单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27151 篇文献，本页显示第 24541 - 24560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24541 | 2024-08-09 |
Mapping systemic lupus erythematosus heterogeneity at the single-cell level
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0743-0
PMID:32747814
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了33名不同疾病活动度的系统性红斑狼疮（SLE）儿童患者和11名匹配对照的外周血单个核细胞，揭示了SLE患者血液转录组的细胞来源及其异质性 | 首次在单细胞水平上详细解析了SLE患者的血液转录组异质性，并识别出与疾病活动度相关的特定细胞亚群 | 研究主要集中在儿童SLE患者，成人SLE患者的验证样本量较少 | 解析系统性红斑狼疮转录组特征的细胞来源及其疾病异质性，为精准医疗应用奠定基础 | 系统性红斑狼疮患者的血液转录组及其细胞来源 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约276,000个外周血单个核细胞来自33名儿童SLE患者和11名对照，以及约82,000个来自成人SLE患者的单个外周血单个核细胞 |
| 24542 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、T细胞受体谱分析和质谱流式细胞术，构建了健康和溃疡性结肠炎（UC）中人结肠CD8 T细胞的无偏倚图谱 | 揭示了CD8 T细胞的广泛异质性，包括扩增的效应和终末分化的后效应CD8 T细胞，并发现UC相关的效应CD8 T细胞能触发组织破坏并产生肿瘤坏死因子（TNF）-α，而后效应细胞获得先天性特征以采取可能缓解过度炎症的调节功能 | NA | 研究结肠CD8 T细胞在健康和溃疡性结肠炎中的细胞表型及其驱动免疫调节和炎症的机制 | 人结肠CD8 T细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学、T细胞受体谱分析、质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 24543 | 2024-08-09 |
Multidimensional study of the heterogeneity of leukemia cells in t(8;21) acute myelogenous leukemia identifies the subtype with poor outcome
2020-08-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2003900117
PMID:32747558
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研究论文 | 本研究通过综合分析免疫表型、RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq），揭示了t(8;21)急性髓系白血病中不同分化阶段的三个独特的白血病细胞群体及其与临床预后的关系 | 首次通过多维分析方法揭示了t(8;21)急性髓系白血病中白血病细胞的多维异质性，并确定了与不良预后相关的细胞亚型 | NA | 研究t(8;21)急性髓系白血病中白血病细胞的异质性及其与临床预后的关系 | t(8;21)急性髓系白血病中的白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个时间点的样本 |
| 24544 | 2024-08-09 |
hubViz: A Novel Tool for Hub-centric Visualization
2020-Aug-15, Chemometrics and intelligent laboratory systems : an international journal sponsored by the Chemometrics Society
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.chemolab.2020.104071
PMID:32753773
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研究论文 | 本文介绍了一种名为hubViz的新工具，用于二进制数据的中心枢纽可视化 | hubViz是首个专门针对二进制数据并考虑观测值中心性的可视化工具 | 传统的可视化算法如MDS、t-SNE和UMAP未针对二进制数据进行优化，且未考虑观测值的中心性 | 提出并评估hubViz工具在基因表达数据、单细胞RNA测序数据和文献挖掘数据中的应用效果 | 评估hubViz在不同类型基因组数据中的可视化性能 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 二进制数据 | 涉及大鼠暴露于可卡因的多个脑区基因表达数据、外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据以及疾病间关系的文献挖掘数据 |
| 24545 | 2024-08-09 |
Author Correction: Single-cell RNA-seq reveals that glioblastoma recapitulates a normal neurodevelopmental hierarchy
2020-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17979-8
PMID:32769982
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correction | 对一篇关于胶质母细胞瘤单细胞RNA测序研究的论文进行修正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24546 | 2024-08-09 |
Enhancing myocardial repair with CardioClusters
2020-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17742-z
PMID:32769998
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研究论文 | 本文研究通过使用CardioClusters（一种由三种不同的心脏来源间质细胞组成的3D结构）来增强心肌修复效果 | 首次报道了使用CardioClusters这种无支架的3D微环境结构，通过scRNA-Seq技术揭示了其表达与干细胞相关的因子、粘附/细胞外基质分子和细胞因子，同时保持与内源性心脏细胞相似的转录组 | 研究仅在预临床的小鼠心肌梗死模型中进行，尚未进行临床试验 | 探索通过细胞疗法改善心脏功能的新方法 | 心肌修复和心脏功能改善 | 细胞疗法 | 心血管疾病 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 小鼠模型，追踪20周 |
| 24547 | 2024-08-09 |
Finding a Needle in a Haystack: Identification of a Beige Fat Progenitor
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.014
PMID:32763184
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研究论文 | Oguri等研究者利用单细胞RNA测序技术，在皮下脂肪组织中鉴定出一种棕色脂肪前体细胞，该细胞能分化为产热脂肪细胞 | 首次鉴定出标记为PDGFRα、Sca1和CD81的棕色脂肪前体细胞，并发现其在冷刺激和鸢尾素作用下通过FAK信号通路增殖 | NA | 鉴定棕色脂肪前体细胞及其调控机制 | 棕色脂肪前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 24548 | 2024-08-09 |
scTyper: a comprehensive pipeline for the cell typing analysis of single-cell RNA-seq data
2020-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03700-5
PMID:32753029
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scTyper的综合性R语言工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | scTyper提供了一个包含213个细胞标记集的数据库scTyper.db，并实现了三种定制方法来估计细胞类型标记表达，以及改进的DNA拷贝数推断方法inferCNV用于恶性细胞类型分析 | NA | 开发一个综合且用户友好的工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包含213个细胞标记集的数据库 |
| 24549 | 2024-08-09 |
Fusion transcript detection using spatial transcriptomics
2020-08-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-00738-5
PMID:32753032
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STfusion的新方法，利用空间转录组学技术推断融合转录本的存在 | 提出了一种新的C评分方法来测量观察到的和预期的多聚A尾数量的差异，从而推断融合转录本 | NA | 研究融合转录本在肿瘤发生中的作用及其在组织切片中的空间分辨率 | 融合转录本在肿瘤细胞系和临床组织数据中的检测 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 12个组织切片 |
| 24550 | 2024-08-09 |
An interspecies translation model implicates integrin signaling in infliximab-resistant inflammatory bowel disease
2020-08-04, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aay3258
PMID:32753478
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研究论文 | 本文开发了一种名为可翻译组件回归（TransComp-R）的方法，结合小鼠蛋白质组数据和患者治疗前转录组数据，以识别在小鼠数据中可预测患者治疗反应的分子特征，揭示了整合素信号通路在抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者中的激活状态。 | TransComp-R方法的创新之处在于它能够克服小鼠模型与人类受试者之间的物种和跨组学差异，为解决模型系统与患者之间的物种、分子和表型差异提供了一个可推广的框架。 | NA | 旨在克服抗肿瘤坏死因子（anti-TNF）治疗抵抗的临床挑战，通过识别和验证与治疗反应相关的分子机制。 | 研究对象包括抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者，以及小鼠模型中的蛋白质组数据。 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 可翻译组件回归（TransComp-R） | 蛋白质组数据，转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 24551 | 2024-08-09 |
Nicotinamide Mononucleotide Supplementation Reverses the Declining Quality of Maternally Aged Oocytes
2020-08-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107987
PMID:32755581
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研究论文 | 本文研究了尼克酰胺单核苷酸（NMN）补充对自然衰老小鼠卵母细胞质量的改善效果 | 首次报道NMN补充能有效提高自然衰老小鼠卵母细胞的质量，通过恢复烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）水平实现 | NA | 探索改善高龄产妇卵母细胞质量的有效方法 | 自然衰老小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24552 | 2024-08-09 |
Robust gene expression programs underlie recurrent cell states and phenotype switching in melanoma
2020-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0547-3
PMID:32753671
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析了黑色素瘤细胞在不同状态下的基因表达程序，揭示了中间状态的存在及其调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序和时间序列分析揭示了黑色素瘤细胞状态转换中的中间状态及其稳定的基因调控网络 | NA | 探索黑色素瘤细胞在黑色素细胞和间充质样状态之间的中间状态及其基因调控网络 | 黑色素瘤细胞的状态转换及其基因表达程序 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 10个黑色素瘤细胞培养物使用单细胞RNA测序，26个额外培养物使用批量RNA测序 |
| 24553 | 2024-08-09 |
Single-Cell Heterogeneity of Cutaneous T-Cell Lymphomas Revealed Using RNA-Seq Technologies
2020-Jul-31, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12082129
PMID:32751918
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review | 本文综述了利用RNA测序和单细胞RNA测序技术揭示皮肤T细胞淋巴瘤恶性细胞分子异质性的新见解 | 利用高吞吐量技术如RNA测序和单细胞RNA测序来识别肿瘤特异性分子特征 | 皮肤T细胞淋巴瘤发展的详细发病机制仍需探索 | 总结利用高吞吐量技术揭示恶性细胞分子异质性的新见解，为治疗、诊断和预后提供指导 | 皮肤T细胞淋巴瘤的分子异质性 | digital pathology | 皮肤T细胞淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24554 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune landscape in kidneys of patients with chronic transplant rejection
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48201
PMID:32754283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性移植肾排斥反应患者的肾脏免疫景观 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性移植肾排斥反应中肾脏细胞的多样性和功能差异 | 研究样本量较小，仅包括三个健康肾脏和两个慢性移植肾排斥反应样本 | 探索慢性移植肾排斥反应的细胞和分子机制 | 慢性移植肾排斥反应患者的肾脏细胞 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个健康人肾脏和两个慢性移植肾排斥反应活检样本 |
| 24555 | 2024-08-09 |
Stem cell programs in cancer initiation, progression, and therapy resistance
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.41648
PMID:32754274
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）在癌症起始、进展和治疗抵抗中的关键特征和机制 | 讨论了CSC治疗抵抗的因素，如静止状态、上皮间质转化（EMT）和DNA损伤诱导的细胞死亡抵抗，并评估了消除治疗抵抗CSC亚群的治疗方法 | 仍需解决的挑战包括研究CSCs的实验方法和治疗靶向CSCs的障碍 | 阐明驱动癌症干细胞维持、可塑性和治疗抵抗的分子机制，以提高针对CSCs的靶向治疗效果 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤进展、治疗抵抗和疾病复发中的作用 | NA | NA | 单细胞测序、CRISPR-Cas9筛选 | NA | NA | NA |
| 24556 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01521
PMID:32765526
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24557 | 2024-08-09 |
Gaps and Doubts in Search to Recognize Glioblastoma Cellular Origin and Tumor Initiating Cells
2020, Journal of oncology
DOI:10.1155/2020/6783627
PMID:32774372
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研究论文 | 本文讨论了胶质母细胞瘤（GB）的细胞起源及其肿瘤起始细胞的问题，并提出了基于与中枢神经系统（CNS）细胞比较的GB起源的可能建议 | 提出了GFAP阳性细胞（星形胶质细胞、放射状胶质细胞或GFAP阳性神经前体细胞）作为GB起源的可能性，并建议进一步研究应聚焦于这些细胞 | 神经生物学家在定义神经干细胞（NSC）方面的不一致性使问题复杂化 | 探讨胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞NGS和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 24558 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Profile of Meniscal Tissue Macrophages in Human Osteoarthritis
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8127281
PMID:32775469
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了人膝关节软骨组织中巨噬细胞在骨关节炎中的异质性和功能特化 | 首次系统地研究了骨关节炎中低丰度的巨噬细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其在健康人群和骨关节炎患者中的基因表达特征变化 | NA | 深入理解骨关节炎炎症的基础，为开发新疗法提供希望 | 人膝关节软骨组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 24559 | 2024-08-09 |
Discovering a sparse set of pairwise discriminating features in high-dimensional data
2021-04-19, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa690
PMID:32730566
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研究论文 | 本文提出了一种无监督方法，用于在高维数据中识别定义低维子空间的关键特征，以进行有效的聚类分析 | 本文创新地提出了一种基于特征选择的无监督方法，用于在低维空间中揭示数据点的线性可分性 | NA | 旨在从高维生物数据中提取有意义的特征，以促进对生物过程的深入理解 | 单细胞RNA测序数据中的关键转录因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据点 | 409个总转录因子中的27个关键转录因子 |
| 24560 | 2024-08-09 |
netAE: semi-supervised dimensionality reduction of single-cell RNA sequencing to facilitate cell labeling
2021-04-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa669
PMID:32726427
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研究论文 | 本文提出了一种半监督的单细胞RNA测序数据降维方法netAE，以促进细胞标记 | netAE方法在少量标记样本的情况下，仍能实现高分类准确度，并保持原始空间的相似性结构 | NA | 旨在通过半监督方法改进细胞标记流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络增强自编码器（netAE） | RNA测序数据 | 三个公共数据集 |