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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2461 | 2026-06-09 |
Gene-Modulated Network Diffusion for Improved Modeling of Amyloid- β Spread in Alzheimer's Disease
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722725
PMID:42146687
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学术论文 | 通过基因调控的网络扩散模型改善阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β扩散的建模 | 将空间转录组学数据(来自Allen人脑图谱)整合到扩展的网络扩散模型中,以调节蛋白质合成项的速率参数,从而反映区域遗传易感性对淀粉样蛋白-β扩散的影响 | 基线网络扩散模型在机制可解释性方面存在不足 | 改进阿尔茨海默病中淀粉样蛋白-β病理扩散的建模与预测 | 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部验证队列中的受试者 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | NA | 网络扩散模型、扩展网络扩散模型 | 影像数据、基因表达数据 | 阿尔茨海默病神经影像学队列和阿尔茨海默病测序项目的外部队列 | NA | 空间转录组学 | Allen人脑图谱 | 来自艾伦人脑图谱的空间转录组学数据用于调节区域脆弱性 |
| 2462 | 2026-06-09 |
Tumor glycosylation engages CD301b-mediated myeloid regulation in breast cancer
2026-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9347231/v1
PMID:42147159
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤糖基化通过CD301b介导的髓系调控影响乳腺癌进展的机制 | 首次鉴定了C型凝集素受体CD301b及其人类同源物CLEC10A在乳腺癌微环境中作为免疫调控因子的作用,并建立了跨物种的髓系调控程序连接 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需扩大;具体髓系-肿瘤相互作用的分子机制仍需进一步阐明 | 探究异常肿瘤糖基化通过凝集素-糖相互作用对乳腺癌免疫微环境的影响及调控机制 | 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类乳腺癌组织中的髓系免疫细胞 | 机器学习和转录组学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和人类乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2463 | 2026-06-09 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-May, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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research paper | 使用空间转录组学探索子宫颈腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌的转化 | 首次通过数字空间分析技术揭示了腺样基底细胞癌向鳞状细胞癌转化过程中过渡性巢的分子特征,证实了疾病谱系的存在 | 样本量有限(仅20例,其中4例用于数字空间分析),仍需更大规模研究指导临床决策 | 阐明腺样基底细胞癌与鳞状细胞癌之间的组织形态学和分子生物学关系,以指导治疗策略 | 20例腺样基底细胞癌病例,多数伴有鳞状细胞癌、过渡性巢或高级别鳞状上皮内病变亚型 | digital pathology | 子宫颈癌 | DSP, H&E, IHC | NA | image | 20例(其中4例用于数字空间分析) | NA | spatial transcriptomics | NA | 数字空间分析(Digital Spatial Profiling) |
| 2464 | 2026-06-09 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal rAAV2- and rAAV9-specific transduction signatures in the mouse liver
2026-May, Gene therapy
IF:4.6Q2
DOI:10.1038/s41434-026-00600-w
PMID:41813829
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研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序,揭示rAAV2和rAAV9载体在小鼠肝脏中的转导特征及性别差异 | 首次利用空间转录组学结合单核RNA测序,在空间层面系统描绘了rAAV2和rAAV9载体在雄性和雌性小鼠肝脏中的分布、转导及转录组变化,揭示了性别特异性的脂代谢、昼夜节律和免疫应激反应失调 | 作为概念验证研究,仅使用CMV-EGFP转基因载体,结果可能受限于单一报告基因和特定血清型,且未涉及不同启动子或治疗性转基因的影响 | 探究rAAV血清型、性别和肝脏分区对转导效率和转录组变化的影响 | rAAV2和rAAV9载体处理的雄性和雌性小鼠肝脏 | 空间转录组学 | 基因治疗相关肝脏疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 两种性别(雄性和雌性)、两种血清型(rAAV2和rAAV9)的小鼠肝脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于组织切片分析,10x Chromium单核RNA测序平台用于单核转录组分析 |
| 2465 | 2026-06-09 |
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2780
PMID:41671077
