单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27151 篇文献，本页显示第 24701 - 24720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24701 | 2024-08-09 |
NeuroD1 Dictates Tumor Cell Differentiation in Medulloblastoma
2020-06-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107782
PMID:32579914
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了髓母细胞瘤（MB）细胞的分化能力，并探讨了NeuroD1在促进MB细胞分化中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了NeuroD1在髓母细胞瘤细胞分化中的关键作用，并提出了通过抑制EZH2来增强NeuroD1表达以促进肿瘤细胞分化的治疗策略。 | NA | 探讨髓母细胞瘤细胞的分化机制及其在治疗中的应用。 | 髓母细胞瘤细胞及其分化能力。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24702 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling and SCOPE-Seq Reveal Lineage Dynamics of Adult Ventricular-Subventricular Zone Neurogenesis and NOTUM as a Key Regulator
2020-06-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107805
PMID:32579931
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了成年室管膜下区神经发生的过程，并揭示了NOTUM作为关键调节因子的作用 | 首次使用SCOPE-Seq技术结合活细胞成像和单细胞RNA测序，揭示了细胞大小转换在神经干细胞分化中的作用，并发现了NOTUM在神经干细胞激活中的关键调节作用 | NA | 研究成年室管膜下区神经发生的动态过程及其分子机制 | 成年室管膜下区的神经干细胞及其产生的嗅球神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 超过56,000个室管膜下区和嗅球细胞 |
| 24703 | 2024-08-09 |
An entropy-based metric for assessing the purity of single cell populations
2020-06-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16904-3
PMID:32572028
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研究论文 | 本文介绍了一种基于熵的统计量ROGUE，用于准确量化单细胞RNA测序（scRNA-seq）中识别的细胞簇的纯度 | 提出了ROGUE指标，能够准确、敏感且稳健地评估细胞簇纯度，并应用于多种模拟和真实数据集 | NA | 开发一种新的方法来评估单细胞RNA测序数据中细胞簇的纯度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇纯度 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 多种模拟和真实数据集，包括成纤维细胞、B细胞和脑数据 |
| 24704 | 2024-08-09 |
scClassify: sample size estimation and multiscale classification of cells using single and multiple reference
2020-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20199389
PMID:32567229
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于集成学习和细胞类型层次结构的多尺度分类框架scClassify，用于单细胞RNA测序数据的自动化细胞类型识别 | scClassify能够估计细胞类型分类所需的样本量，并允许在多个参考数据可用时进行联合分类 | NA | 开发一种新的方法用于单细胞RNA测序数据的自动化细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 单细胞RNA测序数据 | 涉及114对参考和测试数据，代表了不同大小、技术和复杂程度 |
| 24705 | 2024-08-09 |
Cathepsin S and Protease-Activated Receptor-2 Drive Alloimmunity and Immune Regulation in Kidney Allograft Rejection
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00398
PMID:32582696
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研究论文 | 本文探讨了组织蛋白酶S（Cat-S）和蛋白酶激活受体-2（PAR-2）在肾脏同种异体移植排斥中的作用 | 通过单细胞RNA测序和免疫染色证实了Cat-S在肾脏同种异体移植中的表达，并发现Cat-S抑制可以显著保护同种异体移植免受炎症和血管炎的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 研究Cat-S和PAR-2在肾脏同种异体移植排斥中的作用及其机制 | 组织蛋白酶S、蛋白酶激活受体-2、肾脏同种异体移植 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类肾脏同种异体移植样本 |
| 24706 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic analysis of human cerebral organoids
2020, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2020.03.013
PMID:32586444
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研究论文 | 本文描述了如何从人类脑类器官的同一悬浮细胞群中生成单细胞RNA测序和ATAC测序数据，并重点介绍了通过在一个实验中多重化多个个体来减少批次效应的方法。 | 利用干细胞衍生的三维细胞培养系统（脑类器官）来模拟早期大脑发育，并结合单细胞转录组和调控景观分析，以高分辨率理解细胞类型特异性特征和发育中的瞬态状态。 | NA | 研究患者特异性大脑发育，并理解细胞类型特异性特征和发育中的瞬态状态及其调控逻辑。 | 人类脑类器官中的单细胞转录组和调控景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 多个个体 |
| 24707 | 2024-08-09 |
Dissecting transcriptional heterogeneity in primary gastric adenocarcinoma by single cell RNA sequencing
2021-03, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-320368
