单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 24641 - 24660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24641 | 2024-08-09 |
TISCH: a comprehensive web resource enabling interactive single-cell transcriptome visualization of tumor microenvironment
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1020
PMID:33179754
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research paper | 本文介绍了Tumor Immune Single Cell Hub (TISCH)，一个大规模的单细胞转录组数据库，整合了来自27种癌症类型的近200万个细胞的单细胞转录组数据。 | TISCH提供了一个用户友好的界面，用于系统地可视化、搜索和下载肿瘤微环境中的基因表达图谱，支持跨多个数据集的单细胞或集群级别的交互式基因表达可视化。 | NA | 旨在通过整合和利用大量已发表的单细胞RNA-seq数据集，为免疫治疗提供信息支持。 | 肿瘤微环境中的免疫系统异质性。 | digital pathology | NA | single-cell RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 近200万个细胞，来自76个高质量肿瘤数据集 |
| 24642 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal sequence of mesoderm and endoderm lineage segregation during mouse gastrulation
2021-01-07, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193789
PMID:33199445
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研究论文 | 本文研究了小鼠原条期间中胚层和内胚层谱系分离的时空序列 | 结合遗传命运标记和成像方法与单细胞RNA测序(scRNA-seq)来追踪转录身份并定义细胞类型的谱系轨迹 | NA | 探索小鼠胚胎原条期间中胚层和内胚层谱系分离的精确时空模式和分子细节 | 小鼠胚胎中的中胚层和内胚层谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24643 | 2024-08-09 |
VEGF-B Promotes Endocardium-Derived Coronary Vessel Development and Cardiac Regeneration
2021-01-05, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了血管内皮生长因子B（VEGF-B）在心脏中促进源自心内膜的冠状血管发育和心脏再生的作用。 | VEGF-B在心脏发育期间促进源自心内膜的冠状血管形成，并在成年小鼠中促进心内膜下心肌的血管内皮细胞增殖，以及心肌梗死后心脏组织的结构和功能恢复。 | NA | 研究VEGF-B在心脏中对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | VEGF-B在心脏中的作用及其对冠状血管发育和心脏再生的影响。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 基因转移，细胞周期标记，流式细胞术，组织学，免疫组织化学，生物化学方法，单细胞RNA测序，生物信息学分析，微型计算机断层扫描，荧光和示踪剂介导的血管灌注成像分析。 | NA | 图像 | 使用表达VEGF-B转基因的小鼠和大鼠，VEGF-B基因敲除的小鼠和大鼠，以及成年小鼠中的病毒载体介导的VEGF-B基因转移。 |
| 24644 | 2024-08-09 |
Decoding myofibroblast origins in human kidney fibrosis
2021-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2941-1
PMID:33176333
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，分析了健康和纤维化人肾脏近端和非近端小管细胞的转录组，以高分辨率绘制了整个人肾脏的细胞图谱，并识别了在人肾脏纤维化过程中形成瘢痕的主要细胞来源。 | 首次通过单细胞RNA测序和时空转录组学技术，高分辨率地揭示了人肾脏纤维化中肌成纤维细胞的起源和分化过程，并鉴定了潜在的治疗靶点NKD2。 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，可能存在种属差异；且未进行临床试验验证NKD2作为治疗靶点的有效性。 | 揭示人肾脏纤维化中肌成纤维细胞的起源和分化机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 人肾脏纤维化中的肌成纤维细胞及其前体细胞。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 时空转录组学 | NA | 转录组数据 | 健康和纤维化人肾脏的近端和非近端小管细胞 |
| 24645 | 2024-08-09 |
Sharing and Helping: Regularity and Characteristics of Pathogenesis of a Widely Used Transgene Initiated Murine Acute Promyelocytic Leukemia Model
2021-01-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2020.0125
PMID:33176587
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研究论文 | 本文通过改进的急性早幼粒细胞白血病（APL）小鼠模型，补充了该模型发病规律和特征的数据 | 本文填补了现有文献中关于该模型发病规律和特征数据的空白 | NA | 旨在补充和完善APL小鼠模型的发病规律和特征数据 | APL小鼠模型的发病时间、潜伏期、发病率、寿命及APL细胞在外周血、脾脏、骨髓中的比例等 | NA | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 24646 | 2024-08-09 |
Linking axon morphology to gene expression: a strategy for neuronal cell-type classification
2020-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2020.10.006
PMID:33181399
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研究论文 | 本文探讨了将轴突形态与基因表达联系起来，以进行神经细胞类型分类的策略 | 本文提出了一种将单细胞转录组学与轴突投影模式相结合的方法，以更好地描述细胞类型 | NA | 研究大脑如何驱动认知和行为，并理解其细胞组成 | 神经细胞类型的分类 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据，形态学数据 | 小鼠大脑 |
| 24647 | 2024-08-09 |
BMP signaling: at the gate between activated melanocyte stem cells and differentiation
