单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 24621 - 24640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24621 | 2024-08-09 |
Circulating tumor cell detection and single-cell analysis using an integrated workflow based on ChimeraX® -i120 Platform: A prospective study
2021-09, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12876
PMID:33301640
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研究论文 | 本文开发了一种基于ChimeraX -i120平台的综合工作流程，用于循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，并通过477名参与者的前瞻性研究验证了其临床可行性。 | 该研究首次整合了CTC检测和单细胞分子分析，使用ChimeraX -i120平台进行负富集、免疫荧光标记和基于机器学习的CTC识别，具有高灵敏度、准确性和可重复性。 | NA | 开发和验证一种新的综合工作流程，用于非侵入性临床癌症管理中的循环肿瘤细胞检测和单细胞分子分析。 | 循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，以及其在临床癌症管理中的应用。 | 数字病理学 | 肝癌、胆管癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌 | 免疫荧光标记、机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞测序数据 | 477名参与者 |
| 24622 | 2024-08-09 |
scGMAI: a Gaussian mixture model for clustering single-cell RNA-Seq data based on deep autoencoder
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa316
PMID:33300547
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研究论文 | 提出了一种基于自动编码器和高斯混合模型的单细胞RNA测序数据聚类方法scGMAI | scGMAI结合了自动编码器网络和快速独立成分分析(FastICA)，在17个公共单细胞RNA测序数据集上优于现有工具，如Seurat | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据聚类和细胞类型识别工具 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 17个公共单细胞RNA测序数据集 |
| 24623 | 2024-08-09 |
ColorCells: a database of expression, classification and functions of lncRNAs in single cells
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa325
PMID:33313674
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研究论文 | 本文开发了ColorCells数据库，用于比较分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNA的表达、分类和功能 | 首次识别出一批细胞特异性的lncRNA，并验证了其在细胞分类中的能力与已知标记基因相当 | NA | 揭示lncRNA在单细胞水平上的表达特异性和功能 | lncRNA在单细胞中的表达和功能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 167,913个来自六种物种的公开单细胞RNA-Seq数据集 |
| 24624 | 2024-08-09 |
Goals and approaches for each processing step for single-cell RNA sequencing data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa314
PMID:33316046
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据处理各步骤的目标和最流行的计算分析工具 | 提供了对单细胞RNA测序数据质量控制、归一化、插补、特征选择和降维等步骤的全面概述 | 尚未形成适用于所有数据集的金标准分析流程 | 帮助研究者根据特定数据集选择合适的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24625 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of psoriatic skin identifies pathogenic Tc17 cell subsets and reveals distinctions between CD8+ T cells in autoimmunity and cancer
2021-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.028
PMID:33309739
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了银屑病皮肤病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 发现了11种转录上多样化的CD8+ T细胞亚群，其中包括两种与疾病严重程度相关的非耗竭性Tc17细胞亚群 | NA | 旨在全面表征银屑病病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 银屑病和健康皮肤的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机分类器 | 转录组 | 银屑病和健康皮肤的多个样本 |
| 24626 | 2024-08-09 |
Secretory Cells Dominate Airway CFTR Expression and Function in Human Airway Superficial Epithelia
2021-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202008-3198OC
PMID:33321047
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常人肺部气道上皮细胞中CFTR表达的细胞类型特异性 | 首次全面描述了正常人肺部气道上皮细胞中CFTR表达的细胞类型特异性，并验证了其在囊性纤维化治疗中的应用 | NA | 确定表达CFTR的特定细胞类型，为囊性纤维化的精准医疗治疗提供依据 | 正常人肺部气道上皮细胞中CFTR的表达和功能 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 新鲜分离的人类大和小气道上皮细胞 |
| 24627 | 2024-08-09 |
Treatment of granuloma annulare and suppression of proinflammatory cytokine activity with tofacitinib
2021-05, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.10.012
PMID:33317858
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和临床试验评估托法替尼治疗环状肉芽肿的效果 | 首次使用单细胞RNA测序研究环状肉芽肿的免疫发病机制，并评估托法替尼的治疗效果 | 研究样本量较小，仅涉及5名患者 | 深入理解环状肉芽肿的发病机制并评估分子靶向治疗的有效性 | 环状肉芽肿及其治疗 | NA | 环状肉芽肿 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名患有严重、长期环状肉芽肿的患者 |
| 24628 | 2024-08-09 |
Post-infectious inflammatory disease in MIS-C features elevated cytotoxicity signatures and autoreactivity that correlates with severity
2021-Apr-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.12.01.20241364
PMID:33300011
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、无偏倚血清蛋白质组学和实验方法，定义了儿童多系统炎症综合征（MIS-C）与成人COVID-19及健康对照组的免疫异常 | 揭示了MIS-C患者中升高的S100A家族警报素、血清蛋白富集以及NK和CD8 T细胞毒性基因的升高，以及与严重程度相关的自身反应性 | NA | 定义MIS-C的免疫病理特征，为预测和管理由SARS-CoV2引起的儿童危重疾病提供依据 | 儿童多系统炎症综合征（MIS-C）患者的免疫异常 | NA | 儿童多系统炎症综合征 | 单细胞RNA测序、抗原受体谱分析、血清蛋白质组学 | NA | RNA序列、血清蛋白 | NA |
| 24629 | 2024-08-09 |
Antigen-driven PD-1+ TOX+ BHLHE40+ and PD-1+ TOX+ EOMES+ T lymphocytes regulate juvenile idiopathic arthritis in situ
2021-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202048797
PMID:33296081
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合T细胞受体分析，研究了幼年特发性关节炎（JIA）患者滑膜T淋巴细胞的转录和克隆异质性 | 首次鉴定出在原位通过抗原激活的克隆扩增T淋巴细胞亚群，并揭示了这些细胞在JIA中的功能 | NA | 探讨T淋巴细胞在幼年特发性关节炎（JIA）中的功能 | JIA患者的滑膜T淋巴细胞 | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24630 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12967
PMID:33300223
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了分娩前后蜕膜组织的转录组，揭示了其异质性和差异表达。 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了分娩前后蜕膜组织的异质性和差异表达，为研究分娩期蜕膜提供了新的视角。 | NA | 研究分娩期蜕膜组织的异质性和差异表达。 | 分娩前后蜕膜组织的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,231个蜕膜细胞 |
| 24631 | 2024-08-09 |
Combined BRAF, MEK, and CDK4/6 Inhibition Depletes Intratumoral Immune-Potentiating Myeloid Populations in Melanoma
2021-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-0401
PMID:33303574
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研究论文 | 本文通过同源黑色素瘤模型研究了BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对肿瘤内免疫增强骨髓细胞的影响 | 首次探讨了BRAF、MEK和CDK4/6三联疗法对黑色素瘤患者抗肿瘤免疫的影响 | 研究仅限于同源黑色素瘤模型，需要进一步的临床试验验证 | 探讨BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对黑色素瘤抗肿瘤免疫的影响 | 黑色素瘤中的免疫增强骨髓细胞 | NA | 黑色素瘤 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 24632 | 2024-08-09 |
ScGSLC: An unsupervised graph similarity learning framework for single-cell RNA-seq data clustering
2021-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了一种基于图相似学习的单细胞RNA测序数据聚类框架ScGSLC | 将单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络整合到图中，并利用图卷积网络进行图嵌入和细胞聚类 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 图数据 | 九个公共数据集 |
| 24633 | 2024-08-09 |
Dissecting the human kidney allograft transcriptome: single-cell RNA sequencing
2021-02-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000000840
PMID:33315769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 | scRNA-seq技术使得能够研究单个细胞的转录组，并评估细胞群体中的转录差异和相似性 | 传统的RNA测序无法提供关于个体细胞类型和细胞状态的信息 | 深入理解scRNA-seq技术，并总结其在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 | 人类肾脏同种异体移植组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24634 | 2024-08-09 |
A road map from single-cell transcriptome to patient classification for the immune response to trauma
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.145108
PMID:33320841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了创伤后小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞，揭示了创伤诱导的免疫反应及其对患者分类的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了创伤后免疫反应的细胞层面变化，并据此定义了两种创伤患者亚型 | 研究主要集中在小鼠模型和创伤患者，未来研究需要扩展到其他类型的炎症疾病和危重病患 | 解析创伤后的免疫反应，并基于此进行患者分类 | 创伤后的小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞 | 数字病理学 | 创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及受伤小鼠和创伤患者的循环单核细胞 |
| 24635 | 2024-08-09 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种高吞吐量、无标记的方法，用于在纳升液滴中检测未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞密度 | 该方法利用纳升液滴中散射光的快速测量，实现了对细菌增殖的可靠检测，无需基因改造或添加化学代谢标记 | NA | 开发一种高吞吐量、无标记的细菌检测方法，以促进微流控液滴技术在分析微生物学中的广泛应用 | 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 分析生物学 | NA | 微流控液滴技术 | NA | 散射光信号 | NA |
| 24636 | 2024-08-09 |
A microfluidics-based stem cell model of early post-implantation human development
2021-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00417-w
PMID:33311712
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研究论文 | 本文详细介绍了设计和实现一种基于微流控技术的设备，用于模拟人类胚胎植入后早期发育过程 | 该研究开发了一种微流控设备，能够模拟人类胚胎植入后早期的分子和细胞特征，这在技术上是一个创新 | NA | 研究目的是为不孕症和毒理学研究提供一个合适的人类胚胎发育模型 | 研究对象是人类多能干细胞（hPSCs）及其在微流控设备中的发育过程 | 生物技术 | 不孕症 | 微流控技术 | 微流控人类胚胎模型 | 细胞 | 使用人类多能干细胞（hPSCs）进行实验 |
| 24637 | 2024-08-09 |
Plant stem-cell organization and differentiation at single-cell resolution
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2018788117
PMID:33318187
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）对玉米茎尖干细胞微环境及其分化后代进行了无偏差的转录组景观分析 | 发现玉米茎尖干细胞并不存在传统的干细胞组织中心，并且通过轨迹推断揭示了基因表达变化伴随细胞分化的过程 | NA | 研究植物干细胞的组织和分化 | 玉米茎尖干细胞及其分化细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 24638 | 2024-08-09 |
Human embryonic stem cell-derived organoid retinoblastoma reveals a cancerous origin
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2011780117
PMID:33318192
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研究论文 | 本研究开发了一种基于遗传工程人胚胎干细胞（hESCs）衍生的视网膜类器官的视网膜母细胞瘤（Rb）模型，揭示了Rb的癌变起源 | 首次在视网膜类器官中建立了Rb的癌变模型，并通过单细胞测序和免疫染色验证了Rb起源于ARR3阳性成熟锥体前体细胞 | NA | 建立视网膜母细胞瘤的类器官模型，探索其细胞起源并测试新的候选治疗药物 | 视网膜母细胞瘤的细胞起源和治疗策略 | 数字病理学 | 儿童眼内恶性肿瘤 | 单细胞测序 | 类器官模型 | 基因组甲基化数据 | NA |
| 24639 | 2024-08-09 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析，揭示了严重COVID-19患者中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次在严重COVID-19患者中识别出巨核细胞和红细胞的扩展以及浆母细胞的增殖，这些特征与疾病结局相关 | 研究样本量较小，且仅限于两个中心的患者 | 理解严重COVID-19的免疫反应偏斜并定义疾病结局的预测因子 | 严重COVID-19患者的免疫细胞反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 多组学分析 | NA | 转录组、DNA甲基化组和单细胞转录组数据 | 14名患者，包括超过358,000个细胞 |
| 24640 | 2024-08-09 |
Olfactomedin 4 mediation of prostate stem/progenitor-like cell proliferation and differentiation via MYC
2020-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78774-5
PMID:33318499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了嗅觉蛋白4（OLFM4）在正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞（RWPE1）中的表达及其生理功能。 | 首次揭示了OLFM4在前列腺上皮细胞中的表达模式及其在干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | NA | 研究OLFM4在前列腺干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | 正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞（RWPE1）中的OLFM4表达细胞。 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个干细胞/祖细胞样细胞群 |