单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24561 2024-08-09
Combined BRAF, MEK, and CDK4/6 Inhibition Depletes Intratumoral Immune-Potentiating Myeloid Populations in Melanoma
2021-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文通过同源黑色素瘤模型研究了BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对肿瘤内免疫增强骨髓细胞的影响 首次探讨了BRAF、MEK和CDK4/6三联疗法对黑色素瘤患者抗肿瘤免疫的影响 研究仅限于同源黑色素瘤模型,需要进一步的临床试验验证 探讨BRAF、MEK和CDK4/6联合抑制对黑色素瘤抗肿瘤免疫的影响 黑色素瘤中的免疫增强骨髓细胞 NA 黑色素瘤 流式细胞术和单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
24562 2024-08-09
ScGSLC: An unsupervised graph similarity learning framework for single-cell RNA-seq data clustering
2021-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出了一种基于图相似学习的单细胞RNA测序数据聚类框架ScGSLC 将单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络整合到图中,并利用图卷积网络进行图嵌入和细胞聚类 NA 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 图卷积网络 图数据 九个公共数据集
24563 2024-08-09
Dissecting the human kidney allograft transcriptome: single-cell RNA sequencing
2021-02-01, Current opinion in organ transplantation IF:1.8Q3
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 scRNA-seq技术使得能够研究单个细胞的转录组,并评估细胞群体中的转录差异和相似性 传统的RNA测序无法提供关于个体细胞类型和细胞状态的信息 深入理解scRNA-seq技术,并总结其在人类肾脏同种异体移植转录组研究中的应用 人类肾脏同种异体移植组织 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
24564 2024-08-09
A road map from single-cell transcriptome to patient classification for the immune response to trauma
2021-01-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了创伤后小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞,揭示了创伤诱导的免疫反应及其对患者分类的影响 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了创伤后免疫反应的细胞层面变化,并据此定义了两种创伤患者亚型 研究主要集中在小鼠模型和创伤患者,未来研究需要扩展到其他类型的炎症疾病和危重病患 解析创伤后的免疫反应,并基于此进行患者分类 创伤后的小鼠和创伤患者的循环及骨髓单核细胞 数字病理学 创伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及受伤小鼠和创伤患者的循环单核细胞
24565 2024-08-09
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文介绍了一种高吞吐量、无标记的方法,用于在纳升液滴中检测未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞密度 该方法利用纳升液滴中散射光的快速测量,实现了对细菌增殖的可靠检测,无需基因改造或添加化学代谢标记 NA 开发一种高吞吐量、无标记的细菌检测方法,以促进微流控液滴技术在分析微生物学中的广泛应用 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 分析生物学 NA 微流控液滴技术 NA 散射光信号 NA
24566 2024-08-09
A microfluidics-based stem cell model of early post-implantation human development
2021-01, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文详细介绍了设计和实现一种基于微流控技术的设备,用于模拟人类胚胎植入后早期发育过程 该研究开发了一种微流控设备,能够模拟人类胚胎植入后早期的分子和细胞特征,这在技术上是一个创新 NA 研究目的是为不孕症和毒理学研究提供一个合适的人类胚胎发育模型 研究对象是人类多能干细胞(hPSCs)及其在微流控设备中的发育过程 生物技术 不孕症 微流控技术 微流控人类胚胎模型 细胞 使用人类多能干细胞(hPSCs)进行实验
24567 2024-08-09
Plant stem-cell organization and differentiation at single-cell resolution
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)对玉米茎尖干细胞微环境及其分化后代进行了无偏差的转录组景观分析 发现玉米茎尖干细胞并不存在传统的干细胞组织中心,并且通过轨迹推断揭示了基因表达变化伴随细胞分化的过程 NA 研究植物干细胞的组织和分化 玉米茎尖干细胞及其分化细胞 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 具体样本数量未提及
24568 2024-08-09
Human embryonic stem cell-derived organoid retinoblastoma reveals a cancerous origin
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究开发了一种基于遗传工程人胚胎干细胞(hESCs)衍生的视网膜类器官的视网膜母细胞瘤(Rb)模型,揭示了Rb的癌变起源 首次在视网膜类器官中建立了Rb的癌变模型,并通过单细胞测序和免疫染色验证了Rb起源于ARR3阳性成熟锥体前体细胞 NA 建立视网膜母细胞瘤的类器官模型,探索其细胞起源并测试新的候选治疗药物 视网膜母细胞瘤的细胞起源和治疗策略 数字病理学 儿童眼内恶性肿瘤 单细胞测序 类器官模型 基因组甲基化数据 NA
24569 2024-08-09
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过纵向多组学分析,揭示了严重COVID-19患者中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 首次在严重COVID-19患者中识别出巨核细胞和红细胞的扩展以及浆母细胞的增殖,这些特征与疾病结局相关 研究样本量较小,且仅限于两个中心的患者 理解严重COVID-19的免疫反应偏斜并定义疾病结局的预测因子 严重COVID-19患者的免疫细胞反应 数字病理学 COVID-19 多组学分析 NA 转录组、DNA甲基化组和单细胞转录组数据 14名患者,包括超过358,000个细胞
24570 2024-08-09
Olfactomedin 4 mediation of prostate stem/progenitor-like cell proliferation and differentiation via MYC
2020-12-14, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了嗅觉蛋白4(OLFM4)在正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞(RWPE1)中的表达及其生理功能。 首次揭示了OLFM4在前列腺上皮细胞中的表达模式及其在干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 NA 研究OLFM4在前列腺干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞(RWPE1)中的OLFM4表达细胞。 NA 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 多个干细胞/祖细胞样细胞群
24571 2024-08-09
Stromal Cells Exhibit Prevalent Genetic Aberrations in Colorectal Cancer
2020-12-14, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究探讨了结直肠癌中基质细胞的遗传异常 首次结合多组学单细胞测序技术,揭示了结直肠癌基质细胞群体中的普遍遗传改变 NA 研究肿瘤微环境中基质细胞的遗传变化对肿瘤进展的影响 结直肠癌中的基质细胞 数字病理学 结直肠癌 多组学单细胞测序 NA 遗传数据 NA
24572 2024-08-09
Mouse embryonic stem cells self-organize into trunk-like structures with neural tube and somites
2020-12-11, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本文研究了多能性小鼠胚胎干细胞(mESCs)在体外形成高度组织的“躯干样结构”(TLSs),包含神经管和体节的过程 通过单细胞RNA测序分析,证实了这一过程与小鼠发育高度相似,并遵循相同的逐步基因调控程序 NA 探究胚胎植入后胚胎发生过程 小鼠胚胎干细胞的自组织能力及其形成的结构 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
24573 2024-08-09
Trajectory of chemical cocktail-induced neutrophil reprogramming
2020-12-10, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 本研究利用遗传追踪方法CellTagging和单细胞RNA测序技术,揭示了化学混合物诱导的中性粒细胞重编程轨迹 首次报道了中性粒细胞可以被重编程为多能祖细胞,并在体外和体内获得多向分化潜能 NA 研究化学混合物诱导的造血细胞重编程过程 中性粒细胞的重编程轨迹 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因数据 NA
24574 2024-08-09
Global immune characterization of HBV/HCV-related hepatocellular carcinoma identifies macrophage and T-cell subsets associated with disease progression
2020-Dec-08, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV/HCV相关肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中的免疫细胞异质性及其动态变化 首次在单细胞水平上揭示了HBV/HCV相关HCC中免疫细胞的复杂网络,并识别出与疾病进展相关的特定巨噬细胞和T细胞亚群 NA 探究HBV/HCV相关肝细胞癌中免疫细胞的异质性及其与疾病进展的关系 HBV/HCV相关肝细胞癌中的免疫细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA RNA 41,698个免疫细胞来自七对HBV/HCV相关HCC肿瘤和非肿瘤肝组织
24575 2024-08-09
Characterization and generation of human definitive multipotent hematopoietic stem/progenitor cells
2020-Dec-01, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,解析了人类早期造血阶段的多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)的特征,并从人类胚胎干细胞(hESCs)中生成了这些细胞 首次详细描述了人类早期造血过程中的分子特征,并发现了CD44在区分早期原始和确定性造血中的特异性作用 NA 深入理解人类早期造血过程,并为临床目的生成血液和免疫细胞提供基础 人类多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)及其在早期造血过程中的特征 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
24576 2024-08-09
Evolving insights: how DNA repair pathways impact cancer evolution
2020-11-15, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
综述 本文综述了DNA修复途径如何影响癌症进化的最新发现 利用单细胞测序等新技术深入理解癌症进化及其与DNA修复的关系 NA 探讨DNA修复对癌症进化的影响及其在临床治疗中的应用 癌症进化及其与DNA修复的关系 NA 癌症 单细胞测序 NA 基因组数据 NA
24577 2024-08-09
Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis
2020, American journal of translational research IF:1.7Q4
PMID:33312370
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱,并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 NA 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 骨关节炎中的软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 480个软骨细胞样本
24578 2024-08-09
Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2
2020, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制,并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 NA 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 胶质母细胞瘤 数字病理学 神经系统疾病 单细胞测序 NA 转录组数据 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本
24579 2024-08-09
Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors
2020, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达,发现这些组织中受体表达较低 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据,未进行新的实验验证 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 NA NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据
24580 2024-08-09
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了血管平滑肌细胞的可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用 引入了新技术如杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪以及具有空间分辨率的单细胞测序技术,以深化对这些细胞复杂生物学的理解 NA 旨在进一步阐明动脉粥样硬化疾病的发病机制,以发现新的治疗方法 血管平滑肌细胞及其在血管壁炎症中的作用 心血管疾病 动脉粥样硬化 杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪、单细胞测序技术 NA 细胞 NA
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