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research paper | 研究肿瘤基质蛋白聚糖Versican(VCAN)在寡转移结直肠癌患者中如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 | 首次在临床试验中评估VCAN蛋白聚糖及其裂解产物versikine对免疫监视和免疫治疗反应的影响,发现VCAN积累与蛋白水解表型(VPP)与循环CD8+ T细胞效应功能和临床结局改善相关 | 样本量较小(15名患者)的I期临床试验,且未详述机制验证步骤 | 评估VCAN对结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应的影响 | 寡转移结直肠癌患者的T细胞功能和临床结局 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 测序数据 | 243名结直肠癌患者(组织样本)及15名寡转移结直肠癌患者(临床试验) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析循环免疫表型 |
| 2466 | 2026-06-09 |
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-47700-6
PMID:41963494
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研究论文 | 提出一种优化章鱼免疫细胞制备方案以增强单细胞RNA测序成功率的综合指南 | 首次建立适用于章鱼免疫细胞的单细胞RNA测序方法学框架,解决了血细胞聚集和高盐度化学限制的难题 | 未提供关于测序深度和细胞类型确认的详细信息 | 优化章鱼免疫细胞分离方案,实现单细胞RNA测序在非模型海洋物种中的应用 | 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未指定具体数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用低EDTA的MAS培养基兼容10x Genomics化学试剂进行GEM生成、逆转录和cDNA文库构建 |
| 2467 | 2026-06-09 |
Identification of stem cell marker-positive subpopulations in the vocal fold of the larynx through transcriptomic analyses
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71514-9
PMID:41942464
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研究论文 | 通过转录组分析鉴定喉部声带中干细胞标志物阳性亚群 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术鉴定小鼠声带中的SOX9阳性基底细胞亚群和Lgr5阳性细胞亚群,并成功生成了喉部上皮类器官作为体外模型 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证人类喉部中的相应细胞亚群 | 探索喉部组织稳态维持机制,鉴定喉部组织干细胞 | 小鼠喉部黏膜 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 类器官培养 | NA | 基因表达数据 | 小鼠喉部黏膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学通过光隔离化学 |
| 2468 | 2026-06-09 |
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05065-7
PMID:41670688
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研究论文 | 通过多组学分析揭示苯并[a]芘毒性网络在头颈鳞癌中的作用,并确定SERPINE1和STK3为预后生物标志物和治疗靶点 | 系统整合苯并[a]芘毒性靶点与细胞程序性死亡机制,利用空间转录组学和单细胞测序解析细胞特异性表达模式,并通过分子对接和动力学模拟验证毒物-蛋白相互作用 | 未提及 | 阐明苯并[a]芘诱导头颈鳞癌毒性的分子网络,并鉴定预后生物标志物和治疗靶点 | 苯并[a]芘毒性网络、头颈鳞癌中的细胞程序性死亡机制 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 随机森林、支持向量机 | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2469 | 2026-06-09 |
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-04, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2026.01.006
PMID:41846175
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评论 | 本文讨论了关于长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的重要性,基于遗传命运图谱和单细胞测序的最新发现 | 揭示了两类细胞群(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)共同维持IgE水平,为过敏持久性提供新机制见解 | 由于是评论文章,未提供实验验证数据,且未讨论不同过敏模型的差异 | 探讨长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的细胞来源和维持机制 | IgE浆细胞和记忆B细胞两类细胞群 | 机器学习 | 过敏性疾病 | 遗传命运图谱、单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2470 | 2026-06-09 |
Linking Targeted Pancreatic Cancer Genes With Metabolic Disorders: A Cross-Species Translational Pathway
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71775
PMID:41937118
