单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27151 篇文献，本页显示第 24581 - 24600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24581 | 2024-08-09 |
Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-07-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02103-2
PMID:32718323
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研究论文 | 本文通过贝叶斯模型选择方法，明确展示了在多个生物学上现实的单细胞RNA测序数据集中存在零膨胀现象，并指出其主要原因不是技术性的而是生物学性质的 | 本文首次通过贝叶斯模型选择方法明确展示了单细胞RNA测序数据中的零膨胀现象，并揭示了其生物学起源 | 尽管证明了零膨胀的存在，但作者推荐使用非零膨胀的负二项分布的广义线性模型作为单细胞RNA测序分析的合适参考模型 | 探讨单细胞RNA测序数据中零膨胀的生物学起源及其在分析中的适当处理方法 | 单细胞RNA测序数据中的零膨胀现象及其生物学和技术学原因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型选择 | 基因表达数据 | 多个生物学上现实的单细胞RNA测序数据集 |
| 24582 | 2024-08-09 |
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-00924-z
PMID:32718354
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综述 | 本文综述了蛋白酶体靶向嵌合体（PROTACs）在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力，并讨论了提高其临床安全性的策略 | PROTACs通过独特的机制（即以亚化学计量方式降解目标蛋白），能够靶向“不可成药”和突变蛋白，并提高目标选择性 | PROTACs在临床应用中存在一些靶向毒性问题 | 探讨PROTACs在血液恶性肿瘤治疗中的应用及提高其安全性的策略 | PROTACs及其在血液恶性肿瘤治疗中的应用 | NA | 血液恶性肿瘤 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 24583 | 2024-08-09 |
scPADGRN: A preconditioned ADMM approach for reconstructing dynamic gene regulatory network using single-cell RNA sequencing data
2020-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007471
PMID:32716923
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPADGRN的新方法，用于利用单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 | scPADGRN结合了预处理交替方向乘子法和细胞聚类，提高了准确性、鲁棒性和快速收敛性 | NA | 重建动态基因调控网络，揭示细胞分化和疾病发展中的关键转录调控因子 | 单细胞RNA测序数据中的动态基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预处理交替方向乘子法 | 时间序列数据 | 基于三个真实的单细胞数据集 |
| 24584 | 2024-08-09 |
Recent advances of single-cell RNA sequencing technology in mesenchymal stem cell research
2020-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v12.i6.438
PMID:32742561
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在间充质干细胞研究中的最新进展 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了间充质干细胞的新表面标记和功能亚群 | 讨论了单细胞RNA测序在间充质干细胞研究中的挑战和未来方向 | 探讨单细胞RNA测序技术在间充质干细胞及其相关疾病病理生理中的应用 | 间充质干细胞及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24585 | 2024-08-09 |
Midbrain Dopaminergic Neuron Development at the Single Cell Level: In vivo and in Stem Cells
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00463
PMID:32733875
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研究论文 | 本文探讨了中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育，特别是在体内和干细胞中的发育 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和生物信息学技术，详细分析了人类发育中脑中的细胞类型及其基因表达模式 | 目前对人类多巴胺能神经元发育的程序了解较少 | 阐明人类多巴胺能神经元的发育过程，并探讨其在帕金森病细胞替代治疗和疾病模型中的应用 | 中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 24586 | 2024-08-09 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-06, ArXiv
PMID:32699813
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研究论文 | 本研究通过高通量测序技术分析了COVID-19患者在感染期间多个时间点的B细胞受体（BCR）库，以了解不同疾病严重程度下的B细胞反应特征 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞受体库的整体景观，并发现了与SARS-CoV-1和SARS-CoV-2交叉反应的B细胞受体 | 研究样本量较小，仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者中B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
| 24587 | 2024-08-09 |
Defining the Skin Cellular Community Using Single-Cell Genomics to Advance Precision Medicine
2021-02, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.05.104
PMID:32713511
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在皮肤细胞群研究中的应用，特别是通过单细胞RNA测序技术，以推动精准医学的发展 | 单细胞基因组学技术使得对人类组织中不同细胞类型的角色和功能进行高分辨率分析成为可能，为理解细胞通路和相互作用提供了新的视角 | 文章指出，尽管单细胞RNA测序技术具有显著优势，但在实际应用中仍面临实现有意义结果的挑战 | 研究旨在通过单细胞基因组学技术深入理解皮肤细胞群，推动精准医学的进步 | 研究对象为皮肤细胞，包括健康和疾病状态下的皮肤细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 24588 | 2024-08-09 |
Cell Surface Protein mRNAs Show Differential Transcription in Pyramidal and Fast-Spiking Cells as Revealed by Single-Cell Sequencing
2021-01-05, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaa195
PMID:32710103
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序技术，揭示了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞表面蛋白mRNA的差异转录 | 首次通过单细胞测序技术，识别了前额叶皮层中锥体细胞和快速放电细胞的特定表达转录本，并将其与精神疾病相关的细胞机制联系起来 | 研究仅限于小鼠前额叶皮层的急性脑切片，未来研究需扩展到更多物种和更广泛的脑区 | 扩展药物治疗的可能性，并更好地理解临床使用药物的细胞和网络效应 | 前额叶皮层中的锥体细胞和快速放电细胞 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 19,685个转录本 |
| 24589 | 2024-08-09 |
Comparative analysis of cell lineage differentiation during hepatogenesis in humans and mice at the single-cell transcriptome level
2020-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0378-6
PMID:32690901
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，比较了人类和小鼠胚胎发育过程中肝脏细胞谱系分化的差异 | 发现了人类和小鼠肝脏细胞谱系的新标记物，并验证了肝母细胞分化遵循“默认导向”模型 | NA | 揭示人类和小鼠胚胎肝脏发育的细胞动态景观，并比较两者之间的异同 | 人类和小鼠的胚胎肝脏细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 人类和小鼠的整个胚胎肝脏 |
| 24590 | 2024-08-09 |
Single-Cell Reconstruction of Human Basal Cell Diversity in Normal and Idiopathic Pulmonary Fibrosis Lungs
2020-12-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201904-0792OC
PMID:32692579
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了正常和特发性肺纤维化（IPF）肺组织中上皮细胞的转录组，以揭示基底干细胞在疾病中的变化 | 发现基底细胞包括多能性和分泌性基底细胞亚群，并且这些细胞在IPF中表现出特定的扩张 | NA | 旨在更好地理解基底细胞增生及其相关分泌功能障碍在特发性肺纤维化发展中的作用 | 正常和特发性肺纤维化肺组织中的上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自正常和IPF肺组织的孤立上皮细胞 |
| 24591 | 2024-08-09 |
Efficiency and Target Derepression of Anti-miR-92a: Results of a First in Human Study
2020-12, Nucleic acid therapeutics
IF:4.0Q2
DOI:10.1089/nat.2020.0871
PMID:32707001
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研究论文 | 本研究评估了MRG-110（一种针对miR-92a-3p的锁核酸基反义寡核苷酸）在健康成人中的疗效和目标脱抑制作用 | 首次在人体中研究了anti-miR-92a的活性，并展示了其在周围血液隔室中有效抑制miR-92a并脱抑制miR-92a目标的能力 | NA | 探究anti-miR-92a在人体中的活性及其对目标miR-92a-3p的抑制效果 | 健康成人 | NA | 心血管疾病 | 锁核酸基反义寡核苷酸 | NA | 血液 | 多个剂量组的随机分配的健康成人 |
| 24592 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2020-11, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0374-x
PMID:32686767
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了鼻咽癌肿瘤微环境中免疫细胞多样性及其与预后相关的亚型 | 首次在鼻咽癌中识别出新的免疫细胞亚型，如CLEC9A树突状细胞，并揭示了调控免疫细胞多样性的转录因子 | 研究样本仅包括十五个原发性鼻咽癌肿瘤和一个正常样本，可能影响结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境的复杂性，并探索潜在的治疗靶点和预后标志物 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 7581个恶性细胞和40,285个免疫细胞来自十五个原发性鼻咽癌肿瘤和一个正常样本 |
| 24593 | 2024-08-09 |
Notch activation in the mouse mammary luminal lineage leads to ductal hyperplasia and altered partitioning of luminal cell subtypes
2020-10-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2020.112156
PMID:32707133
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研究论文 | 本研究通过在小鼠乳腺腔上皮细胞系中表达激活形式的Notch1，分析了其对肿瘤形成和腔上皮细胞系转录组景观的影响 | 首次展示了Notch1 ICD在腔上皮细胞系中的表达导致导管增生和分支频率增加，并伴随腔细胞亚型分布的改变 | NA | 探讨Notch信号通路在乳腺异常增生和肿瘤发生中的作用 | 小鼠乳腺腔上皮细胞系 | NA | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及表达Notch1 ICD的小鼠和对照小鼠的乳腺细胞 |
| 24594 | 2024-08-09 |
Tissue engineered corneal epithelium derived from clinical-grade human embryonic stem cells
2020-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2020.07.009
PMID:32710961
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研究论文 | 本文通过逐步诱导临床级人胚胎干细胞（hESCs）分化，构建了组织工程角膜上皮，并研究了分化过程中的动态基因表达谱和表型转变 | 首次成功诱导临床级hESCs分化为角膜上皮细胞，并通过scRNA-seq分析揭示了分化过程中与眼表上皮细胞系相关的基因上调及信号通路的激活 | NA | 研究临床级hESCs分化为角膜上皮的生物学过程及其在治疗角膜缘干细胞缺乏症中的应用潜力 | 临床级人胚胎干细胞（hESCs）分化为角膜上皮细胞的过程及其生物安全性 | NA | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了临床级hESCs Q-CTS-hESC-1，并在兔角膜缘干细胞缺乏（LSCD）模型中进行了移植实验 |
| 24595 | 2024-08-09 |
Status and Potential of Single-Cell Transcriptomics for Understanding Plant Development and Functional Biology
2020-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24196
PMID:32713117
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物发育和功能生物学研究中的现状、挑战和潜力 | 单细胞转录组学技术能够以微观分辨率增强我们对基因表达复杂性的理解，并有望彻底改变我们表征复杂细胞集合体和研究其空间组织、动态、克隆分布、途径、功能和网络的方式 | 单细胞组学在植物研究中的应用才刚刚开始 | 探讨单细胞转录组学技术在植物发育和功能生物学中的应用潜力 | 植物的发育和功能生物学 | 转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24596 | 2024-08-09 |
Pathogenic Autoimmunity in Atherosclerosis Evolves From Initially Protective Apolipoprotein B100-Reactive CD4+ T-Regulatory Cells
2020-09-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中由最初保护性的载脂蛋白B100反应性CD4+调节T细胞演变为致病性自身免疫反应的过程。 | 发现载脂蛋白B反应性Tregs在动脉粥样硬化中具有混合表型，并揭示了其从保护性到致病性的转变过程。 | NA | 探究动脉粥样硬化中自身反应性CD4+ T细胞的功能及其与致病性TH1细胞的关系。 | 载脂蛋白B反应性CD4+ T细胞及其在动脉粥样硬化中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠和人类样本 |
| 24597 | 2024-08-09 |
Impact of Local Alloimmunity and Recipient Cells in Transplant Arteriosclerosis
2020-09-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.316470
PMID:32689904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了移植动脉硬化的细胞异质性及其潜在机制 | 发现了先前未知的细胞亚群，并揭示了CCL21/CXCR3在调节免疫反应中的重要作用 | NA | 旨在阐明移植动脉硬化中的细胞异质性及其潜在机制 | 移植动脉硬化的细胞异质性和疾病进展机制 | NA | 移植动脉硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 11,868个细胞 |
| 24598 | 2024-08-09 |
Different lineage contexts direct common pro-neural factors to specify distinct retinal cell subtypes
2020-09-07, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202003026
PMID:32699896
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研究论文 | 本文通过在体谱系追踪技术研究斑马鱼视网膜前体细胞，揭示了神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 发现了亚型特异性的刻板神经发生谱系，并揭示了单个促神经因子在谱系依赖方式下指定不同神经元类型/亚型的能力 | NA | 探讨神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 斑马鱼视网膜前体细胞及其神经元亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 细胞谱系数据 | 约1,000个单个斑马鱼视网膜前体细胞 |
| 24599 | 2024-08-09 |
The activation trajectory of plasmacytoid dendritic cells in vivo during a viral infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0731-4
PMID:32690951
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研究论文 | 本研究通过结合Ifnb1报告小鼠、流式细胞术、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜和CD4 T细胞激活测定，深入描述并关联了感染小鼠巨细胞病毒的动物中pDC的激活状态 | 提出了一个新的模型，解释了个体pDC如何在病毒感染期间在时间和空间上紧密协调地执行不同功能 | NA | 研究pDC在病毒感染期间的功能及其调控机制 | pDC在病毒感染中的激活轨迹及其功能 | NA | NA | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 感染小鼠巨细胞病毒的动物 |
| 24600 | 2024-08-09 |
Corneal epithelial biology: Lessons stemming from old to new
2020-09, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2020.108094
PMID:32697979
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综述 | 本文综述了角膜上皮细胞生物学的最新进展，特别关注了新型调控因子在干细胞稳态、伤口愈合、角膜/结膜边界维持中的作用以及单细胞RNA测序在视觉生物学研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在视觉生物学研究中的应用 | NA | 探讨角膜上皮细胞生物学中的新型调控因子及其在干细胞稳态和伤口愈合中的作用 | 角膜上皮细胞、干细胞、伤口愈合机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |