单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 24661 - 24680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24661 | 2024-08-09 |
Current Status of Stem Cell-Derived Therapies for Parkinson's Disease: From Cell Assessment and Imaging Modalities to Clinical Trials
2020, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2020.558532
PMID:33177975
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研究论文 | 本文综述了干细胞衍生的多巴胺神经元移植作为帕金森病治疗方案的最新进展，包括细胞来源、评估方法和临床试验结果 | 探讨了干细胞移植在帕金森病治疗中的应用潜力，并总结了临床试验的教训 | 文章指出干细胞移植治疗帕金森病仍需考虑多种因素，如干细胞来源、质量、患者年龄等 | 旨在更新干细胞衍生的多巴胺神经元移植治疗帕金森病的现状和进展 | 主要研究对象为帕金森病患者和干细胞衍生的多巴胺神经元 | NA | 帕金森病 | 单细胞测序、成像技术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24662 | 2024-08-09 |
Differential Expression of Viral Transcripts From Single-Cell RNA Sequencing of Moderate and Severe COVID-19 Patients and Its Implications for Case Severity
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.603509
PMID:33178176
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析中度和重度COVID-19患者的病毒转录本表达差异及其对病例严重程度的意义 | 首次报道了SARS-CoV-2 ORF10基因在中度和重度病例中的差异表达，并发现了与病毒领导者序列独立融合的转录调控序列（TRS）主要在死亡病例中检测到 | 研究结果需要更多数据验证 | 探索SARS-CoV-2感染细胞中病毒基因表达的特征和进化差异，以预测疾病进展和患者分级 | 中度和重度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的感染细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 中度和重度COVID-19患者的样本 |
| 24663 | 2024-08-09 |
Profiling Microglia From Alzheimer's Disease Donors and Non-demented Elderly in Acute Human Postmortem Cortical Tissue
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00134
PMID:33192286
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研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序技术，分析了阿尔茨海默病（AD）患者和非痴呆老年人死后急性皮质脑组织中的小胶质细胞转录组 | 首次在人类样本中识别出七种具有基因表达异质性的小胶质细胞亚群 | 研究未发现AD患者和非痴呆老年人之间小胶质细胞的基因表达和亚群组成有显著差异 | 探讨小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其基因表达特征 | 阿尔茨海默病患者和非痴呆老年人的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用急性人类死后皮质脑样本 |
| 24664 | 2024-08-09 |
LRR-Containing Oncofetal Trophoblast Glycoprotein 5T4 Shapes Neural Circuits in Olfactory and Visual Systems
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.581018
PMID:33192298
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研究论文 | 本文探讨了含有LRR的癌胚滋养层糖蛋白5T4在嗅觉和视觉系统中神经回路形成中的作用 | 首次揭示了5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的关键作用 | NA | 研究5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的作用 | 嗅觉和视觉系统中的神经回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24665 | 2024-08-09 |
BrainWiki-A Wiki-Style, User Driven, Comparative Brain Anatomy Tool
2020, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2020.548172
PMID:33192339
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研究论文 | 介绍了一个名为BrainWiki的用户友好型网络脑图谱平台，该平台将人类和小鼠大脑并列展示，便于直接比较 | BrainWiki是首个将人类和小鼠大脑并列展示的网络平台，支持用户互动和贡献，使其成为一个动态更新的脑科学资源 | NA | 旨在创建一个用户驱动的、比较性的脑解剖学工具，以促进对人类和小鼠大脑的理解 | 人类和小鼠的大脑解剖结构及其相关研究 | 神经科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 24666 | 2024-08-09 |
Identification of Immune Cell Infiltration and Immune-Related Genes in the Tumor Microenvironment of Glioblastomas
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.585034
PMID:33193404
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研究论文 | 本研究旨在识别胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫相关基因 | 本研究通过RNA测序和临床数据分析，识别了24个与肿瘤微环境浸润相关的免疫相关基因，这些基因可能作为新的生物标志物和免疫治疗靶点 | NA | 识别胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和CGGA的GBM样本数据 |
| 24667 | 2024-08-09 |
NeuralEE: A GPU-Accelerated Elastic Embedding Dimensionality Reduction Method for Visualizing Large-Scale scRNA-Seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00786
PMID:33193561
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研究论文 | 本文设计了一种GPU加速的方法NeuralEE，结合了弹性嵌入和神经网络的优势，用于大规模单细胞RNA测序数据的降维和可视化 | NeuralEE方法具有可扩展性和通用性，能够在有限的计算资源下保持高性能 | NA | 开发一种高效的降维和可视化工具，以应对单细胞RNA测序数据量和规模的急剧增加 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | GPU加速 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 130万个小鼠脑细胞 |
| 24668 | 2024-08-09 |
Stemness Related Genes Revealed by Network Analysis Associated With Tumor Immune Microenvironment and the Clinical Outcome in Lung Adenocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.549213
PMID:33193623
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）全面分析了癌症干细胞特性与肿瘤微环境（TME）在肺腺癌（LUAD）中的作用 | 本研究首次揭示了癌症干细胞特性与抗肿瘤免疫之间的关系，并通过多种算法探索了关键基因表达与癌症免疫特性的关系 | 研究结果需要在更大样本中进一步验证，以确认其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 | 探讨癌症干细胞特性与肿瘤微环境在肺腺癌中的作用及其对临床结果的影响 | 肺腺癌（LUAD）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 24669 | 2024-08-09 |
Evolution of Advanced Chronic Lymphoid Leukemia Unveiled by Single-Cell Transcriptomics: A Case Report
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.584607
PMID:33194728
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病例报告 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了慢性淋巴细胞白血病（CLL）在诊断和复发阶段的遗传和转录异质性 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在CLL患者中发现了在治疗过程中克隆优势的重大转变，并揭示了与疾病进展相关的特定克隆和信号通路的激活 | 本研究仅基于单一病例，可能无法完全代表所有CLL患者的普遍情况 | 通过单细胞转录组学分析，揭示CLL的疾病异质性，以优化治疗方案 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）的遗传和转录异质性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 单一CLL病例，包括诊断和复发阶段的样本 |
| 24670 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
|
研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE，利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态，并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具，以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 |
| 24671 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
|
研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性，并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识，特别关注头部感觉神经节，强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术，近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 24672 | 2024-08-09 |
Molecular Genetics of Kappa Opioids in Pain and Itch Sensations
2022, Handbook of experimental pharmacology
DOI:10.1007/164_2020_397
PMID:33145633
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综述 | 本文综述了kappa阿片受体（KOR）及其内源性激动剂dynorphins在调节痒感和疼痛中的作用 | 介绍了KOR及其受体影响细胞和神经回路的最新发现，并重新分析了单细胞测序数据，展示了这些分子的表达谱 | 仅考虑了KOR与来自prodynorphin基因的肽和其他亲和力较低的阿片肽的相互作用 | 探讨kappa阿片系统在特定解剖位置中的作用及其在神经系统中的相互联系 | kappa阿片受体及其内源性激动剂dynorphins在痒感和疼痛调节中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 24673 | 2024-08-09 |
Evaluating single-cell cluster stability using the Jaccard similarity index
2021-08-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa956
PMID:33165513
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研究论文 | 本文介绍了一套工具，通过子采样方法评估单细胞聚类的稳定性，以指导参数选择和辅助生物学解释 | 提出了使用Jaccard相似性指数来评估单细胞聚类稳定性的方法，并开发了相应的R包和Snakemake工作流程 | 未提及 | 旨在提高单细胞RNA测序实验中聚类结果的稳定性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24674 | 2024-08-09 |
CellTalkDB: a manually curated database of ligand-receptor interactions in humans and mice
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa269
PMID:33147626
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CellTalkDB的手动 curated 数据库，该数据库包含了人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | CellTalkDB数据库不仅包含了2033对小鼠的配体-受体相互作用，还额外包含了377对人类的配体-受体相互作用，相比于现有的SingleCellSignalR资源，提供了更全面的数据 | NA | 构建一个全面的手动 curated 数据库，以帮助进一步推断和理解基于配体-受体相互作用的细胞间通信 | 人类和小鼠中的配体-受体相互作用对 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据库 | 3398对人类配体-受体相互作用和2033对小鼠配体-受体相互作用 |
| 24675 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of murine mural cells reveals cellular heterogeneity
2021-Jul, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1823-2
PMID:33165809
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞数据集GSE109774，展示了小鼠壁细胞（MCs）的转录异质性 | 首次详细研究了壁细胞的转录异质性，并通过重新聚类识别了五个不同的亚群 | NA | 揭示壁细胞的转录异质性及其在组织中的分布和相互作用 | 小鼠壁细胞（MCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用公开数据集GSE109774 |
| 24676 | 2024-08-09 |
ILoReg: a tool for high-resolution cell population identification from single-cell RNA-seq data
2021-05-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa919
PMID:33151294
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研究论文 | 介绍了一种名为ILoReg的R包，用于通过单细胞RNA测序数据进行高分辨率的细胞群体识别 | ILoReg通过概率特征提取步骤和迭代聚类投影（ICP）算法，提高了对具有细微差异的细胞群体的识别能力 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞群体的识别分辨率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 迭代聚类投影（ICP） | 转录组数据 | NA |
| 24677 | 2024-08-09 |
The Whey Acidic Protein WFDC12 Is Specifically Expressed in Terminally Differentiated Keratinocytes and Regulates Epidermal Serine Protease Activity
2021-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.09.025
PMID:33157095
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研究论文 | 本研究探讨了WFDC12蛋白在表皮角质形成细胞终末分化中的表达及其对表皮丝氨酸蛋白酶活性的调控作用 | 首次发现WFDC12在表皮角质形成细胞终末分化阶段的特异性表达，并揭示了其在调控角质层蛋白酶活性中的作用 | NA | 研究WFDC蛋白家族成员在表皮稳态中的作用 | WFDC12蛋白在人类表皮中的表达及其功能 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序，免疫金-电子显微镜 | NA | RNA | 涉及银屑病、特应性皮炎、Darier病和Netherton综合征患者的皮肤样本 |
| 24678 | 2024-08-09 |
Regulatory eosinophils induce the resolution of experimental arthritis and appear in remission state of human rheumatoid arthritis
2021-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2020-218902
PMID:33148700
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研究论文 | 本研究探讨了哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎（RA）中的促分解特性及其机制 | 发现了嗜酸性粒细胞的一个新亚型——调节性嗜酸性粒细胞（rEos），其在关节炎的缓解中起关键作用 | NA | 研究哮喘中的嗜酸性粒细胞在类风湿性关节炎中的促分解作用及其机制 | 嗜酸性粒细胞、类风湿性关节炎、哮喘 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括小鼠模型和人类RA患者的样本 |
| 24679 | 2024-08-09 |
Targeting fibroblast growth factor 23-responsive pathways uncovers controlling genes in kidney mineral metabolism
2021-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2020.10.024
PMID:33159963
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研究论文 | 本研究通过基因阵列和单细胞RNA测序技术，探索了FGF23响应途径中的调控基因，特别是在肾脏矿物质代谢中的作用 | 发现HBEGF作为FGF23下游调控基因的新角色，并通过靶向共同信号途径发挥作用 | NA | 识别可作为控制FGF23介导的矿物质代谢目标的新基因 | FGF23响应途径中的调控基因及肾脏矿物质代谢 | NA | NA | 基因阵列，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 野生型小鼠肾脏样本 |
| 24680 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of cardiac progenitors reveals functional subpopulations and their cooperative crosstalk in cardiac repair
2021-02, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00788-6
PMID:33159668
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |