单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 24701 - 24720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24701 | 2024-08-09 |
Widespread Traces of Lytic Kaposi Sarcoma-Associated Herpesvirus in Primary Effusion Lymphoma at Single-Cell Resolution
2020-Nov-05, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00851-20
PMID:33154001
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，检测了原发性渗出性淋巴瘤（PEL）细胞中Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）和Epstein-Barr病毒（EBV）的转录相互作用 | 首次在单细胞分辨率下检测到KSHV裂解基因的广泛表达痕迹 | NA | 探究KSHV和EBV在PEL细胞中的转录相互作用 | 原发性渗出性淋巴瘤细胞中的KSHV和EBV | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24702 | 2024-08-09 |
The bone marrow microenvironment of pre-B acute lymphoblastic leukemia at single-cell resolution
2020-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76157-4
PMID:33154494
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了小鼠骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的动力学特征 | 首次详细揭示了骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病早期阶段的分子复杂性和细胞间相互作用 | NA | 深入了解骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病中的分子复杂性 | 骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的分子变化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓微环境中的细胞样本 |
| 24703 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-Nov-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02182-1
PMID:33143736
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24704 | 2024-08-09 |
Embryonic liver developmental trajectory revealed by single-cell RNA sequencing in the Foxa2eGFP mouse
2020-11-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01364-8
PMID:33144666
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研究论文 | 本研究利用转基因Foxa2报告鼠系，通过单细胞全长mRNA测序技术，揭示了从E7.5到E15.5胚胎阶段肝脏发育轨迹及其转录组特征 | 首次详细描述了胚胎肝脏发育轨迹，识别了具有肠道和肝脏特征的肝脏原基，并记录了肝细胞转化过程中的动态基因表达 | NA | 深入理解肝脏和胆囊在早期胚胎阶段的发育过程 | 胚胎肝脏和胆囊的发育轨迹及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞全长mRNA测序 | NA | 转录组 | 从E7.5到E15.5的十个胚胎阶段的内胚层和肝细胞 |
| 24705 | 2024-08-09 |
Mitochondria Define Intestinal Stem Cell Differentiation Downstream of a FOXO/Notch Axis
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.10.005
PMID:33147486
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研究论文 | 本文研究了线粒体在FOXO/Notch信号通路下游对肠道干细胞分化的影响 | 揭示了FOXO转录因子和Notch信号在调控线粒体分裂及干细胞向杯状细胞和潘氏细胞分化中的新作用 | NA | 探讨线粒体在肠道干细胞分化中的作用及其与FOXO和Notch信号的相互关系 | 肠道干细胞及其分化过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠肠道组织 |
| 24706 | 2024-08-09 |
A network medicine approach to investigation and population-based validation of disease manifestations and drug repurposing for COVID-19
2020-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000970
PMID:33156843
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研究论文 | 本研究采用网络医学方法，结合临床和多组学观察，旨在识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 研究揭示了COVID-19与炎症性肠病和哮喘之间的共同病理生物学，并发现褪黑素可能作为预防和治疗COVID-19的潜在药物 | 研究主要基于观察性研究和网络预测，需要进一步的临床试验验证 | 识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 网络医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、代谢组学、转录组学 | 网络模型 | 蛋白质相互作用、转录组、蛋白质组 | 26,779名个体 |
| 24707 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Different Stages of Oral Cancer Carcinogenesis in a Mouse Model
2020-Oct-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218171
PMID:33142921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在小鼠模型中口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上分析了口腔癌致癌过程中的基因表达变化，并识别了与MYC_targets_v1通路相关的细胞亚型标记物 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床应用需要进一步验证 | 探究口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征，并寻找潜在的生物标志物 | 小鼠口腔癌致癌过程中的细胞亚型及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | Louvain算法 | 基因表达数据 | 使用了C57BL/6J雄性小鼠，分为对照组和治疗组，共进行了8、16、20和29周的实验 |
| 24708 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity of the decidual endothelial cells that participate in labor onset
2020-10, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202010_23385
PMID:33155267
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了分娩前后蜕膜内皮细胞的异质性及其功能变化 | 揭示了蜕膜内皮细胞在分娩过程中的异质性，并发现了可能在分娩中更活跃的特定亚型 | NA | 探究蜕膜内皮细胞的异质性及其在分娩过程中的变化 | 蜕膜内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9748个细胞 |
| 24709 | 2024-08-09 |
Advances and challenges in single-cell RNA-seq of microbial communities
2020-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2020.10.001
PMID:33160164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在微生物群落研究中的进展和挑战 | 探讨了如何将单细胞RNA测序技术扩展到高吞吐量，以研究数千种微生物 | 单细胞RNA测序技术在真菌、原生生物和细菌中的应用仍处于初级阶段 | 旨在整合哺乳动物和微生物的单细胞分析，以研究健康和疾病中的微生物群落 | 微生物群落的分子状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24710 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses identify dysfunctional CD16+ CD8 T cells in smokers
2020-07-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100054
PMID:33163982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了吸烟者和非吸烟者外周血中的免疫细胞，发现吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群增加，这些细胞表现出NK细胞样特征和免疫老化迹象 | 首次揭示吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群的增加及其与免疫老化的关联 | NA | 识别吸烟对免疫细胞的影响 | 吸烟者和非吸烟者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 吸烟者和非吸烟者的外周血样本 |
| 24711 | 2024-08-09 |
The identification and functional analysis of CD8+PD-1+CD161+ T cells in hepatocellular carcinoma
2020, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00133-4
PMID:33145436
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞免疫环境，分析了肝细胞癌（HCC）中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的分布、功能和进化轨迹 | 首次详细描述了CD8+PD-1+CD161+和CD8+PD-1+CD161- T细胞在肿瘤和非肿瘤组织中的差异分布及其免疫活性，为HCC免疫环境的异质性提供了新的见解 | NA | 探索肝细胞癌中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的功能和分布，为免疫治疗提供新的靶点 | 肝细胞癌（HCC）中的CD8+PD-1+CD161+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约20,000,000个免疫细胞来自15对HCC肿瘤和非肿瘤邻近组织及10份血液样本（包括5份HCC和5份健康对照） |
| 24712 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Immune Cell Repertoire of the Atlantic Cod Which Naturally Lacks the Major Histocompatibility Class II System
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.559555
PMID:33154745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了大西洋鳕鱼免疫组织（脾脏和外周血白细胞）中的细胞类型 | 首次揭示了大西洋鳕鱼中可能代表树突状细胞、自然杀伤样细胞和表达T辅助2细胞主转录因子的细胞亚群 | NA | 探究缺乏主要组织相容性II类系统的大西洋鳕鱼如何对抗细菌感染及产生免疫记忆的机制 | 大西洋鳕鱼的免疫细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 脾脏和外周血白细胞中的细胞 |
| 24713 | 2024-08-09 |
Identification of a novel cancer stem cell subpopulation that promotes progression of human fatal renal cell carcinoma by single-cell RNA-seq analysis
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.46645
PMID:33162821
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群促进人类致命性肾细胞癌的进展 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，鉴定并表征了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群在肾细胞癌的进展和转移中起关键作用 | 研究样本仅来自一对原发和转移部位的集合管肾细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 旨在描绘癌症干细胞介导的生物学特性的基线图谱，为肿瘤进化、抗肿瘤药物选择和药物抗性提供重要信息 | 癌症干细胞亚群及其在肾细胞癌进展中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15208个细胞 |
| 24714 | 2024-08-09 |
Characteristics of TCR Repertoire Associated With Successful Immune Checkpoint Therapy Responses
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587014
PMID:33163002
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综述 | 本文综述了TCR库如何影响免疫检查点疗法（ICT）的反应，以及ICT如何影响TCR库的多样性 | 探讨了网络分析氨基酸相似性在TCR序列中的应用，以及单细胞测序技术在识别关键T细胞克隆中的作用 | 讨论了当前用于表征和表示TCR库多样性的指标的优缺点 | 旨在理解免疫机制，识别预测ICT反应的生物标志物，并开发将非反应患者转化为反应患者的方法 | T细胞受体（TCR）库及其在ICT中的动态变化 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 24715 | 2024-08-09 |
Tissue disaggregation and isolation of specific cell types from transgenic Xenopus appendages for transcriptional analysis by FACS
2021-09, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.268
PMID:33137227
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研究论文 | 本文介绍了一种从转基因非洲爪蟾附肢中分离特定细胞类型并进行转录分析的方法 | 提出了一种使用荧光激活细胞分选（FACS）从复杂尾和肢芽组织中分离特定细胞群体的协议 | NA | 研究非洲爪蟾胚胎和蝌蚪中的细胞类型特异性转录分析 | 非洲爪蟾胚胎和蝌蚪的特定细胞类型 | 细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 细胞 | NA |
| 24716 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic profile-based analysis of tissue differentiation in colorectal cancer
2021-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1811-5
PMID:33141303
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研究论文 | 本文开发了一种方法，利用正常胃肠道的单细胞转录组数据分析结直肠癌中的组织分化谱，并应用于281个肿瘤样本，识别出三种具有不同组织分化模式的结直肠癌亚型 | 本文首次直接测量了结直肠癌组织中的分化程度，并观察到分化状态与抗肿瘤免疫反应及患者预后密切相关 | NA | 研究结直肠癌进展中的组织分化状态变化 | 结直肠癌的组织分化状态及其与免疫反应和患者预后的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 281个肿瘤样本 |
| 24717 | 2024-08-09 |
scAPAtrap: identification and quantification of alternative polyadenylation sites from single-cell RNA-seq data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa273
PMID:33142319
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研究论文 | 提出了一种名为scAPAtrap的工具，用于从基于3'标签的单细胞RNA测序数据中识别和量化选择性多聚腺苷酸化位点 | scAPAtrap能够识别低读取覆盖率的精确多聚腺苷酸化位点，并且不依赖于先验基因组注释，有助于发现先前被忽视区域的新的多聚腺苷酸化位点 | NA | 开发一种新的计算方法，用于在单细胞分辨率下识别和分析选择性多聚腺苷酸化位点 | 单细胞RNA测序数据中的选择性多聚腺苷酸化位点 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 不同实验技术和物种的单细胞RNA测序数据 |
| 24718 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Understandings Towards Pathogenesis and Treatment for Intrauterine Adhesion and Disruptive Insights from Single-Cell Analysis
2021-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-020-00343-y
PMID:33125685
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综述 | 本文综述了宫腔粘连的发病机制和治疗进展，并强调了单细胞分析在该领域的重要性 | 强调了单细胞RNA测序在揭示子宫细胞异质性和细胞间相互作用中的重要性 | 干细胞相关疗法的潜力虽大，但主要基于动物研究且研究设计不标准 | 总结和评估宫腔粘连的当前治疗进展和研究方法 | 宫腔粘连的发病机制和治疗方法 | NA | 妇科疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 110篇文章 |
| 24719 | 2024-08-09 |
A data-driven dimensionality-reduction algorithm for the exploration of patterns in biomedical data
2021-06, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-020-00635-3
PMID:33139824
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'特征增强嵌入机'（FEM）的数据驱动降维算法，用于探索生物医学数据中的模式 | 该算法能够学习数据结构和数据组件的固有特征，对数据进行去噪和组件分离，然后将数据投影到较低维度 | NA | 开发一种准确且广泛适用的数据驱动降维算法 | 生物医学数据中的模式探索 | 机器学习 | NA | 特征增强嵌入机（FEM） | NA | 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据、计算机断层扫描数据、脑电图数据和可穿戴生理传感器数据 | NA |
| 24720 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals novel mitochondria-related musculoskeletal cell populations during adult axolotl limb regeneration process
2021-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-020-00640-8
PMID:33116295
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞RNA测序技术，分析了成年蝾螈肢体再生过程中的细胞分类，揭示了与再生相关的线粒体相关肌肉骨骼细胞群。 | 发现了支持再生过程的线粒体相关集群和通过细胞间相互作用信号促进再生的COL2+集群，以及支持肌肉骨骼系统再生的COL2-线粒体子集群。 | NA | 探索蝾螈肢体再生过程中的关键驱动因素，为人类肢体再生提供新见解。 | 成年蝾螈肢体再生过程中的细胞亚群和细胞外基质。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 大规模单细胞样本 |