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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2441 | 2025-11-27 |
Targeting FTL regulates ferroptosis and remodels lymph node metastasis microenvironment in esophageal squamous cell carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.112017
PMID:41281761
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现铁死亡在食管鳞癌淋巴结转移中的重要作用,并确定FTL为关键靶基因 | 首次揭示FTL通过NRF2通路促进食管鳞癌发展和转移,并通过NCOA4蛋白抑制铁死亡的新机制 | NA | 探究FTL在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 食管鳞癌患者组织样本和癌细胞 | 单细胞测序分析 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2442 | 2025-11-27 |
Prognostic value and immune infiltration of anoikis-related genes in osteosarcoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1669470
PMID:41282023
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后预测模型并分析免疫浸润特征 | 首次结合单细胞RNA测序和失巢凋亡相关基因构建骨肉瘤预后模型,并验证模型在免疫治疗预测中的价值 | NA | 开发骨肉瘤预后预测模型并探索其与免疫治疗的关系 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组化 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TARGET数据库数据集和两个验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2443 | 2025-11-27 |
KSRV: a Kernel PCA-Based framework for inferring spatial RNA velocity at single-cell resolution
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1695803
PMID:41282470
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研究论文 | 提出了一种基于核主成分分析的空间RNA速度推断计算框架KSRV | 首次将核主成分分析用于整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,实现单细胞分辨率的空间RNA速度推断 | 未提及方法在更复杂组织或疾病模型中的验证 | 开发计算框架以推断空间分辨组织中的RNA速度 | 小鼠大脑和小鼠器官发生过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 核主成分分析(Kernel PCA) | 基因表达数据,空间位置数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics,Vizgen | 空间转录组学,单分子荧光原位杂交 | 10x Visium,MERFISH | 10x Visium空间转录组平台,MERFISH单分子成像技术 |
| 2444 | 2025-11-27 |
Deciphering the role of Hat1 in spermatogenesis: Chromatin organization and beyond
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20240
PMID:41282984
|
研究论文 | 本研究通过多学科方法揭示了组蛋白乙酰转移酶Hat1在小鼠精子发生过程中的动态表达模式及其在染色质组织中的阶段特异性功能 | 首次系统阐明了Hat1在精子发生不同阶段的特异性表达定位及其在染色质组织中的动态功能转换 | 需要进一步的功能验证实验来确认Hat1的具体作用机制 | 探究Hat1在小鼠睾丸中的时空表达模式及其在精子发生过程中染色质组织的具体作用 | 小鼠睾丸组织及雄性生殖细胞 | 表观遗传学 | 男性不育 | RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光定位, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 3周龄和8周龄小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于单细胞测序数据集GSE214315 |
| 2445 | 2025-11-27 |
Single-Cell Multiomics Identifies Glycan Epitope LacNAc as a Potential Cell-Surface Effector Marker of Peripheral T Cells in Bladder Cancer Patients
2024-12-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00635
PMID:39582226
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术首次系统整合了膀胱癌患者外周血中单细胞转录组、T细胞受体谱和糖基化表位LacNAc分析 | 首次系统整合单细胞转录组、TCR谱和糖基化表位LacNAc分析,开发了不改变免疫细胞转录状态的单细胞糖组学多组学平台 | NA | 探索膀胱癌患者外周T细胞的糖基化表位标志物及其免疫功能 | 膀胱癌患者的外周血免疫细胞 | 单细胞多组学 | 膀胱癌 | 单细胞多组学,化学酶标记,DNA条形码 | NA | 单细胞转录组,T细胞受体谱,糖基化数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | 利用化学酶标记与DNA条形码的单细胞糖组学多组学平台 |
| 2446 | 2025-11-27 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 首次发现肝脓肿易感性是多基因性状并以性别依赖方式遗传,且与早期炎症反应强度相关 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证 | 探究E. coli肝脓肿形成的宿主遗传和免疫机制 | 小鼠肝脏组织和免疫细胞 | 空间生物学 | 肝脓肿 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠品系(包括C57BL/6N等) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2447 | 2025-11-27 |
Fasting-Mimicking Diet Drives Antitumor Immunity against Colorectal Cancer by Reducing IgA-Producing Cells
2023-11-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0323
PMID:37602826
