体外压缩模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 探究机械压缩如何影响细胞染色体稳定性及其在癌症进化中的作用 活细胞(具体细胞类型未明确说明) 细胞生物学 癌症(实体瘤) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2478 2026-04-01
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过八个下游任务的综合实验,评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能,并提出了scEval框架用于评估训练过程 首次对十个单细胞基础模型进行系统性性能评估和比较,提出了scEval评估框架,并为单细胞基础模型的预训练和微调提供了指导方针 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 评估基础模型在单细胞测序数据分析中的效用和性能 单细胞测序数据 机器学习 NA 单细胞测序 基础模型(包括scGPT, Geneformer, CellFM等) 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2479 2026-04-01
Visinin-like protein 1 disrupts calcium homeostasis and promotes atrial fibrillation in human and rodent models
2026-Mar-23, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究通过整合人类心房颤动患者和啮齿动物模型的转录组学与电生理学数据,揭示了视锥蛋白样蛋白1在破坏钙稳态和促进心房颤动中的关键作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 首次在心肌细胞中发现并证实VILIP-1通过依赖豆蔻酰化的运输机制增加钠钙交换体1的表面丰度,从而破坏钙稳态并诱发心房颤动,并发现两种FDA批准药物可通过靶向VILIP-1或其豆蔻酰化来减轻房颤易感性 研究主要基于动物模型和体外机制探索,在人类患者中的直接干预效果和长期安全性仍需进一步临床验证 探究视锥蛋白样蛋白1在心房颤动发生发展中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 人类心房颤动患者的心房组织、起搏诱导的大鼠心房颤动模型以及心房心肌细胞 心血管疾病研究 心房颤动 bulk RNA测序、单细胞转录组学、电生理学分析 NA 转录组数据、电生理数据 人类AF患者和啮齿动物AF模型(具体数量未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics NA NA
2480 2026-04-01
A cell atlas of multiple liver organoids and the fetal liver based on scRNA-seq
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合多个肝脏类器官和人类胎儿肝脏的单细胞RNA测序数据,构建了一个包含217,025个高质量细胞的统一肝脏类器官细胞图谱 首次构建了跨多个培养方案的肝脏类器官综合细胞图谱,并系统比较了类器官与胎儿组织之间的差异 类器官在造血谱系代表性方面存在不足 理解肝脏类器官生长过程中的细胞特征和调控网络,以促进肝脏发育和功能研究 肝脏类器官和人类胎儿肝脏 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 217,025个高质量细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部