单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 24601 - 24620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24601 | 2024-08-09 |
Thymic iNKT single cell analyses unmask the common developmental program of mouse innate T cells
2020-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20073-8
PMID:33288744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过10,000个胸腺不变自然杀伤T细胞的分化过程，揭示了这些细胞的成熟、功能和命运决策 | 研究发现胸腺不变自然杀伤T细胞与黏膜相关不变T细胞之间存在共同的转录谱，并揭示了Hivep3转录因子在早期前体中的表达及其对iNKT细胞增殖、分化和功能的影响 | NA | 研究胸腺中不变自然杀伤T细胞的分化过程及其共同发育程序 | 胸腺不变自然杀伤T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过10,000个胸腺不变自然杀伤T细胞 |
| 24602 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of a Postmenopausal Normal Breast Tissue Identifies Multiple Cell Types That Contribute to Breast Cancer
2020-Dec-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123639
PMID:33291647
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自绝经后正常乳腺组织的3193个单细胞，识别出多种与乳腺癌相关的细胞类型 | 首次全面分析了绝经后正常乳腺组织中的非上皮细胞类型，并探讨了这些细胞类型在乳腺癌中的潜在作用 | 研究样本仅来自单一的绝经后乳腺组织，可能无法代表所有乳腺组织的情况 | 探究绝经后正常乳腺组织中的细胞组成及其在乳腺癌中的作用 | 绝经后正常乳腺组织中的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3193个单细胞 |
| 24603 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals CD16- monocytes as key regulators of human monocyte transcriptional response to Toxoplasma
2020-12-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78250-0
PMID:33273621
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研究论文 | 本研究使用单细胞双RNA测序技术（scDual-Seq）首次全面定义了人类单核细胞与弓形虫相互作用中的转录反应 | 首次使用单细胞双RNA测序技术在单细胞水平上全面定义了人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | NA | 深入理解人类单核细胞与弓形虫相互作用的分子机制，以加速开发新型人类弓形虫病控制策略 | 人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞双RNA测序（scDual-Seq） | NA | 转录组数据 | 涉及单个单核细胞样本 |
| 24604 | 2024-08-09 |
Tumor-promoting macrophages prevail in malignant ascites of advanced gastric cancer
2020-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00538-y
PMID:33277616
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的细胞特征 | 首次揭示了胃癌恶性腹水中巨噬细胞的非炎症特性，并展示了这些特性与胃癌预后的关联 | 样本量较小，仅分析了四个恶性腹水样本和一个脑脊液样本 | 探索胃癌恶性腹水中细胞的特征，以优化治疗策略 | 胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 分析了180个细胞，包括肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 |
| 24605 | 2024-08-09 |
Alternative Polyadenylation: a new frontier in post transcriptional regulation
2020-Nov-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00249-6
PMID:33292571
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综述 | 本文综述了选择性多聚腺苷酸化（APA）这一重要的转录后调控机制，及其在RNA加工、细胞功能和疾病调控中的作用 | 介绍了现代高通量技术如下一代测序（NGS）和单细胞测序技术在APA研究中的应用 | APA的许多生物学过程仍未知，需要进一步研究 | 综述APA的当前知识及其调控机制，并探讨APA研究的未来方向 | 选择性多聚腺苷酸化及其调控因子 | NA | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA |
| 24606 | 2024-08-09 |
Osteopontin Links Myeloid Activation and Disease Progression in Systemic Sclerosis
2020-11-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100140
PMID:33294861
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研究论文 | 本文探讨了骨桥蛋白（OPN）在系统性硬化症（SSc）患者中与髓系细胞激活和疾病进展的关系 | 首次证明了免疫复合物（ICs）通过激活人单核细胞并促进肺成纤维细胞迁移，部分通过OPN分泌，以及OPN与单核细胞集落刺激因子和白细胞介素-6的相互作用 | NA | 揭示系统性硬化症中肺纤维化的潜在机制 | 系统性硬化症患者的肺纤维化 | NA | 系统性硬化症 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性硬化症患者的肺组织和血清样本 |
| 24607 | 2024-08-09 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
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研究论文 | 本文开发了一种名为DSAVE的方法，用于评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | DSAVE方法利用下采样消除采样噪声差异，并使用基于对数似然度的度量来帮助识别错误分类的细胞 | NA | 评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的错误分类细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24608 | 2024-08-09 |
Ultra-fast scalable estimation of single-cell differentiation potency from scRNA-Seq data
2021-07-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa987
PMID:33244588
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Correlation of Connectome and Transcriptome (CCAT)的单细胞分化潜能评估方法，该方法能够快速准确地处理大规模scRNA-Seq数据 | CCAT方法在处理大规模数据时比现有最先进方法快100倍，且具有更高的鲁棒性和较低的计算成本 | NA | 开发一种快速且准确的算法来评估单细胞RNA-Seq数据中的分化潜能 | 单细胞RNA-Seq数据中的分化潜能 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | CCAT | RNA-Seq数据 | 超过200万个细胞 |
| 24609 | 2024-08-09 |
Transcriptional dynamics of induced pluripotent stem cell differentiation into β cells reveals full endodermal commitment and homology with human islets
2021-04, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2020.10.004
PMID:33246884
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了诱导多能干细胞（iPSCs）向β细胞分化的转录动力学，揭示了其完全的内胚层承诺及与人类胰岛的高度同源性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了iPSCs向β细胞分化的转录动态过程，并发现了内分泌/非内分泌细胞命运的分叉 | 研究指出，未来的工作需要改进生成的内分泌细胞，并避免分化为非胰腺内胚层细胞 | 研究iPSCs向β细胞分化的转录动力学，并确定最终分化产物的身份 | 诱导多能干细胞（iPSCs）及其向β细胞的分化过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从iPSCs向β细胞分化的四个阶段及人类供体胰岛中获取的数据 |
| 24610 | 2024-08-09 |
Schistosoma mansoni venom allergen-like protein 6 (SmVAL6) maintains tegumental barrier function
2021-03, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2020.09.004
PMID:33253697
|
研究论文 | 本文研究了曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6（SmVAL6）在维持体表屏障功能中的作用 | 首次提供了Group 2 SmVAL在血吸虫生物学中具有基本功能的证据 | 目前缺乏对Group 2 SmVAL其他功能的研究支持 | 探讨SmVAL6在血吸虫生物学中的功能 | 曼氏血吸虫毒液过敏原样蛋白6（SmVAL6）及其在血吸虫体表屏障功能中的作用 | NA | NA | 原位杂交（WISH）、小干扰RNA（siRNA）、酵母双杂交筛选、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、计算机模拟 | NA | RNA | 涉及成年血吸虫的细胞和组织 |
| 24611 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Skin Aging
2021-02-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.002
PMID:33238152
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了不同年龄段健康人眼睑皮肤的细胞类型及其分子和功能特性，揭示了皮肤老化过程中细胞类型和分子变化的模式 | 首次构建了人类皮肤老化的单细胞转录组图谱，揭示了光老化相关变化和慢性炎症随年龄的累积，以及关键转录因子在皮肤老化中的作用 | NA | 深入理解人类皮肤老化的分子和功能特性 | 人类眼睑皮肤的细胞类型及其在老化过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同年龄段的健康个体 |
| 24612 | 2024-08-09 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Studies of Autoimmune Diseases: a Comprehensive Review
2021-Feb, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-020-08813-6
PMID:33236283
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够揭示细胞异质性的复杂机制，发现新的细胞亚群，并有助于揭示发病机制、疾病演变和药物抗性的分子机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在自身免疫疾病研究中的应用及其对诊断和治疗策略的贡献 | 自身免疫疾病及其相关免疫细胞 | 生命科学研究 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24613 | 2024-08-09 |
Kidney Single-cell Transcriptomes Predict Spatial Corticomedullary Gene Expression and Tissue Osmolality Gradients
2021-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020070930
PMID:33239393
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，预测和量化了小鼠肾脏皮质和髓质轴上的空间基因表达和组织渗透压梯度 | 首次通过单细胞转录组数据重建了肾脏细胞的空间位置，并预测了皮质和髓质轴上的基因表达 | NA | 探索单细胞转录组数据在预测肾脏细胞空间位置和基因表达中的应用 | 小鼠肾脏细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞或单核mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型小鼠和Grhl2CD-/-小鼠的肾脏组织 |