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研究论文 | 本研究揭示模拟禁食饮食通过抑制IgA+B细胞激活抗肿瘤免疫从而抑制结直肠癌的机制 | 首次发现模拟禁食饮食通过促进脂肪酸氧化诱导RUNX3乙酰化,进而抑制IgA类型转换和CD8+T细胞抑制 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证有限 | 阐明模拟禁食饮食在结直肠癌中激活抗肿瘤免疫的具体分子机制 | 结直肠癌小鼠模型和患者样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2448 | 2025-11-27 |
Radiotherapy-Induced Neurocognitive Impairment Is Driven by Heightened Apoptotic Priming in Early Life and Prevented by Blocking BAX
2023-10-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1337
PMID:37470810
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了放疗引起神经认知损伤的年龄依赖性机制,并发现阻断BAX可预防此类损伤 | 首次发现幼年神经细胞存在更高的凋亡启动状态,并阐明BAX介导的凋亡通路是放疗神经毒性的关键机制 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究放疗引起年龄依赖性神经认知损伤的分子机制及防护策略 | 小鼠神经干细胞、祖细胞、神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统肿瘤 | 单细胞RNA测序,BH3分析,组织学分析 | 小鼠放疗模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 不同年龄阶段的小鼠神经细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2449 | 2025-11-27 |
Single-Cell Characterization of Pulmonary Nodules Implicates Suppression of Immunosurveillance across Early Stages of Lung Adenocarcinoma
2023-10-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0128
PMID:37477508
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早期肺腺癌肺结节的免疫特征,发现免疫监视在早期阶段即受到抑制 | 首次在早期肺腺癌谱系中系统揭示自然杀伤细胞和自然杀伤T细胞细胞毒性活性下降及调节性T细胞早期增加 | 样本来源仅限于手术切除的肺结节,未涵盖更广泛的早期病变类型 | 阐明早期肺肿瘤发生的免疫发病机制 | 手术切除的肺结节及相关正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 多个手术切除肺结节样本及相关正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2450 | 2025-11-27 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析肺腺癌患者样本,揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能异质性及其与CCR2+细胞毒性T细胞的相互作用 | 首次发现肺腺癌中肥大细胞的功能异质性及其通过CCL2-CCR2轴招募细胞毒性T细胞的机制 | 肥大细胞浸润与化疗后生存改善无关联,且样本来源仅限于肺腺癌患者 | 探究肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的调控机制和功能作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肺腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2451 | 2025-11-27 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 本研究揭示Chi3l1通过调控胶质瘤干细胞状态促进胶质母细胞瘤生长的分子机制 | 首次发现Chi3l1通过CD44受体诱导Akt/β-catenin信号通路和MAZ转录活性,形成促进间质表型的正向反馈环路 | NA | 探究Chi3l1在胶质母细胞瘤干细胞状态调控中的作用及其治疗潜力 | 患者来源的胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA velocity | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 2452 | 2025-11-27 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步切除的结直肠癌原发灶和肝转移灶,揭示了肿瘤内部和病灶间的异质性及驱动不同表型的转录组程序 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移同步切除术后预后的实际应用价值,并探究驱动疾病进展的功能生物学机制 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 组织学评估、基因组panel分析、bulk转录组、免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织样本、转录组数据、空间转录组数据 | 接受同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析 |
| 2453 | 2025-11-27 |
Phagocytosis of Glioma Cells Enhances the Immunosuppressive Phenotype of Bone Marrow-Derived Macrophages
2023-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1570
PMID:36622331
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中表达巨噬细胞和肿瘤特征的双阳性TAMs亚群,并证明其通过吞噬胶质瘤细胞获得免疫抑制表型 | 首次鉴定出胶质母细胞瘤中表达双标记的TAMs亚群,并证明BMDMs通过吞噬胶质瘤细胞转化为免疫抑制表型的机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据分析,需要进一步体内验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞如何转化为免疫抑制表型及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤组织、骨髓来源巨噬细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | 胶质母细胞瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 2454 | 2025-11-27 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
|