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研究论文 | 通过跨物种分析,探究胰腺导管腺癌相关基因与代谢紊乱分子间的相互作用 | 首次系统整合人类与小鼠脂肪组织及胰腺癌单细胞数据,揭示PDAC复发相关基因与肥胖、糖尿病等代谢通路共享的免疫代谢调控轴 | 样本量有限且仅采用公开数据集,功能验证仅通过qPCR而未进行基因敲除或动物模型验证 | 阐明胰腺癌相关基因与代谢紊乱(肥胖、糖尿病、炎症)之间的分子联系通路 | 胰腺导管腺癌相关基因(ITGAM、PECAM1、CCL5、STAT1、STAT2、CD44)及代谢紊乱通路 | 生物信息学 | 胰腺癌,代谢性疾病 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 公开数据集(人类及小鼠脂肪组织bulk RNA-Seq、晚期PDAC单细胞RNA-Seq)和人类脂肪组织qPCR样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2471 | 2026-06-09 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 | 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联,提出免疫治疗潜力 | 样本量较小(94例),且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 | 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征,为潜在治疗策略提供依据 | 激素受体阳性(HR+)和阴性(HR-)乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 靶向基因表达谱分析(AmoyDx Master Panel),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 94例乳腺癌患者(53例HR+,41例HR-) | AmoyDx | 靶向基因表达谱分析,单细胞RNA测序 | AmoyDx Master Panel | NA |
| 2472 | 2026-06-09 |
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.116966
PMID:41671084
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评论 | 综述了细菌应激反应中表型异质性背后的隐藏变量,提出看似随机的现象实际由可测定的确定性因素驱动 | 将细菌应激反应中的表型变异从随机噪声重新定义为可预测的隐藏变量,整合了确定性因素和前沿技术视角 | 主要基于已有案例和观点论述,缺乏原创实验数据验证 | 揭示细菌应激反应中表型异质性的隐藏变量,推动预测微生物学发展 | 细菌细胞及其应激反应行为 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,微流控 | 机器学习 | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析系统 |
| 2473 | 2026-06-09 |
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,包括基因组不稳定性、转录和表观遗传重塑以及代谢重编程,并探讨了新兴计算技术、多组学整合和精准微生物组医学的应用 | 系统整合了多组学策略和计算工具在解析微生物群-宿主相互作用中的最新进展,并展望了人工智能驱动计算整合和精准微生物组医学在结直肠癌预防、诊断和治疗中的转化潜力 | 数据组成性、稀疏性和高维度等分析挑战仍阻碍有意义的结果解读 | 总结结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,并评估新兴计算技术和多组学整合方法在相关研究中的作用 | 结直肠癌相关的微生物群与宿主相互作用 | machine learning | 结直肠癌 | 高通量测序, 长读长测序, 细菌单细胞空间转录组学 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、表观基因组、代谢组) | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细菌单细胞空间转录组学(具体平台未明确提及) |
| 2474 | 2026-06-09 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
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研究论文 | 研究WAS蛋白缺乏对急性LCMV感染期间记忆B细胞形成的影响 | 首次利用单细胞RNA测序揭示WAS蛋白缺乏促进非典型记忆B细胞形成并降低经典记忆B细胞比例 | 未完全阐明WAS蛋白调控记忆B细胞分化的分子机制 | 探究WAS蛋白缺乏对急性病毒感染中记忆B细胞分化的影响及机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染后的记忆B细胞 | 机器学习和单细胞测序 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LCMV感染后第11天的WASp敲除小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2475 | 2026-06-09 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
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研究论文 | 通过大规模整合已发表的单细胞RNA测序数据集,创建了AML单细胞转录组图谱,并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 | 构建了迄今最大的人类AML单细胞数据资源(含748,679个细胞),并首次利用该图谱揭示t(8;21) AML中年龄相关的基因调控网络特征,发现BCLAF1作为有前景的预后指标 | 主要基于已发表数据的整合分析,缺乏前瞻性实验验证;年龄相关发现在t(8;21)亚型中验证,对其他AML亚型的推广性有待确认 | 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络及其临床意义 | 来自159名AML患者和51名健康供体的748,679个细胞,以及t(8;21) AML患者的额外多组学数据集(scRNA-seq和scATAC-seq) | 数字病理学, 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 批量转录组数据 | 159名AML患者和51名健康供体(共748,679个细胞),来自20项研究;额外包含多组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2476 | 2026-06-09 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 对空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法进行比较研究,并提出基于广义估计方程的方法 | 提出广义估计方程框架替代Wilcoxon秩和检验,有效纳入空间相关性以降低假阳性率,并在模拟和真实数据中验证了其优越性 | 研究未评估方法在不同空间转录组平台或更大规模数据集上的泛化能力 | 开发更稳健的统计方法用于空间转录组数据中的差异表达分析 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程 | 基因表达数据 | 模拟数据集及乳腺癌、前列腺癌空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2477 | 2026-06-09 |
Anti-PD-1 blockade reverses low-intensity electric stimulation-driven pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1793161
PMID:42238591
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研究论文 | 探索低强度电刺激联合抗PD-1阻断对胰腺癌免疫微环境的影响及协同抗肿瘤效应 | 首次使用原位胰腺导管腺癌模型系统评估低强度电刺激的免疫调节和巨噬细胞极化作用,并发现抗PD-1阻断可逆转低强度电刺激驱动的肿瘤进展 | 未提及研究局限性 | 探究低强度电刺激后的肿瘤免疫微环境重塑并评估其与抗PD-1阻断联合的抗肿瘤效果 | 胰腺导管腺癌小鼠原位模型及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | 小鼠原位胰腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2478 | 2026-06-09 |
A tryptophan metabolism-related gene signature predicts prognosis and immune features in cutaneous melanoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1806319
PMID:42238596
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研究论文 | 构建色氨酸代谢相关基因风险模型预测皮肤黑色素瘤预后和免疫特征 | 首次基于色氨酸代谢相关基因构建五基因风险模型,结合bulk和单细胞RNA测序数据全面分析免疫微环境差异,并通过体外实验验证IDO1对黑色素瘤细胞功能的影响 | 未明确说明局限性 | 探索色氨酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫状态中的预测价值 | 皮肤黑色素瘤患者样本及黑色素瘤细胞系 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归风险模型 | 转录组数据, 临床数据 | 457例皮肤黑色素瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2479 | 2026-06-09 |
Molecular heterogeneity of HPV-associated cancers and strategies to overcome treatment resistance
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
DOI:10.47248/chp2603010002
PMID:41938668
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综述 | 本文总结了HPV相关癌症的分子异质性及其导致的治疗耐药机制,并探讨了克服这些挑战的新型联合治疗策略 | 整合单细胞转录组学与HPV整合图谱,揭示病毒和宿主异质性如何共同塑造免疫逃逸和治疗响应,为个性化联合疗法提供框架 | 未详细讨论具体临床试验数据或定量分析不同联合策略的疗效差异 | 阐述HPV相关癌症的分子异质性及其对治疗耐药的影响,提出应对策略以改善患者预后 | HPV相关癌症(包括宫颈癌、口咽癌、肛门癌及其他肛门生殖器癌)及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2480 | 2026-06-09 |
Piezo1-Fstl1 Axis in Fracture Healing: Modulation of the Chondrocyte Inflammation-ROS-Mitochondrial Damage Cascade and Application of Smart Delivery System
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.125814
PMID:41943852
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研究论文 | 本研究探讨了智能递药系统通过Piezo1-Fstl1信号轴促进骨折愈合的调控机制,并验证了其对软骨细胞炎症反应、线粒体氧化应激和成骨细胞分化的调节作用 | 首次揭示了Piezo1-Fstl1轴在骨折愈合中调控软骨细胞炎症-活性氧-线粒体损伤级联反应的作用,并开发了含软骨细胞靶向脂质纳米颗粒的HA-PBA/TA自愈合水凝胶作为智能递药系统 | 研究主要基于小鼠模型,在人体内的验证尚未进行;智能递药系统的长期安全性和有效性需要进一步评估 | 探究Piezo1-Fstl1信号轴在骨折愈合中的作用机制并开发智能递药系统促进骨折修复 | 小鼠股骨骨折模型中的软骨细胞和骨折愈合过程 | 机器学习和数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠股骨骨折部位组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |