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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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24661 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
24662 | 2024-08-09 |
Clonal Hematopoiesis-Driver DNMT3A Mutations Alter Immune Cells in Heart Failure
2021-01-22, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317104
PMID:33155517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在人类中定义了由DNMT3A克隆性造血驱动突变介导的炎症免疫细胞亚群 | 样本量较小,需要进一步的大规模研究验证 | 探讨DNMT3A突变在慢性心力衰竭患者中对免疫细胞的影响 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名携带DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者和4名无DNMT3A突变的慢性心力衰竭患者 |
24663 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell RNA sequencing identifies immunotherapy persister cells following PD-1 blockade
2021-01-19, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI135038
PMID:33151910
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研究论文 | 本研究通过动态单细胞RNA测序技术,在PD-1阻断治疗的小鼠肿瘤球体中识别出免疫治疗持久细胞(IPCs) | 首次通过动态单细胞RNA测序技术识别出PD-1阻断后的免疫治疗持久细胞,并揭示了其特征和潜在的治疗靶点 | 研究主要在小鼠模型中进行,需要进一步在人体中验证其有效性和安全性 | 揭示PD-1阻断治疗中免疫逃逸的基本机制,并寻找新的治疗靶点 | 小鼠肿瘤球体中的免疫治疗持久细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肿瘤球体 |
24664 | 2024-08-09 |
GRNdb: decoding the gene regulatory networks in diverse human and mouse conditions
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa995
PMID:33151298
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研究论文 | 本文介绍了GRNdb数据库,该数据库系统预测了人类和小鼠在184种不同生理和病理条件下涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本的基因调控网络(GRNs),并提供了一个用户友好的平台用于搜索、比较、浏览、可视化和下载相关信息。 | GRNdb是首个提供全面的人类和小鼠在单细胞水平上不同正常组织和疾病基因调控网络信息的数据库。 | NA | 开发一个全面的数据库,用于解析在多种条件下基因表达调控的功能和机制。 | 人类和小鼠的基因调控网络及其在不同生理和病理条件下的变化。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及超过633,000个细胞和27,700个批量样本 |
24665 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Plants: Advances and Challenges
2021-01-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.10.012
PMID:33152518
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在植物科学中的应用进展和面临的挑战 | scRNA-seq技术能够以前所未有的分辨率和规模研究植物发育和生理,揭示细胞间的异质性 | 植物科学中单细胞转录组分析仍处于早期阶段,有许多挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在植物研究中的应用,并提出未来研究方向 | 使用拟南芥根模型进行的研究,以及新的单细胞分析工具 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA |
24666 | 2024-08-09 |
Enhanced Efficacy of Simultaneous PD-1 and PD-L1 Immune Checkpoint Blockade in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2021-01-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1674
PMID:33158814
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research paper | 本研究通过免疫功能和单细胞RNA测序转录组分析,探讨了双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的作用机制 | 首次揭示了双特异性抗体诱导NK细胞和部分CD8 T细胞状态转变,增强免疫检查点阻断疗法在高度浆液性卵巢癌中的疗效 | NA | 研究双特异性抗PD-1/PD-L1抗体在高度浆液性卵巢癌中的免疫治疗效果及其作用机制 | 高度浆液性卵巢癌的肿瘤细胞与免疫细胞共培养模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
24667 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals Clonal Architecture of Myeloid Cancers
2021-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2020-163
PMID:33158845
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术揭示了髓系癌症的克隆结构 | 首次使用单细胞测序技术来解析髓系癌症的克隆结构 | NA | 探究髓系癌症的克隆结构 | 急性髓系白血病的克隆结构 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
24668 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Cells
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0810-4_9
PMID:33165847
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研究论文 | 本文详细介绍了两种用于血液细胞单细胞RNA测序(scRNA-Seq)的方法:Smart-Seq2(基于板)和10× Genomics(基于液滴)。 | scRNA-Seq技术的发展为血液学领域带来了进步,增进了我们对正常和恶性造血过程的理解。 | 不同的scRNA-Seq方法各有优缺点,需要在实验设计时加以考虑。 | 探索和优化用于血液细胞的单细胞RNA测序技术。 | 血液细胞的转录状态。 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA | NA |
24669 | 2024-08-09 |
Chitinase 3-like 1 and neurofilament light chain in CSF and CNS atrophy in MS
2021-01, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000906
PMID:33172960
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研究论文 | 研究脑脊液中神经丝轻链(NfL)和新兴标记物壳多糖酶3样蛋白1(CHI3L1)与多发性硬化症(MS)患者脑和脊髓萎缩的横断面关联 | 首次探讨了CHI3L1和NfL在MS患者脑脊液中的水平与脑和脊髓萎缩的关系,并评估了CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 研究为单中心研究,样本量有限,可能影响结果的普遍性 | 探讨CHI3L1和NfL在MS患者中的表达与脑和脊髓萎缩的关系,以及CHI3L1在不同细胞类型中的表达 | 多发性硬化症患者(复发缓解型MS和进行性MS)及健康对照组的脑脊液中NfL和CHI3L1水平 | NA | 多发性硬化症 | MRI | NA | 脑脊液 | 131名MS患者(42名复发缓解型MS和89名进行性MS)及42名匹配的健康对照 |
24670 | 2024-08-09 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
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研究论文 | 本文探讨了表皮干细胞的基因表达时空调控及其在再生医学中的应用 | 引入了单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度和细胞熵等技术,揭示了表皮干细胞的高度异质性和可塑性 | 分离表皮干细胞与其后代仍然是一个挑战 | 探索表皮干细胞的可塑性及其在再生医学中的应用 | 表皮干细胞及其亚群角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
