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当前共找到 39643 篇文献，本页显示第 2441 - 2460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2441 | 2026-04-25 |
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04066-2
PMID:42026624
|
研究论文 | 提出SEAGALL深度学习方法，基于几何正则化自编码器和可解释图注意力网络，量化分子特征对细胞表型的影响 | 首次将几何正则化自编码器与可解释图注意力网络结合，用于揭示驱动细胞身份的分子特征，超越传统差异标志基因分析 | 未提及具体局限性 | 解释单细胞染色质状态和基因表达，量化分子特征对细胞表型的影响 | 单细胞测序数据中的细胞身份和分子特征 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 几何正则化自编码器，可解释图注意力网络 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2442 | 2026-04-25 |
Trajectory-guided dimensionality reduction for multi-sample single-cell RNA-seq data reveals biologically relevant sample-level heterogeneity
2026-Apr-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag192
PMID:42024616
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研究论文 | 提出一种名为MUSTARD的轨迹引导降维方法，用于多样本单细胞RNA-seq数据，以揭示具有生物学意义的样本异质性 | 创新性地将伪时间信息整合到降维过程中，同时捕获沿伪时间轨迹和跨多个样本的主要基因表达变异模式，实现无监督的样本异质性发现 | 尚未明确讨论方法在高度复杂或大规模数据集上的计算效率及参数敏感性 | 开发适用于多条件单细胞RNA-seq数据的轨迹引导降维方法，以发现样本异质性及其相关基因标记 | 多条件单细胞RNA-seq数据中的生物样本 | 机器学习 | 新冠肺炎、结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个新冠肺炎数据集和一个结核病数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2443 | 2026-04-25 |
Immune modulation promotes heart regeneration through macrophage and Granulin functions in medaka
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2524705123
PMID:41980096
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research paper | 本研究通过bulk和单细胞转录组学结合功能实验，探究免疫调节如何通过巨噬细胞和颗粒蛋白前体功能加速非再生性的青鳉心脏修复 | 首次揭示免疫调节通过重塑巨噬细胞功能状态以促进心脏再生的机制，并发现巨噬细胞相关的颗粒蛋白前体表达与再生结局的关联 | 研究限于青鳉模型，未在哺乳动物中验证，且未完全明确巨噬细胞亚群特异的再生机制 | 探究免疫调节在促进心脏再生中的作用及其分子机制 | 非再生性的青鳉 | machine learning, 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 杂交链式反应空间分析 | NA | 转录组数据 | 青鳉心脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2444 | 2026-04-25 |
Clonal analysis for understanding fate biases in developing embryos
2026-Apr-21, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102475
PMID:42025228
|
综述 | 本文综述了利用克隆分析理解发育胚胎中命运偏倚的实验与计算方法 | 强调空间和基于扰动的策略在克隆生物学中的新兴应用 | 未明确提及局限性 | 总结当前用于理解发育胚胎中克隆多样性的前沿实验与计算方法 | 发育胚胎中的多能祖细胞及其命运偏倚 | 机器学习和数字病理学 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2445 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026-Apr-21, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞与足细胞通讯失调的机制 | 首次构建膜性肾病单细胞转录组图谱，发现并验证了致病性巨噬细胞-足细胞轴的双重失衡机制 | 基于小鼠模型，结果是否完全适用于人类膜性肾病需要进一步验证 | 解析膜性肾病中驱动肾损伤的细胞网络机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾细胞 | 数字化病理学 | 膜性肾病 | scRNA-seq, 细胞通讯分析(CellChat) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2446 | 2026-04-25 |
Macrophage heterogeneity governs the balance between fibrosis and tissue protection in systemic sclerosis
2026-Apr-20, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/kfkfod
PMID:42024552
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综述 | 本文综述了巨噬细胞异质性如何超越传统的M1/M2范式，作为连接血管损伤、免疫失调和成纤维细胞介导纤维化的“纤维-免疫轴”的核心调控因子，在系统性硬化症（SSc）及其间质性肺病（SSc-ILD）中发挥作用 | 利用单细胞RNA测序和空间多组学技术，揭示了SSc组织中不同巨噬细胞亚群（如SPP1+、FCGR3A+、TREM2+）的独特角色和功能，并发现“纤维化生态位”中巨噬细胞与成纤维细胞的致病性互作机制，为靶向治疗提供了新视角 | 对时间动态变化和空间信号分辨率的研究仍存在挑战 | 阐明巨噬细胞异质性在系统性硬化症进展中的核心作用，为开发机制导向的治疗策略奠定基础 | 系统性硬化症患者及其间质性肺病中的巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2447 | 2026-04-25 |
Protocol for isolating stromal cells from lymphoid tissue for performing scRNA-seq
2026-Apr-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104501
PMID:41989919
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protocol | 提供从淋巴组织中分离基质细胞以进行单细胞RNA测序的协议 | 专门针对低丰度基质细胞（占比小于2%）的分离和纯化步骤优化 | 未提及 | 建立从淋巴组织中纯化成纤维细胞用于单细胞RNA测序分析的标准化流程 | 淋巴组织中的基质细胞（成纤维细胞） | NA | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2448 | 2026-04-25 |
Transcriptomic and single-cell analyses reveal the prognostic value of ETV4 and its role in shaping the immune landscape of colorectal cancer
2026-Apr-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102775
PMID:41997046
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞分析揭示了ETV4在结直肠癌中的预后价值及其通过诱导M2巨噬细胞极化重塑免疫微环境的作用 | 首次综合转录组和单细胞RNA测序数据，明确ETV4通过WNT/β-catenin通路调控，促进M2型巨噬细胞极化，进而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 未在更大规模独立队列中验证，且ETV4与其他免疫细胞亚群的直接相互作用机制尚需进一步探索 | 研究ETV4在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 结直肠癌肿瘤组织及HCT-116细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化, Q-PCR, Western blot | CIBERSORT, GSVA, GSEA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 650例CRC肿瘤组织和51例癌旁正常组织（TCGA队列） | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2449 | 2026-04-25 |
Advances and limitations in angiogenesis assays: Integrating in vitro, in vivo, and emerging technologies
2026-Apr-13, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2026.107607
PMID:41985854
|
综述 | 该综述综合探讨了血管生成实验方法的进展与局限，包括体外、体内模型及前沿技术整合，并提供了基于应用驱动的决策框架 | 创新点在于引入综合决策矩阵和算法选择指南，平衡生理保真度、实验约束与3R伦理原则，实现个性化实验设计 | 依赖现有技术综述，未涉及实际实验验证；技术整合的长期有效性尚未评估 | 提供血管生成实验方法的选择框架，优化实验设计的可重复性与转化相关性 | 血管生成实验技术，包括体外、体内模型及新兴技术 | 机器视觉 | NA | NA | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2450 | 2026-04-11 |
Integrating machine learning and spatial transcriptomics uncovers shared immunomodulatory deubiquitinases in MAFLD and HCC
2026-Apr-10, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02833-6
PMID:41961303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2451 | 2026-04-25 |
RNA m6A methylation regulates CDH6 to promote epithelial-to-mesenchymal transition in cholangiocytes of biliary atresia
2026-Apr, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
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research paper | 本研究探讨了RNA m6A甲基化通过调控CDH6促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示了m6A甲基化通过METTL3/YTHDF2轴调控CDH6表达，进而促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于公开单细胞RNA测序数据集和体外实验，缺乏体内动物模型验证及临床样本的大规模验证 | 探究m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的参与作用及其机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | machine learning | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, RNA免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA-seq数据 | 公开单细胞RNA测序数据集HRA003163 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2452 | 2026-04-25 |
