单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24741 2024-08-09
The Roles of T cells in Bladder Pathologies
2021-03, Trends in immunology IF:13.1Q1
研究论文 本文探讨了T淋巴细胞在膀胱疾病中的作用,包括细菌感染、膀胱癌和慢性炎症 利用单细胞RNA测序和报告小鼠等新技术,揭示了T细胞在膀胱免疫中的新角色 NA 研究T细胞在膀胱疾病中的作用及其潜在的免疫治疗价值 T细胞在膀胱疾病中的作用 免疫学 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA NA NA
24742 2024-08-09
SiglecF(HI) Marks Late-Stage Neutrophils of the Infarcted Heart: A Single-Cell Transcriptomic Analysis of Neutrophil Diversification
2021-02-16, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了心肌梗死(MI)后中性粒细胞的分化和动态变化 首次揭示了心肌梗死后中性粒细胞的多样化,特别是SiglecF标记的晚期中性粒细胞的发现和特性 研究仅限于小鼠模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探究心肌梗死后中性粒细胞的分化和动态变化 心肌梗死后的中性粒细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 超过28,000个中性粒细胞转录组
24743 2024-08-09
SATB2 induction of a neural crest mesenchyme-like program drives melanoma invasion and drug resistance
2021-02-02, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文通过过表达筛选80种表观遗传/转录调节因子,发现神经嵴间质发育调节因子SATB2能加速黑色素瘤的侵袭性发展,并诱导zebrafish肿瘤和人类黑色素瘤细胞系的侵袭和药物抗性 首次发现SATB2通过诱导神经嵴间质样程序,驱动黑色素瘤的侵袭和药物抗性 NA 测试转录适应是否能驱动黑色素瘤的进展 SATB2在黑色素瘤侵袭和药物抗性中的作用 数字病理学 黑色素瘤 scRNA-seq NA 基因表达数据 80种表观遗传/转录调节因子
24744 2024-08-09
CNS fibroblasts form a fibrotic scar in response to immune cell infiltration
2021-02, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本文研究了中枢神经系统(CNS)纤维母细胞在免疫细胞浸润后形成纤维化瘢痕的过程 首次确定CNS纤维化瘢痕主要来源于增殖的CNS纤维母细胞,而非周细胞或浸润的骨髓来源细胞,并通过特定细胞表达的疱疹胸苷激酶敲除增殖的纤维化细胞,观察到运动障碍的减少 NA 探讨CNS在免疫细胞浸润后的纤维化反应机制 CNS纤维母细胞、纤维化瘢痕、免疫细胞浸润 NA 多发性硬化症 单细胞测序 NA 细胞 实验使用了实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型
24745 2024-08-09
UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
24746 2024-08-09
Reply to: UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
24747 2024-08-09
mRNA-1273 efficacy in a severe COVID-19 model: attenuated activation of pulmonary immune cells after challenge
2021-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果,发现该疫苗能减轻肺部免疫细胞的激活 使用单细胞RNA测序技术分析了接种mRNA-1273疫苗的仓鼠肺组织,提供了人类接种疫苗后肺部潜在反应的见解 研究仅限于仓鼠模型,结果可能不完全适用于人类 评估mRNA-1273疫苗在严重COVID-19模型中的效果 mRNA-1273疫苗在仓鼠模型中的免疫反应和保护效果 疫苗学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 仓鼠
24748 2024-08-09
Tb3+-doped fluorescent glass for biology
2021-01, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 介绍了一种含稀土离子铽(III)的新型硼硅酸盐玻璃材料,该材料在蓝光激发下发出绿色荧光,适用于常规生物研究环境 开发了一种新型Tb3+掺杂荧光玻璃,可用于单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和活体神经元在线光学定位 NA 探索Tb3+掺杂荧光玻璃在生物实验中的应用 Tb3+掺杂荧光玻璃及其在生物实验中的应用 生物技术 NA 荧光显微镜控制下的单细胞电穿孔、单细胞转录组分析和膜片钳记录 NA 荧光信号 NA
24749 2024-08-09
Identification of the Different Gene Expression Characteristics from Liver Cirrhosis to Hepatocellular Carcinoma Using Single-Cell Sequencing Analyses
2021, Journal of immunology research IF:3.5Q2
研究论文 利用单细胞测序技术分析从肝硬化到肝细胞癌的基因表达特征 首次在单细胞分辨率下分析肝细胞癌和肝硬化组织的转录组比较,并发现了与患者生存率相关的特定基因 研究依赖于已发表的单细胞测序数据库,可能限制了结果的全面性 深入理解肝细胞癌的分子生物学机制 肝细胞癌和肝硬化组织的基因表达特征 数字病理学 肝癌 单细胞测序技术(scRNA-seq) NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
24750 2024-08-09
Application of Microfluidics in Single-cell Manipulation, Omics and Drug Development
2021, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本文综述了微流控技术在单细胞操作、组学和药物开发中的应用 微流控技术为单细胞研究提供了一个灵活、精确的工具,能够揭示细胞异质性并应用于药物开发 NA 总结和介绍微流控技术在单细胞分离和操作、单细胞组学以及药物开发中的应用 微流控技术在单细胞层面的应用 生物技术 NA 微流控技术 NA 细胞 NA
24751 2024-08-09
DOCK11 and DENND2A play pivotal roles in the maintenance of hepatitis B virus in host cells
2021, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了DOCK11和DENND2A在维持HBV在宿主细胞中潜伏状态的关键作用 首次发现DOCK11和DENND2A基因在维持HBV潜伏状态中的作用 研究仅限于肝细胞系和初级人肝细胞,可能需要进一步在更广泛的细胞类型中验证 探究HBV在宿主细胞中维持潜伏状态的机制 DOCK11和DENND2A基因在HBV感染中的作用 NA 肝炎 单细胞RNA测序 NA RNA 肝细胞系和初级人肝细胞
24752 2024-08-09
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素,并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素,并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 研究样本量相对较小,且未涵盖所有可能的易感性因素 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者
24753 2024-08-09
Disrupted spermatogenesis in a metabolic syndrome model: the role of vitamin A metabolism in the gut-testis axis
2022-01, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究探讨了饮食诱导的肠道微生物失调对睾丸轴的影响,特别是在代谢综合征模型中对精子发生的影响 通过单细胞RNA测序和代谢组学分析,揭示了维生素A代谢在肠道-睾丸轴中的作用,以及肠道微生物与精子发生之间的直接联系 NA 旨在揭示肠道-睾丸轴在精子发生障碍中的作用机制 代谢综合征模型中的睾丸样本、宿主代谢组和肠道微生物群 NA 代谢综合征 单细胞RNA测序、代谢组学分析、16S rDNA测序 NA RNA、代谢物、微生物序列 NA
24754 2024-08-09
Single cell transcriptomic analysis identifies novel vascular smooth muscle subsets under high hydrostatic pressure
2021-Oct, Science China. Life sciences
研究论文 本研究构建了一个高静水压细胞培养系统,模拟持续高血压环境,并通过单细胞转录组分析鉴定了人类主动脉平滑肌细胞(HASMCs)的新型分子分类 发现了两种新型HASMC亚群,即炎症亚群和内皮功能抑制亚群,这些亚群在高静水压下表现出不同的基因表达模式,并参与调节内皮功能 NA 探究高血压进展中直接的生物力学效应 人类主动脉平滑肌细胞(HASMCs)在高静水压下的分子分类 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 在100-mmHg和200-mmHg静水压下培养的HASMCs,以及来自高血压患者和实验动物模型高血压的动脉中膜样本
24755 2024-08-09
DSTG: deconvoluting spatial transcriptomics data through graph-based artificial intelligence
2021-09-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为DSTG的新方法,通过基于图的卷积网络对空间转录组数据进行解卷积,以揭示组织内细胞异质性的空间结构 DSTG方法能够准确地解卷积每个spot的观察基因表达并恢复其细胞组成,实现了高水平的分割 NA 研究旨在通过解卷积空间转录组数据来揭示组织细胞异质性的空间结构 研究对象包括小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织 机器学习 NA 空间转录组学 图卷积网络 转录组数据 涉及小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织
24756 2024-08-09
Elucidating the cellular dynamics of the brain with single-cell RNA sequencing
2021-07, RNA biology IF:3.6Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在过去十年的发展及其在神经科学领域的应用 介绍了多组学适应和空间转录组学工作流程的最新进展,这些技术能够从单个细胞中收集更全面的信息 NA 探讨scRNA-seq技术的发展及其在神经科学中的应用,特别是在健康和疾病状态下对神经系统基本细胞动态和分子机制的理解 单细胞RNA测序技术及其在神经科学中的应用 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
24757 2024-08-09
Chemotherapy Induces Senescence-Like Resilient Cells Capable of Initiating AML Recurrence
2021-06, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文研究了急性髓系白血病(AML)患者化疗后复发的原因,发现化疗诱导AML细胞进入一种衰老样表型,这种表型具有再增殖和植入潜力,与AML复发有关。 本文首次揭示了化疗诱导的衰老样表型在AML复发中的作用,并发现ATR抑制剂可以有效抑制这种表型的持久性。 NA 探讨急性髓系白血病化疗后复发机制,并寻找针对性的治疗策略。 急性髓系白血病细胞及其化疗后的生物学行为。 NA 白血病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
24758 2024-08-09
Development of an optimal protocol for molecular profiling of tumor cells in pleural effusions at single-cell level
2021-May, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本文旨在开发一种优化的实验室测试协议,用于对胸腔积液中的游离肿瘤细胞(FTCs)进行单细胞测序 开发了一种精确的单细胞突变检测器(ASMD),用于识别FTCs中的体细胞突变,并改进了全基因组扩增(WGA)协议以减少相关错误 NA 开发一种优化的单细胞测序协议,用于分析胸腔积液中的游离肿瘤细胞 胸腔积液中的游离肿瘤细胞(FTCs) 数字病理学 NA 全基因组扩增(WGA),基因组测序 NA 基因组数据 案例1:19个细胞,案例2:20个细胞
24759 2024-08-09
Single-cell profiling for advancing birth defects research and prevention
2021-04-15, Birth defects research IF:1.6Q4
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在揭示发育途径和过程中前所未有的分辨率,以及其在实验胚胎学和人类胚胎发育中的应用 单细胞RNA测序技术提供了对不同细胞类型基因表达集的全面表征,并揭示了细胞类型从早期细胞状态的演变 NA 探讨单细胞技术在推进出生缺陷研究和预防中的应用 发育过程中的细胞分析和毒性研究 基因组学 出生缺陷 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA
24760 2024-08-09
Single-cell Immune Landscape of Human Recurrent Miscarriage
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了正常和不明原因复发性流产妊娠早期绒毛和外周白细胞的细胞和分子特征 揭示了复发性流产患者绒毛和外周白细胞的细胞和分子图谱,特别是发现了一种独特的促炎性CD56CD16 dNK亚群在复发性流产绒毛中大量积累 NA 深入理解复发性流产中的系统性和绒毛免疫环境 复发性流产患者的绒毛和外周白细胞 数字病理学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 涉及正常和不明原因复发性流产妊娠早期的绒毛和外周白细胞样本
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