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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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24601 | 2024-08-09 |
Long-term self-renewing stem cells in the adult mouse hippocampus identified by intravital imaging
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00759-4
PMID:33349709
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研究论文 | 本研究通过活体成像技术,识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的神经干细胞(NSCs)。 | 首次通过活体成像技术识别出在小鼠成年海马体中具有长期自我更新能力的Gli1靶向NSCs,并比较了Gli1和Ascl1靶向细胞的转录组特征。 | 研究仅限于小鼠模型,且依赖于特定的基因标记技术。 | 旨在揭示成年小鼠海马体中神经干细胞的长期自我更新能力及其潜在机制。 | 研究对象为成年小鼠海马体中的神经干细胞及其子代细胞。 | NA | NA | 双光子显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | 研究涉及多个基因标记的神经干细胞及其子代细胞。 |
24602 | 2024-08-09 |
MS4A1 expression and function in T cells in the colorectal cancer tumor microenvironment
2021-02, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104260
PMID:33352466
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研究论文 | 本文研究了MS4A1基因在结直肠癌肿瘤微环境中T细胞的表达和功能 | 首次报道MS4A1基因在结直肠癌中的表达与患者生存率正相关,并发现CD8CD20 T细胞亚群在肿瘤微环境中的作用 | NA | 探讨MS4A1基因在结直肠癌免疫治疗中的作用机制 | MS4A1基因在结直肠癌中的表达及其对T细胞功能的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | RNA序列 | 来自公共数据库的scRNA-Seq数据集及已发表的nivolumab治疗数据集 |
24603 | 2024-08-09 |
PD-1 blockade restores helper activity of tumor-infiltrating, exhausted PD-1hiCD39+ CD4 T cells
2021-01-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.142513
PMID:33332284
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研究论文 | 本文通过表型、转录组和功能方法研究了头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞耗竭情况,并探讨了PD-1阻断对这些细胞辅助活性的恢复作用 | 首次详细描述了CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态,并证明了PD-1阻断可以恢复其辅助活性 | NA | 研究CD4 T细胞在肿瘤微环境中的耗竭状态及其对免疫检查点阻断的响应 | 头颈、宫颈和卵巢癌患者的CD4 T细胞 | 免疫学 | 头颈癌、宫颈癌、卵巢癌 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | NA |
24604 | 2024-08-09 |
The autotaxin-lysophosphatidic acid pathway mediates mesenchymal cell recruitment and fibrotic contraction in lung transplant fibrosis
2021-01, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2020.10.005
PMID:33339555
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研究论文 | 本文研究了自噬素-溶血磷脂酸途径在肺移植纤维化中的间充质细胞招募和纤维化收缩的作用 | 首次展示了肺移植受者BAL液对人类肺组织衍生MSC的强烈趋化作用,并诱导收缩表型,通过LPA阻断完全消除了BAL介导的MSC趋化和胶原凝胶收缩 | NA | 识别诱导肺组织间充质干细胞迁移和收缩分化的介质 | 肺移植受者的间充质干细胞和肺移植纤维化机制 | NA | 肺纤维化 | 酶联免疫吸附试验,液相色谱-串联质谱法,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 7名健康对照和21名肺移植受者的BAL液,7名健康对照和31名肺移植受者的BAL液,1名CLAD肺移植受者的BAL细胞 |
24605 | 2024-08-09 |
Study on the clinical mechanism of Tong-Xie-An-Chang Decoction in the treatment of diarrheal irritable bowel syndrome based on single-cell sequencing technology
2020-Dec-24, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000023868
PMID:33350782
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研究论文 | 本研究旨在评估通泻安肠汤治疗腹泻型肠易激综合征的临床疗效和安全性,并基于单细胞测序技术阐明其基因层面的治疗机制 | 利用单细胞测序技术探索腹泻型肠易激综合征患者外周血中T淋巴细胞的差异基因表达和细胞异质性 | NA | 评估通泻安肠汤在腹泻型肠易激综合征治疗中的临床疗效和安全性,并阐明其基因层面的治疗机制 | 腹泻型肠易激综合征患者 | NA | 肠易激综合征 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 72名符合条件的腹泻型肠易激综合征患者 |
24606 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes display distinct transcriptional and phenotypic properties
2020-12-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002843
PMID:33351116
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、组织学、倍性分析和流式细胞术研究了来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞的转录组和表型特征 | 发现肺巨核细胞具有独特的转录特征,富集了成熟标志物,可能表明其具有更高效的血小板生产能力,并且表现出免疫和炎症相关的富集特征 | NA | 探讨肺巨核细胞的转录和表型特性 | 肺巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞 |
24607 | 2024-08-09 |
Pulmonary neuroendocrine cells: physiology, tissue homeostasis and disease
2020-12-21, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.046920
PMID:33355253
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综述 | 本文综述了肺神经内分泌细胞(PNECs)的生理功能、组织稳态及其在疾病中的作用 | 介绍了PNECs在肺通气动力学、机械感应和类型2免疫反应中的作用,以及单细胞RNA测序揭示的PNECs基因表达异质性和再生过程中的重编程 | NA | 深入理解PNECs的基本特性在肺生物学和病理学中的重要性 | 肺神经内分泌细胞(PNECs)及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
24608 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对人类寄生虫曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段进行了细胞图谱分析 | 首次为曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段提供了全面的细胞类型图谱 | NA | 揭示驱动曼氏血吸虫在哺乳动物体内发育的机制 | 曼氏血吸虫的早期发育阶段,特别是称为血吸虫幼虫的阶段 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两天的曼氏血吸虫幼虫样本 |
24609 | 2024-08-09 |
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01499-8
PMID:33339962
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research paper | 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统,用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 | 开发了一种新的测序系统,能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息,并提出了名为“分子足迹”的新方法 | NA | 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 | DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 | NA | NA | 单分子测序 | NA | DNA条形码分子 | 30种DNA条形码分子 |
24610 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10120513
PMID:33353164
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响,并识别了不同β细胞群的基因表达模式 | 研究仅限于一周的高脂饮食干预,可能无法完全反映长期饮食干预的影响 | 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 | 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本 |
24611 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01476-1
PMID:33328604
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞,揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型,并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞,并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 | 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌,可能影响结果的普遍性。 | 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 | 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本 |
24612 | 2024-08-09 |
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Kidney Organoids with Improved Collecting Duct Maturation and Injury Modeling
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108514
PMID:33326782
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研究论文 | 本文通过独立生成两种肾前体细胞群——间充质和尿管芽样细胞,成功生成了具有收集系统的肾类器官,并探讨了激素在收集管细胞分化中的作用。 | 本文首次通过独立生成两种肾前体细胞群,实现了肾类器官中收集系统的形成,并利用单细胞RNA测序技术展示了近端小管成熟度的提高和非目标细胞群的减少。 | NA | 探索人类多能干细胞衍生的肾类器官在药物测试和再生医学中的应用,以及疾病模型的建立。 | 人类多能干细胞衍生的肾类器官及其收集管成熟和损伤模型的建立。 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
24613 | 2024-08-09 |
GAS2L1 Is a Potential Biomarker of Circulating Tumor Cells in Pancreatic Cancer
2020-Dec-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123774
PMID:33333841
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌循环肿瘤细胞(CTC)的单细胞RNA测序数据,并提出GAS2L1作为胰腺癌CTC的新型生物标志物 | 本研究通过组合使用GAS2L1和其他标志物,提高了胰腺癌CTC的检测率 | NA | 探索胰腺癌循环肿瘤细胞的生物标志物 | 胰腺癌循环肿瘤细胞及其生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括遗传工程小鼠模型(GEMM)和胰腺癌患者样本 |
24614 | 2024-08-09 |
The Evolving Knowledge on T and NK Cells in Classic Hodgkin Lymphoma: Insights into Novel Subsets Populating the Immune Microenvironment
2020-Dec-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123757
PMID:33327433
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综述 | 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤(cHL)中T细胞和NK细胞的最新研究进展,特别是通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等高维度分析技术揭示的免疫微环境中T细胞和NK细胞亚群的新发现 | 利用高维度分析技术揭示了cHL中T细胞和NK细胞亚群的新组成,并识别出具有耗竭表型的新型细胞毒性亚群,这些发现有助于理解先前未被认识的免疫逃逸机制 | NA | 探讨cHL微环境中最近识别的T细胞和NK细胞亚群的免疫学特征和功能属性,并讨论如何利用这些知识预测免疫治疗反应及设计提高PD-1阻断疗效的新策略 | 经典霍奇金淋巴瘤中的T细胞和NK细胞亚群 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
24615 | 2024-08-09 |
Elevated TUBA1A Might Indicate the Clinical Outcomes of Patients with Gastric Cancer, Being Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment
2020-Dec-12, Journal of gastrointestinal and liver diseases : JGLD
IF:2.1Q3
DOI:10.15403/jgld-2834
PMID:33331338
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研究论文 | 本研究评估了TUBA1A在胃癌中的表达及其对临床结果的影响,特别是与肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的关联 | 首次探讨了TUBA1A与胃癌患者生存和临床病理特征的关系,以及其在肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的作用 | NA | 探究TUBA1A在胃癌中的表达及其对患者生存和临床病理特征的影响 | 胃癌患者及正常样本中的TUBA1A表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 基因集富集分析(GSEA) | NA | RNA测序数据 | 1881个样本,包括1618名胃癌患者和263个正常样本 |
24616 | 2024-08-09 |
Creation of bladder assembloids mimicking tissue regeneration and cancer
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-3034-x
PMID:33328632
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研究论文 | 本文通过重组组织干细胞与基质成分,创建了多层膀胱'装配体',模拟成熟器官结构和相关组织微环境,并开发了恶性肿瘤装配体以重现体内尿路上皮癌的病理生理特征。 | 本文创新性地创建了模拟成熟膀胱结构和功能的膀胱装配体,并开发了恶性肿瘤装配体,揭示了FOXA1-BMP-hedgehog信号反馈轴在肿瘤可塑性控制中的重要性。 | NA | 研究旨在开发新型组织模型,以更好地模拟成熟器官结构和功能,并探索肿瘤发展的分子机制。 | 膀胱组织装配体及其恶性肿瘤对应物。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
24617 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集,并与肿瘤免疫微环境密切相关,可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本,6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
24618 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
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研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱,并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例,对照组6例 |
24619 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR,用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目,并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响,实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果,且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法,以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集,单细胞数量从822到5,132 |
24620 | 2024-08-09 |
Dysfunction of VIPR2 leads to myopia in humans and mice
2022-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2020-107220
PMID:33318135
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研究论文 | 研究VIP-VIPR2信号通路在调控近视发展中的作用 | 首次揭示了VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用,并验证了VIPR2基因敲除小鼠的近视表型 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人类中验证 | 探究VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用 | VIP-VIPR2信号通路及其在近视发展中的影响 | NA | 近视 | 单细胞转录组测序,批量RNA测序,药理学操作,基因敲除研究 | NA | RNA | 中国汉族人群中的高近视关联分析,VIPR2基因敲除小鼠 |