Mapping the zygote-to-adult developmental cell phylogeny in Arabidopsis thaliana reveals a three-cell rule of branching
2026-Apr, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02264-1
PMID:41975122
|
研究论文 | 通过开发e-SMALT系统整合单细胞RNA测序，绘制拟南芥从合子到成体的发育细胞系统发育树，揭示三分枝规则 | 首次在高等植物中实现从合子到成体的全发育追踪，发现每个枝条起源于三个创始细胞的三细胞规则，并通过单细胞转录组解析三层胚层起源 | 当前仅分析两个个体，且barcode序列长度与突变率的依赖性可能限制更复杂组织的解析能力 | 阐明多细胞生物从单细胞合子到成体组织的发育细胞谱系及其分支规则 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）的枝条、花和果实组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞谱系追踪 | 系统发育树重建 | 单细胞转录组数据、突变条形码数据 | 两株3月龄拟南芥个体，数千个细胞来自多个枝条分支 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组建库方法 |
| 2453 | 2026-04-25 |
A Novel CRYBB2 Splicing Mutation Is Associated With Lens Extracellular Matrix Remodeling and Vascular Alterations in Congenital Cataract
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.36
PMID:41989229
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研究论文 | 该研究在一个先天性白内障家系中发现CRYBB2基因的新剪接突变，并通过体内外实验揭示该突变导致晶状体细胞外基质重塑和血管异常 | 首次发现CRYBB2剪接突变与晶状体血管相互作用异常相关，并通过单细胞转录组分析揭示了晶状体对邻近血管的非细胞自主性影响 | 研究主要基于家系样本和斑马鱼模型，人类样本数量有限，且血管表型的分子机制尚需进一步验证 | 鉴定先天性白内障的遗传病因并阐明CRYBB2剪接突变对晶状体发育及相关眼部表型的影响 | 一个常染色体显性遗传先天性白内障大家系中的患者及斑马鱼模型 | 数字病理学 | 先天性白内障 | 全外显子测序，Sanger测序，RNA测序，定量逆转录PCR，单细胞RNA测序，免疫染色，细胞粘附实验，斑马鱼晶状体结构检测，血管成像 | NA | DNA序列数据，RNA测序数据，图像数据（免疫荧光、血管成像） | 一个先天性白内障家系中的多名成员及斑马鱼胚胎（具体数量未明确） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序在斑马鱼48小时受精卵阶段进行 |
| 2454 | 2026-04-25 |
High ALG1 Expression Is Correlated With Poor Prognosis and the Immune Microenvironment in Glioma
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71142
PMID:42002825
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研究论文 | 本研究探讨ALG1在胶质瘤中的表达及其临床意义，发现ALG1高表达与不良预后和免疫微环境改变相关 | 首次系统揭示ALG1在胶质瘤中的过表达及其通过促进细胞迁移、调控上皮间充质转化和改变免疫抑制微环境促进肿瘤恶性的机制 | 未提及具体局限性 | 探究ALG1在胶质瘤中的表达模式、预后价值及其与免疫微环境的关系 | ALG1基因在胶质瘤中的表达和功能 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化/免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 临床样本数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质瘤样本，以及临床样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | TCGA和CGGA数据库来源的转录组测序数据，具体平台细节未明确 |
| 2455 | 2026-04-25 |
M6A demethylase ALKBH5 mediated Igfbp4 mRNA m6A modification drives fibroblast activation and pathological upper airway fibrosis
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70656
PMID:42015658
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研究论文 | 发现M6A去甲基化酶ALKBH5通过介导Igfbp4 mRNA的m6A修饰驱动成纤维细胞活化和上气道病理性纤维化 | 首次阐明ALKBH5-IGFBP4调控轴在喉气管狭窄中驱动成纤维细胞活化和气道纤维化的作用机制 | NA | 探究ALKBH5在喉气管狭窄中对成纤维细胞活化和纤维化的作用及其分子机制 | 喉气管狭窄大鼠模型及成纤维细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, MeRIP测序, RNA免疫沉淀定量PCR, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据 | 喉气管狭窄大鼠模型及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 标准RNA测序, MeRIP测序 | NA | NA |
| 2456 | 2026-04-25 |
Cellular stress-induced eccrine gland dysfunction as a potential mechanism in acquired idiopathic generalized anhidrosis
2026-Apr-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.022