2020-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.340281.120
PMID:33184221
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和比较基因表达分析，研究了静止、激活和黑素细胞成熟过程中黑素细胞干细胞的转录动力学，并探讨了WNT和BMP信号通路在这一过程中的整合作用。 | 本文揭示了WNT和BMP信号通路在黑素细胞干细胞激活和分化过程中的协同作用，并强调了BMP信号在驱动完全分化中的关键作用。 | NA | 阐明黑素细胞干细胞在静止、激活和黑素细胞成熟过程中的转录动力学，并理解WNT和BMP信号通路的整合机制。 | 黑素细胞干细胞及其在毛发周期中的激活和分化过程。 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24648 | 2024-08-09 |
Guidelines for reporting single-cell RNA-seq experiments
2020-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00744-z
PMID:33188371
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24649 | 2024-08-09 |
Analyses of metastasis-associated genes in IDH wild-type glioma
2020-Nov-16, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-020-07628-0
PMID:33198677
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据挖掘，探索了IDH野生型胶质瘤中的转移相关基因，并构建了基于这些基因的预后模型 | 首次通过单细胞测序数据识别胶质瘤中的转移相关基因，并构建了预后模型 | NA | 探索胶质瘤转移相关基因，并识别可能的预后标志物 | IDH野生型胶质瘤中的转移相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | PCA, tSNE | 基因数据 | 数据来自GEO数据库和TCGA/CGGA数据库 |
| 24650 | 2024-08-09 |
Characterisation of CD4+ T-cell subtypes using single cell RNA sequencing and the impact of cell number and sequencing depth
2020-11-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76972-9
PMID:33188258
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析CD4+ T细胞亚型的特征，并探讨细胞数量和测序深度对识别这些亚型的影响 | 首次系统评估了细胞数量和测序深度对复杂细胞群体如CD4+ T细胞亚型识别的影响 | 研究结果基于单一个体，可能需要进一步的多样本验证 | 旨在确定减少测序深度和细胞数量对准确识别CD4+ T细胞亚型的影响 | CD4+ T细胞及其在静息和刺激条件下的亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 基于单一个体 |
| 24651 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing confirms IgG transcription and limited diversity of VHDJH rearrangements in proximal tubular epithelial cells
2020-11-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75013-9
PMID:33184300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和嵌套PCR结合Sanger测序技术，探索了近端小管上皮细胞（PTECs）中免疫球蛋白（Ig）的表达情况 | 首次证实PTECs能表达IgG，并展示了与B细胞来源IgG相比，PTEC来源IgG在VDJ重排多样性上的差异 | 研究样本仅来自两名肾癌患者的正常肾皮质，样本量较小 | 探究近端小管上皮细胞是否表达免疫球蛋白 | 近端小管上皮细胞中的免疫球蛋白表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），嵌套PCR，Sanger测序 | NA | RNA | 91个单细胞样本来自两名肾癌患者的正常肾皮质 |
| 24652 | 2024-08-09 |
Data Sanitization to Reduce Private Information Leakage from Functional Genomics
2020-11-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.036
PMID:33186529
|
研究论文 | 本文开发了一种数据净化程序，旨在减少功能基因组学数据中的私人信息泄露，同时允许共享原始读取数据。 | 提出了一个新的数据共享模式，超越了传统的受控访问模型，能够在保护隐私的同时实现数据的有效共享。 | NA | 减少功能基因组学数据中的私人信息泄露，同时促进数据的广泛共享。 | 功能基因组学数据及其隐私保护。 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | 使用了高度准确的参考基因组和更现实的环境样本数据 |
| 24653 | 2024-08-09 |
Methamphetamine Increases the Proportion of SIV-Infected Microglia/Macrophages, Alters Metabolic Pathways, and Elevates Cell Death Pathways: A Single-Cell Analysis
2020-11-12, Viruses
DOI:10.3390/v12111297
PMID:33198269
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研究论文 | 研究甲基苯丙胺对SIV感染的微胶质细胞/巨噬细胞的影响，通过单细胞RNA测序分析其代谢途径和细胞死亡途径的变化 | 首次通过单细胞RNA测序分析甲基苯丙胺对SIV感染的微胶质细胞/巨噬细胞的影响，揭示了甲基苯丙胺增加SIV感染比例并影响细胞死亡和神经炎症途径 | 研究仅限于SIV感染的恒河猴模型，可能需要进一步的人体研究以验证结果 | 探讨甲基苯丙胺与HIV感染在脑部的相互作用及其对微胶质细胞和脑巨噬细胞的影响 | SIV感染的微胶质细胞和脑巨噬细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SIV感染的恒河猴微胶质细胞和脑巨噬细胞 |
| 24654 | 2024-08-09 |
Digital microfluidic isolation of single cells for -Omics
2020-11-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19394-5
PMID:33177493
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研究论文 | 介绍了一种名为DISCO的平台，该平台利用数字微流控技术、激光细胞裂解和人工智能驱动的图像处理技术，从异质细胞群中收集单个细胞的内容物，并通过下一代测序技术分析单细胞基因组和转录组，以及通过纳米流液相色谱和串联质谱分析蛋白质组 | DISCO平台能够实现与现有技术相当或更优的测序水平，能够识别单核苷酸变异等特征 | NA | 开发一种新的平台，用于从有限样本中选择特定细胞进行单细胞水平的组学分析 | 单细胞的基因组、转录组和蛋白质组 | 数字病理 | NA | 下一代测序、纳米流液相色谱和串联质谱 | 人工智能驱动的图像处理 | 图像、基因组和转录组数据 | 有限初始样本大小 |
| 24655 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Aquaporin 5-Expressing Mouse Lung Epithelial Cells Identifies GPRC5A as a Novel Validated Type I Cell Surface Marker
2020-11-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112460
PMID:33187367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了表达水通道蛋白5（AQP5）的小鼠肺上皮细胞，并鉴定出GPRC5A作为新型验证的I型细胞表面标记物 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定出GPRC5A作为I型肺泡上皮细胞（AT1细胞）的保守表面标记物 | 研究仅限于特定的小鼠模型，且样本量较小 | 旨在通过单细胞RNA测序技术鉴定和验证新的肺泡上皮I型细胞表面标记物 | 表达AQP5的小鼠肺上皮细胞和AT1细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 92个细胞 |
| 24656 | 2024-08-09 |
Prepronociceptin-Expressing Neurons in the Extended Amygdala Encode and Promote Rapid Arousal Responses to Motivationally Salient Stimuli
2020-11-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108362
PMID:33176134
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研究论文 | 本文研究了表达prepronociceptin基因的神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用 | 首次发现prepronociceptin神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用，并揭示了这些神经元的亚群可能对动机性刺激的快速唤醒反应有不同的调节作用 | NA | 探讨prepronociceptin神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用 | 表达prepronociceptin基因的神经元在终纹床核中的功能 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像、光遗传学 | NA | 生理数据 | 小鼠 |
| 24657 | 2024-08-09 |
Prrx1 Fibroblasts Represent a Pro-fibrotic Lineage in the Mouse Ventral Dermis
2020-11-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108356
PMID:33176144
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组学研究，揭示了在小鼠腹侧真皮中表达配对相关同源盒1（Prrx1）的成纤维细胞在急性和慢性纤维化中的作用 | 首次证明Prrx1表达的成纤维细胞在小鼠腹侧真皮中具有内在的瘢痕形成潜力 | NA | 研究小鼠腹侧真皮中成纤维细胞的异质性及其在纤维化中的作用 | 小鼠腹侧真皮中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 谱系追踪，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24658 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Heterogeneity of the Stromal Niche in Cutaneous Melanoma Heterogeneous Spheroids
2020-Nov-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113324
PMID:33182777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同真皮成纤维细胞引入的黑色素瘤异质性球体中的微环境因子 | 本研究首次区分了黑色素瘤球体中人类原代成纤维细胞的三个功能簇，并验证了IL-6在促进黑色素瘤侵袭中的作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序分析不同成纤维细胞对黑色素瘤异质性球体微环境的影响 | 黑色素瘤异质性球体中的微环境因子及成纤维细胞的多样性 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自年轻捐赠者防晒皮肤和成年捐赠者日晒损伤皮肤的正常真皮成纤维细胞 |
| 24659 | 2024-08-09 |
Laser Capture Microdissection-Based RNA Microsequencing Reveals Optic Nerve Crush-Related Early mRNA Alterations in Retinal Ganglion Cell Layer
2020-10, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.9.11.30
PMID:33173609
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研究论文 | 本文通过激光捕获显微切割（LCM）和RNA微测序技术，研究了视神经挤压（ONC）相关的视网膜神经节细胞（RGC）层早期mRNA变化 | 首次使用LCM结合单细胞RNA测序技术，揭示了ONC相关早期mRNA变化的分子机制 | NA | 建立LCM和RNA微测序方法，探索视神经挤压相关的视网膜神经节细胞层早期mRNA变化 | 视网膜神经节细胞层的早期mRNA变化 | 数字病理学 | NA | 激光捕获显微切割（LCM），RNA微测序 | NA | RNA | 30微米厚的视网膜组织切片 |
| 24660 | 2024-08-09 |
Multiple Expression Assessments of ACE2 and TMPRSS2 SARS-CoV-2 Entry Molecules in the Urinary Tract and Their Associations with Clinical Manifestations of COVID-19
2020, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S270543
PMID:33177848
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研究论文 | 本研究探讨了ACE2和TMPRSS2在人体主要器官中的表达模式，特别是在特定疾病条件下，并评估了它们与COVID-19临床表现的关系 | 首次详细研究了ACE2和TMPRSS2在泌尿系统中的表达及其与COVID-19临床表现的关系 | NA | 揭示SARS-CoV-2的致病机制及其在人体睾丸和肾脏中的临床表现 | ACE2和TMPRSS2在人体器官中的表达及其与COVID-19的关系 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及慢性肾脏疾病或糖尿病肾病的个体 |