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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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24561 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals β cell maturation in stem cell-derived islets after transplantation
2021-Mar-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108850
PMID:33691098
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
24562 | 2024-08-09 |
Multiple sclerosis risk gene Mertk is required for microglial activation and subsequent remyelination
2021-03-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108835
PMID:33691116
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研究论文 | 本文研究了多发性硬化症风险基因Mertk在微胶质细胞激活及随后的髓鞘再生中的作用 | 首次证明了Mertk基因在髓鞘再生中的关键作用,并揭示了其在微胶质细胞激活、吞噬和迁移中的具体机制 | NA | 探讨Mertk基因在多发性硬化症髓鞘再生中的作用及其机制 | Mertk基因敲除小鼠与野生型小鼠在髓鞘再生过程中的差异 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Mertk基因敲除小鼠与野生型小鼠 |
24563 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis of eutopic endometrium and ectopic lesions of adenomyosis
2021-Mar-08, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00562-z
PMID:33685511
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了异位子宫内膜和腺肌症异位病变的基因表达模式变化,并探讨了腺肌症潜在的新发病机制 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了腺肌症异位病变与正常子宫内膜之间基因表达模式的差异,并发现了具有肿瘤样特征的高拷贝数变异细胞亚群 | 研究样本量较小,仅包括一个对照组和一个腺肌症患者样本,可能影响结果的普遍性和可靠性 | 揭示腺肌症的精确发病机制,并探索潜在的治疗策略 | 异位子宫内膜和腺肌症异位病变的细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1个对照组样本,1个腺肌症患者样本,3个平滑肌瘤样本,3个腺肌症样本 |
24564 | 2024-08-09 |
Immune cell profiling of the cerebrospinal fluid enables the characterization of the brain metastasis microenvironment
2021-03-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21789-x
PMID:33686071
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合T细胞受体基因分型,研究了脑转移瘤和匹配的脑脊液中的免疫细胞特征 | 首次通过分析脑脊液中的免疫细胞,提供了一种非侵入性的方法来预测免疫检查点抑制剂的反应,并识别脑转移瘤中的T细胞受体克隆型 | NA | 研究脑转移瘤微环境中的免疫细胞特征,并探索预测免疫检查点抑制剂反应的新方法 | 脑转移瘤和脑脊液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
24565 | 2024-08-09 |
Dynamic blood single-cell immune responses in patients with COVID-19
2021-03-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00526-2
PMID:33677468
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研究论文 | 研究通过单细胞分辨率下的5'基因表达、T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)V(D)J转录组分析,探讨了COVID-19患者在不同阶段血液免疫反应的动态变化。 | 本研究首次详细描述了COVID-19患者血液中免疫细胞的动态变化,并揭示了特定免疫反应对SARS-CoV-2抗原的作用。 | 研究样本量相对较小,可能需要更大规模的研究来验证这些发现。 | 揭示SARS-CoV-2感染后人体血液免疫反应的动态变化,为治疗COVID-19提供潜在的治疗线索。 | COVID-19患者的血液免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 341,420个外周血单个核细胞(PBMCs),185,430个克隆型T细胞和28,802个克隆型B细胞,来自16名COVID-19患者的25个样本。 |
24566 | 2024-08-09 |
Single cell eQTL analysis identifies cell type-specific genetic control of gene expression in fibroblasts and reprogrammed induced pluripotent stem cells
2021-03-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02293-3
PMID:33673841
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和群体遗传学,研究了遗传变异对不同细胞亚型基因表达的影响 | 首次在单细胞水平上评估了遗传变异对重编程细胞系基因表达的影响,并揭示了细胞类型特异性的表达数量性状位点(eQTLs) | NA | 研究遗传变异如何影响不同细胞亚型的基因表达 | 纤维母细胞和重编程诱导的多能干细胞 | 群体遗传学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 64,018个纤维母细胞来自79个供体,19,967个重编程诱导的多能干细胞来自31个重编程供体线 |
24567 | 2024-08-09 |
Deciphering the state of immune silence in fatal COVID-19 patients
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21702-6
PMID:33674591
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研究论文 | 研究通过整合单细胞RNA测序分析血液样本和支气管肺泡灌洗液与临床、免疫学和体外功能数据,揭示了与COVID-19严重程度相关的免疫特征 | 首次揭示了COVID-19患者中由髓系细胞驱动的免疫抑制现象,并强调了单核细胞中精氨酸酶-1表达的免疫调节特征 | NA | 解析致命性COVID-19患者中的免疫沉默状态 | COVID-19患者的免疫特征和临床结果 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 血液样本和支气管肺泡灌洗液 |
24568 | 2024-08-09 |
Identifying transposable element expression dynamics and heterogeneity during development at the single-cell level with a processing pipeline scTE
2021-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21808-x
PMID:33674594
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research paper | 本文开发了一种名为scTE的单细胞转座子处理流程,用于研究不同生物背景下单细胞中转座子的表达情况 | 首次开发了针对单细胞转座子表达分析的scTE处理流程,并展示了其在多种生物过程中的应用 | NA | 研究转座子在单细胞水平上的表达动态及其对细胞异质性的贡献 | 转座子在单细胞中的表达及其在细胞异质性和生物过程中的作用 | NA | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell ATAC-seq data | 涉及多种生物背景下的单细胞样本 |
24569 | 2024-08-09 |
Evaluation of Ranzoni et al.: Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Human Developmental Hematopoiesis
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.020
PMID:33667351
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评论 | 本文展示了“人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析”(Ranzoni等人,2021年)的同行评审过程示例 | NA | NA | 展示同行评审过程 | 人类发育性造血的综合单细胞RNA测序和ATAC测序分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | RNA-Seq和ATAC-Seq数据 | NA |
24570 | 2024-08-09 |
An Outline of the Outset of Thrombopoiesis in Human Embryos At Last
2021-03-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.007
PMID:33667354
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人卵黄囊和胎肝,追踪了巨核细胞分化的两条替代途径 | 揭示了巨核细胞具有止血和造血干细胞支持功能,并发现人胚胎干细胞衍生的血小板反应蛋白1阳性内皮细胞能在体外产生巨核细胞 | NA | 探究人类胚胎中血栓形成过程的起点 | 人卵黄囊和胎肝中的巨核细胞分化 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
24571 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: one step closer to the clinic
2021-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01276-y
PMID:33664491
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
24572 | 2024-08-09 |
A multiscale model via single-cell transcriptomics reveals robust patterning mechanisms during early mammalian embryo development
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008571
PMID:33684098
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研究论文 | 本文构建了一个多尺度的三维模型,用于重现从受精卵到晚期囊胚的哺乳动物胚胎发育过程,并探讨了形成Epi/PE层的两个关键过程 | 本文通过整合多个单细胞转录组数据集的时空信息,提出了一种选择性的细胞间粘附机制和细胞信号的时间衰减机制 | NA | 研究早期哺乳动物胚胎发育中形成Epi/PE层的稳健模式机制 | 哺乳动物胚胎的早期发育过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 三维模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
24573 | 2024-08-09 |
Spatial profiling technologies and applications for brain cancers
2021-Mar, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2021.1900735
PMID:33685321
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在脑癌研究中的应用 | 介绍了下一代成像和多组学技术如何为精细表征脑肿瘤组织生物学提供工具 | NA | 旨在提高对脑肿瘤微环境细胞组成的理解,并探索有效的治疗策略 | 脑癌及其微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学 | NA | 蛋白质/mRNA | NA |
24574 | 2024-08-09 |
Transcriptional bursts explain autosomal random monoallelic expression and affect allelic imbalance
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008772
PMID:33690599
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研究论文 | 本文研究了转录爆发如何解释单细胞RNA测序数据中观察到的等位基因表达模式,包括常染色体单等位基因表达的频繁现象 | 本文首次通过转录爆发模型解释了单细胞中等位基因表达的模式,并揭示了爆发频率对单等位基因表达比例的影响 | 文章未提及具体的局限性 | 探究转录爆发对单细胞中等位基因表达模式的影响 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 转录爆发模型 | RNA | 未具体说明样本数量 |
24575 | 2024-08-09 |
The T Cell Repertoires from Nickel Sensitized Joint Implant Failure Patients
2021-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052428
PMID:33670995
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研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术分析了镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | 本研究首次详细描述了镍敏感导致的关节植入失败患者中镍特异性T细胞库的Vα和Vβ使用情况,并发现与接触性皮炎研究中的使用情况有所不同 | 研究样本仅来自两名患者,可能不足以代表所有镍敏感导致的关节植入失败患者的情况 | 旨在阐明镍过敏导致关节植入失败的机制 | 镍敏感导致的关节植入失败患者的外周血中镍反应性T细胞库 | NA | NA | 单细胞VDJ测序 | NA | T细胞受体序列 | 两名患者 |
24576 | 2024-08-09 |
Time-Resolved scRNA-Seq Tracks the Adaptation of a Sensitive MCL Cell Line to Ibrutinib Treatment
2021-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052276
PMID:33668876
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研究论文 | 本研究使用时间分辨的单细胞RNA测序技术,追踪了敏感的套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系对伊布替尼治疗的适应过程 | 揭示了五个亚群及其对治疗的个体反应,并发现了B细胞受体信号通路的激活、与微环境的相互作用、代谢重编程等与伊布替尼耐药相关的机制 | NA | 旨在解析敏感的套细胞淋巴瘤细胞系对伊布替尼治疗的反应 | 套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的单细胞 |
24577 | 2024-08-09 |
Ex uno, plures-From One Tissue to Many Cells: A Review of Single-Cell Transcriptomics in Cardiovascular Biology
2021-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22042071
PMID:33669808
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在心血管生物学中的应用,探讨了其在心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤中的作用 | 单细胞分析提供了比传统整体方法更精确的组织组成、细胞分化轨迹和细胞间通讯的定义 | NA | 旨在回顾单细胞多组学研究如何改变我们对心脏发育及健康与疾病状态下成年心肌细胞动力学的理解 | 心脏发育、心肌稳态及心血管系统应激与损伤 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
24578 | 2024-08-09 |
Guide Cells Support Muscle Regeneration and Affect Neuro-Muscular Junction Organization
2021-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22041939
PMID:33669272
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别并分离了一类能够促进肌源性分化的血管相关细胞亚群,称为'引导'细胞,并研究了它们在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的影响。 | 首次识别并分离出能够促进肌源性分化的'引导'细胞,并探讨了其在肌肉再生中对神经肌肉接头形成的作用。 | 需要进一步研究这些细胞的起源及其在再生肌纤维终末分化中的必要性。 | 研究肌肉再生过程中神经肌肉接头的形成机制。 | 肌肉再生过程中的'引导'细胞及其对神经肌肉接头形成的影响。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 在小鼠急性肌肉损伤和再生模型中进行了实验。 |
24579 | 2024-08-09 |
Case Report: Transformation From Cold to Hot Tumor in a Case of NSCLC Neoadjuvant Immunochemotherapy Pseudoprogression
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.633534
PMID:33679783
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病例报告 | 本文报告了一例非小细胞肺癌患者在接受新辅助免疫化疗后,从冷肿瘤转变为热肿瘤的病例 | 首次报道了通过手术病理、单细胞RNA测序和成像质谱流式技术证实的新辅助免疫化疗假进展病例 | NA | 探讨新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的变化 | 一例56岁男性非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、成像质谱流式技术 | NA | RNA序列、图像 | 单个病例 |
24580 | 2024-08-09 |
SSRP1 Is a Prognostic Biomarker Correlated with CD8+ T Cell Infiltration in Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9409836
PMID:33688504
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研究论文 | 研究探讨了结构特异性识别蛋白1(SSRP1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 发现SSRP1与CD8+ T细胞浸润水平呈正相关,尤其是在耗竭的CD8+ T细胞中,这为HCC的免疫治疗提供了新的见解 | NA | 探索SSRP1在HCC中的作用及其作为预后标志物的潜力 | SSRP1在HCC中的表达及其与临床特征和免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | NA | NA | 基因表达数据 | 使用多个数据库(HCCDB, Oncomine, HPA等)进行分析 |