单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28094 篇文献，本页显示第 24561 - 24580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24561 | 2024-08-09 |
Single cell eQTL analysis identifies cell type-specific genetic control of gene expression in fibroblasts and reprogrammed induced pluripotent stem cells
2021-03-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02293-3
PMID:33673841
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和群体遗传学，研究了遗传变异对不同细胞亚型基因表达的影响 | 首次在单细胞水平上评估了遗传变异对重编程细胞系基因表达的影响，并揭示了细胞类型特异性的表达数量性状位点（eQTLs） | NA | 研究遗传变异如何影响不同细胞亚型的基因表达 | 纤维母细胞和重编程诱导的多能干细胞 | 群体遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 64,018个纤维母细胞来自79个供体，19,967个重编程诱导的多能干细胞来自31个重编程供体线 |
| 24562 | 2024-08-09 |
Deciphering the state of immune silence in fatal COVID-19 patients
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21702-6
PMID:33674591
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序分析血液样本和支气管肺泡灌洗液与临床、免疫学和体外功能数据，揭示了与COVID-19严重程度相关的免疫特征 | 首次揭示了COVID-19患者中由髓系细胞驱动的免疫抑制现象，并强调了单核细胞中精氨酸酶-1表达的免疫调节特征 | NA | 解析致命性COVID-19患者中的免疫沉默状态 | COVID-19患者的免疫特征和临床结果 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 血液样本和支气管肺泡灌洗液 |
| 24563 | 2024-08-09 |
Identifying transposable element expression dynamics and heterogeneity during development at the single-cell level with a processing pipeline scTE
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21808-x
PMID:33674594
|
research paper | 本文开发了一种名为scTE的单细胞转座子处理流程，用于研究不同生物背景下单细胞中转座子的表达情况 | 首次开发了针对单细胞转座子表达分析的scTE处理流程，并展示了其在多种生物过程中的应用 | NA | 研究转座子在单细胞水平上的表达动态及其对细胞异质性的贡献 | 转座子在单细胞中的表达及其在细胞异质性和生物过程中的作用 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell ATAC-seq data | 涉及多种生物背景下的单细胞样本 |
| 24564 | 2024-08-09 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文展示了“人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析”（Ranzoni等人，2021年）的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示同行评审过程 | 人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | RNA-Seq和ATAC-Seq数据 | NA |
| 24565 | 2024-08-09 |
An Outline of the Outset of Thrombopoiesis in Human Embryos At Last
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.007
PMID:33667354
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人卵黄囊和胎肝，追踪了巨核细胞分化的两条替代途径 | 揭示了巨核细胞具有止血和造血干细胞支持功能，并发现人胚胎干细胞衍生的血小板反应蛋白1阳性内皮细胞能在体外产生巨核细胞 | NA | 探究人类胚胎中血栓形成过程的起点 | 人卵黄囊和胎肝中的巨核细胞分化 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24566 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: one step closer to the clinic
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01276-y
PMID:33664491
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24567 | 2024-08-09 |
A multiscale model via single-cell transcriptomics reveals robust patterning mechanisms during early mammalian embryo development
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008571
PMID:33684098
|
研究论文 | 本文构建了一个多尺度的三维模型，用于重现从受精卵到晚期囊胚的哺乳动物胚胎发育过程，并探讨了形成Epi/PE层的两个关键过程 | 本文通过整合多个单细胞转录组数据集的时空信息，提出了一种选择性的细胞间粘附机制和细胞信号的时间衰减机制 | NA | 研究早期哺乳动物胚胎发育中形成Epi/PE层的稳健模式机制 | 哺乳动物胚胎的早期发育过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
| 24568 | 2024-08-09 |
Spatial profiling technologies and applications for brain cancers
2021-Mar, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2021.1900735
PMID:33685321
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在脑癌研究中的应用 | 介绍了下一代成像和多组学技术如何为精细表征脑肿瘤组织生物学提供工具 | NA | 旨在提高对脑肿瘤微环境细胞组成的理解，并探索有效的治疗策略 | 脑癌及其微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学 | NA | 蛋白质/mRNA | NA |
| 24569 | 2024-08-09 |
Transcriptional bursts explain autosomal random monoallelic expression and affect allelic imbalance
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008772
PMID:33690599
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研究论文 | 本文研究了转录爆发如何解释单细胞RNA测序数据中观察到的等位基因表达模式，包括常染色体单等位基因表达的频繁现象 | 本文首次通过转录爆发模型解释了单细胞中等位基因表达的模式，并揭示了爆发频率对单等位基因表达比例的影响 | 文章未提及具体的局限性 | 探究转录爆发对单细胞中等位基因表达模式的影响 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 转录爆发模型 | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 24570 | 2024-08-09 |
The T Cell Repertoires from Nickel Sensitized Joint Implant Failure Patients
2021-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052428
PMID:33670995
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术分析了镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | 本研究首次详细描述了镍敏感导致的关节植入失败患者中镍特异性T细胞库的Vα和Vβ使用情况，并发现与接触性皮炎研究中的使用情况有所不同 | 研究样本仅来自两名患者，可能不足以代表所有镍敏感导致的关节植入失败患者的情况 | 旨在阐明镍过敏导致关节植入失败的机制 | 镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | NA | NA | 单细胞VDJ测序 | NA | T细胞受体序列 | 两名患者 |
| 24571 | 2024-08-09 |
Time-Resolved scRNA-Seq Tracks the Adaptation of a Sensitive MCL Cell Line to Ibrutinib Treatment
2021-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052276
PMID:33668876
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研究论文 | 本研究使用时间分辨的单细胞RNA测序技术，追踪了敏感的套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系对伊布替尼治疗的适应过程 | 揭示了五个亚群及其对治疗的个体反应，并发现了B细胞受体信号通路的激活、与微环境的相互作用、代谢重编程等与伊布替尼耐药相关的机制 | NA | 旨在解析敏感的套细胞淋巴瘤细胞系对伊布替尼治疗的反应 | 套细胞淋巴瘤（MCL）细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的单细胞 |
| 24572 | 2024-08-09 |
Ex uno, plures-From One Tissue to Many Cells: A Review of Single-Cell Transcriptomics in Cardiovascular Biology
2021-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22042071
PMID:33669808
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在心血管生物学中的应用，探讨了其在心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤中的作用 | 单细胞分析提供了比传统整体方法更精确的组织组成、细胞分化轨迹和细胞间通讯的定义 | NA | 旨在回顾单细胞多组学研究如何改变我们对心脏发育及健康与疾病状态下成年心肌细胞动力学的理解 | 心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 24573 | 2024-08-09 |
Guide Cells Support Muscle Regeneration and Affect Neuro-Muscular Junction Organization
2021-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22041939
PMID:33669272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别并分离了一类能够促进肌源性分化的血管相关细胞亚群，称为'引导'细胞，并研究了它们在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的影响。 | 首次识别并分离出能够促进肌源性分化的'引导'细胞，并探讨了其在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的作用。 | 需要进一步研究这些细胞的起源及其在再生肌纤维终末分化中的必要性。 | 研究肌肉再生过程中神经肌肉接头的形成机制。 | 肌肉再生过程中的'引导'细胞及其对神经肌肉接头形成的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在小鼠急性肌肉损伤和再生模型中进行了实验。 |
| 24574 | 2024-08-09 |
Case Report: Transformation From Cold to Hot Tumor in a Case of NSCLC Neoadjuvant Immunochemotherapy Pseudoprogression
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.633534
PMID:33679783
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病例报告 | 本文报告了一例非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫化疗后，从冷肿瘤转变为热肿瘤的病例 | 首次报道了通过手术病理、单细胞RNA测序和成像质谱流式技术证实的新辅助免疫化疗假进展病例 | NA | 探讨新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的变化 | 一例56岁男性非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、成像质谱流式技术 | NA | RNA序列、图像 | 单个病例 |
| 24575 | 2024-08-09 |
SSRP1 Is a Prognostic Biomarker Correlated with CD8+ T Cell Infiltration in Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9409836
PMID:33688504
|
研究论文 | 研究探讨了结构特异性识别蛋白1（SSRP1）在肝细胞癌（HCC）中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 发现SSRP1与CD8+ T细胞浸润水平呈正相关，尤其是在耗竭的CD8+ T细胞中，这为HCC的免疫治疗提供了新的见解 | NA | 探索SSRP1在HCC中的作用及其作为预后标志物的潜力 | SSRP1在HCC中的表达及其与临床特征和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NA | NA | 基因表达数据 | 使用多个数据库（HCCDB, Oncomine, HPA等）进行分析 |
| 24576 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing With Combined Use of Bulk RNA Sequencing to Reveal Cell Heterogeneity and Molecular Changes at Acute Stage of Ischemic Stroke in Mouse Cortex Penumbra Area
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.624711
PMID:33692998
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序结合批量RNA测序技术，探讨了小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域在急性期的细胞异质性和分子变化 | 本研究首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，揭示了缺血性卒中急性期半暗带区域的细胞异质性和分子变化，为早期治疗提供了潜在靶点 | NA | 研究缺血性卒中急性期半暗带区域的细胞异质性和分子变化，寻找早期治疗靶点 | 小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域的细胞和分子变化 | 数字病理学 | 卒中 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA | 小鼠大脑皮质缺血性卒中半暗带区域的细胞样本 |
| 24577 | 2024-08-09 |
Inter and intra-tumoral heterogeneity as a platform for personalized therapies in medulloblastoma
2021-12, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2021.107828
PMID:33662447
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综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性，并探讨了这些异质性如何为个性化治疗提供平台 | 讨论了基于特定分子缺陷的新型疗法的潜力，以及单细胞测序方法的应用前景 | 当前方法在罕见疾病应用中的局限性 | 探讨髓母细胞瘤的异质性及其对个性化治疗的影响 | 髓母细胞瘤的肿瘤间和肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 儿童常见恶性CNS肿瘤 | 下一代测序（NGS）、单细胞测序 | NA | 组织样本 | 每年美国约350名患者 |
| 24578 | 2024-08-09 |
BET proteolysis targeted chimera-based therapy of novel models of Richter Transformation-diffuse large B-cell lymphoma
2021-09, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01181-w
PMID:33654205
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研究论文 | 本文报道了三种新建立的患者源性异种移植（PDX）模型中RT-DLBCL的遗传改变、染色质可及性、活性增强子、基因表达及抗淋巴瘤药物敏感性的特征 | 首次使用CRISPR敲除IRF4并结合BET抑制剂和BET-PROTAC与ibrutinib或venetoclax的联合治疗，显著减少了淋巴瘤负担并提高了免疫缺陷小鼠的生存率 | NA | 开发针对Richter Transformation-diffuse large B-cell lymphoma的新疗法 | RT-DLBCL的遗传特征及药物敏感性 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种患者源性异种移植模型 |
| 24579 | 2024-08-09 |
Anatomy, Endocrine Regulation, and Embryonic Development of the Rete Testis
2021-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab046
PMID:33661305
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综述 | 本文综述了哺乳动物睾丸网（rete testis）的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育，重点探讨了其分子调控机制的最新发现 | 利用现代分子方法如全局RNA测序揭示了睾丸网细胞前体的转录特征，指出其与Sertoli细胞至少有部分共同起源 | 睾丸网发育的胚胎起源和分子调控机制仍了解不足，缺乏独特的分子标记 | 旨在填补对睾丸网发育分子调控机制的知识空白，并确定未来研究方向 | 睾丸网的解剖结构、内分泌调控及其胚胎发育 | NA | NA | 全局RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24580 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: An overview for the ophthalmologist
2021-May-19, Seminars in ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.1080/08820538.2021.1889615
PMID:33635751
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review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNAseq）技术在眼科领域的应用及其对疾病分子机制理解的重要性 | scRNAseq技术相较于传统的混合RNA分析，能够识别组织中细胞的组成和异质性，为新发现提供了新的机会 | NA | 探讨scRNAseq技术在眼科疾病研究中的应用及其对疾病病理生理机制理解的影响 | 眼科疾病相关的病理组织 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | RNA | 数千个细胞 |