单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 24501 - 24520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24501 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome dissection of the toxic impact of Di (2-ethylhexyl) phthalate on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55006
PMID:33754040
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次揭示了DEHP暴露对小鼠原始卵泡形成过程中基因表达动态的影响，并通过生物化学实验验证了这些发现 | NA | 探讨DEHP对小鼠原始卵泡形成过程中的生殖毒性 | 小鼠卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24502 | 2024-08-09 |
Deciphering the autophagy regulatory network via single-cell transcriptome analysis reveals a requirement for autophagy homeostasis in spermatogenesis
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55645
PMID:33754041
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示自噬调节网络在精子发生中的重要性 | 首次全面分析了人类精子发生过程中自噬相关基因的转录特征，并发现Cst3基因在调节精子干细胞维持和后续男性生殖细胞发育中的作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的生殖障碍患者 | 探讨自噬在人类精子发生中的作用及其与男性不育的关联 | 人类精子发生过程中的自噬相关基因 | 数字病理学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 9名生育控制样本（包括2名正常人和7名阻塞性无精子症患者）和1名非阻塞性无精子症患者 |
| 24503 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for engineering and studying human islets
2020-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2020.06.003
PMID:33738370
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人胰岛细胞在不同成熟和糖尿病状态下的转录特征 | 利用单细胞RNA测序技术，能够准确评估特定细胞类型和β细胞亚型，揭示胰岛发育和糖尿病病理的深入见解 | NA | 探讨胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病病理中的作用 | 干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同成熟和糖尿病状态的干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 |
| 24504 | 2024-08-09 |
Modeling dynamic correlation in zero-inflated bivariate count data with applications to single-cell RNA sequencing data
2022-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13457
PMID:33720414
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研究论文 | 本文针对单细胞RNA测序数据中的零膨胀和过度分散特性，提出了一种新的零膨胀负二项动态相关模型（ZENCO），用于探索动态依赖结构。 | 提出了ZENCO模型，该模型通过引入潜在变量来模拟协变量依赖的相关结构，并能处理零膨胀和过度分散的计数数据。 | NA | 探索单细胞RNA测序数据中的动态基因共表达模式。 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式。 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 零膨胀负二项动态相关模型（ZENCO） | 计数数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24505 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Compartment-Specific Differences in Immune Responses and Contributions for Complement Factor 3 in Hemorrhagic Shock Plus Tissue Trauma
2021-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000001765
PMID:33710107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了出血性休克合并组织损伤模型中血液、肝脏和脾脏的白细胞基因表达变化 | 揭示了补体因子3在调节免疫细胞反应中的新作用，特别是在抑制单核细胞主要组织相容性复合体II类表达和促进干扰素信号传导中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，且样本来自单一时间点（6小时） | 探究出血性休克合并组织损伤后免疫细胞的基因表达变化及其机制 | 血液、肝脏和脾脏中的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了野生型和补体因子3敲除小鼠的样本 |
| 24506 | 2024-08-09 |
Osteomodulin is a Potential Genetic Target for Hypertrophic Cardiomyopathy
2021-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-021-10050-1
PMID:33715137
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）和基因集富集分析（GSEA），识别与肥厚型心肌病（HCM）相关的关键基因，特别是骨调素（OMD），并验证其在HCM诊断和治疗中的潜在价值 | 首次将骨调素（OMD）确定为肥厚型心肌病的关键基因，并验证了其在疾病诊断中的有效性 | NA | 揭示与肥厚型心肌病发病机制相关的基因，并提供诊断和治疗的新靶点 | 肥厚型心肌病及其相关基因 | 遗传学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞测序（sc-RNA seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24507 | 2024-08-09 |
DCI: learning causal differences between gene regulatory networks
2021-09-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab167
PMID:33704425
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DCI的算法，用于高效学习不同条件下基因调控网络之间的因果差异 | DCI算法能够直接推断两个因果图之间的差异，无需单独估计每个可能的大型因果图，从而提高了样本和计算效率 | NA | 设计干预措施以控制基因调控，需要通过因果图模型化基因调控网络 | 基因调控网络的因果差异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因果图 | 基因表达数据 | 高样本量 |
| 24508 | 2024-08-09 |
ExperimentSubset: an R package to manage subsets of Bioconductor Experiment objects
2021-09-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab179
PMID:33715007
|
研究论文 | 介绍了一个名为ExperimentSubset的R包，用于高效管理和检索Bioconductor实验对象的子集 | 提出了一个能够提供数据溯源的R包，通过维护子集和父集之间的关系，实现了更高效的数据管理 | NA | 开发一个能够高效存储和检索子集数据的R包 | Bioconductor实验对象的子集管理 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 矩阵数据 | NA |
| 24509 | 2024-08-09 |
sepal: identifying transcript profiles with spatial patterns by diffusion-based modeling
2021-Sep-09, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab164
PMID:33704427
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法来分析空间转录组数据，通过模拟单个转录本的扩散来提取具有空间模式的基因 | 本文提出的方法与现有的基于统计假设检验的方法不同，更少依赖于基因的表达水平，并且在多核运行时表现出更好的时间性能 | NA | 旨在区分具有空间模式的转录本轮廓与背景噪声 | 空间转录组数据中的基因 | 组学 | NA | 扩散建模 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24510 | 2024-08-09 |
Generation of Pulmonary Endothelial Progenitor Cells for Cell-based Therapy Using Interspecies Mouse-Rat Chimeras
2021-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202003-0758OC
PMID:33705684
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研究论文 | 研究通过跨物种小鼠-大鼠嵌合体生成肺内皮祖细胞，用于治疗新生儿肺部疾病 | 首次通过跨物种嵌合体从多能胚胎干细胞中生成肺内皮祖细胞，并验证其在新生儿肺部疾病治疗中的功能 | NA | 研究肺内皮祖细胞的异质性及其从多能干细胞中的生成和功能 | 肺内皮祖细胞及其在新生儿肺部疾病治疗中的应用 | 细胞疗法 | 新生儿肺部疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和大鼠的肺组织样本 |
| 24511 | 2024-08-09 |
Resolving organoid brain region identities by mapping single-cell genomic data to reference atlases
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.015
PMID:33711282
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研究论文 | 本文开发了一套计算工具（VoxHunt），通过与空间和单细胞转录组参考数据集的比较，评估脑类器官的模式、发育状态和细胞身份 | 开发了VoxHunt工具，用于评估脑类器官的工程协议和注释在遗传和环境扰动实验中在类器官中出现的细胞命运 | NA | 研究脑类器官的细胞组成、分化轨迹和遗传扰动 | 脑类器官的细胞身份和发育状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞和批量基因组数据 | 多个类器官协议模型的不同脑结构 |
| 24512 | 2024-08-09 |
Activity of Combined Androgen Receptor Antagonism and Cell Cycle Inhibition in Androgen Receptor Positive Triple Negative Breast Cancer
2021-06, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-20-0807
PMID:33722849
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研究论文 | 研究联合使用雄激素受体拮抗剂和细胞周期抑制剂在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌中的活性 | 首次探讨了CDK4/6抑制剂abemaciclib与靶向雄激素生物合成及雄激素受体活性的药物seviteronel联合使用在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌模型中的协同效应 | 研究仅限于细胞系和小鼠异种移植模型，尚未进行人体临床试验 | 探索CDK4/6抑制剂abemaciclib与seviteronel联合使用在雄激素受体阳性三阴性乳腺癌中的治疗效果 | 雄激素受体阳性三阴性乳腺癌细胞系、细胞系异种移植模型及患者来源的异种移植模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了多个雄激素受体阳性三阴性乳腺癌细胞系及患者来源的异种移植模型 |
| 24513 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Treatment Effects in Prostate Cancer
2021-05, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-RW2021-035
PMID:33712490
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞转录组的影响 | 首次通过单细胞转录组学分析了恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞的转录组差异 | NA | 研究恩扎卢胺治疗对前列腺癌和小细胞癌细胞转录组的影响 | 前列腺癌和小细胞癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24514 | 2024-08-09 |
DNA glycosylase Neil3 regulates vascular smooth muscle cell biology during atherosclerosis development
2021-05, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本文研究了DNA糖基化酶NEIL3在动脉粥样硬化发展中对血管平滑肌细胞（VSMC）表型的调节作用 | 首次揭示了NEIL3通过非经典机制影响VSMC表型，特别是通过激活Akt信号通路促进动脉粥样硬化的形成 | NA | 探讨NEIL3在动脉粥样硬化发展中的作用及其对VSMC表型的影响 | NEIL3缺陷的Apoe-/-小鼠和NEIL3缺失的人类主动脉VSMC | NA | 心血管疾病 | qPCR, 免疫组织化学, 酶学检测, 单细胞RNA测序, mRNA测序, 蛋白质组学, BrdU增殖实验, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NEIL3缺陷的Apoe-/-小鼠和NEIL3缺失的人类主动脉VSMC |
| 24515 | 2024-08-09 |
Computational modeling of malignant ascites reveals CCL5-SDC4 interaction in the immune microenvironment of ovarian cancer
2021-05, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23289
PMID:33721368
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了卵巢癌患者的腹水细胞，揭示了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌免疫微环境中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序和NicheNet分析预测了卵巢癌中免疫细胞与癌细胞之间的通信，并发现了CCL5-SDC4相互作用在卵巢癌细胞生存中的潜在作用 | 研究样本量较小，仅基于五个患者的腹水细胞进行分析 | 探究卵巢癌患者腹水中细胞类型及其相互作用，寻找潜在的预后标志物 | 卵巢癌患者的腹水细胞及其在免疫微环境中的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NicheNet | 细胞 | 五个卵巢癌患者的腹水细胞 |
| 24516 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics as a building block for determining mechanistic insight of abdominal aortic aneurysm formation
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab083
PMID:33723571
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24517 | 2024-08-09 |
Methods and tools for spatial mapping of single-cell RNAseq clusters in Drosophila
2021-04-15, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyab019
PMID:33713129
|
review | 本文综述了在果蝇中进行单细胞RNA测序（scRNAseq）簇空间映射的方法和工具 | 讨论了多重基因表达原位检测的需求、可用方法和试剂，以及利用现有数据集和新技术进行高分辨率空间映射的可能性 | 需要额外的验证来精确映射簇中细胞的空间位置 | 探讨如何将scRNAseq簇映射到果蝇的具体解剖区域 | 单细胞RNA测序实验中识别的细胞簇 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | text | NA |
| 24518 | 2024-08-09 |
Decoding Neuronal Diversification by Multiplexed Single-cell RNA-Seq
2021-04-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.02.006
PMID:33711266
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研究论文 | 本文通过多重单细胞RNA测序技术，研究了人类皮肤成纤维细胞中20种促进神经元转录因子的异位表达，揭示了神经元多样化的分子机制 | 本文采用多重单细胞RNA测序技术，首次展示了神经元多样化的广泛性和特异性，并揭示了神经元谱系特异性的关键决定因素和调控逻辑 | NA | 探索细胞类型特化和多样化的调控逻辑 | 人类皮肤成纤维细胞中的神经元多样化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种促进神经元的转录因子 |
| 24519 | 2024-08-09 |
Topoisomerase IIβ immunoreactivity (IR) co-localizes with neuronal marker-IR but not glial fibrillary acidic protein-IR in GLI3-positive medulloblastomas: an immunohistochemical analysis of 124 medulloblastomas from the Japan Children's Cancer Group
2021-Apr, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-021-00396-0
PMID:33704596
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研究论文 | 本研究探讨了拓扑异构酶IIβ（TOP2β）在表达神经元标记物（NM）和胶质纤维酸性蛋白（GFAP）的成神经管细胞瘤中的作用，并分析了GLI3、NM、GFAP和TOP2β表达的病理角色。 | 研究首次揭示了TOP2β免疫反应性与神经元标记物共定位，而非与胶质纤维酸性蛋白共定位，这一发现有助于理解成神经管细胞瘤的神经分化调控机制。 | 研究主要基于免疫组织化学分析和单细胞RNA测序数据，可能需要更多类型的实验验证和更大样本量的研究来进一步确认结果。 | 旨在探讨TOP2β在成神经管细胞瘤中的作用及其与神经元分化相关标记物的关系。 | 研究对象为124例成神经管细胞瘤样本，分为NM-/GFAP-、NM+/GFAP-和GFAP+三组。 | 数字病理学 | 成神经管细胞瘤 | 免疫组织化学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 124例成神经管细胞瘤样本 |
| 24520 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing redefines the mesenchymal cell landscape of mouse endometrium
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002123R
PMID:33710643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术重新定义了小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 首次明确分析了成年小鼠子宫内膜中的间充质细胞，并识别出五个亚群，为比较子宫内膜与其他易发生纤维化的成年组织中的间充质细胞提供了平台 | NA | 重新定义小鼠子宫内膜的间充质细胞景观 | 小鼠子宫内膜的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个亚群的细胞 |