24671 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略,用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略,使用microRNA引导的神经元标签(mAGNET)来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性,并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 |
24672 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
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research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统,用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议,利用重力作为灌流压力,并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统,以提高心肌细胞的活性和纯度,满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 |
24673 | 2024-08-09 |
Toward a Consensus View of Mammalian Adipocyte Stem and Progenitor Cell Heterogeneity
2020-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.09.007
PMID:33148396
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综述 | 本文综述了关于哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞异质性的当前知识 | 利用单细胞转录组学技术,提供了对不同哺乳动物脂肪库中ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍未完全理解 | 探讨哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞的异质性 | 脂肪干细胞和前体细胞(ASPCs)及其在脂肪组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明 |
24674 | 2024-08-09 |
Defining the Teratoma as a Model for Multi-lineage Human Development
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.018
PMID:33152263
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研究论文 | 本文提出畸胎瘤作为研究人类多谱系发育过程的有前景的平台,并通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9敲除筛选等技术验证了其潜力 | 畸胎瘤被证明能够模拟多谱系发育、泛组织功能遗传筛选和组织工程 | NA | 探索畸胎瘤作为研究人类发育过程的平台 | 畸胎瘤及其在人类发育中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq), CRISPR-Cas9, 微RNA (miRNA) 调控 | NA | 细胞 | 23个畸胎瘤,共179,632个细胞,来自4个细胞系 |
24675 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of single-cell RNA sequencing data from healthy human marrow hematopoietic cells
2020-Nov-10, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-020-05357-y
PMID:33168060
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体的391个骨髓CD34+细胞,以揭示造血过程中的转录异质性和动态变化 | 首次综合分析了健康人骨髓造血细胞的单细胞RNA测序数据,并结合长非编码RNA表达和染色质可及性测序数据,揭示了造血细胞分化过程中的基因表达调控模式 | NA | 探究造血过程中的转录异质性和动态变化 | 健康人骨髓中的CD34+造血干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 391个单细胞 |
24676 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis demonstrates inter-patient and intra-tumor heterogeneity in primary and metastatic lung adenocarcinoma
2020-11-10, Aging
DOI:10.18632/aging.103945
PMID:33170151
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研究论文 | 本研究通过分析来自GSE123902和GSE131907数据集的50个原发性和转移性肺腺癌样本的单细胞转录组数据,揭示了患者间和肿瘤内异质性的景观 | 研究展示了单细胞转录组分析在揭示肺腺癌原发和转移组织中与肿瘤进展、化疗抵抗和代谢相关的通路调控异质性方面的创新应用 | NA | 确定原发性和转移性肺腺癌中患者间和肿瘤内异质性的景观 | 原发性和转移性肺腺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 50个原发性和转移性肺腺癌样本 |
24677 | 2024-08-09 |
Unveiling the heterogeneity of NKT cells in the liver through single cell RNA sequencing
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76659-1
PMID:33173202
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝脏中NKT细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描述了NKT细胞的异质性,并发现了一个先前未定义的功能性NKT细胞亚群 | NA | 研究NKT细胞在肝脏中的异质性及其功能 | 肝脏中的NKT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型、Jα18缺陷型和CD1d缺陷型小鼠的肝脏NKT细胞 |
24678 | 2024-08-09 |
Fate and functional roles of Prominin 1+ cells in liver injury and cancer
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76458-8
PMID:33173221
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研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪研究了Prominin 1 (PROM1)细胞在酒精性肝炎(AH)和肝细胞癌(HCC)中的起源、命运和功能 | 首次揭示了PROM1细胞在AH和HCC中的起源和功能,并发现Discodin Domain Receptor 1 (DDR1)在PROM1细胞中的独特上调及其与患者生存的负相关性 | NA | 探讨PROM1细胞在肝脏损伤和癌症中的作用及其潜在的驱动因子 | PROM1细胞在酒精性肝炎和肝细胞癌中的起源、命运和功能 | NA | 肝细胞癌 | 遗传谱系追踪、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
24679 | 2024-08-09 |
Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19015-1
PMID:33159064
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研究论文 | 本文通过五个单细胞RNA测序数据集生成的伪批量混合物,评估了数据转换、预处理、标记选择、细胞类型组成和方法选择对转录组数据细胞类型反卷积结果的综合影响 | 首次全面评估了影响转录组数据细胞类型反卷积的各种因素,并提出了提高反卷积性能的一般指导原则 | 研究主要集中在方法的比较和数据处理的影响上,未涉及实际生物样本的应用 | 评估和优化转录组数据细胞类型反卷积的方法 | 转录组数据的细胞类型反卷积方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个单细胞RNA测序数据集 |
24680 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas and lineage analysis of the adult Drosophila ovary
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19361-0
PMID:33159074
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了成年果蝇卵巢的综合细胞图谱,包括生殖干细胞及其微环境细胞、滤泡干细胞和先前未描述的伴细胞亚群的转录组特征 | 发现了伴细胞的一个独特亚群能够在饥饿或遗传操作下转化为滤泡干细胞 | NA | 研究果蝇卵巢中细胞类型及其转录组特征和细胞谱系 | 成年果蝇卵巢中的主要细胞类型及其功能 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 包含成年果蝇卵巢中每种主要细胞类型的转录组数据 |