PMID:32532891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，系统地描绘了胃腺癌的转录组异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了胃腺癌的细胞亚群及其转录特征，并验证了其在公共数据集中的存在 | 仅基于转录组数据进行分析，未涉及其他类型的分子数据 | 揭示胃腺癌的分子和细胞异质性，为精准诊断和预后提供帮助 | 胃腺癌细胞及其转录组 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27677个细胞，来自9个肿瘤和3个非肿瘤样本 |
| 24708 | 2024-08-09 |
Virus strain from a mild COVID-19 patient in Hangzhou represents a new trend in SARS-CoV-2 evolution potentially related to Furin cleavage site
2020-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2020.1781551
PMID:32543348
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2病毒基因组在COVID-19传播过程中的突变情况，特别是从杭州一名轻症患者中分离出的ZJ01株，并探讨了Furin切割位点在病毒进化中的作用 | 发现了ZJ01株可能代表SARS-CoV-2的一个潜在进化分支，并首次详细分析了Furin切割位点在病毒进化中的重要性 | NA | 探索SARS-CoV-2病毒在COVID-19传播过程中的基因突变机制及其对病毒进化的影响 | SARS-CoV-2病毒基因组突变及其进化 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 基因序列 | 788名COVID-19患者 |
| 24709 | 2024-08-09 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics: Discovery of novel cell states and cellular interactions in liver physiology and disease biology
2020-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.06.004
PMID:32534107
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中的应用，强调了这些方法在揭示新的细胞状态和细胞间相互作用方面的最新发现和见解。 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术使得能够在单细胞或空间层面研究转录活性，揭示了正常和疾病肝脏中先前未知的细胞类型和亚型，并通过添加空间信息，深化了对组织功能组织和细胞间相互作用的理解。 | NA | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中的应用，以及这些技术如何帮助发现新的细胞状态和细胞间相互作用。 | 肝脏生理和疾病生物学中的细胞类型、亚型及其相互作用。 | 基因组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24710 | 2024-08-09 |
Single-Cell Genomics and Epigenomics: Technologies and Applications in Plants
2020-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2020.04.016
PMID:32532595
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研究论文 | 本文综述了单细胞基因组学和表观基因组学技术及其在植物生物学中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在基因组学和表观基因组学领域的最新进展，这些技术能够解析细胞异质性，为多生物过程提供新的研究途径 | 传统的批量分析方法通过提供平均信息来稀释细胞特异性信息，从而限制了基因组学和功能基因组学研究的分辨率 | 探讨单细胞基因组学和表观基因组学技术在植物生物学中的应用及其潜在意义和未来展望 | 植物生物学中的细胞异质性和多生物过程 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和表观基因组数据 | NA |
| 24711 | 2024-08-09 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究了正常和青光眼患者视网膜神经节细胞（RGCs）的发育轨迹和亚型多样性 | 使用疾病模型干细胞研究RGCs对青光眼退化的发育易感性，并分析了SIX6风险等位基因对RGCs发育和亚型组成的影响 | 目前尚未提及 | 探讨RGCs对青光眼退化的发育易感性，为治疗策略的制定提供信息 | 正常和青光眼患者的视网膜神经节细胞（RGCs） | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 特定于SIX6风险等位基因的青光眼患者和对照组的hRGCs样本 |
| 24712 | 2024-08-09 |
Reconstruction of cell spatial organization from single-cell RNA sequencing data based on ligand-receptor mediated self-assembly
2020-09, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0353-2
PMID:32541867
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研究论文 | 本文介绍了一种基于配体-受体介导的自组装方法，从单细胞RNA测序数据中重建细胞空间组织结构的计算工具CSOmap | CSOmap能够从scRNA-seq数据中推断细胞间的相互作用，并成功重现人类和小鼠多个器官的空间组织结构，包括肿瘤微环境 | NA | 开发一种新的计算工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建细胞空间组织 | 细胞空间组织结构及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类和小鼠的多个器官及肿瘤微环境 |
| 24713 | 2024-08-09 |
A pan-cancer blueprint of the heterogeneous tumor microenvironment revealed by single-cell profiling
2020-09, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0355-0
PMID:32561858
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术分析了来自肺、结直肠、卵巢和乳腺癌患者的233,591个单细胞，构建了一个泛癌种的肿瘤微环境基质细胞异质性蓝图 | 首次构建了一个泛癌种的肿瘤微环境基质细胞异质性蓝图，并展示了其如何指导解释单细胞RNA测序数据 | NA | 探究不同器官癌症中肿瘤微环境基质细胞异质性的相似程度 | 肺、结直肠、卵巢和乳腺癌患者的肿瘤微环境基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质测序 | NA | 单细胞数据 | 36名患者，共233,591个单细胞 |
| 24714 | 2024-08-09 |
Discordance between GLP-1R gene and protein expression in mouse pancreatic islet cells
2020-08-14, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA120.014368
PMID:32554468
