单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24701 2024-08-09
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术,分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类,揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群,以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 NA 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素,为人类肢体再生提供新见解。 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 大规模单细胞样本
24702 2024-08-09
Reshaping the Immune Microenvironment by Oncolytic Herpes Simplex Virus in Murine Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021-02-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过建立免疫活性同基因的胰腺导管腺癌模型,探讨了溶瘤单纯疱疹病毒-1(oHSV)对肿瘤微环境(TME)免疫细胞组成的影响 oHSV通过下调肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),尤其是抗炎性巨噬细胞,并增加肿瘤浸润淋巴细胞的比例,包括激活的细胞毒性CD8 T细胞和T辅助(Th)1细胞,从而重塑PDAC的TME,增强免疫活性 NA 研究oHSV在胰腺导管腺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境(TME) 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多色荧光激活细胞分选(FACS) NA 细胞 涉及携带肿瘤的小鼠
24703 2024-08-09
TransSynW: A single-cell RNA-sequencing based web application to guide cell conversion experiments
2021-02, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 介绍了一种基于单细胞RNA测序数据的网络应用程序TransSynW,用于预测用户指定细胞群体的细胞转换转录因子(TFs) TransSynW优先考虑预测转换TFs中的先驱因子,以促进细胞转换时常需的染色质开放,并预测标记基因以评估细胞转换实验的性能 NA 开发一种计算工具,帮助研究人员利用单细胞RNA测序数据生成所需的功能性细胞 细胞转换转录因子(TFs)和标记基因 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA
24704 2024-08-09
Exploring cardiac macrophage heterogeneity in the healthy and diseased myocardium
2021-02, Current opinion in immunology IF:6.6Q1
研究论文 本文探讨了健康和病变心肌中心脏巨噬细胞的异质性,利用遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,提供了一个概念框架来评估心脏巨噬细胞的复杂性。 本文采用了遗传命运图谱和单细胞RNA测序技术,超越了传统的M1/M2分类,更细致地解析了巨噬细胞的异质性。 文章讨论了当前对心脏巨噬细胞多样性理解的局限性,特别是在缺血性损伤、高血压和心肌炎中的应用。 提供一个起点,帮助研究人员解析已知心脏巨噬细胞亚群的功能。 心脏巨噬细胞的异质性和其在健康及病变心肌中的作用。 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
24705 2024-08-09
ARHGAP36 regulates proliferation and migration in papillary thyroid carcinoma cells
2021-01, Journal of molecular endocrinology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了甲状腺乳头状癌(PTC)患者原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织的细胞表达谱,发现ARHGAP36在恶性细胞中高表达,并调控其增殖和迁移 首次揭示ARHGAP36在甲状腺乳头状癌恶性细胞中的特异性表达,并证实其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 研究样本量较小,需进一步扩大样本验证ARHGAP36的临床应用价值 探索甲状腺乳头状癌复发和转移的诊断标志物及治疗靶点 甲状腺乳头状癌患者的原发肿瘤、淋巴结转移及邻近正常组织细胞 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 11,805个单细胞样本
24706 2024-08-09
Combining Whole-Cell Patch-Clamp Recordings with Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文详细描述了如何结合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序技术来研究脑切片中的神经元 本文首次详细介绍了将全细胞膜片钳记录与单细胞RNA测序技术相结合的方法 NA 理解大脑功能及其组成细胞的特性 神经元的内在电特性及其在神经回路中的突触连接 NA NA 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 NA 电生理数据, 转录组数据 脑切片中的神经元
24707 2024-08-09
Toxicity in hematopoietic stem cells from bone marrow and peripheral blood in mice after benzene exposure: Single-cell transcriptome sequencing analysis
2021-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究使用Smart-seq2单细胞转录组测序技术,分析了苯暴露后小鼠骨髓和外周血造血干细胞的转录组变化 首次报道了苯暴露后造血干细胞的转录组特征,并通过加权基因共表达网络分析揭示了关键的生物学途径 NA 探究苯暴露对造血干细胞的毒性作用及其分子机制 小鼠骨髓和外周血中的造血干细胞 数字病理学 白血病 Smart-seq2单细胞转录组测序 NA 转录组数据 使用了苯处理的C57B/6雄性小鼠的骨髓和外周血造血干细胞样本
24708 2024-08-09
Single-cell transcriptome analysis of tumor-infiltrating B cells reveals their clinical implications in non-small cell lung cancer
2021-01, Thoracic cancer IF:2.3Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
24709 2024-08-09
New insights into macrophage heterogeneity in rheumatoid arthritis
2021-01, Joint bone spine IF:3.8Q1
综述 本文综述了类风湿性关节炎中巨噬细胞异质性的最新研究进展 应用单细胞RNA测序技术深入研究了巨噬细胞亚群及其在人和小鼠滑膜关节组织中的潜在功能 NA 旨在识别可能放大炎症反应或促进组织稳态恢复的滑膜巨噬细胞亚群 类风湿性关节炎中的巨噬细胞亚群及其功能 NA 类风湿性关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA NA
24710 2024-08-09
There and back again: The mechanisms of differentiation and transdifferentiation in Drosophila blood cells
2021-01-01, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本文总结了果蝇血细胞中浆细胞向包囊细胞转分化的现有数据,并尝试将其与基于转录组的血细胞聚类相结合,以更好地理解果蝇中转分化的机制。 利用最新的单细胞测序方法对果蝇幼虫中的吞噬血细胞进行聚类分析,以研究转分化的机制。 NA 研究果蝇血细胞中转分化的机制。 果蝇血细胞中的浆细胞和包囊细胞。 NA NA 单细胞测序 NA 转录组数据 NA
24711 2024-08-09
In silico analysis of inner ear development using public whole embryonic body single-cell RNA-sequencing data
2021-01-01, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究利用公共的全胚胎单细胞RNA测序数据,通过计算机模拟分析早期内耳发育中的谱系特异性基因 本研究首次利用单细胞RNA测序数据,识别并分类了内耳早期发育中的15个细胞簇,并鉴定了多个谱系特异性基因候选 NA 旨在识别早期内耳发育中的谱系特异性基因 内耳的四个上皮域及其亚区域 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 5000个单细胞转录组数据
24712 2024-08-09
PlacentaCellEnrich: A tool to characterize gene sets using placenta cell-specific gene enrichment analysis
2021-01-01, Placenta IF:3.0Q2
研究论文 开发了一个名为PlacentaCellEnrich的工具,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)数据,开发了一个新的工具PlacentaCellEnrich,用于分析基因集在胎盘细胞特异性表达模式中的富集情况 NA 旨在开发一个工具,帮助理解模型系统中的表达模式与人类胎盘早期表达模式的对应关系 人类胎盘的单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 NA
24713 2024-08-09
Neuroblastoma and Stem Cell Therapy: An Updated Review
2021, CNS & neurological disorders drug targets
综述 本文综述了神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法在治疗神经母细胞瘤中的应用 探讨了通过单细胞RNA测序技术和计算方法揭示神经母细胞瘤异质性的新途径 目前研究主要基于大量细胞分析,对细胞群体信息提供有限 讨论神经母细胞瘤的发病机制及干细胞疗法的应用 神经母细胞瘤及其治疗 NA 儿童癌症 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
24714 2024-08-09
Intravenous nanoparticle vaccination generates stem-like TCF1+ neoantigen-specific CD8+ T cells
2021-01, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 研究通过静脉注射纳米颗粒疫苗诱导肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞,并探讨了不同接种途径对T细胞数量和质量的影响 首次展示了静脉注射纳米颗粒疫苗能诱导产生干细胞样TCF1+新抗原特异性CD8+ T细胞,并在治疗模型中显示出优越的抗肿瘤反应 NA 优化抗肿瘤免疫反应,通过调节疫苗参数生成特定类型的CD8 T细胞 肿瘤新抗原特异性CD8+ T细胞的生成和功能 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
24715 2024-08-09
Transcriptional Programs of Circuit Assembly in the Drosophila Visual System
2020-12-23, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,研究了果蝇视觉系统发育过程中多个阶段的神经元转录组,揭示了神经元间突触连接的遗传编码模式。 本文开发了一种高效策略,通过在单一池中对多个时间点的神经元进行测序,减少了批次效应并提高了时间序列数据的可靠性。 NA 研究果蝇视觉系统中神经元电路组装的转录程序。 果蝇视觉系统中多个发育阶段的神经元转录组。 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 超过150种不同的神经元群体,其中88种神经元群体在突触形成过程中被追踪。
24716 2024-08-09
Single-cell transcriptome analysis reveals thyrocyte diversity in the zebrafish thyroid gland
2020-12-03, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其周围非腺泡细胞的分子特征 首次通过单细胞转录组测序揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性,并验证了转录因子pax2a在腺泡细胞中的双峰表达模式 NA 探索斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其分子特征 斑马鱼甲状腺腺泡细胞及其周围细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 6249个细胞
24717 2024-08-09
Single cell transcriptome research in human placenta
2020-12, Reproduction (Cambridge, England)
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类胎盘研究中的应用,总结了不同妊娠阶段及妊娠并发症中的研究进展 介绍了单细胞RNA测序技术在胎盘细胞异质性研究中的应用 未提及具体的研究局限性 揭示正常和疾病胎盘中不同细胞类型的异质性及细胞间的分子相互作用 人类胎盘及其在妊娠并发症中的表现 基因组学 妊娠并发症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 未提及具体样本量
24718 2024-08-09
Single-Cell Profiling of AKI in a Murine Model Reveals Novel Transcriptional Signatures, Profibrotic Phenotype, and Epithelial-to-Stromal Crosstalk
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,在AKI的小鼠模型中揭示了新的转录组特征、促纤维化表型和上皮-间质相互作用 发现了AKI中多个阶段和所有肾细胞类型的基因表达模式变化,以及新的基因和细胞身份混合现象 NA 深入理解AKI中的分子通路,以识别可能改善治疗的潜在靶点 AKI的小鼠模型中的单细胞转录组 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 多个时间点(1天、2天、4天、7天、11天和14天)的AKI小鼠模型
24719 2024-08-09
Breast cancers, mammary stem cells, and cancer stem cells, characteristics, and hypotheses
2020-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本文探讨了乳腺癌细胞异质性对治疗的影响,并提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞 提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞,并探讨了癌症干细胞在乳腺癌发展、转移和复发中的作用 目前针对这些特定癌细胞群体的临床试验较少 研究乳腺癌的细胞异质性及其对治疗的影响 乳腺癌、乳腺干细胞和癌症干细胞 NA 乳腺癌 单细胞测序 NA NA NA
24720 2024-08-09
Functional module detection through integration of single-cell RNA sequencing data with protein-protein interaction networks
2020-Nov-02, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究介绍了一种名为SCPPIN的方法,该方法通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络,来检测不同转录状态细胞中的活性模块 SCPPIN方法能够识别出不仅限于差异表达基因的生物学信息,揭示了标准差异表达基因分析之外的生物学功能 NA 开发一种方法,通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质相互作用数据,系统分析差异表达基因 人类肝脏球体和人类脂肪组织的RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 两个RNA测序数据集
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