单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37592 篇文献,本页显示第 2441 - 2460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2441 2026-02-18
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,识别了与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通讯介质,特别是F11R,并揭示了其在疾病严重程度中的空间富集作用 开发了一个空间框架来识别免疫通讯介质,首次将F11R与银屑病严重程度和局部免疫放大联系起来,为自身免疫炎症的精准调控提供了新靶点 研究主要基于转录组数据,功能验证有限;样本可能不足以覆盖所有自身免疫性皮肤病的亚型;未深入探讨F11R在循环免疫细胞中的表达差异机制 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通讯新兴介质 特应性皮炎和银屑病皮肤样本中的树突状细胞和T细胞 数字病理学 自身免疫性皮肤病 空间转录组学, 单细胞RNA测序, CITE-seq NA 转录组数据, 空间数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
2442 2026-02-18
Muscularis Macrophage-Derived ApoE is Dispensable for Maintaining Gut Motility in Mice
2026-Feb, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在小鼠肠道运动调控中的作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了肌肉层巨噬细胞中ApoE的高表达及其在肠道操作后的上调,并利用骨髓嵌合体和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠模型,系统评估了ApoE在生理和应激条件下对肠道运动的影响 研究主要基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;且仅关注了ApoE在肌肉层巨噬细胞中的功能,未全面探讨其他细胞类型中ApoE的可能作用 探究肌肉层巨噬细胞来源的ApoE在维持肠道运动中的功能角色 小鼠(包括全局ApoE敲除小鼠、骨髓嵌合体小鼠和巨噬细胞特异性ApoE缺陷小鼠) NA 术后肠梗阻 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2443 2026-02-18
Isolation of Pericytes from Mouse Cortical Tissue Using FACS for Single-cell Sequencing
2026-Jan-30, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文建立了一种优化的、可重复的FACS方法,用于从小鼠皮层组织中分离周细胞,以进行单细胞RNA测序 在已建立的CD13/CD31分选策略基础上,引入了关键改进,特别是使用20% BSA溶液重悬细胞以减少应激和聚集,从而最大化细胞活力和RNA质量,专门针对scRNA-seq应用进行优化 该方法仅在小鼠模型(C57BL/6)中进行了验证,样本量较小(3只成年小鼠),且未在其他物种或疾病模型中广泛测试 研究周细胞的异质性,并阐明其在神经血管疾病中的机制,以单细胞分辨率进行 小鼠大脑皮层组织中的周细胞 单细胞测序 神经血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 3只成年C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2444 2026-02-18
Multimodal single-cell network analysis uncovers BSG/CD147 as an early biomarker and signaling hub in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-27, Research square
研究论文 本研究通过多模态单细胞网络分析,揭示了BSG/CD147作为肝细胞癌早期生物标志物和信号枢纽的作用 首次将单细胞RNA测序与高维加权基因共表达网络分析结合,识别出BSG/CD147作为早期肝细胞癌的关键枢纽基因,并验证其在小于2厘米病灶中的诊断价值 研究基于两个公开数据集,样本量有限;需要进一步在更大队列和前瞻性研究中验证BSG/CD147的临床实用性 识别肝细胞癌早期恶性转化的分子标志物,改善早期诊断 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 定量免疫荧光 高维加权基因共表达网络分析, CellChat, 伪时间分析 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 两个独立scRNA-seq数据集(GSE149614和GSE189903),包含非肿瘤和HCC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2445 2026-02-18
Intracerebral hemorrhage induces monocyte TNF signaling that is suppressed by Siponimod (BAF312): a single-cell transcriptomics study in patients
2026-Jan-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和血浆细胞因子分析,探讨了免疫调节药物BAF312(Siponimod)对脑出血患者外周血免疫反应的影响 首次在脑出血患者中应用单细胞转录组学分析BAF312对单核细胞TNF信号通路的抑制作用,并揭示了单核细胞在疾病亚急性期的复杂作用 研究样本量较小,且未评估BAF312对血浆细胞因子或趋化因子浓度的影响 研究脑出血后免疫反应及BAF312的免疫调节作用 脑出血患者的外周血样本 单细胞转录组学 脑出血 单细胞RNA测序,血浆细胞因子分析 NA 单细胞RNA测序数据,血浆细胞因子数据 脑出血患者的外周血样本,在出血后第1、3、7天采集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2446 2026-02-18
ICI-induced Granulomatous Sialadenitis is Responsive to Prednisone
2026-Jan-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文报告了首例免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎病例,并通过整合分析揭示了其发病机制及对皮质类固醇治疗的反应 首次报道免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎病例,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学进行整合分析 仅基于单个病例报告,且尽管治疗,广泛的纤维化持续存在 研究免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件(irAEs)的病理机制及治疗反应 一名患有BRAF-V600E突变乳头状甲状腺癌的中年男性患者 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 组织学图像,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 1例患者 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2447 2026-02-18
Distinct Endothelial Phenotype Associates with Macrophage-Enriched Microenvironments in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-23, Research square
研究论文 本研究探讨了三阴性乳腺癌中巨噬细胞富集微环境与血管状态之间的关联,揭示了巨噬细胞如何影响肿瘤血管正常化和免疫活性 首次通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞富集微环境中内皮细胞的炎症表型和静脉样状态,并验证其在人类TNBC中的保守性 研究主要基于小鼠模型和现有人类数据集,缺乏直接临床干预验证 探究巨噬细胞富集微环境对三阴性乳腺癌血管状态和免疫-血管协调动态的影响 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类单细胞数据集中的肿瘤内皮细胞与巨噬细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 基于已建立的小鼠TNBC模型和人类TNBC单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2448 2026-02-18
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的方法,利用反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络模型从多个2D空间转录组学切片重建3D空间结构,以克服现有方法在三维空间分析中的限制 Spa3D通过结合反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络,首次从多个2D SRT切片重建3D空间结构,提升了空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 NA 开发一种能够从二维空间转录组学数据重建三维空间结构的方法,以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 图卷积神经网络 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2449 2026-02-18
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signaling, in Aged Hippocampus
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了鼻内给予人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体对老年小鼠海马神经炎症的影响 首次证明hiPSC-NSC-EVs中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)能分别抑制NLRP3炎症小体和STING通路的激活,并通过单细胞RNA测序揭示了其对小胶质细胞转录组的广泛调控作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;治疗效果的长期持续性未知;特定miRNA的作用机制需进一步阐明 评估hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马神经炎症的抑制作用及其认知功能改善效果 18月龄的雄性和雌性C57BL6/J小鼠以及基因工程RAW细胞 神经科学 老年疾病 单细胞RNA测序,体外功能验证 动物模型(小鼠),细胞模型(RAW细胞) RNA测序数据,蛋白质表达数据,行为学数据 未明确具体数量,但涉及18月龄C57BL6/J小鼠的雄性和雌性个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2450 2026-02-18
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,揭示了小鼠脊髓的组织特性及其在神经性疼痛模型中的变化 首次应用空间分辨的单细胞转录组分析,系统描绘了成年小鼠脊髓的神经元亚型空间分布、性别差异及在神经性疼痛中的转录组变化 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;空间转录组技术分辨率可能受限于当前平台 解码脊髓在健康和疾病状态下的感觉与运动功能电路机制 成年小鼠脊髓组织 空间转录组学 神经性疼痛 空间分辨单细胞转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但基于成年小鼠脊髓 NA 空间转录组学 NA NA
2451 2026-02-18
Transcriptomic signature-guided depletion of intermediate alveolar epithelial cells ameliorates pulmonary fibrosis in mice
