单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 24581 - 24600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24581 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals that the Switching of the Transcriptional Profiles of Cysteine-Related Genes Alters the Virulence of Entamoeba histolytica
2020-Dec-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.01095-20
PMID:33361325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究了阿米巴原虫的转录组特征，揭示了硫代谢和蛋白酶体途径在病原性中的重要性，并探讨了在胱氨酸缺乏条件下，阿米巴原虫如何调节胱氨酸相关基因的表达以影响其毒力和吞噬作用。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了阿米巴原虫在胱氨酸缺乏条件下的转录组变化，以及这种变化如何影响其毒力和细胞毒性。 | 研究主要集中在单个阿米巴原虫的转录组分析，未涉及更广泛的细胞群体或其他相关病原体的比较研究。 | 探讨阿米巴原虫的转录组特征及其在胱氨酸缺乏条件下的调节机制，以理解其毒力变化的生物学特性。 | 阿米巴原虫的单个原虫及其后代 | 数字病理学 | 阿米巴病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个阿米巴原虫及其后代 |
| 24582 | 2024-08-09 |
Modulation of Immune Checkpoints by Chemotherapy in Human Colorectal Liver Metastases
2020-12-22, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100160
PMID:33377131
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研究论文 | 本研究探讨了化疗对人类结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 发现了两种对化疗反应不同的细胞亚型，并揭示了化疗与免疫检查点抑制剂联合使用的潜在协同效应 | NA | 研究化疗对结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 人类结直肠癌肝转移瘤切片 | NA | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8例 |
| 24583 | 2024-08-09 |
[Research advances on application of single-cell RNA sequencing in islet cell biology]
2020-Dec-20, Zhonghua shao shang za zhi = Zhonghua shaoshang zazhi = Chinese journal of burns
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学研究中的应用进展 | 单细胞RNA测序技术能够表征稀有类型的内分泌细胞，发现典型内分泌细胞的细胞异质性和新的细胞亚型，分析不同物种间内分泌细胞的差异，并更准确地描述各种类型胰岛细胞在发育过程和代谢疾病中的不同状态 | 目前单细胞RNA测序对低丰度转录本的检测效率相对较低 | 探讨单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学中的应用 | 胰岛细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及人类和鼠类的胰岛细胞 |
| 24584 | 2024-08-09 |
Preparing Highly Viable Single-Cell Suspensions from Mouse Pancreatic Islets for Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100144
PMID:33377038
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研究论文 | 本文描述了一种从鼠胰腺胰岛中制备高存活率单细胞悬液的方法，用于单细胞RNA测序 | 提供了一种有效的鼠胰腺胰岛单细胞悬液制备协议，适用于单细胞RNA测序 | NA | 研究胰腺胰岛的细胞异质性和亚群 | 鼠胰腺胰岛的单细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 24585 | 2024-08-09 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
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研究论文 | 本文介绍了一种针对包括COVID-19在内的传染病进行单细胞转录组学研究的完整且安全的实验流程 | 提出了一个针对新病原体SARS-CoV-2的安全实验流程，用于从细胞分离到数据分析的scRNA-seq实验 | NA | 开发一种安全的工作流程，用于研究包括COVID-19在内的传染病的单细胞转录组学 | 感染患者的血液样本 | 单细胞测序 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 感染患者的血液样本 |
| 24586 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of mouse preimplantation embryos by third-generation sequencing
2020-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001017
PMID:33378329
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研究论文 | 本文开发了一种基于第三代测序平台的新型单细胞RNA测序技术SCAN-seq，并应用于小鼠植入前胚胎的分析 | SCAN-seq技术具有高灵敏度和准确性，能够捕获大量未注释的转录本，并展示出高验证率 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序技术，并应用于小鼠植入前胚胎的转录组分析 | 小鼠植入前胚胎 | 基因组学 | NA | 第三代测序（TGS） | NA | RNA序列 | 9,338个基因中的27,250个未注释转录本 |
| 24587 | 2024-08-09 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Heterogeneities of Non-cardiomyocytes in Healthy and Ischemic Hearts
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.615161
PMID:33365332