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研究论文 | 研究探讨了小鼠胰岛β细胞中GLP-1R基因与蛋白表达的不一致性及其在代谢应激下的变化 | 首次揭示了GLP-1R在小鼠胰岛β细胞中的表达异质性，并发现代谢应激对GLP-1R阳性β细胞数量的影响 | 研究结果表明单细胞RNA测序数据在解释低丰度转录本如肠促胰岛素受体时需谨慎 | 探究GLP-1R在胰岛β细胞中的表达模式及其在代谢应激下的变化 | 小鼠胰岛α细胞、β细胞和δ细胞中的GLP-1R基因与蛋白表达 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNASeq）、流式细胞术（FACS）、定量RT-PCR、流式细胞仪 | NA | RNA序列数据 | 涉及小鼠和人类的β细胞样本 |
| 24715 | 2024-08-09 |
The Mincle/Syk/NF-κB Signaling Circuit Is Essential for Maintaining the Protumoral Activities of Tumor-Associated Macrophages
2020-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0782
PMID:32532809
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了模式识别受体Mincle在肿瘤相关巨噬细胞（TAM）中的高表达，并发现Mincle/Syk/NF-κB信号通路对维持TAM的促肿瘤活性至关重要。 | 发现了Mincle/Syk/NF-κB信号通路在TAM中的新机制，并证明了通过沉默Mincle可以抑制TAM驱动的癌症进展。 | NA | 探讨肿瘤相关巨噬细胞中的信号通路及其在癌症进展中的作用。 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAM）及其在癌症中的作用。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及非小细胞肺癌患者和NOD/SCID小鼠模型。 |
| 24716 | 2024-08-09 |
IL-23 Promotes a Coordinated B Cell Germinal Center Program for Class-Switch Recombination to IgG2b in BXD2 Mice
2020-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2000280
PMID:32554431
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研究论文 | 本研究探讨了IL-23在BXD2小鼠中促进B细胞生发中心程序和IgG2b类别转换重组的作用 | 发现IL-23在BXD2小鼠中通过促进Tfh-IL-17细胞的形成，间接影响生发中心B细胞的类别转换重组相关基因表达 | NA | 研究IL-23在B细胞生发中心程序和类别转换重组中的作用 | BXD2小鼠中的IL-23和B细胞生发中心 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | BXD2和BXD2-小鼠的生发中心B细胞 |
| 24717 | 2024-08-09 |
Hedgehog-FGF signaling axis patterns anterior mesoderm during gastrulation
2020-07-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914167117
PMID:32561646
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探究胚胎发育过程中前部中胚层的模式化缺陷，并定义了 Hedgehog (Hh)-纤维母细胞生长因子 (FGF) 信号轴在原肠胚形成期间对前部中胚层谱系发育的必要性 | 本研究首次揭示了 Hh-FGF 信号轴在原肠胚形成期间对前部中胚层模式化的重要作用，并通过单细胞转录组分析详细阐明了其分子机制 | NA | 探究胚胎发育过程中前部中胚层的模式化机制 | 前部中胚层在原肠胚形成期间的发育 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | Hh 缺陷中胚层的单细胞样本 |
| 24718 | 2024-08-09 |
Integrative multi-omics analysis of a colon cancer cell line with heterogeneous Wnt activity revealed RUNX2 as an epigenetic regulator of EMT
2020-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-020-1351-z
PMID:32535615
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学分析，揭示了结肠癌细胞系中异质性Wnt活性的细胞群体，并发现RUNX2作为EMT的表观遗传调控因子 | 首次揭示了RUNX2作为结肠癌细胞中EMT异质性的关键表观遗传调控因子，并验证了其在体外和体内的EMT增强效应 | NA | 探究结肠癌细胞中EMT异质性的表观遗传驱动因素 | 结肠癌细胞系中的异质性Wnt活性细胞群体 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个具有正相关Wnt活性和EMT状态的不同细胞群体 |
| 24719 | 2024-08-09 |
Sequencing of RNA in single cells reveals a distinct transcriptome signature of hematopoiesis in GATA2 deficiency
2020-06-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019001352
PMID:32556286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的独特转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细描述了GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的转录组特征，并揭示了其与正常细胞的差异 | 研究样本量较小，仅涉及8名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的转录组特征及其与临床表型的关系 | GATA2缺陷患者的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名患者 |
| 24720 | 2024-08-09 |
New Classification of Macrophages in Plaques: a Revolution
2020-06-18, Current atherosclerosis reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11883-020-00850-y
PMID:32556603
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）发现的动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的转录变异，以更好地理解它们对动脉粥样硬化的贡献 | scRNA-seq提供了更详细的动脉粥样硬化中巨噬细胞的转录图谱，挑战了传统观点 | NA | 通过分析巨噬细胞在动脉粥样硬化中的转录变异，理解其在疾病发展中的作用 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的转录变异 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了GSE97310数据集中的LDLR-/-小鼠，喂食高脂饮食11和20周的巨噬细胞样本 |