单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 24621 - 24640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24621 | 2024-08-09 |
Human cutaneous neurofibroma matrisome revealed by single-cell RNA sequencing
2021-01-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-020-01103-4
PMID:33413690
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类皮肤神经纤维瘤的基质组 | 发现经典的促纤维化胶原蛋白I肌成纤维细胞在神经纤维瘤中很少见，而促肿瘤发生的胶原蛋白VI在神经纤维瘤中丰富，主要由神经纤维瘤成纤维细胞分泌 | NA | 揭示神经纤维瘤中基质基因及其相关基因（即基质组）的确切谱系及其功能 | 人类皮肤神经纤维瘤的基质组 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24622 | 2024-08-09 |
SCC: an accurate imputation method for scRNA-seq dropouts based on a mixture model
2021-Jan-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03878-8
PMID:33407064
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研究论文 | 提出了一种名为SCC的新方法，用于填补单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的缺失值（dropouts） | SCC方法在减少细胞内距离和提高聚类准确性方面优于现有两种方法 | NA | 解决scRNA-seq数据中的dropout噪声问题 | scRNA-seq数据中的dropouts | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合模型 | 基因表达数据 | NA |
| 24623 | 2024-08-09 |
Recent progress in pancreatic islet cell therapy
2021-Jan-05, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-020-00152-5
PMID:33402224
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研究论文 | 本文综述了利用人多能干细胞（包括人胚胎干细胞和诱导多能干细胞）通过体外定向分化再生胰腺胰岛细胞的最新进展 | 通过单细胞RNA测序技术分析PSC衍生的内分泌β细胞，并与人类胰岛进行比较，发现了在胰腺分化和成熟过程中涉及的新信号通路和分子。此外，结合基因编辑技术，从糖尿病患者源性的PSC系可以分化为功能性胰腺胰岛细胞，为未来的自体细胞治疗提供了可能性 | NA | 探讨人多能干细胞衍生的胰腺胰岛细胞的定向分化过程、转录组和代谢组研究的新发现，以及在疾病模型中的最新进展 | 人多能干细胞衍生的胰腺胰岛细胞 | 干细胞研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、代谢组 | NA |
| 24624 | 2024-08-09 |
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining
2021-01-05, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-020-00162-6
PMID:33402683
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研究论文 | 本文介绍了一种基于稀疏连接自编码器（SCA）的工具，用于单细胞RNA测序（scRNAseq）数据的功能挖掘 | 提出了两种新的度量标准QCC和QCM，用于量化SCA重建有价值细胞簇的能力和评估神经网络质量 | NA | 开发一种工具，用于揭示与scRNAseq数据相关的隐藏特征 | 单细胞RNA测序数据及其细胞簇 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 稀疏连接自编码器（SCA） | 文本 | 使用了多种实验验证的数据（TF靶点、miRNA靶点、激酶靶点和癌症相关免疫特征） |
| 24625 | 2024-08-09 |
Overcoming Expressional Drop-outs in Lineage Reconstruction from Single-Cell RNA-Sequencing Data
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108589
PMID:33406427
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SClineager的方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断准确的进化谱系，通过借鉴相关细胞的信息来克服表达下降问题 | SClineager方法的创新之处在于能够有效地处理单细胞RNA测序数据中的表达下降问题，从而实现准确的谱系重建 | NA | 开发一种新方法，用于从单细胞RNA测序数据中进行基于遗传的谱系追踪 | 单细胞RNA测序数据中的表达下降问题及其对谱系重建的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 24626 | 2024-08-09 |
Integrated decoding hematopoiesis and leukemogenesis using single-cell sequencing and its medical implication
2021-Jan-05, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00223-4
PMID:33408321
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了23个临床样本中的约200,000个骨髓单个核细胞及其亚群的转录组，构建了一个全面的造血参考图谱，并开发了对应复合指数（CCI）来寻找每个白血病细胞亚群的健康对应细胞，以揭示白血病异质性的起源。 | 本研究开发了对应复合指数（CCI），通过整合多种统计方法将白血病细胞映射到参考造血细胞上，为理解白血病发生提供了新的生物学和医学意义。 | NA | 研究目的是通过整合分析造血和白血病发生，提供新的见解。 | 研究对象包括骨髓单个核细胞及其亚群的单细胞转录组。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 23个临床样本中的约200,000个单细胞 |
| 24627 | 2024-08-09 |
Defining human mesenchymal and epithelial heterogeneity in response to oral inflammatory disease
2021-01-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62810
PMID:33393902
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了人类口腔黏膜在慢性炎症疾病过程中的上皮和间质细胞异质性及其变化 | 首次揭示了人类口腔黏膜在疾病进展中的细胞类型变化，并识别了潜在的细胞间相互作用枢纽 | NA | 探讨人类口腔黏膜在慢性炎症疾病中的细胞异质性及其对疾病进展的影响 | 人类口腔黏膜的上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 24628 | 2024-08-09 |
Targeting Lymphotoxin Beta and Paired Box 5: a potential therapeutic strategy for soft tissue sarcoma metastasis
2021-Jan-04, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-020-01632-x
PMID:33397394
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研究论文 | 本研究旨在揭示软组织肉瘤（STS）中潜在的转移机制及相关信号通路，通过分析差异表达基因和肿瘤浸润细胞 | 本研究通过RNA测序和Pearson相关性分析，构建了转移相关预测模型，并验证了LTB和PAX5的转录调控模式 | NA | 探索软组织肉瘤的转移机制及相关信号通路 | 软组织肉瘤中的差异表达基因和肿瘤浸润细胞 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 261个软组织肉瘤样本 |
| 24629 | 2024-08-09 |
Molecular Mechanisms of Renal Progenitor Regulation: How Many Pieces in the Puzzle?
2021-01-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10010059
PMID:33401654
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综述 | 本文综述了肾脏祖细胞在维持日常稳态和损伤后内源性再生过程中的分子机制 | 探讨了单细胞RNA测序技术在肾脏祖细胞特性研究中的应用前景 | NA | 总结指导肾脏祖细胞在稳态和肾损伤后反应的分子机制 | 肾脏祖细胞及其在生理和病理条件下的再生响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24630 | 2024-08-09 |
The prospects of tumor chemosensitivity testing at the single-cell level
2021-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2020.100741
PMID:33387814
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综述 | 本文综述了单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试（SCC-DST）的发展及其在克服传统药物筛选方法障碍中的应用 | SCC-DST通过微流控芯片技术集成多种分析方法，提高了对个体患者药物敏感性测试的预测能力 | NA | 探讨SCC-DST如何克服传统药物筛选方法的障碍，并展望其与单细胞RNA测序和人工智能结合的可能性 | 单细胞水平肿瘤化疗敏感性测试技术及其应用 | NA | 癌症 | 微流控芯片技术 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 24631 | 2024-08-09 |
Specific MiRNAs in naïve T cells associated with Hepatitis C Virus-induced Hepatocellular Carcinoma
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.49594
PMID:33391397
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研究论文 | 本研究通过结合HCV诱导的肝细胞癌（HCC）组织中的bulk mRNA和miRNA测序数据以及T细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了T细胞与miRNAs在HCV-HCC中的关联 | 本研究利用去卷积的bulk RNA-seq数据和miRNA图谱，识别了与幼稚CD4+ T细胞相关的miRNAs，有助于阐明抗HCV免疫反应的潜在机制 | NA | 确定T细胞与miRNAs在HCV诱导的肝细胞癌（HCC）中的关联 | HCV诱导的肝细胞癌（HCC）组织中的T细胞和miRNAs | NA | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | mRNA和miRNA数据 | NA |
| 24632 | 2024-08-09 |
Macrophage imaging and subset analysis using single-cell RNA sequencing
2021, Nanotheranostics
DOI:10.7150/ntno.50185
PMID:33391974
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术进行巨噬细胞成像和亚群分析，以支持个性化患者治疗策略的可能性 | 介绍了纳米颗粒基对比剂在巨噬细胞成像中的应用，以及单细胞RNA测序技术在解析特定细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的机制作用 | 当前临床成像技术在量化广泛分子程序方面的能力有限，无法解释特定成像剂标记的细胞亚群及其在药物反应或抗药性中的作用 | 探讨巨噬细胞成像作为伴随诊断工具，以指导个性化患者治疗策略 | 巨噬细胞及其在药物反应和抗药性中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | NA |
| 24633 | 2024-08-09 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals a subpopulation of fibroblasts associated with favorable prognosis of liver cancer patients
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100981
PMID:33395744
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研究论文 | 本文通过综合单细胞转录组分析，揭示了与肝癌患者良好预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在单细胞水平上描述了肝癌与正常肝脏在细胞和分子成分上的变化，并发现了一种与减少血管侵袭和延长肝癌患者生存期相关的成纤维细胞亚群 | NA | 研究肝癌发展中的细胞类型特异性分子改变，并探索与肝癌预后相关的成纤维细胞亚群 | 肝癌和正常肝脏组织的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组分析 | 主成分分析 | 转录组数据 | 肝癌和正常肝脏组织的多个样本 |
| 24634 | 2024-08-09 |
Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma
2021-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1125-8
PMID:33398161
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，分析了15名胃腺癌患者的腹膜癌病（PC）细胞，构建了45,048个PC细胞的地图，并探讨了肿瘤细胞群体的转录组状态及其与患者生存的关系 | 本文首次揭示了肿瘤细胞系/状态组成的多样性是腹膜癌病（PC）细胞内异质性的关键贡献因素，并开发了一个12基因的预后标志物，用于胃腺癌的预后评估和患者分层 | NA | 探索胃腺癌腹膜癌病（PC）细胞的内异质性及其与患者生存的关系 | 胃腺癌患者的腹膜癌病（PC）细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 15名胃腺癌患者 |
| 24635 | 2024-08-09 |
Six Novel Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of Esophageal squamous cell carcinoma: validated by scRNA-seq and qPCR
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.50443
PMID:33403046
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研究论文 | 本研究通过分析六个GEO和TCGA的ESCC数据集，筛选出六个新的生物标志物，并通过scRNA-seq和qPCR验证其在食管鳞状细胞癌中的表达和预后价值 | 首次鉴定并验证了PBK, KIF2C, NUF2, KIF20A, RAD51AP1和DEPDC1作为食管鳞状细胞癌的诊断和预后生物标志物 | NA | 鉴定新的食管鳞状细胞癌生物标志物 | 食管鳞状细胞癌的生物标志物 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 六个GEO和TCGA的ESCC数据集 |
| 24636 | 2024-08-09 |
Imaging atherosclerotic plaques by targeting Galectin-3 and activated macrophages using (89Zr)-DFO- Galectin3-F(ab')2 mAb
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.50247
PMID:33408786
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研究论文 | 本研究探索了通过靶向Galectin-3（Gal3）在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性，使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET成像。 | 本研究首次使用(89Zr)-DFO-Galectin3-F(ab')2 mAb进行PET/CT成像，以追踪动脉粥样硬化斑块，为个体化干预提供了新的工具。 | NA | 探索通过靶向Galectin-3在斑块中的表达来追踪动脉粥样硬化的可行性。 | 动脉粥样硬化斑块中的Galectin-3表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | PET/CT成像 | NA | 图像 | 使用了ApoE-KO小鼠和人类斑块样本。 |
| 24637 | 2024-08-09 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，对患有胆汁淤积性肝病的儿童肝脏中的巨噬细胞进行了转录组特征分析，并识别出三种不同的巨噬细胞亚群 | 首次在人类儿童胆汁淤积性肝病中进行单细胞RNA测序，并识别出三种具有独特转录特征的巨噬细胞亚群 | NA | 进一步阐明儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录组特征 | 儿童胆汁淤积性肝病中的巨噬细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胆道闭锁（BA）患者6例，Alagille综合征（ALGS）患者6例 |
| 24638 | 2024-08-09 |
Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001615
PMID:33414263
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研究论文 | 本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型，通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序，研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异，揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。 | 首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术，揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。 | NA | 研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制，为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。 | HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞TCR测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 100%的受体小鼠中肿瘤初始生长，约25%的小鼠无干预下肿瘤清除 |
| 24639 | 2024-08-09 |
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 | 提出将单细胞mRNA测序（scRNA-seq）与其他测序方法（如CITE-seq）结合使用，以提高结果的精确性和可信度 | 未提及具体限制 | 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 | 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA与蛋白质表达数据 | 未提及具体样本数量 |
| 24640 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 | 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 | NA | 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 | 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 单个细胞 |