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研究论文 | 本研究通过整合三个代表性的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，探讨了在心肌梗死或假手术后3天和7天分离的27,349个非心肌细胞的异质性 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，揭示了健康和非健康心脏中非心肌细胞的不同动态和功能特性 | NA | 旨在探讨是否可以通过整合多个相似的scRNA-seq数据集，更全面地理解疾病 | 非心肌细胞在健康和心肌缺血心脏中的异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 27,349个非心肌细胞 |
| 24588 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into retinal endothelial barrier properties
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33380778
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研究论文 | 通过分析牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组，深入了解视网膜内皮屏障特性 | 开发了一种单细胞转录组学工作流程，并揭示了视网膜微血管屏障中先前未报道的连接蛋白 | NA | 更好地表征视网膜内皮屏障特性 | 牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个RMECs |
| 24589 | 2024-08-09 |
Identification of Pro-Fibrotic Macrophage Populations by Single-Cell Transcriptomic Analysis in West Highland White Terriers Affected With Canine Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.611749
PMID:33384697
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞群体，以识别与疾病相关的细胞异质性 | 首次在犬类特发性肺纤维化模型中使用单细胞RNA测序技术，识别出具有促纤维化能力的巨噬细胞/单核细胞群体 | 需要进一步研究以理解这些巨噬细胞/单核细胞群体在疾病发病机制中的具体作用 | 识别和分析患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬肺部中的促纤维化巨噬细胞群体 | 患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 犬类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5只患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬和3只健康西高地白梗犬 |
| 24590 | 2024-08-09 |
Sc-GPE: A Graph Partitioning-Based Cluster Ensemble Method for Single-Cell
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.604790
PMID:33384718
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图划分聚类集成的单细胞RNA测序数据分析方法Sc-GPE | Sc-GPE结合了五种基于图划分的单细胞聚类方法，并通过构建加权共识矩阵来区分各方法的重要性 | NA | 开发一种有效的聚类集成策略，用于解决不同单细胞聚类方法结果不一致的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图划分聚类方法 | 数据矩阵 | 12个单细胞RNA测序数据集 |
| 24591 | 2024-08-09 |
Cannabinoid Receptor Activation on Haematopoietic Cells and Enterocytes Protects against Colitis
2021-Jun-22, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa253
PMID:33331878
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研究论文 | 研究了大麻素受体激活在造血细胞和肠上皮细胞中对结肠炎的保护作用 | 首次探讨了大麻素受体激活对结肠炎的保护作用中微生物组、代谢组以及造血和非造血细胞各自贡献的角色 | 研究主要集中在实验模型和动物实验上，尚未在人类群体中进行验证 | 探讨大麻素受体激活在减轻炎症性肠病中的作用及其机制 | C57BL/6雌性小鼠在化学诱导的结肠炎模型中的反应 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和qRT-PCR | NA | RNA | C57BL/6雌性小鼠 |
| 24592 | 2024-08-09 |
Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian
2021-05-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa333
PMID:33355655
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术对acoel扁虫Isodiametra pulchra进行细胞类型分析 | 发现了acoel扁虫中十种主要的细胞类型，并描述了大量特定类群的标记基因，表明存在特定类群的共同分子机制 | NA | 探索双边对称动物细胞类型的进化及其身体结构的起源 | acoel扁虫Isodiametra pulchra的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 24593 | 2024-08-09 |
CRISPR Screening of CAR T Cells and Cancer Stem Cells Reveals Critical Dependencies for Cell-Based Therapies
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1243
PMID:33328215
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选技术，研究了CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC）中影响CAR介导的肿瘤杀伤的关键分子决定因素 | 通过相互CRISPR筛选，识别了CAR T细胞和肿瘤细胞中调控CAR T细胞细胞毒性的基因，为增强CAR T细胞的抗肿瘤疗效提供了分子靶向策略 | NA | 探索增强CAR T细胞疗法对胶质母细胞瘤疗效的方法 | CAR T细胞和胶质母细胞瘤干细胞（GSC） | 免疫疗法 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR筛选 | NA | 基因组数据 | 患者来源的GSCs和编辑的CAR T细胞 |
| 24594 | 2024-08-09 |
Decoding Human Megakaryocyte Development
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.11.006
PMID:33340451
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞发育过程 | 首次详细描述了早期巨核细胞的转录组、细胞异质性和发育轨迹，并发现了一种具有免疫反应相关基因高表达的CD42bCD14巨核细胞亚群 | NA | 揭示早期人类巨核细胞发育的分子和细胞机制 | 人类胚胎卵黄囊和胎肝中的巨核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自胚胎卵黄囊和胎肝的巨核细胞样本 |
| 24595 | 2024-08-09 |
Single-cell profiles of human bone marrow-derived mesenchymal stromal cells after IFN-γ and TNF-α licensing
2021-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.145347
PMID:33333228
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研究论文 | 研究分析了IFN-γ和TNF-α预处理后的人骨髓来源间充质干细胞的单细胞表达谱 | 首次在单细胞分辨率下展示了未经和经过IFN-γ和TNF-α预处理的间充质干细胞在细胞周期、干性、分化潜能和免疫调节能力方面的表达谱 | 细胞异质性限制了对炎症预处理效应的全面理解 | 探讨IFN-γ和TNF-α预处理对间充质干细胞免疫命运和免疫调节能力的影响 | 人骨髓来源的间充质干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了公开的Gene Expression Omnibus数据库中的单细胞RNA测序数据 |
| 24596 | 2024-08-09 |
Novel biomarkers of intervertebral disc cells and evidence of stem cells in the intervertebral disc
2021-03, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2020.12.005
PMID:33338640
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研究论文 | 本研究使用10X Genomics技术分析了野生型大鼠椎间盘的单细胞转录组，识别了新的椎间盘细胞基因标记，并提供了椎间盘细胞的单细胞基因表达图谱 | 本研究首次在单细胞水平上提供了椎间盘细胞的表型和标记基因，并提出了新的标记基因，包括多能干细胞（MSC）标记基因 | NA | 旨在深入了解健康成熟椎间盘细胞的标记基因和细胞表型 | 大鼠椎间盘细胞及其异质性细胞群 | 数字病理学 | NA | 10X Genomics技术 | NA | 单细胞转录组 | 13,578个单细胞转录本 |
| 24597 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Niches for Digestive Organ Development, Homeostasis, and Disease
2021-03, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.11.010
PMID:33349527
|
研究论文 | 本文探讨了间质细胞在消化器官发育、稳态及疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学和多组学分析，揭示了间质细胞的异质性及其在器官发育和疾病中的调控机制 | NA | 研究间质细胞在消化器官发育和疾病中的作用及其调控机制 | 消化器官的间质细胞及其在器官发育和疾病中的作用 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA |
| 24598 | 2024-08-09 |
Microbial single-cell RNA sequencing by split-pool barcoding
2021-02-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba5257
PMID:33335020
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研究论文 | 本文介绍了一种名为microSPLiT的高通量单细胞RNA测序方法，用于分析革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 | microSPLiT方法能够解析细菌中异质的转录状态，并为无法进行单细胞分析的自然微生物群落提供高通量基因表达分析 | NA | 开发一种适用于细菌的高通量单细胞RNA测序方法 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的转录状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过25,000个细胞 |
| 24599 | 2024-08-09 |
Systemic transcriptome comparison between early- And late-onset pre-eclampsia shows distinct pathology and novel biomarkers
2021-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12968
PMID:33332660
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研究论文 | 本研究通过比较早期和晚期发作的先兆子痫的系统转录组，揭示了其不同的病理机制并发现了新的生物标志物 | 本研究首次系统比较了早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组，并结合单细胞转录组学，发现了新的特定生物标志物 | NA | 旨在揭示早期和晚期发作的先兆子痫之间的差异，并识别新的生物标志物 | 早期和晚期发作的先兆子痫的胎盘和外周血转录组 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用患者血液样本进行实验验证 |
| 24600 | 2024-08-09 |
Hepatobiliary acid-base homeostasis: Insights from analogous secretory epithelia
2021-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.10.010
PMID:33342564
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综述 | 本文综述了从类似分泌上皮中获得的关于肝胆酸碱稳态的见解 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集分析了人类胆管细胞的表达，提供了关于pH稳态及其在胆道系统中失调的分子基础的见解 | NA | 探讨在类似分泌上皮中发现的保守原则，并结合当前对胆管细胞生理学的认识 | 肝胆酸碱稳态及其在类似分泌上皮中的机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |