单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24681 2024-08-09
A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Skin Aging
2021-02-08, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同年龄段健康人眼睑皮肤的细胞类型及其分子和功能特性,揭示了皮肤老化过程中细胞类型和分子变化的模式 首次构建了人类皮肤老化的单细胞转录组图谱,揭示了光老化相关变化和慢性炎症随年龄的累积,以及关键转录因子在皮肤老化中的作用 NA 深入理解人类皮肤老化的分子和功能特性 人类眼睑皮肤的细胞类型及其在老化过程中的变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自不同年龄段的健康个体
24682 2024-08-09
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Studies of Autoimmune Diseases: a Comprehensive Review
2021-Feb, Clinical reviews in allergy & immunology IF:8.4Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用 单细胞RNA测序技术能够揭示细胞异质性的复杂机制,发现新的细胞亚群,并有助于揭示发病机制、疾病演变和药物抗性的分子机制 NA 探讨单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用及其对诊断和治疗策略的贡献 自身免疫疾病及其相关免疫细胞 生命科学研究 自身免疫疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 NA
24683 2024-08-09
Kidney Single-cell Transcriptomes Predict Spatial Corticomedullary Gene Expression and Tissue Osmolality Gradients
2021-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序技术,预测和量化了小鼠肾脏皮质和髓质轴上的空间基因表达和组织渗透压梯度 首次通过单细胞转录组数据重建了肾脏细胞的空间位置,并预测了皮质和髓质轴上的基因表达 NA 探索单细胞转录组数据在预测肾脏细胞空间位置和基因表达中的应用 小鼠肾脏细胞及其基因表达 数字病理学 NA 单细胞或单核mRNA测序 NA 转录组数据 野生型小鼠和Grhl2CD-/-小鼠的肾脏组织
24684 2024-08-09
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本文通过单细胞RNA测序研究了人诱导多能干细胞衍生的肺泡器官模型中肺泡I型细胞的分化机制 首次通过抑制Wnt信号通路成功诱导人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞分化,并利用单细胞RNA测序技术定义了这些细胞的转录组特征 NA 探究人肺泡I型细胞从肺泡II型细胞分化过程中的机制 人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞及其分化机制 干细胞研究 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 包括人诱导多能干细胞衍生的上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞的肺泡器官模型
24685 2024-08-09
Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文提供了一种使用单细胞RNA测序(scRNAseq)探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞(MDSCs)的详细流程 利用单细胞转录组学技术,深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性,特别是免疫细胞亚群中的MDSCs NA 定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征 乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞(MDSCs) 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNAseq) NA 转录组 涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞
24686 2024-08-09
Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice
2021-01, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分,鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型 首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源,并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物 NA 深入了解棕色前脂肪细胞的异质性 C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分
24687 2024-08-09
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文回顾了转录组分析的关键发展,并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程,以及基于Illumina技术的最佳实践建议 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 NA 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 mRNA测序实验和数据分析 生物信息学 NA RNA-seq NA 文本 NA
24688 2024-08-09
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2
研究论文 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 结合单细胞基因组学分析,这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 数字病理学 NA 下一代测序 NA 单细胞RNA测序 数千个造血祖细胞在单个小鼠中
24689 2024-08-09
SARS-CoV-2 Receptors and Entry Genes Are Expressed in the Human Olfactory Neuroepithelium and Brain
2020-Dec-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究探讨了SARS-CoV-2受体和进入基因在人类嗅觉神经上皮和大脑中的表达 首次发现嗅觉神经上皮中的支持细胞表达SARS-CoV-2受体ACE2和TMPRSS2,可能是病毒进入神经系统的一个潜在入口 NA 验证嗅觉神经上皮是否为SARS-CoV-2的靶点,并探讨其在神经系统中的潜在作用 人类嗅觉神经上皮和支持细胞,以及特定脑细胞类型 NA COVID-19 RNA-seq NA RNA 人类和鼠类的嗅觉组织及脑细胞
24690 2024-08-09
New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2020-12-18, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在理解心脏纤维化和心力衰竭发展中的应用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一个新的平台,用于识别可能驱动心脏纤维化和心力衰竭发展的新的细胞和分子主角 讨论了在解释scRNA-seq数据时的一些关键考虑因素及其局限性 理解心脏纤维化和心力衰竭的发展 心脏细胞景观及其在心脏纤维化中的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24691 2024-08-09
