单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 24601 - 24620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24601 | 2024-08-09 |
Ileal Transcriptomic Analysis in Paediatric Crohn's Disease Reveals IL17- and NOD-signalling Expression Signatures in Treatment-naïve Patients and Identifies Epithelial Cells Driving Differentially Expressed Genes
2021-May-04, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa236
PMID:33232439
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研究论文 | 本研究通过靶向自身免疫RNA测序和单细胞测序技术，分析了未经治疗的儿科克罗恩病患者的回肠组织，揭示了IL17和NOD信号通路的表达特征，并识别了驱动差异表达基因的特定上皮细胞。 | 本研究首次在未经治疗的儿科克罗恩病患者中发现了IL17、NOD和Oncostatin-M信号通路的显著上调，并确定了驱动这些信号通路的特定上皮细胞。 | 研究样本量相对较小，且仅限于未经治疗的儿科克罗恩病患者，可能限制了结果的普遍性。 | 旨在确定儿科克罗恩病中激活的信号通路和驱动细胞类型。 | 儿科克罗恩病患者的回肠组织及其与对照组的比较。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 靶向自身免疫RNA测序、单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA序列数据 | 27名未经治疗的克罗恩病患者、26名已确诊的克罗恩病患者和17名对照组 |
| 24602 | 2024-08-09 |
Looking at the developing lung in single-cell resolution
2021-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00385.2020
PMID:33205990
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胎儿和新生儿肺发育研究中的主要发现，并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 单细胞RNA测序技术为研究肺发育过程中的复杂细胞动态提供了无偏见且强有力的评估方法 | 目前关于健康或异常发育肺的单细胞转录组研究仍较少 | 探讨单细胞RNA测序技术在肺发育疾病研究中的应用 | 肺发育过程中的细胞类型及其基因表达变化 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24603 | 2024-08-09 |
Elucidating memory in the brain via single-cell transcriptomics
2021-05, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15250
PMID:33230878
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学方法在揭示大脑记忆神经机制中的应用 | 利用单细胞转录组学技术，以空前的分辨率和通量深入理解记忆机制 | NA | 阐明大脑中记忆的神经机制 | 海马体和杏仁核区域的记忆机制 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24604 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus and In Situ RNA-Sequencing Reveal Cell Topographies in the Human Pancreas
2021-03, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.11.010
PMID:33212097
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序和原位RNA测序技术，揭示了人类胰腺中的细胞拓扑结构。 | 创新性地开发了单核RNA测序协议，并首次创建了全面的人类胰腺细胞图谱。 | NA | 旨在更好地理解健康和疾病状态下新生儿和成人胰腺的异质性和细胞组成。 | 人类胰腺细胞的异质性和组成。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 细胞 | 超过120,000个细胞来自成人和新生儿的胰腺捐赠者。 |
| 24605 | 2024-08-09 |
Vascular neutrophilic inflammation and immunothrombosis distinguish severe COVID-19 from influenza pneumonia
2021-02, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15179
PMID:33217134
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研究论文 | 本研究通过比较SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本，揭示了血管中性粒细胞招募、NETosis和随后的免疫血栓形成是严重COVID-19的典型特征，而在流感肺炎中这些特征不明显。 | 本研究首次详细描述了严重COVID-19中血管中性粒细胞炎症和免疫血栓形成的路径机制，并探讨了其上游调控。 | NA | 研究免疫血栓形成是否为COVID-19的特异性病理因素，以及其上游调控机制。 | SARS-CoV-2感染和流感感染的肺部组织病理学样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 组织样本 | NA |
| 24606 | 2024-08-09 |
A High-Content Screen Identifies Drugs That Restrict Tumor Cell Extravasation across the Endothelial Barrier
2021-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-3911
PMID:33218969
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研究论文 | 本文通过高内涵筛选方法识别了限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 首次发现尼克酰胺作为一种有效药物，通过调节信号通路、趋化因子和肿瘤-内皮细胞相互作用来增强内皮屏障稳定性 | NA | 识别限制肿瘤细胞跨内皮屏障外渗的药物 | 3,520种化合物、斑马鱼模型和肺转移小鼠模型 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高内涵筛选、单细胞RNA测序、蛋白质组分析 | NA | 图像 | 3,520种化合物、斑马鱼和小鼠模型 |
| 24607 | 2024-08-09 |
A Microfluidic Chip for Efficient Circulating Tumor Cells Enrichment, Screening, and Single-Cell RNA Sequencing