2026-Jan-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了肺纤维化中的中间上皮细胞状态,并开发了一种RNA感应依赖的蛋白质翻译技术,选择性靶向并耗竭这些细胞,从而在小鼠模型中减轻了肺纤维化 引入了RNA感应依赖的蛋白质翻译技术,能够选择性靶向并耗竭Krt8+肺泡分化中间细胞,首次证明了这些过渡性上皮细胞在肺纤维化中的致病驱动作用 研究主要基于小鼠模型,人类细胞的应用和临床转化仍需进一步验证 探究肺纤维化中中间上皮细胞的功能贡献,并开发靶向治疗策略 小鼠模型中的Krt8+肺泡分化中间细胞及人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序,RNA感应依赖的蛋白质翻译技术 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2452 2026-02-18
Multiomics analysis of polyamine metabolism in colorectal cancer, highlighting the key role of extracellular putrescine in impairing CXCR6+CD8+ T cell anti-tumor activity
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中多胺代谢,特别是细胞外腐胺,如何通过损害CXCR6+CD8+ T细胞的抗肿瘤活性来促进肿瘤进展 定义了新的“Pi值”来量化CXCR6+CD8+ T细胞周围的局部腐胺积累,并揭示了细胞外腐胺直接抑制这些T细胞毒性功能的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,其在人类患者中的直接临床转化仍需进一步验证 阐明腐胺代谢在结直肠癌肿瘤免疫监视受损中的作用机制 结直肠癌患者样本、结直肠癌细胞系(HCT-116和RKO)、CXCR6+CD8+ T细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 多组学分析 结直肠癌 单细胞RNA测序,多组学分析 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 来自131名受试者的221个样本,共计517,191个细胞;两个独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2453 2026-02-18
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2025-Dec-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过血浆蛋白质组学分析,发现TAOK3作为类风湿关节炎活动期骨破坏的潜在生物标志物和治疗靶点 首次将TAOK3与类风湿关节炎活动期的骨破坏关联,并验证其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 研究样本量有限,且主要在体外和动物模型中进行功能验证,需进一步临床验证 识别类风湿关节炎活动期骨破坏的新型生物标志物,为精准监测和靶向治疗提供策略 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞和胶原诱导关节炎小鼠模型 蛋白质组学 类风湿关节炎 数据非依赖性采集质谱、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定、多重免疫组织化学 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据 160名RA患者和40名健康对照的血浆样本,以及两个独立验证队列(N1=50,N2=10) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2454 2026-02-18
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2
研究论文 本研究评估了新型27基因面板Sig27及其衍生面板Sig27IMG在前列腺癌复发预测中的作用,并揭示了其与免疫抑制特征(特别是肿瘤相关单核/巨噬细胞和内皮细胞)的关联 开发了新型27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG,用于前列腺癌复发风险分层,并首次系统性地揭示了这些基因在多种癌症类型中与肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制功能的关联 研究主要基于回顾性RNA-seq数据集,需要前瞻性临床验证来确认其预测价值;样本量虽大但可能存在批次效应;未详细探讨这些基因在肿瘤微环境中的具体作用机制 开发并验证基因表达面板用于前列腺癌复发风险分层,并探究其与肿瘤免疫抑制特征的关联 前列腺癌患者肿瘤组织样本(包括原发性和转移性)以及多种癌症类型的肿瘤样本 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 基因表达面板(多基因特征) 基因表达数据(RNA-seq和scRNA-seq) 批量RNA-seq:3,133个肿瘤样本(13个数据集);单细胞RNA-seq:53名患者(6个数据集);多癌症类型验证:单细胞RNA-seq 386名患者(26种癌症类型),批量RNA-seq 5,672名患者(17种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2455 2026-02-18
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种多步骤基因工程小鼠模型,用于模拟葡萄膜黑色素瘤的进展,并揭示其表型可塑性 该模型首次结合了时空控制的GNAQ突变、BAP1缺失和MYC激活,成功模拟了人类葡萄膜黑色素瘤的进展和免疫微环境 模型可能无法完全捕捉人类疾病的所有复杂性,且单细胞测序样本量有限 研究葡萄膜黑色素瘤的生物学机制、驱动基因功能及免疫治疗策略 基因工程小鼠模型中的葡萄膜黑色素瘤肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 葡萄膜黑色素瘤 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 基因表达数据 未明确指定,但涉及小鼠模型中的肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2456 2026-02-18
Deconvolution and Phylogeny Inference of Diverse Variant Types Integrating Bulk DNA-seq with Single-cell RNA-seq
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为TUSV-int的方法,通过整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,进行去卷积和系统发育推断,以解决癌症克隆结构重建中的技术限制 TUSV-int首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,利用整数线性规划同时处理SNV、CNA和SV等多种变异类型,提高了克隆谱系树的分辨率 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性,且scDNA-seq的高成本和挑战性可能限制大规模队列应用,对结构变异和拷贝数变异的观测在RNA-seq中仍存在困难 开发一种整合多组学数据的方法,以改进癌症克隆谱系树的重建和突变历史解析 癌症基因组数据,包括bulk DNA-seq和scRNA-seq数据,专注于乳腺癌数据集 生物信息学 乳腺癌 bulk DNA-seq, scRNA-seq 整数线性规划 基因组序列数据,RNA序列数据 NA NA single-cell RNA-seq, bulk DNA-seq NA NA
2457 2026-02-18
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了囊性纤维化相关糖尿病(CFRD)中胰岛GLP-1受体表达降低及细胞特异性转录程序紊乱的机制 首次结合空间转录组学和免疫组化揭示CFRD中胰岛α/β细胞基因表达失调及GLP-1R蛋白表达特异性降低 样本量有限,未验证GLP-1R恢复是否能直接改善β细胞功能 阐明CFRD中胰岛素分泌受损的分子机制 人类胰腺组织(CFRD患者与非CF/非糖尿病对照) 空间转录组学 囊性纤维化相关糖尿病 免疫组化、空间转录组学、基因集富集分析 NA 组织切片图像、空间基因表达数据 人类CFRD与非CF/非糖尿病对照胰腺样本(未明确数量) NA 空间转录组学 NA NA
2458 2026-02-18
iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
2024-06-06, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为iIMPACT的多阶段统计方法,用于整合组织学图像和分子数据以改进空间转录组学分析 iIMPACT首次结合AI重建的组织学图像和基因表达空间背景来定义空间区域,并检测区域特异性差异表达基因,提升了准确性和可解释性 未在摘要中明确说明 克服现有空间转录组学聚类分析仅依赖分子信息而忽略形态特征的局限 空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 图像、基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2459 2026-02-17
Single-cell transcriptomics combined with spatial proteomics defines phagocytes type-specific immune regulation in diabetic cataract
2026-Apr, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究结合单细胞转录组学和空间蛋白质组学,定义了糖尿病性白内障中吞噬细胞类型特异性的免疫调节机制 首次在糖尿病性白内障中结合单细胞RNA测序和基于串联质量标签的定量蛋白质组学,系统揭示了单核吞噬细胞在疾病发展中的关键作用,并发现了MIF蛋白作为重要巨噬细胞趋化因子的上调 研究样本主要来自大鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的人类队列研究来验证结果;免疫细胞的具体功能机制仍需进一步探索 研究糖尿病性白内障中免疫细胞的特征及其潜在机制,以寻找潜在的治疗靶点 糖尿病大鼠的晶状体样本、糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 数字病理学 糖尿病性白内障 单细胞RNA测序,基于串联质量标签的定量蛋白质组学,免疫荧光染色,前节光学相干断层扫描 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,图像数据 糖尿病大鼠和正常大鼠的晶状体样本,糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 NA 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学 NA NA
2460 2026-02-17
The CD74-MIF axis contributes to acute uveitic injury by upregulating proinflammatory cytokine secretion in murine cytomegalovirus intracameral infection mouse models
2026-Apr, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过小鼠巨细胞病毒前房内感染模型,探讨了CD74-MIF轴在急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 首次在小鼠巨细胞病毒前房内感染模型中,通过单细胞测序揭示了CD74在C57BL/6小鼠眼内CD45免疫细胞中的显著上调,并证实CD74-MIF轴通过促进促炎细胞因子分泌驱动眼部炎症 研究主要基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证;体外实验使用原代外周血单个核细胞,可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究CD74-MIF轴在小鼠巨细胞病毒前房内感染诱导的急性葡萄膜炎损伤中的作用机制 C57BL/6和BALB/c小鼠,以及原代外周血单个核细胞 数字病理学 葡萄膜炎 单细胞测序,细胞因子检测,体外细胞培养 NA 测序数据,细胞计数数据,细胞因子浓度数据 C57BL/6和BALB/c小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部