研究论文 | 本文介绍了IMMUcan scDB数据库的开发与应用,这是一个专门用于人类癌症单细胞RNA测序数据的集成数据库 | 开发了首个专门针对人类癌症的单细胞RNA测序数据库,包含144个数据集和56种癌症类型,提供详细的临床、技术和生物学注释 | 数据库主要基于已发表研究,可能受原始数据质量和研究异质性的限制 | 通过整合和分析多个人类癌症单细胞RNA测序数据集,促进肿瘤微环境的研究 | 人类癌症单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 细胞本体分类器 | 单细胞RNA测序数据 | 144个数据集,涵盖56种不同癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2455 | 2025-11-27 |
Liver Colonization by Colorectal Cancer Metastases Requires YAP-Controlled Plasticity at the Micrometastatic Stage
2022-05-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0933
PMID:35570706
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌肝转移过程中YAP控制的细胞可塑性在微转移阶段的关键作用 | 发现微转移灶缺乏癌症干细胞,而明显转移灶通过多细胞阶段的细胞可塑性重新产生癌症干细胞 | NA | 研究结直肠癌肝转移的分子机制和细胞动态变化 | 结直肠癌患者肝标本、小鼠肝脏转移模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 活体显微镜、单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2456 | 2025-11-26 |
Fibroblastic FLT3L supports lymph node dendritic cells in the interfollicular niche
2025-Dec, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02332-2
PMID:41249485
|
研究论文 | 本研究揭示了表达Gremlin1的淋巴结成纤维网状细胞通过提供FLT3L支持树突状细胞稳态的机制 | 首次发现GREM1+成纤维网状细胞是淋巴结中提供FLT3L支持树突状细胞稳态的特定生态位 | NA | 探索淋巴结中维持树突状细胞稳态的特定生态位和机制 | 人和小鼠淋巴结中的树突状细胞和成纤维网状细胞 | 细胞生物学 | NA | 空间转录组学,细胞流式分析,遗传模型 | NA | 基因表达数据,细胞定位数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2457 | 2025-11-26 |
Macrophage Cell and Diagnostic Biomarkers in BLCA: Integrating Machine Learning With Single-Cell Analysis
2025-Dec, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102447
PMID:41139554
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析和机器学习方法,识别膀胱癌中巨噬细胞亚型并构建预后预测模型 | 首次系统识别膀胱癌中9种巨噬细胞亚型,并基于7个巨噬细胞相关基因构建预后模型 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 探索膀胱癌中巨噬细胞异质性并开发诊断生物标志物 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、膀胱癌细胞和尿路上皮来源细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 伪时间分析, 细胞间通讯分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO回归, 随机森林 | 单细胞测序数据, 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2458 | 2025-11-26 |
Construction of a deep learning model and identification of BSG, PPARD, and SLC16A8 expression as potential indicators in the context of strategies for precision therapy to acute myeloid leukemia
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2592516
PMID:41284982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病肿瘤微环境中T细胞的异质性,构建了基于BSG、PPARD和SLC16A8基因的预后风险模型 | 首次在AML中基于特定T细胞亚群(Cluster 4)构建深度学习预后模型,并鉴定BSG、PPARD和SLC16A8作为独立预后标志物 | 研究依赖于外部数据集进行验证,需要进一步实验验证基因功能机制 | 探索AML肿瘤微环境中T细胞异质性,寻找精准治疗的生物标志物 | 急性髓系白血病患者的T细胞亚群 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | AML患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2459 | 2025-11-26 |
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152841
PMID:41205579
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 首次系统鉴定胃癌腹膜转移中CAF亚群的异质性,发现MFAP5+ CAFs作为终末促转移亚群的特异性富集 | NA | 探究胃癌腹膜转移的基质微环境驱动机制 | 配对的原发性胃癌和腹膜转移组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组化, 传统免疫组化 | NA | RNA测序数据, 免疫组化图像 | 配对的胃癌原发和转移组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2460 | 2025-11-26 |
Dexamethasone-induced immunosuppression in Pneumocystis pneumonia reprograms neutrophil metabolism and impairs antimicrobial function
2025-Nov-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152889
PMID:41205576
|
研究论文 | 本研究揭示了地塞米松在肺孢子菌肺炎中通过重编程中性粒细胞代谢状态损害其抗菌功能的机制 | 首次发现地塞米松诱导的免疫抑制通过特异性抑制脂肪酸氧化代谢通路损害中性粒细胞功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究地塞米松在肺孢子菌肺炎中改变肺部免疫的免疫学和代谢机制 | 地塞米松处理的免疫缺陷小鼠肺组织中的中性粒细胞 | 免疫代谢学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,批量RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 对照和地塞米松处理的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |