单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24741 2024-08-09
Single cell profiling of capillary blood enables out of clinic human immunity studies
2020-11-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文开发了一种利用多重单细胞测序和非临床毛细血管血液提取的平台,以简化、低成本地对人类免疫系统进行单细胞分辨率的跨时间和人群的分析 本文创新地利用了多重单细胞测序技术,结合非临床毛细血管血液提取,实现了对人类免疫系统的单细胞分辨率分析 NA 研究目的是更好地理解基因表达在不同免疫细胞类型中的时间性和个体间变异性 研究对象是人类免疫系统中的基因表达变异性 数字病理学 NA 多重单细胞测序 NA 基因表达数据 多个受试者的毛细血管血液样本
24742 2024-08-09
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
研究论文 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据,揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者,可能存在地域和时间限制 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 NA COVID-19 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 119名COVID-19阳性患者
24743 2024-08-09
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
研究论文 本文综述了肝细胞癌(HCC)在精准治疗领域的最新进展,包括新型血清生物标志物的发现与应用、精准肝脏手术技术的改进以及分子靶向治疗和免疫治疗的结合 介绍了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术革新对HCC生物学理解的加速作用,以及这些技术带来的新的治疗机会 肝细胞癌的高度异质性和治疗抵抗性仍然是未满足的医疗需求,需要更深入的疾病生物学研究和新型疗法 探讨肝细胞癌精准治疗的最新研究前沿,以提高患者生存率并寻找新的治疗突破 肝细胞癌(HCC)及其精准治疗策略 NA 肝癌 单细胞测序、基因组编辑 NA 血清生物标志物、影像数据 NA
24744 2024-08-09
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
综述 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法,以及其在精准医学中的潜在应用 NA 加速对细胞异质性的理解 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24745 2024-08-09
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术,深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 NA 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA NA
24746 2024-08-09
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平,并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 NA 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞,以及324个人乳腺癌样本
24747 2024-08-09
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析,特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 NA NA 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 血管组织的异质性,特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA
24748 2024-08-09
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观,并发现幼稚B细胞高度浸润,可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润,并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据,需要进一步的实验验证。 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制,特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 数字病理学 肺部疾病 CIBERSORT-X NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化(IPF)患者的肺组织样本
24749 2024-08-09
Defining HPV-specific B cell responses in patients with head and neck cancer
2021-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文研究了人乳头瘤病毒(HPV)阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的存在及其特征 首次展示了HPV特异性B细胞反应在HPV阳性头颈癌患者中的存在,并详细描述了这些反应的特征,包括HPV特异性抗体的产生和定位 NA 探讨HPV阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的特征及其在免疫治疗中的潜在应用 HPV阳性头颈癌患者的肿瘤样本 NA 头颈癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 多个患者的肿瘤样本
24750 2024-08-09
Deep feature extraction of single-cell transcriptomes by generative adversarial network
2021-06-16, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种单细胞生成对抗网络(scGAN),用于从原始数据中同时获取模式并最小化由技术伪影或其他数据固有因素引起的混杂效应 scGAN通过将每个细胞投影到潜在嵌入来建模数据似然性,并尝试最小化潜在嵌入与批次标签之间的相关性 NA 解决单细胞RNA测序(scRNA-seq)中的批次效应问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 生成对抗网络(GAN) 基因表达数据 三个公共scRNA-seq数据集
24751 2024-08-09
Single-cell RNA-seq reveals developmental plasticity with coexisting oncogenic states and immune evasion programs in ETP-ALL
2021-05-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过全长单细胞RNA测序技术,探讨了早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)中的治疗抵抗机制,揭示了细胞发育可塑性与共存致癌状态及免疫逃避程序的关系 研究发现两种高度不同的干细胞样状态,这些状态在细胞周期和致癌信号传导方面存在关键差异,并且能够分化为具有显著免疫调节功能的更成熟白血病状态 NA 探讨ETP-ALL中的治疗抵抗机制及其与细胞发育可塑性和免疫逃避程序的关系 ETP-ALL中的恶性细胞和微环境细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
24752 2024-08-09
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 本研究通过靶向自身免疫RNA测序和单细胞测序技术,分析了未经治疗的儿科克罗恩病患者的回肠组织,揭示了IL17和NOD信号通路的表达特征,并识别了驱动差异表达基因的特定上皮细胞。 本研究首次在未经治疗的儿科克罗恩病患者中发现了IL17、NOD和Oncostatin-M信号通路的显著上调,并确定了驱动这些信号通路的特定上皮细胞。 研究样本量相对较小,且仅限于未经治疗的儿科克罗恩病患者,可能限制了结果的普遍性。 旨在确定儿科克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型。 儿科克罗恩病患者的回肠组织及其与对照组的比较。 数字病理学 克罗恩病 靶向自身免疫RNA测序、单细胞测序 加权基因共表达网络分析(WGCNA) RNA序列数据 27名未经治疗的克罗恩病患者、26名已确诊的克罗恩病患者和17名对照组
24753 2024-08-09
Looking at the developing lung in single-cell resolution
2021-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在胎儿和新生儿肺发育研究中的主要发现,并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 单细胞RNA测序技术为研究肺发育过程中的复杂细胞动态提供了无偏见且强有力的评估方法 目前关于健康或异常发育肺的单细胞转录组研究仍较少 探讨单细胞RNA测序技术在肺发育疾病研究中的应用 肺发育过程中的细胞类型及其基因表达变化 分子生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
24754 2024-08-09
Elucidating memory in the brain via single-cell transcriptomics
2021-05, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
研究论文 本文讨论了单细胞转录组学方法在揭示大脑记忆神经机制中的应用 利用单细胞转录组学技术,以空前的分辨率和通量深入理解记忆机制 NA 阐明大脑中记忆的神经机制 海马体和杏仁核区域的记忆机制 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
24755 2024-08-09
Single-Nucleus and In Situ RNA-Sequencing Reveal Cell Topographies in the Human Pancreas
2021-03, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本文通过单核RNA测序和原位RNA测序技术,揭示了人类胰腺中的细胞拓扑结构。 创新性地开发了单核RNA测序协议,并首次创建了全面的人类胰腺细胞图谱。 NA 旨在更好地理解健康和疾病状态下新生儿和成人胰腺的异质性和细胞组成。 人类胰腺细胞的异质性和组成。 数字病理学 NA 单核RNA测序 NA 细胞 超过120,000个细胞来自成人和新生儿的胰腺捐赠者。
24756 2024-08-09
Vascular neutrophilic inflammation and immunothrombosis distinguish severe COVID-19 from influenza pneumonia
2021-02, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过比较SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本,揭示了血管中性粒细胞招募、NETosis和随后的免疫血栓形成是严重COVID-19的典型特征,而在流感肺炎中这些特征不明显。 本研究首次详细描述了严重COVID-19中血管中性粒细胞炎症和免疫血栓形成的路径机制,并探讨了其上游调控。 NA 研究免疫血栓形成是否为COVID-19的特异性病理因素,以及其上游调控机制。 SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本。 数字病理学 COVID-19 scRNA-seq NA 组织样本 NA
24757 2024-08-09
A High-Content Screen Identifies Drugs That Restrict Tumor Cell Extravasation across the Endothelial Barrier
2021-02-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文通过高内涵筛选方法识别了限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 首次发现尼克酰胺作为一种有效药物,通过调节信号通路、趋化因子和肿瘤-内皮细胞相互作用来增强内皮屏障稳定性 NA 识别限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 3,520种化合物、斑马鱼模型和肺转移小鼠模型 数字病理学 肿瘤 高内涵筛选、单细胞RNA测序、蛋白质组分析 NA 图像 3,520种化合物、斑马鱼和小鼠模型
24758 2024-08-09
A Microfluidic Chip for Efficient Circulating Tumor Cells Enrichment, Screening, and Single-Cell RNA Sequencing
2021-02, Proteomics IF:3.4Q2
研究论文 本文开发了一种集成微流控芯片,用于循环肿瘤细胞(CTCs)的高效富集、筛选和单细胞RNA测序 该芯片集成了CTCs的连续富集、分离和单细胞水平表征,并在同一芯片上实现了单CTC裂解 NA 研究肿瘤异质性、转移和药物耐药性的机制 循环肿瘤细胞(CTCs) 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 细胞 通过将肿瘤细胞加入全血中进行验证
24759 2024-08-09
Intraoperative opioids are associated with improved recurrence-free survival in triple-negative breast cancer
2021-02, British journal of anaesthesia IF:9.1Q1
研究论文 本文评估了手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌(TNBC)患者肿瘤学结果之间的关联,并探讨了TNBC中阿片类受体的表达模式 发现手术中使用阿片类药物对TNBC患者的无复发生存期有保护作用,且阿片类受体的表达与阿片类激动剂的净保护作用一致 研究未发现手术中使用阿片类药物与总体生存期之间有显著关联 评估手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌患者肿瘤学结果之间的关联 三阴性乳腺癌患者 NA 乳腺癌 RNA测序 NA RNA 1143例三阴性乳腺癌病例
24760 2024-08-09
Next-Generation Lineage Tracing and Fate Mapping to Interrogate Development
2021-01-11, Developmental cell IF:10.7Q1
review 本文广泛回顾了命运图谱和谱系追踪方法的起源,并重点介绍了单细胞基因组学进展所允许的谱系追踪的最新发展 本文探讨了利用新技术合成高分辨率命运图谱的当前潜力,并讨论了它们在深入探究发育过程中的潜力 NA 回顾并探讨命运图谱和谱系追踪技术在发育生物学中的应用 命运图谱和谱系追踪技术 NA NA 单细胞和空间转录组学 NA 基因组数据 NA
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