Single-Cell Immune Profiling in Coronary Artery Disease: The Role of State-of-the-Art Immunophenotyping With Mass Cytometry in the Diagnosis of Atherosclerosis
2020-12-15, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
综述 本文综述了心血管免疫学的重要进展,并总结了免疫系统与动脉粥样硬化之间的临床证据 介绍了质谱流式细胞术和单细胞RNA测序等高分辨率技术在早期动脉粥样硬化诊断中的应用 主要血清生物标志物的特异性较低 探讨新的诊断和治疗方法,以改善冠状动脉疾病的早期检测和干预 冠状动脉疾病及其相关免疫细胞亚型 NA 心血管疾病 质谱流式细胞术 NA 单细胞数据 NA
24692 2024-08-09
Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets
2020-12, Trends in immunology IF:13.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,探讨了人类树突状细胞(DCs)的新亚群及其在基于发育的分类中的位置 利用高吞吐量的单细胞方法,特别是在转录组水平上揭示了人类DCs的进一步异质性 NA 研究人类树突状细胞的新亚群及其特征 人类树突状细胞的亚群及其分类 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未提及
24693 2024-08-09
muscat detects subpopulation-specific state transitions from multi-sample multi-condition single-cell transcriptomics data
2020-11-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了在多样本多条件单细胞转录组数据中检测亚群特异性状态转换的方法 开发了一种灵活的模拟方法来评估跨条件差异状态分析的方法性能,并提供了muscat R包中的多条件分析工具 NA 评估和比较不同统计框架在跨条件差异状态分析中的表现 单细胞RNA测序数据中的亚群特异性响应 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 混合模型 转录组数据 涉及小鼠皮质细胞的scRNA-seq数据
24694 2024-08-09
Atherosclerosis in Different Vascular Locations Unbiasedly Approached with Mouse Genetics
2020-11-28, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了不同血管位置的动脉粥样硬化与遗传因素之间的关系,并利用小鼠模型进行无偏倚的遗传学研究 通过全基因组关联研究揭示了人类颈动脉斑块和冠状动脉疾病相关的遗传位点不重叠,表明不同位置可能涉及不同的遗传途径。此外,单细胞转录组分析揭示了一小群对炎症刺激“超响应”的血管平滑肌细胞 物种差异限制了小鼠模型的直接应用 研究不同血管位置动脉粥样硬化的遗传机制 不同血管位置的动脉粥样硬化及其遗传影响因素 NA 心血管疾病 全基因组关联研究、单细胞转录组分析 NA 基因组数据、转录组数据 小鼠模型
24695 2024-08-09
An allosteric interleukin-1 receptor modulator mitigates inflammation and photoreceptor toxicity in a model of retinal degeneration
2020-Nov-27, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文研究了一种变构白细胞介素-1受体调节剂在视网膜退化模型中减轻炎症和光感受器毒性的作用 首次验证了变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela在抑制有害炎症反应和保护光感受器密度及功能方面的有效性 NA 验证白细胞介素-1β在神经视网膜退化中的重要性,并评估变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela的疗效 小鼠视网膜在蓝光诱导下的退化 NA 视网膜退化 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠样本,具体数量未详述
24696 2024-08-09
Single cell profiling of capillary blood enables out of clinic human immunity studies
2020-11-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文开发了一种利用多重单细胞测序和非临床毛细血管血液提取的平台,以简化、低成本地对人类免疫系统进行单细胞分辨率的跨时间和人群的分析 本文创新地利用了多重单细胞测序技术,结合非临床毛细血管血液提取,实现了对人类免疫系统的单细胞分辨率分析 NA 研究目的是更好地理解基因表达在不同免疫细胞类型中的时间性和个体间变异性 研究对象是人类免疫系统中的基因表达变异性 数字病理学 NA 多重单细胞测序 NA 基因表达数据 多个受试者的毛细血管血液样本
24697 2024-08-09
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
研究论文 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据,揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者,可能存在地域和时间限制 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 NA COVID-19 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 119名COVID-19阳性患者
24698 2024-08-09
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
研究论文 本文综述了肝细胞癌(HCC)在精准治疗领域的最新进展,包括新型血清生物标志物的发现与应用、精准肝脏手术技术的改进以及分子靶向治疗和免疫治疗的结合 介绍了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术革新对HCC生物学理解的加速作用,以及这些技术带来的新的治疗机会 肝细胞癌的高度异质性和治疗抵抗性仍然是未满足的医疗需求,需要更深入的疾病生物学研究和新型疗法 探讨肝细胞癌精准治疗的最新研究前沿,以提高患者生存率并寻找新的治疗突破 肝细胞癌(HCC)及其精准治疗策略 NA 肝癌 单细胞测序、基因组编辑 NA 血清生物标志物、影像数据 NA
24699 2024-08-09
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
综述 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法,以及其在精准医学中的潜在应用 NA 加速对细胞异质性的理解 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24700 2024-08-09
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术,深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 NA 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA NA
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