单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24581 2024-08-09
Guidelines for Setting Up a mRNA Sequencing Experiment and Best Practices for Bioinformatic Data Analysis
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文回顾了转录组分析的关键发展,并详细介绍了mRNA测序实验设计和数据处理的工作流程,以及基于Illumina技术的最佳实践建议 讨论了单细胞RNA测序和长读长技术测序的新前沿 NA 提供mRNA测序实验设置和生物信息学数据分析的最佳实践指南 mRNA测序实验和数据分析 生物信息学 NA RNA-seq NA 文本 NA
24582 2024-08-09
Systems analysis of hematopoiesis using single-cell lineage tracing
2021-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2
研究论文 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液生成系统分析中的应用及其最新发现 结合单细胞基因组学分析,这些研究允许对小鼠和人类的血液生成进行系统级描述 需要进一步研究以完全理解这些技术在人类生物学和疾病中的应用 探讨单细胞谱系追踪技术在血液生成研究中的优势、不足以及未来的发展方向 血液生成过程中的细胞行为和动态发展过程 数字病理学 NA 下一代测序 NA 单细胞RNA测序 数千个造血祖细胞在单个小鼠中
24583 2024-08-09
SARS-CoV-2 Receptors and Entry Genes Are Expressed in the Human Olfactory Neuroepithelium and Brain
2020-Dec-18, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究探讨了SARS-CoV-2受体和进入基因在人类嗅觉神经上皮和大脑中的表达 首次发现嗅觉神经上皮中的支持细胞表达SARS-CoV-2受体ACE2和TMPRSS2,可能是病毒进入神经系统的一个潜在入口 NA 验证嗅觉神经上皮是否为SARS-CoV-2的靶点,并探讨其在神经系统中的潜在作用 人类嗅觉神经上皮和支持细胞,以及特定脑细胞类型 NA COVID-19 RNA-seq NA RNA 人类和鼠类的嗅觉组织及脑细胞
24584 2024-08-09
New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2020-12-18, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在理解心脏纤维化和心力衰竭发展中的应用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一个新的平台,用于识别可能驱动心脏纤维化和心力衰竭发展的新的细胞和分子主角 讨论了在解释scRNA-seq数据时的一些关键考虑因素及其局限性 理解心脏纤维化和心力衰竭的发展 心脏细胞景观及其在心脏纤维化中的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24585 2024-08-09
Single-Cell Immune Profiling in Coronary Artery Disease: The Role of State-of-the-Art Immunophenotyping With Mass Cytometry in the Diagnosis of Atherosclerosis
2020-12-15, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
综述 本文综述了心血管免疫学的重要进展,并总结了免疫系统与动脉粥样硬化之间的临床证据 介绍了质谱流式细胞术和单细胞RNA测序等高分辨率技术在早期动脉粥样硬化诊断中的应用 主要血清生物标志物的特异性较低 探讨新的诊断和治疗方法,以改善冠状动脉疾病的早期检测和干预 冠状动脉疾病及其相关免疫细胞亚型 NA 心血管疾病 质谱流式细胞术 NA 单细胞数据 NA
24586 2024-08-09
Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets
2020-12, Trends in immunology IF:13.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析,探讨了人类树突状细胞(DCs)的新亚群及其在基于发育的分类中的位置 利用高吞吐量的单细胞方法,特别是在转录组水平上揭示了人类DCs的进一步异质性 NA 研究人类树突状细胞的新亚群及其特征 人类树突状细胞的亚群及其分类 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未提及
24587 2024-08-09
muscat detects subpopulation-specific state transitions from multi-sample multi-condition single-cell transcriptomics data
2020-11-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了在多样本多条件单细胞转录组数据中检测亚群特异性状态转换的方法 开发了一种灵活的模拟方法来评估跨条件差异状态分析的方法性能,并提供了muscat R包中的多条件分析工具 NA 评估和比较不同统计框架在跨条件差异状态分析中的表现 单细胞RNA测序数据中的亚群特异性响应 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 混合模型 转录组数据 涉及小鼠皮质细胞的scRNA-seq数据
24588 2024-08-09
Atherosclerosis in Different Vascular Locations Unbiasedly Approached with Mouse Genetics
2020-11-28, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了不同血管位置的动脉粥样硬化与遗传因素之间的关系,并利用小鼠模型进行无偏倚的遗传学研究 通过全基因组关联研究揭示了人类颈动脉斑块和冠状动脉疾病相关的遗传位点不重叠,表明不同位置可能涉及不同的遗传途径。此外,单细胞转录组分析揭示了一小群对炎症刺激“超响应”的血管平滑肌细胞 物种差异限制了小鼠模型的直接应用 研究不同血管位置动脉粥样硬化的遗传机制 不同血管位置的动脉粥样硬化及其遗传影响因素 NA 心血管疾病 全基因组关联研究、单细胞转录组分析 NA 基因组数据、转录组数据 小鼠模型
24589 2024-08-09
An allosteric interleukin-1 receptor modulator mitigates inflammation and photoreceptor toxicity in a model of retinal degeneration
2020-Nov-27, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本文研究了一种变构白细胞介素-1受体调节剂在视网膜退化模型中减轻炎症和光感受器毒性的作用 首次验证了变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela在抑制有害炎症反应和保护光感受器密度及功能方面的有效性 NA 验证白细胞介素-1β在神经视网膜退化中的重要性,并评估变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela的疗效 小鼠视网膜在蓝光诱导下的退化 NA 视网膜退化 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠样本,具体数量未详述
24590 2024-08-09
Single cell profiling of capillary blood enables out of clinic human immunity studies
2020-11-25, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文开发了一种利用多重单细胞测序和非临床毛细血管血液提取的平台,以简化、低成本地对人类免疫系统进行单细胞分辨率的跨时间和人群的分析 本文创新地利用了多重单细胞测序技术,结合非临床毛细血管血液提取,实现了对人类免疫系统的单细胞分辨率分析 NA 研究目的是更好地理解基因表达在不同免疫细胞类型中的时间性和个体间变异性 研究对象是人类免疫系统中的基因表达变异性 数字病理学 NA 多重单细胞测序 NA 基因表达数据 多个受试者的毛细血管血液样本
24591 2024-08-09
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
研究论文 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据,揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者,可能存在地域和时间限制 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 NA COVID-19 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 119名COVID-19阳性患者
24592 2024-08-09
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
研究论文 本文综述了肝细胞癌(HCC)在精准治疗领域的最新进展,包括新型血清生物标志物的发现与应用、精准肝脏手术技术的改进以及分子靶向治疗和免疫治疗的结合 介绍了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术革新对HCC生物学理解的加速作用,以及这些技术带来的新的治疗机会 肝细胞癌的高度异质性和治疗抵抗性仍然是未满足的医疗需求,需要更深入的疾病生物学研究和新型疗法 探讨肝细胞癌精准治疗的最新研究前沿,以提高患者生存率并寻找新的治疗突破 肝细胞癌(HCC)及其精准治疗策略 NA 肝癌 单细胞测序、基因组编辑 NA 血清生物标志物、影像数据 NA
24593 2024-08-09
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
综述 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法,以及其在精准医学中的潜在应用 NA 加速对细胞异质性的理解 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24594 2024-08-09
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术,深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 NA 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA NA
24595 2024-08-09
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平,并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 NA 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞,以及324个人乳腺癌样本
24596 2024-08-09
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析,特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 NA NA 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 血管组织的异质性,特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA
24597 2024-08-09
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观,并发现幼稚B细胞高度浸润,可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润,并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据,需要进一步的实验验证。 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制,特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 数字病理学 肺部疾病 CIBERSORT-X NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化(IPF)患者的肺组织样本
24598 2024-08-09
Defining HPV-specific B cell responses in patients with head and neck cancer
2021-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文研究了人乳头瘤病毒(HPV)阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的存在及其特征 首次展示了HPV特异性B细胞反应在HPV阳性头颈癌患者中的存在,并详细描述了这些反应的特征,包括HPV特异性抗体的产生和定位 NA 探讨HPV阳性头颈癌患者肿瘤微环境中HPV特异性B细胞反应的特征及其在免疫治疗中的潜在应用 HPV阳性头颈癌患者的肿瘤样本 NA 头颈癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 多个患者的肿瘤样本
24599 2024-08-09
Deep feature extraction of single-cell transcriptomes by generative adversarial network
2021-06-16, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种单细胞生成对抗网络(scGAN),用于从原始数据中同时获取模式并最小化由技术伪影或其他数据固有因素引起的混杂效应 scGAN通过将每个细胞投影到潜在嵌入来建模数据似然性,并尝试最小化潜在嵌入与批次标签之间的相关性 NA 解决单细胞RNA测序(scRNA-seq)中的批次效应问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 生成对抗网络(GAN) 基因表达数据 三个公共scRNA-seq数据集
24600 2024-08-09
Single-cell RNA-seq reveals developmental plasticity with coexisting oncogenic states and immune evasion programs in ETP-ALL
2021-05-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过全长单细胞RNA测序技术,探讨了早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP-ALL)中的治疗抵抗机制,揭示了细胞发育可塑性与共存致癌状态及免疫逃避程序的关系 研究发现两种高度不同的干细胞样状态,这些状态在细胞周期和致癌信号传导方面存在关键差异,并且能够分化为具有显著免疫调节功能的更成熟白血病状态 NA 探讨ETP-ALL中的治疗抵抗机制及其与细胞发育可塑性和免疫逃避程序的关系 ETP-ALL中的恶性细胞和微环境细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
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