| 24614 | 2024-08-09 |
Directed induction of alveolar type I cells derived from pluripotent stem cells via Wnt signaling inhibition
2021-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3302
PMID:33241896
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人诱导多能干细胞衍生的肺泡器官模型中肺泡I型细胞的分化机制 | 首次通过抑制Wnt信号通路成功诱导人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞分化，并利用单细胞RNA测序技术定义了这些细胞的转录组特征 | NA | 探究人肺泡I型细胞从肺泡II型细胞分化过程中的机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肺泡I型细胞及其分化机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人诱导多能干细胞衍生的上皮细胞和胎儿肺成纤维细胞的肺泡器官模型 |
| 24615 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Workflow for Splenic Myeloid-Derived Suppressor Cells from Murine Breast Cancer Models
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1060-2_14
PMID:33237548
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研究论文 | 本文提供了一种使用单细胞RNA测序（scRNAseq）探索乳腺癌模型中脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs）的详细流程 | 利用单细胞转录组学技术，深入研究了以往未被充分认识的细胞异质性，特别是免疫细胞亚群中的MDSCs | NA | 定义乳腺癌模型中脾脏髓系细胞的独特分子特征 | 乳腺癌模型中的脾脏髓系来源抑制细胞（MDSCs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组 | 涉及乳腺癌模型小鼠和野生型对照小鼠的脾脏髓系细胞 |
| 24616 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of distinct brown adipocyte subtypes in C57BL/6J mice
2021-01, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000924
PMID:33257475
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析C57BL/6J小鼠棕色脂肪组织中的基质血管部分，鉴定并表征了不同的棕色脂肪细胞亚型 | 首次研究了棕色脂肪细胞亚型的发育起源，并确认了区分棕色脂肪细胞亚型的标记物 | NA | 深入了解棕色前脂肪细胞的异质性 | C57BL/6J小鼠的棕色脂肪组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57/BL6小鼠的棕色脂肪组织基质血管部分 |
| 24617 | 2024-08-09 |
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1201-9_10
PMID:33263908
|
研究论文 | 本文回顾了转录组分析的关键发展，并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程，以及基于Illumina技术的最佳实践建议 | 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 | NA | 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 | mRNA测序实验和数据分析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 24618 | 2024-08-09 |
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000624
PMID:33264223
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研究论文 | 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 | 结合单细胞基因组学分析，这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 | 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 | 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 | 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 数千个造血祖细胞在单个小鼠中 |
| 24619 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Receptors and Entry Genes Are Expressed in the Human Olfactory Neuroepithelium and Brain
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101839
PMID:33251489
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2受体和进入基因在人类嗅觉神经上皮和大脑中的表达 | 首次发现嗅觉神经上皮中的支持细胞表达SARS-CoV-2受体ACE2和TMPRSS2，可能是病毒进入神经系统的一个潜在入口 | NA | 验证嗅觉神经上皮是否为SARS-CoV-2的靶点，并探讨其在神经系统中的潜在作用 | 人类嗅觉神经上皮和支持细胞，以及特定脑细胞类型 | NA | COVID-19 | RNA-seq | NA | RNA | 人类和鼠类的嗅觉组织及脑细胞 |
| 24620 | 2024-08-09 |
New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20191255
PMID:33259583
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在理解心脏纤维化和心力衰竭发展中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）提供了一个新的平台，用于识别可能驱动心脏纤维化和心力衰竭发展的新的细胞和分子主角 | 讨论了在解释scRNA-seq数据时的一些关键考虑因素及其局限性 | 理解心脏纤维化和心力衰竭的发展 | 心脏细胞景观及其在心脏纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |