单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 24681 - 24700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24681 | 2024-08-09 |
CD276 expression enables squamous cell carcinoma stem cells to evade immune surveillance
2021-09-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.011
PMID:33945793
|
研究论文 | 本文研究了鳞状细胞癌干细胞通过上调免疫检查点分子CD276来逃避宿主免疫反应的机制 | 首次揭示了鳞状细胞癌干细胞通过表达CD276来逃避免疫监视的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨鳞状细胞癌干细胞逃避免疫监视的机制，并评估靶向CD276的治疗潜力 | 鳞状细胞癌干细胞及其免疫逃逸机制 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和人类的头颈部鳞状细胞癌样本 |
| 24682 | 2024-08-09 |
Generation of hypothalamic arcuate organoids from human induced pluripotent stem cells
2021-09-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.006
PMID:33961804
|
研究论文 | 本文报道了从人诱导多能干细胞（iPSCs）生成下丘脑弓状器官（ARCOs）的方法，用于模拟人类下丘脑弓状核的发育 | 首次成功生成能够模拟特定下丘脑亚区域发育的器官模型，并通过单细胞RNA测序和机器学习分析揭示了弓状核细胞类型的分子异质性 | NA | 研究人类下丘脑弓状核的发育及其在Prader-Willi综合征（PWS）中的异常 | 人诱导多能干细胞（iPSCs）生成的下丘脑弓状器官（ARCOs） | 数字病理学 | Prader-Willi综合征 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组 | NA |
| 24683 | 2024-08-09 |
NK cell and ILC heterogeneity in colorectal cancer. New perspectives from high dimensional data
2021-08, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2021.100967
PMID:33941383
|
综述 | 本文综述了自然杀伤细胞（NK细胞）和先天性淋巴细胞（ILCs）在结直肠癌（CRC）中的异质性及其在疾病发生发展中的作用 | 利用下一代测序技术和单细胞RNA测序方法，结合多维流式细胞术分析，揭示了ILC系统在稳态和病理状态下的复杂性和异质性 | NA | 探讨NK细胞和ILCs在CRC发病机制中的保护性和有害作用 | NK细胞和ILCs在CRC中的表型和转录修饰 | NA | 结直肠癌 | 下一代测序技术，单细胞RNA测序 | NA | 高维数据 | NA |
| 24684 | 2024-08-09 |
A hypothetical role for autophagy during the day/night rhythm-regulated melatonin synthesis in the rat pineal gland
2021-Aug, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12742
PMID:33960014
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了松果体中不同细胞群体背后的基因调控网络，并首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，表明自噬可能在调节松果体中的褪黑激素合成中起作用 | 首次描述了松果体中自噬流在昼夜节律中的激活，并提出了自噬在昼夜节律调节褪黑激素合成中的潜在作用 | NA | 探讨自噬在昼夜节律调节松果体中褪黑激素合成中的作用 | 大鼠松果体中的自噬流和褪黑激素合成 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠松果体中的单个细胞 |
| 24685 | 2024-08-09 |
Variants in GCNA, X-linked germ-cell genome integrity gene, identified in men with primary spermatogenic failure
2021-Aug, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02287-y
PMID:33963445
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研究论文 | 本文通过基因组研究分析了精子发生失败（SPGF）的男性，发现X连锁的生殖细胞核抗原（GCNA）基因中的单核苷酸变异（SNV）与男性不育有关。 | 首次揭示GCNA基因在人类男性不育中的作用，该基因对维持生殖细胞基因组完整性至关重要。 | NA | 研究GCNA基因变异与男性不育之间的关系。 | GCNA基因在男性不育中的作用及其变异的影响。 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，计算建模 | NA | 基因组数据 | 初始分析样本量为176，后续研究样本量为2049。 |
| 24686 | 2024-08-09 |
Single-cell Profiles and Prognostic Impact of Tumor-Infiltrating Lymphocytes Coexpressing CD39, CD103, and PD-1 in Ovarian Cancer
2021-07-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4394
PMID:33963000
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研究论文 | 本研究评估了在卵巢癌中表达CD39、CD103和PD-1的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的表型、克隆性和预后意义 | 首次详细描述了同时表达CD39、CD103和PD-1的TIL亚群，并揭示了其在卵巢癌中的预后价值和潜在的免疫治疗靶点 | NA | 探讨肿瘤浸润淋巴细胞中特定标记物的表达及其在卵巢癌中的预后影响 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSC）中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高维流式细胞术、单细胞测序、多重免疫荧光 | NA | 细胞 | 初级和匹配的化疗前/后HGSC样本 |
| 24687 | 2024-08-09 |
Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege
2021-07, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010
PMID:33964410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术描绘了人类角膜缘组织的细胞图谱，并揭示了其在角膜稳态和免疫血管生成特权中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了人类角膜缘组织的细胞类型和状态，揭示了角膜缘干细胞/祖细胞在细胞间通讯中的核心作用及其与微环境细胞的双向调控关系 | NA | 描绘人类角膜缘组织的细胞图谱，揭示其在角膜稳态和免疫血管生成特权中的作用 | 人类角膜缘组织的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 细胞 | 从六个人类角膜缘组织中收集了47,627个细胞 |
| 24688 | 2024-08-09 |
Cellular components of the hematopoietic niche and their regulation of hematopoietic stem cell function
2021-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000656
PMID:33966008
|
综述 | 本文综述了造血干细胞（HSC）功能的调控机制，特别是骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | 利用转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学和活体动物成像等新技术，揭示了HSC在骨内的位置及维持微环境所需的信号分子 | NA | 探讨造血干细胞的发育和功能如何被造血微环境中的多种细胞成分调控 | 骨细胞、骨巨噬细胞和巨核细胞在造血微环境中的作用及其相互作用 | NA | NA | 转基因小鼠模型、单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组学、活体动物成像 | NA | NA | NA |
| 24689 | 2024-08-09 |
DSCAM/PAK1 pathway suppression reverses neurogenesis deficits in iPSC-derived cerebral organoids from patients with Down syndrome
2021-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135763
PMID:33945512
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研究论文 | 本研究通过组织学检测和无偏倚的单细胞RNA测序分析，探讨了唐氏综合征患者诱导多能干细胞衍生的脑类器官中与早期大脑发育相关的细胞类型特异性异常，并发现抑制DSCAM/PAK1通路可以逆转神经发生缺陷。 | 首次展示了通过抑制DSCAM/PAK1通路可以逆转唐氏综合征患者脑类器官中的异常神经发生，为理解唐氏综合征的分子机制提供了新视角。 | 研究样本量较小，仅包括3名唐氏综合征患者的iPSCs和4个正常细胞系，可能影响结果的普遍性。 | 探讨唐氏综合征早期大脑发育中的细胞类型特异性异常及其分子机制。 | 唐氏综合征患者的诱导多能干细胞衍生的脑类器官。 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 细胞 | 4个正常细胞系和3名唐氏综合征患者的iPSCs |
| 24690 | 2024-08-09 |
Multi-tissue single-cell analysis deconstructs the complex programs of mouse natural killer and type 1 innate lymphoid cells in tissues and circulation
2021-06-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.024
PMID:33945787
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了小鼠自然杀伤细胞和1型先天淋巴细胞在不同组织和循环系统中的基因表达程序 | 首次全面揭示了小鼠不同组织中自然杀伤细胞和1型先天淋巴细胞的基因表达程序，并发现肿瘤小鼠循环系统中自然杀伤细胞程序的重塑 | NA | 解析小鼠自然杀伤细胞和1型先天淋巴细胞在不同组织和循环系统中的复杂基因表达程序 | 小鼠自然杀伤细胞和1型先天淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自血液、脾脏、多种组织和实体肿瘤的小鼠NK1.1NKp46细胞 |
| 24691 | 2024-08-09 |
A regulatory role for CHD4 in maintenance of the spermatogonial stem cell pool
2021-06-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.04.003
PMID:33961790
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研究论文 | 本文研究了核小体重塑蛋白CHD4在维持精原干细胞（SSC）功能中的调控作用 | 首次揭示了CHD4在控制精原干细胞池命运决策中的先前未被重视的作用 | NA | 探讨CHD4在维持精原干细胞功能中的作用 | 精原干细胞（SSC） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠测试样本 |
| 24692 | 2024-08-09 |
The landscape of cell-cell communication through single-cell transcriptomics
2021-Jun, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2021.03.007
PMID:33969247
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综述 | 本文综述了通过单细胞转录组学研究细胞间通讯的最新方法和技术 | 利用单细胞转录组学技术，能够以前所未有的规模和深度研究单个细胞的遗传特征，从而更全面地描述细胞间通讯 | 非空间和空间单细胞转录组学技术各有优缺点，需要进一步发展以克服这些限制 | 探讨如何利用单细胞转录组学技术更全面地描述细胞间通讯 | 细胞间通讯 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24693 | 2024-08-09 |
Hotspot identifies informative gene modules across modalities of single-cell genomics
2021-05-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.04.005
PMID:33951459
|
研究论文 | 本文提出了一种名为“Hotspot”的方法，用于在单细胞基因组学的多模态数据中识别信息性基因模块 | Hotspot方法能够直接在给定的细胞间相似性度量上操作，并可与任何识别细胞间转录变异主要轴的方法（线性或非线性）集成 | NA | 旨在解决单细胞RNA-seq数据分析中识别信息性基因变异及其模块化组织的问题 | 单细胞RNA-seq数据中的基因变异及其模块化组织 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 24694 | 2024-08-09 |
scSNV: accurate dscRNA-seq SNV co-expression analysis using duplicate tag collapsing
2021-05-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02364-5
PMID:33962667
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研究论文 | 本文介绍了scSNV，一种用于dscRNA-seq实验中通过分子重复标签折叠来准确识别单核苷酸变异及其共表达的新方法 | scSNV通过折叠分子重复标签，提高了变异识别的准确性，并能同时检测遗传变异和A>G RNA编辑 | NA | 开发一种新的流程，以最大化dscRNA-seq实验中变异调用的准确性，并利用分子重复来优化变异共表达的检测 | dscRNA-seq实验中的单核苷酸变异及其共表达 | 生物信息学 | NA | dscRNA-seq | NA | RNA序列 | 二十二个样本 |
| 24695 | 2024-08-09 |
scRNA Transcription Profile of Adult Zebrafish Podocytes Using a Novel Reporter Strain
2021-May-05, Cellular physiology and biochemistry : international journal of experimental cellular physiology, biochemistry, and pharmacology
IF:2.5Q2
DOI:10.33594/000000366
PMID:33945241
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研究论文 | 本文通过建立转基因斑马鱼模型，利用荧光报告基因标记足细胞并进行单细胞RNA测序，以识别和分离足细胞并构建scRNA-seq文库。 | 首次使用转基因斑马鱼模型进行足细胞的单细胞RNA测序，识别了多种足细胞转录本，并与人类和小鼠的成熟足细胞表达的蛋白质相关。 | NA | 识别维持足细胞完整性的分子标记，以更好地理解导致损伤的变化。 | 斑马鱼足细胞的分子标记和单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从转基因斑马鱼报告系中分离的足细胞 |
| 24696 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals urothelial cell heterogeneity and regenerative cues following cyclophosphamide-induced bladder injury
2021-05-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03740-6
PMID:33953164
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研究论文 | 本研究使用基于液滴的单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠膀胱黏膜层在正常和受伤条件下的细胞类型，揭示了尿路上皮细胞的异质性及其在环磷酰胺诱导的膀胱损伤后的再生机制 | 首次详细描述了在环磷酰胺诱导的膀胱损伤中，不同膀胱细胞亚群如何协同作用以驱动修复和再生过程 | NA | 深入理解环磷酰胺诱导的膀胱损伤期间的细胞动态，并识别对受伤膀胱再生有重要贡献的微环境因子 | 小鼠膀胱黏膜层的细胞在正常和受伤条件下的类型和功能 | 数字病理学 | 膀胱疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24697 | 2024-08-09 |
Deep generative model embedding of single-cell RNA-Seq profiles on hyperspheres and hyperbolic spaces
2021-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22851-4
PMID:33953202
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPhere的可扩展深度生成模型，用于将单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据嵌入到低维的超球面或双曲空间中，以准确表示scRNA-seq数据 | scPhere模型解决了多层次的复杂批次因素，促进了大型数据集的交互式可视化，解决了细胞拥挤问题，并揭示了时间轨迹 | NA | 开发一种新的方法来处理和解释单细胞RNA测序数据中的维度降低问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度生成模型 | 文本 | 九个大型数据集，来自人类患者或动物发育的复杂组织 |
| 24698 | 2024-08-09 |
Distinct identities of leaf phloem cells revealed by single cell transcriptomics
2021-05-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaa060
PMID:33955487
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术揭示了叶片韧皮部细胞的不同身份 | 首次通过单细胞转录组学技术详细分析了叶片韧皮部细胞的代谢途径和功能 | NA | 探究叶片韧皮部细胞的特性和功能 | 叶片韧皮部细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 至少19种细胞集群 |
| 24699 | 2024-08-09 |
Evidence for phloem loading via the abaxial bundle sheath cells in maize leaves
2021-05-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaa055
PMID:33955497
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了C4玉米叶片中束鞘细胞的分化，特别是背侧束鞘细胞在韧皮部装载中的作用 | 发现了玉米中一种新的韧皮部装载机制，其中背侧束鞘细胞为主要途径，用于质外体蔗糖向韧皮部的转移 | NA | 研究C4玉米叶片中束鞘细胞的分化及其在韧皮部装载中的作用 | C4玉米的束鞘细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24700 | 2024-08-09 |
Single-keratinocyte transcriptomic analyses identify different clonal types and proliferative potential mediated by FOXM1 in human epidermal stem cells
2021-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22779-9
PMID:33947848
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了人类表皮干细胞中由FOXM1介导的不同克隆类型和增殖潜力 | 发现FOXM1作为YAP依赖的关键调节因子在表皮干细胞中的作用 | NA | 提高表皮培养中干细胞测量的标准 | 人类表皮干细胞及其克隆类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |