单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 24541 - 24560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24541 | 2024-08-09 |
The power to "di-sc-seq-t"
2021-03-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.02.001
PMID:33577786
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research paper | 本文研究了T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性，并使用scRNA-seq技术证明了病毒复制不仅发生在肿瘤细胞中 | 首次展示了T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性，并揭示了病毒复制在非肿瘤细胞中的发生 | NA | 研究T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的作用机制 | T-VEC在皮肤B细胞淋巴瘤中的活性及病毒复制机制 | NA | 皮肤B细胞淋巴瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 24542 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq dissects the intratumoral heterogeneity of triple-negative breast cancer based on gene regulatory networks
2021-Mar-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.12.018
PMID:33575114
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三阴性乳腺癌的基因调控网络，以解析其肿瘤内异质性 | 首次通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，揭示了三阴性乳腺癌的关键调控基因及其在不同亚型中的不同作用 | NA | 解析三阴性乳腺癌的肿瘤内异质性并识别关键基因 | 三阴性乳腺癌的基因调控网络及其关键基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | 545个恶性细胞 |
| 24543 | 2024-08-09 |
A new graph-based clustering method with application to single-cell RNA-seq data from human pancreatic islets
2021-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa087
PMID:33575647
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研究论文 | 本文提出了一种基于图模型的新的聚类框架，用于处理单细胞RNA测序数据中的异质性，并应用于人类胰岛细胞的分析 | 引入了基于图模型的聚类方法，并考虑了单细胞RNA测序数据组成的特性，采用对数比变换 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型检测问题 | 人类胰岛细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图模型 | 单细胞RNA测序数据 | 人类胰岛细胞 |
| 24544 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of early-relapse hepatocellular carcinoma
2021-Mar, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-021-00428-2
PMID:33594272
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24545 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies: (Trends in Cancer 6, 13-19, 2020)
2021-Mar, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2021.02.001
PMID:33596415
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24546 | 2024-08-09 |
Cell-specific network analysis of human folliculogenesis reveals network rewiring in antral stage oocytes
2021-03, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16315
PMID:33599396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了人类卵泡发育过程中卵母细胞和颗粒细胞的动态调控网络，揭示了卵泡腔阶段卵母细胞的基因网络结构及其重构过程 | 首次在单细胞网络层面探索卵泡发育过程中的基因功能，发现了两个潜在的基因子网络，这些子网络可能在卵母细胞功能中起重要作用 | NA | 探索卵泡发育过程中单细胞分辨率的动态调控网络 | 人类卵母细胞和颗粒细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | WGCNA, MCODE | 基因表达数据 | NA |
| 24547 | 2024-08-09 |
Potential therapeutic targets in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma: reversing the protumor effect of tumor-associated macrophages
2021-Feb-17, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01873-2
PMID:33596985
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综述 | 本文综述了肝细胞癌患者中肿瘤微环境的治疗靶点，特别是针对肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤促进效应的逆转 | 利用单细胞测序技术揭示了肿瘤微环境中细胞间的相互作用网络，并识别出肿瘤相关巨噬细胞作为关键节点 | NA | 探讨如何通过重塑肿瘤微环境和重新编程肿瘤相关巨噬细胞表型来提高肝细胞癌患者的免疫治疗效果 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 24548 | 2024-08-09 |
Dissection of intercellular communication using the transcriptome-based framework ICELLNET
2021-02-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21244-x
PMID:33597528
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研究论文 | 本文开发了基于转录组的框架ICELLNET，用于解析细胞间通信 | ICELLNET集成了专家 curated的配体-受体相互作用数据库、通信分数量化、与31种参考人类细胞类型的连接以及三种可视化模式 | NA | 开发一个全面的、多功能的、生物学验证的、易于使用的框架，用于从单个或多个基于细胞的转录组数据中解析细胞通信 | 细胞间通信的解析 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | 转录组数据 | 涉及31种参考人类细胞类型 |
| 24549 | 2024-08-09 |
Molecular Signatures of Inflammatory Profile and B-Cell Function in Patients with Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome
2021-02-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02583-20
PMID:33593977
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研究论文 | 本研究利用靶向蛋白质组学和单细胞转录组学技术，分析了SFTS患者血液中的免疫景观变化，并揭示了B细胞功能改变与SFTSV感染致死性的关联 | 首次揭示了SFTSV感染导致B细胞亚群改变及干扰素途径下调，以及这些变化与疾病严重程度和致死性的关系 | NA | 探究SFTSV感染的临床表现机制及其与免疫反应的关系 | SFTS患者的血液样本，特别是外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | 靶向蛋白质组学，单细胞转录组学 | NA | 蛋白质，RNA | NA |
| 24550 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals the differences in cell differentiation and immune microenvironment of papillary thyroid carcinoma between genders
2021-Feb-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00549-w
PMID:33588924
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境的差异 | 首次揭示了性别对PTC中单细胞转录组景观的影响，包括细胞簇和免疫微环境的详细差异 | NA | 旨在阐明性别对甲状腺乳头状癌中细胞簇和免疫微环境的影响 | 甲状腺乳头状癌（PTC）在不同性别间的细胞分化和免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共生成6720、14666和33373个单细胞转录组，分别来自4名男性PTC患者、7名女性PTC患者和3名结节性甲状腺肿患者 |
| 24551 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals the potential oncogenic expression atlas of human iPSC-derived cardiomyocytes
2021-02-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.053348
PMID:33589441
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的心肌细胞的致癌表达图谱 | 发现了与致癌相关的动态表达事件，以及Yamanaka因子基因的动态表达和共表达模式 | NA | 理解iPSC衍生的心肌细胞在单细胞分辨率下的特性 | 人类iPSC衍生的心肌细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 32,365个细胞 |
| 24552 | 2024-08-09 |
Fast and precise single-cell data analysis using a hierarchical autoencoder
2021-02-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21312-2
PMID:33589635
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDHA的分析框架，用于从单细胞RNA测序数据中提取代表性信息 | scDHA框架包括一个非负核自动编码器和一个堆叠的贝叶斯自动编码器，能够有效去除不重要的基因或成分，并通过在压缩空间中反复扰动来学习更通用的数据表示 | NA | 解决单细胞RNA测序研究中数据量大和噪声水平高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | NA |
| 24553 | 2024-08-09 |
Cellular transcriptomics reveals evolutionary identities of songbird vocal circuits
2021-02-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abd9704
PMID:33574185
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了鸣禽鸣叫运动通路的神经元谱，揭示了鸣禽鸣叫电路与哺乳动物新皮质在神经发育上的差异和转录相似性 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了鸣禽鸣叫电路与哺乳动物新皮质在神经发育上的差异和转录相似性 | NA | 探究鸣禽鸣叫行为与哺乳动物复杂行为是否源自共享或不同的神经电路 | 鸣禽鸣叫运动通路的神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24554 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of human B cell maturation predicts how antibody class switching shapes selection dynamics
2021-02-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe6291
PMID:33579751
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析人类B细胞成熟过程，预测抗体类别转换如何影响选择动力学 | 提供了人类B细胞成熟的全面路线图，结合单细胞转录组学和抗体谱系数据，定义了B细胞状态的基因表达、抗体谱系和克隆共享 | NA | 揭示B细胞介导的人类免疫反应的动态细胞状态，并强调抗体同种型在其抗体依赖性选择中的作用 | 人类B细胞的成熟过程及其在免疫反应中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24555 | 2024-08-09 |
Inflammatory Mechanisms Underlying Nonalcoholic Steatohepatitis and the Transition to Hepatocellular Carcinoma
2021-Feb-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13040730
PMID:33578800
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中炎症机制及其向肝细胞癌（HCC）转化的过程 | 介绍了单细胞测序、遗传命运图谱和活体显微镜等新技术在揭示免疫介导的肝脏损伤复杂机制中的应用 | NA | 深入理解非酒精性脂肪肝炎（NASH）进展及其向肝细胞癌转化的炎症机制 | NAFLD的炎症机制及其向HCC的转化 | NA | 肝病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 24556 | 2024-08-09 |
Sexual Dimorphism through the Lens of Genome Manipulation, Forward Genetics, and Spatiotemporal Sequencing
2021-02-03, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa243
PMID:33587127
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研究论文 | 本文探讨了通过基因组操作、正向遗传学和时空测序技术来研究性二态性的分子机制 | 引入了“4D基因组技术”，结合精确基因编辑、诱导性转基因系统和单细胞RNA测序等技术，以及经典实验设计，以高分辨率揭示性二态性的分子遗传基础 | NA | 揭示性二态性的分子遗传基础 | 性二态性的遗传机制 | 遗传学 | NA | 基因组操作、正向遗传学、时空测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 24557 | 2024-08-09 |
DIscBIO: A User-Friendly Pipeline for Biomarker Discovery in Single-Cell Transcriptomics
2021-Jan-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22031399
PMID:33573289
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研究论文 | 本文介绍了DIscBIO，一个用于单细胞转录组学中生物标志物发现的开放源代码、多算法管道 | DIscBIO整合了多个scRNA-seq包，允许通过决策树和基因富集分析在网络环境中进行生物标志物发现 | 为了进行有意义的scRNA-seq分析，用户需要理解所实施的方法及其可能的选项和限制 | 开发一个用户友好的管道，用于在单细胞转录组学中进行生物标志物发现 | 单细胞转录组数据中的细胞亚群和生物标志物 | 生物信息学 | 乳腺癌，黏液脂肪肉瘤 | scRNA-seq | 决策树 | 单细胞测序读取计数 | 两个scRNA-seq数据集，第一个数据集来自乳腺癌患者的循环肿瘤细胞，第二个数据集来自黏液脂肪肉瘤的细胞周期调控 |
| 24558 | 2024-08-09 |
Decoding the multicellular ecosystem of lung adenocarcinoma manifested as pulmonary subsolid nodules by single-cell RNA sequencing
2021-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd9738
PMID:33571124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了16个肺部亚实性结节（SSN）样本、6个邻近正常肺组织（nLung）和9个伴有淋巴结转移的肺腺癌（mLUAD）样本，揭示了SSN的转录组特征和肿瘤微环境（TME）。 | 首次提供了SSN及其肿瘤微环境的单细胞转录组图谱，发现细胞毒性自然杀伤/T细胞在SSN的TME中占主导地位，恶性细胞经历了强烈的代谢重编程和免疫压力。 | 研究样本数量相对有限，可能影响结果的普遍性。 | 深入了解表现为肺部亚实性结节的肺腺癌的生物学行为和肿瘤微环境，为肺癌免疫治疗提供新的见解。 | 肺部亚实性结节（SSN）、邻近正常肺组织（nLung）和伴有淋巴结转移的肺腺癌（mLUAD）。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 16个SSN样本，6个nLung样本，9个mLUAD样本，共118,293个细胞，约0.6亿个独特转录本。 |
| 24559 | 2024-08-09 |
Novel Biomarkers for Lupus Nephritis in the "OMICS" Era
2021, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了在精准医学时代，利用基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学技术开发的狼疮性肾炎（LN）新型生物标志物的最新数据 | 综述了多种组学技术在LN诊断和监测中的应用，提供了更深入的疾病发病机制理解，并可能改变未来LN病例的管理方式 | NA | 总结和评估在精准医学时代开发的新型生物标志物，以改善LN的诊断和监测 | 狼疮性肾炎（LN）及其相关生物标志物 | NA | 自身免疫性疾病 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因数据、转录数据、蛋白质数据、代谢数据 | NA |
| 24560 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Reveals Dual and Multi-Transmitter Use in Neurons Across Metazoans
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.623148
PMID:33597849
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究，探讨了跨门动物神经元中双或多神经递质的使用情况 | 挑战了传统的Dale原则，即一个神经元只表达一种神经递质，提供了证据支持一个神经元可以表达多种神经递质 | NA | 研究神经元中神经递质的表达模式，特别是在单细胞水平上 | 跨门动物的神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个动物物种的神经元 |