2021-02, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202000060
PMID:33219587
|
研究论文 | 本文开发了一种集成微流控芯片，用于循环肿瘤细胞（CTCs）的高效富集、筛选和单细胞RNA测序 | 该芯片集成了CTCs的连续富集、分离和单细胞水平表征，并在同一芯片上实现了单CTC裂解 | NA | 研究肿瘤异质性、转移和药物耐药性的机制 | 循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 通过将肿瘤细胞加入全血中进行验证 |
| 24608 | 2024-08-09 |
Intraoperative opioids are associated with improved recurrence-free survival in triple-negative breast cancer
2021-02, British journal of anaesthesia
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.bja.2020.10.021
PMID:33220939
|
研究论文 | 本文评估了手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌（TNBC）患者肿瘤学结果之间的关联，并探讨了TNBC中阿片类受体的表达模式 | 发现手术中使用阿片类药物对TNBC患者的无复发生存期有保护作用，且阿片类受体的表达与阿片类激动剂的净保护作用一致 | 研究未发现手术中使用阿片类药物与总体生存期之间有显著关联 | 评估手术中使用阿片类药物与三阴性乳腺癌患者肿瘤学结果之间的关联 | 三阴性乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 1143例三阴性乳腺癌病例 |
| 24609 | 2024-08-09 |
Next-Generation Lineage Tracing and Fate Mapping to Interrogate Development
2021-01-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.10.021
PMID:33217333
|
review | 本文广泛回顾了命运图谱和谱系追踪方法的起源，并重点介绍了单细胞基因组学进展所允许的谱系追踪的最新发展 | 本文探讨了利用新技术合成高分辨率命运图谱的当前潜力，并讨论了它们在深入探究发育过程中的潜力 | NA | 回顾并探讨命运图谱和谱系追踪技术在发育生物学中的应用 | 命运图谱和谱系追踪技术 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 24610 | 2024-08-09 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CSEA-DB的数据库，用于分析人类复杂性状和细胞类型之间的关联 | 首次提供了一个包含5120个GWAS总结统计数据和超过90万个细胞的综合数据库，通过deTS算法进行了10,250,480次性状-细胞类型关联分析 | NA | 构建一个用于研究人类复杂性状及其潜在细胞类型关联的参考数据库 | 人类复杂性状和细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞技术 | deTS算法 | 基因组数据 | 5120个GWAS总结统计数据，超过90万个细胞，包括752种组织细胞类型 |
| 24611 | 2024-08-09 |
Lnc2Cancer 3.0: an updated resource for experimentally supported lncRNA/circRNA cancer associations and web tools based on RNA-seq and scRNA-seq data
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1006
PMID:33219685
|
研究论文 | 本文介绍了Lnc2Cancer 3.0数据库的更新，该数据库包含与人类癌症相关的实验支持的长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）的全面数据，并描述了基于RNA测序和单细胞RNA测序的lncRNA表达分析的网络工具。 | Lnc2Cancer 3.0新增了多个功能，包括增加癌症相关lncRNA条目、新增实验支持的circRNA-癌症关联、包含癌症相关lncRNA和circRNA的实验支持的调控机制和生物学功能，以及实验支持的临床相关性。此外，还开发了两个灵活的在线工具，用于快速和自定义分析及可视化癌症中的lncRNA。 | NA | 旨在阐明lncRNA、circRNA与癌症之间的关联 | 长非编码RNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA）与人类癌症的关联 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 当前版本包括9254个lncRNA-癌症关联，涉及2659个lncRNA和216个癌症亚型；新增1049个实验支持的circRNA-癌症关联，涉及743个circRNA和70个癌症亚型 |
| 24612 | 2024-08-09 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
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研究论文 | 本研究探讨了在雌激素受体阳性（ER+）转移性乳腺癌中，化疗后出现的耐药亚克隆中癌症干细胞样（CSL）细胞的增加情况，并研究了组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂在逆转这种耐药性中的作用 | 本研究首次展示了HDAC抑制剂在阻止化疗诱导的耐药性表型中的作用，并提出了‘一石二鸟’的治疗策略 | NA | 研究HDAC抑制剂在逆转ER+乳腺癌化疗耐药性中的作用 | 雌激素受体阳性（ER+）转移性乳腺癌细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本 |
| 24613 | 2024-08-09 |
High-resolution mouse subventricular zone stem-cell niche transcriptome reveals features of lineage, anatomy, and aging
2020-12-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014389117
PMID:33229571
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的转录组分析 | 首次对SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的单细胞RNA测序分析，揭示了不同年龄段干细胞的异质性和转录特征 | NA | 研究SVZ区域神经干细胞的异质性及其在不同年龄段的转录特征 | 小鼠SVZ区域的神经干细胞及其在不同年龄段的转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞样本 |
| 24614 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing of Human Milk-Derived Cells Reveals Sub-Populations of Mammary Epithelial Cells with Molecular Signatures of Progenitor and Mature States: a Novel, Non-invasive Framework for Investigating Human Lactation Physiology
2020-12, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-020-09466-z
PMID:33216249
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人乳来源的乳腺上皮细胞，揭示了其亚群及其转录特征，为研究人类哺乳生理提供了一种新颖的非侵入性框架 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析人乳来源的乳腺上皮细胞，并提供了一个计算框架供未来研究使用 | 目前使用乳汁来源细胞研究人类乳腺生理的临床潜力和局限性 | 研究人乳中的细胞作为非侵入性材料，用于探索哺乳生理 | 人乳来源的乳腺上皮细胞及其转录特征 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 3740个细胞来自两名产后两周的母亲的乳汁样本 |
| 24615 | 2024-08-09 |
Author Correction: Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00776-5
PMID:33230294
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24616 | 2024-08-09 |
Deconvolution of cellular subsets in human tissue based on targeted DNA methylation analysis at individual CpG sites
2020-11-24, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00910-4
PMID:33234153
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研究论文 | 本研究通过靶向DNA甲基化分析在单个CpG位点上对人类组织中的细胞亚群进行去卷积 | 本研究首次探讨了使用单个细胞类型特异性CpG位点进行靶向分析的可行性，并开发了基于这些位点的去卷积方法 | NA | 验证通过单个CpG位点的DNA甲基化分析来反映细胞混合物和不同组织中细胞组成的可行性 | 人类非恶性细胞类型及其在组织中的相对含量 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化分析，pyrosequencing | NA | DNA甲基化数据 | 579个Illumina 450k BeadChip DNA甲基化数据集，涵盖14种不同的非恶性人类细胞类型 |
| 24617 | 2024-08-09 |
Integrating transcriptomics and bulk time course data into a mathematical framework to describe and predict therapeutic resistance in cancer
2020-11-20, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abb09c
PMID:33215611
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研究论文 | 本文提出了一种将机器学习模型的静态输出与治疗反应的动态模型相结合的框架，用于整合单细胞转录组数据和纵向的细胞群体数据，以描述和预测癌症治疗抵抗 | 首次明确地将单细胞克隆解析的转录组数据与批量时间序列数据结合，共同校准药物抵抗动力学的数学模型 | NA | 开发一种方法，将分散的数据集整合到全面的框架中，以生成最佳的临床决策 | 乳腺癌细胞 | 生物医学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 24618 | 2024-08-09 |
Functional compensation precedes recovery of tissue mass following acute liver injury
2020-11-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19558-3
PMID:33214549
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研究论文 | 本文研究了急性肝损伤后功能补偿在组织恢复前的作用机制 | 首次识别了急性肝损伤后功能补偿的新阶段，并揭示了依赖于巨噬细胞来源的WNT/β-catenin信号的适应性重编程机制 | NA | 探讨急性肝损伤后肝脏如何在组织恢复前维持重要生理功能 | 肝脏在急性损伤后的功能补偿机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的小鼠肝损伤模型 |
| 24619 | 2024-08-09 |
Opportunities for Single-Cell Sequencing Technologies and Data Science
2020-Nov-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113433
PMID:33227959
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研究论文 | 本特刊旨在强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | NA | NA | 强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | 单细胞测序技术和数据分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 24620 | 2024-08-09 |
Bivalent genes that undergo transcriptional switching identify networks of key regulators of embryonic stem cell differentiation
2020-Nov-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07009-8
PMID:33208095
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研究论文 | 本文开发了一种方法，通过检测单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的'双峰'基因表达模式，捕捉经历转录开关的基因，并结合染色质状态分析，识别出与细胞状态相关的双峰、双价基因模式。 | 本文提出了一种新的方法，通过分析接近活动边界（ON/OFF）的基因，从scRNA-seq数据中推断转录开关网络，这种方法补充了传统的scRNA-seq分析。 | NA | 研究胚胎干细胞分化过程中双价基因的转录开关及其调控网络。 | 胚胎干细胞中的双价基因及其在分化过程中的转录开关。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 隐马尔可夫模型 | 基因表达数据 | NA |