PMID:41933877
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研究论文 | 通过组织学和单细胞RNA测序分析，探究获得性特发性全身性无汗症（AIGA）的发病机制及糖皮质激素脉冲疗法的治疗作用 | 首次发现未折叠蛋白反应相关的细胞应激导致外泌腺功能障碍是AIGA的潜在发病机制，并阐明糖皮质激素脉冲疗法通过减轻细胞应激而非仅靠免疫抑制发挥作用 | 样本量较小，仅对少数病例进行详细分析；缺乏功能性验证实验 | 阐明获得性特发性全身性无汗症的潜在机制及糖皮质激素脉冲疗法的作用原理 | 获得性特发性全身性无汗症（AIGA）患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 获得性特发性全身性无汗症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织病理图像 | 多例AIGA患者的皮肤样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2457 | 2026-04-25 |
Decoding NK Cell Subset Dysregulation in SARS-CoV-2 Infection: Phenotypic, Functional, and Transcriptomic Insights Into COVID-19 Pathogenesis
2026-Apr, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.70115
PMID:41981866
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综述 | 综述了SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的表型、功能和转录组学失调及其在COVID-19发病机制中的作用 | 整合多组学和表型方法，全面解析NK细胞亚群失调与疾病严重程度的关联，并提出潜在生物标志物和治疗靶点 | 未提供原始实验数据，可能依赖已有研究的局限性，如样本异质性和技术差异 | 阐明SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的失调机制及其在COVID-19免疫病理学中的作用 | 自然杀伤细胞（NK细胞）亚群 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2458 | 2026-04-25 |
Cell type-specific inflammatory response of ischemia-reperfusion injury in lung transplantation
2026-Mar-30, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.02.007
PMID:41921751
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综述 | 本文以细胞类型特异性方式综述了肺移植中缺血再灌注损伤的炎症反应机制，重点关注基础研究发现向临床应用的转化 | 首次从细胞类型特异性角度系统梳理肺移植缺血再灌注损伤中多种细胞类型（肺泡巨噬细胞、肺上皮细胞、内皮细胞等）的炎症调控机制，并整合转录组学、代谢组学和单细胞RNA测序等新技术带来的动态基因表达与代谢变化新见解 | 未明确讨论不同细胞类型间交叉调控网络的复杂性以及现有治疗方法的具体局限性 | 总结肺移植缺血再灌注损伤的细胞特异性炎症机制，促进基础发现向改善移植预后的临床转化 | 肺移植缺血再灌注损伤中的肺泡巨噬细胞、中性粒细胞、单核细胞、淋巴细胞、肺上皮细胞、内皮细胞和免疫抑制细胞 | 数字病理学 | 肺移植缺血再灌注损伤 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 | 不适用 | 文本 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2459 | 2026-04-25 |
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-026-10216-5
PMID:41896290
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研究论文 | 通过综合分析生物信息学和实验验证，揭示昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化共病中的关键作用 | 首次鉴定出AEBP1作为骨质疏松和动脉粥样硬化共病的关键共享标志基因，并揭示昼夜节律在骨髓基质细胞和血管平滑肌细胞中的调控机制 | 尚需进一步验证AEBP1作为治疗靶点的具体功能机制，且动物模型可能不完全模拟人类疾病复杂性 | 探索骨质疏松和动脉粥样硬化共存的共享标志基因及细胞机制 | 骨质疏松和动脉粥样硬化相关的单细胞RNA测序数据和mRNA表达谱，自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导小鼠模型 | 生物信息学 | 骨质疏松, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, mRNA表达谱分析 | hdWGCNA, AUCell | 基因表达数据 | 人类骨髓样本（9种细胞系17个亚群）和颈动脉样本（6种细胞系18个亚群），小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2460 | 2026-04-25 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101329
PMID:41825449
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研究论文 | 提出一种可扩展的非参数聚类方法NCLUSION，用于单细胞RNA-seq数据的统一标记基因选择与聚类分析 | 利用贝叶斯稀疏先验的非参数无限混合模型，同时实现标记基因识别和聚类，并采用变分推理算法支持百万级细胞规模 | 未明确说明局限性，但可能依赖公开数据集验证，需进一步评估在多样化样本中的泛化能力 | 开发一种无需用户预定义参数的聚类方法，以鲁棒统计方式同时识别标记基因并降低假发现率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数无限混合模型 | 基因表达数据 | 模拟数据及公开scRNA-seq数据集（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |