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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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24501 | 2024-08-09 |
Digestive symptoms of COVID-19 and expression of ACE2 in digestive tract organs
2020, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-020-00307-w
PMID:32818075
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研究论文 | 本研究旨在全面调查COVID-19患者的消化道症状及其在消化道器官中的潜在致病途径,并探讨ACE2在这些器官中的表达情况 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序数据,首次揭示了消化道器官中ACE2表达水平高于肺部,并且在肿瘤细胞中的表达高于正常组织 | 研究样本量较小,仅包括48名患者,可能影响结果的普遍性 | 探讨COVID-19患者的消化道症状及SARS-CoV-2在消化道器官中的感染途径 | COVID-19患者的消化道症状及消化道器官中ACE2的表达 | NA | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 48名COVID-19患者 |
24502 | 2024-08-09 |
Inferring cancer progression from Single-Cell Sequencing while allowing mutation losses
2021-04-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa722
PMID:32805010
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research paper | 本文介绍了一种基于模拟退火的新方法Simulated Annealing Single-Cell inference (SASC),用于从单细胞测序数据中推断癌症进展,并引入了一种允许有限突变损失的Dollo-k模型 | 提出了一种新的基于模拟退火的SASC方法,并引入了允许有限突变损失的Dollo-k模型 | NA | 开发一种新的计算方法,用于从单细胞测序数据中推断癌症进展,并允许突变损失 | 单细胞测序数据中的癌症进展推断 | digital pathology | NA | 单细胞测序(SCS) | 模拟退火 | 单细胞测序数据 | NA |
24503 | 2024-08-09 |
Single-Nucleus RNA-Sequencing Profiling of Mouse Lung. Reduced Dissociation Bias and Improved Rare Cell-Type Detection Compared with Single-Cell RNA Sequencing
2020-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0095MA
PMID:32804550
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研究论文 | 本文介绍了单核RNA测序(snRNASeq)在小鼠肺组织中的应用,并与单细胞RNA测序(scRNASeq)进行了比较 | snRNASeq技术减少了分离偏差,提高了罕见细胞类型的检测,并且可以应用于存档的小鼠肺样本 | NA | 研究单核RNA测序在小鼠肺组织中的应用及其与单细胞RNA测序的比较 | 小鼠肺组织的细胞和核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序(snRNASeq) | NA | 转录组数据 | 16,110个单核转录组和11,934个单细胞转录组 |
24504 | 2024-08-09 |
Application of single-cell RNA sequencing in embryonic development
2020-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.08.007
PMID:32781204
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胚胎发育研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅反映了细胞间的异质性,还能揭示有限样本中不同细胞的基因表达特征 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在胚胎发育研究中的应用,并为相关疾病的治疗提供创新思路 | 胚胎发育过程中的细胞行为和基因调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限数量的早期胚胎细胞 |
24505 | 2024-08-09 |
Neuroinflammation at single cell level: What is new?
2020-10, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.3MR0620-035R
PMID:32779279
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综述 | 本文综述了多发性硬化症(MS)及其模型实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)在单细胞水平上的最新研究进展,特别是通过CyTOF和单细胞RNA测序技术揭示的神经炎症机制。 | 利用CyTOF和单细胞RNA测序等新技术,深入探讨了MS/EAE中特定细胞群和关键分子在疾病发展中的作用。 | 文章主要集中在单细胞分析的最新发现上,未涵盖所有可能的研究方法和结果。 | 旨在通过单细胞分析技术,深入理解多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎的细胞和分子机制。 | 研究对象包括多发性硬化症患者和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的血液及中枢神经系统浸润细胞。 | NA | 多发性硬化症 | CyTOF, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
24506 | 2024-08-09 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了五种人类三阴性乳腺癌(TNBC)中的基质细胞多样性,揭示了与免疫逃避相关的不同基质细胞亚群 | 首次详细描述了TNBC中基质细胞的异质性,并展示了这些基质细胞亚群在调节细胞外基质和免疫反应中的独特功能 | 研究样本量较小,仅包括五种TNBC,可能影响结果的普遍性 | 探究三阴性乳腺癌中基质细胞的多样性及其与免疫逃避的关系 | 三阴性乳腺癌中的基质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五种三阴性乳腺癌样本 |
24507 | 2024-08-09 |
Disturbed nitric oxide signalling gives rise to congenital bicuspid aortic valve and aortopathy
2020-09-28, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044990
PMID:32801116
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研究论文 | 本研究通过组织学检查和超声成像技术,结合细胞系分析和单细胞RNA测序,探讨了先天性二叶主动脉瓣(BAV)相关主动脉病变的发病机制。 | 首次揭示了内皮介导的一氧化氮(NO)信号通路紊乱在BAV相关主动脉病变中的作用,特别是抑制弹性纤维形成导致主动脉扩张和撕裂。 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行,结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探究先天性二叶主动脉瓣相关主动脉病变的发病机制。 | 先天性二叶主动脉瓣(BAV)及其相关主动脉病变。 | NA | 心血管疾病 | 组织学检查、超声成像、单细胞RNA测序 | NA | 组织、细胞 | 约13%的小鼠出现自发性主动脉撕裂,小鼠在成年早期易发生主动脉扩张。 |
24508 | 2024-08-09 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人CD34+CD90+造血干细胞(HSC)来减少目标细胞群并提高慢病毒转导效率,以用于基因治疗。 | 研究首次展示了CD90细胞选择策略在减少目标细胞数量的同时,不损害其植入潜力,并显著提高了慢病毒转导效率。 | NA | 研究旨在探索一种新的HSC富集策略,以提高基因治疗的效率和安全性。 | 研究对象为人的CD34+CD90+造血干细胞及其在基因治疗中的应用。 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性疾病和感染性疾病 | 流式细胞术 | NA | RNA测序 | 研究涉及了不同细胞亚群的比较,具体样本数量未详细说明。 |
24509 | 2024-08-09 |
Systems biological assessment of immunity to mild versus severe COVID-19 infection in humans
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abc6261
PMID:32788292
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研究论文 | 研究分析了76名COVID-19患者和69名健康个体的免疫反应,发现COVID-19患者外周血单个核细胞中HLA-DR和促炎细胞因子的表达减少,以及mTOR信号传导和IFN-α产生的受损 | 揭示了COVID-19患者免疫反应的机制,并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 评估轻度和重度COVID-19感染的人类免疫反应 | COVID-19患者和健康个体的免疫反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 76名COVID-19患者和69名健康个体 |
24510 | 2024-08-09 |
Resolving Fates and Single-Cell Transcriptomes of Hematopoietic Stem Cell Clones by PolyloxExpress Barcoding
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.018
PMID:32783885
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研究论文 | 本文开发了PolyloxExpress等位基因,通过Cre重组酶依赖的RNA条形码技术,实现了同一细胞中造血干细胞(HSC)命运和单细胞转录组的关联研究 | 首次将HSC的细胞命运与其单细胞转录组信息相结合,揭示了HSC克隆在转录组景观中的分布及其命运特异性的基因特征 | NA | 旨在识别HSC命运的转录组特征,并探索其分子决定因素 | 造血干细胞(HSC)及其克隆的命运和转录组 | NA | NA | Cre重组酶依赖的RNA条形码技术 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
24511 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell phenotyping of immune cells using the microfluidic platform DropMap
2020-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0354-0
PMID:32788719
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DropMap的微流控平台,用于同时测量单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | DropMap平台能够对单个免疫细胞进行定量和动态表型分析,特别是分析分泌蛋白如细胞因子和抗体 | NA | 开发一种新的微流控平台,用于动态表征免疫细胞 | 单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 数万个单个免疫细胞 |
24512 | 2024-08-09 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0762-x
PMID:32788748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者外周血样本中的免疫细胞转录组特征 | 首次详细描述了COVID-19患者免疫细胞的转录组特征,特别是干扰素-α反应和急性炎症反应的强度 | 样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19疾病严重程度与宿主免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名健康捐赠者和13名COVID-19患者 |
24513 | 2024-08-09 |
Over 60 Years of Experimental Hematology (without a License)
2020-09, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.08.005
PMID:32798645
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research paper | 本文作者回顾了其在实验血液学领域超过60年的研究经历,特别是在红细胞发育和功能相关蛋白质和RNA的克隆与特性研究,以及近期利用单细胞转录组学技术在红细胞前体细胞平衡和药物治疗Epo抵抗性贫血方面的研究 | 作者及其团队开发并应用了多种新颖的实验技术,如单细胞转录组学技术,以解决红细胞发育中的复杂问题 | NA | 探讨红细胞发育的调控机制及开发治疗特定血液疾病的新药物 | 红细胞发育相关的蛋白质、RNA以及红细胞前体细胞 | 分子细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞转录组学(scRNAseq) | NA | RNA | NA |
24514 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Cynomolgus Macaque Testis Reveals Conserved Transcriptional Profiles during Mammalian Spermatogenesis
2020-08-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.07.018
PMID:32795394
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了食蟹猴睾丸细胞,揭示了哺乳动物精子发生过程中的保守转录谱 | 本文首次提供了食蟹猴睾丸细胞的高分辨率单细胞RNA测序图谱,并详细描述了精子发生过程中的转录变化,特别是DNA损伤反应途径基因在维持基因组完整性和影响减数分裂性染色体失活中的双重作用 | NA | 研究哺乳动物精子发生过程中的转录谱和基因表达变化 | 食蟹猴的睾丸细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个食蟹猴睾丸细胞样本 |
24515 | 2024-08-09 |
Coupled scRNA-Seq and Intracellular Protein Activity Reveal an Immunosuppressive Role of TREM2 in Cancer
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.032
PMID:32783915
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研究论文 | 本文介绍了一种名为INs-seq的综合技术,该技术能够大规模并行记录单细胞RNA测序和细胞内蛋白质活性,并揭示了TREM2在癌症中的免疫抑制作用 | 引入了一种新的综合技术INs-seq,用于同时记录单细胞RNA测序和细胞内蛋白质活性,有助于发现新的免疫亚群和细胞功能 | NA | 开发和验证一种新的技术INs-seq,用于揭示肿瘤模型中细胞的转录和细胞内活动 | 肿瘤模型中的Arg1 Trem2调节性髓系(Mreg)细胞及其相关标记、代谢活性和通路 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 涉及小鼠模型 |
24516 | 2024-08-09 |
TREM2 Modulation Remodels the Tumor Myeloid Landscape Enhancing Anti-PD-1 Immunotherapy
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.013
PMID:32783918
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research paper | 本文研究了TREM2在调节肿瘤髓系细胞景观中的作用,并探讨了其对PD-1免疫疗法的影响 | 发现TREM2的调节可以改变肿瘤髓系细胞的组成,增强PD-1免疫疗法的效果 | NA | 研究TREM2在肿瘤髓系细胞中的作用及其对PD-1免疫疗法的影响 | TREM2在肿瘤髓系细胞中的表达及其对肿瘤生长的影响 | NA | cancer | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 超过200个人类癌症病例 |
24517 | 2024-08-09 |
XJB-5-131 inhibited ferroptosis in tubular epithelial cells after ischemia-reperfusion injury
2020-08-14, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-020-02871-6
PMID:32796819
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研究论文 | 研究探讨了XJB-5-131在抑制缺血-再灌注损伤后肾小管上皮细胞铁死亡中的作用 | 发现XJB-5-131通过特异性抑制铁死亡而非坏死和焦亡,减轻了小鼠的缺血-再灌注诱导的肾脏损伤和炎症 | NA | 研究铁死亡在肾小管损伤中的作用及XJB-5-131作为治疗策略的潜力 | 肾小管上皮细胞在缺血-再灌注损伤后的铁死亡 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及人类肾脏疾病和小鼠模型 |
24518 | 2024-08-09 |
Distinct fibroblast subsets regulate lacteal integrity through YAP/TAZ-induced VEGF-C in intestinal villi
2020-08-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17886-y
PMID:32796823
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研究论文 | 本文探讨了肠道间质细胞(IntSCs)在维持肠道稳态中的作用,特别是通过YAP/TAZ诱导的VEGF-C在肠绒毛中调节乳糜管完整性的机制 | 首次揭示了肠绒毛间质细胞的异质性,并阐明了特定亚型的肠绒毛成纤维细胞通过YAP/TAZ诱导的VEGF-C分泌调节乳糜管完整性的新机制 | NA | 研究肠道间质细胞在维持肠道稳态中的作用及其对乳糜管结构和功能的影响 | 肠道间质细胞(IntSCs)和乳糜管 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
24519 | 2024-08-09 |
Maximizing transcription of nucleic acids with efficient T7 promoters
2020-08-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01167-x
PMID:32796901
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研究论文 | 本研究通过5'RACE-Seq筛选T7启动子的随机初始转录区域,发现位置+4至+8的序列影响T7启动子活性,并鉴定出能显著增强转录输出的启动子变体,提高了体外转录反应的产量。此外,引入CEL-Seq方法,使用优化的T7启动子放大cDNA,用于单细胞RNA测序,显著提高了文库复杂性和每个细胞检测到的表达基因数量。 | 本研究发现了影响T7启动子活性的关键序列,并优化了启动子以提高转录效率,特别是在单细胞RNA测序中的应用。 | NA | 旨在优化T7启动子以提高体外转录反应的产量和单细胞RNA测序的效率。 | T7启动子的转录活性和其在单细胞RNA测序中的应用。 | 分子生物学 | NA | 5'RACE-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | NA |
24520 | 2024-08-09 |
Cellular and molecular properties of neural progenitors in the developing mammalian hypothalamus
2020-08-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17890-2
PMID:32792525
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研究论文 | 本文探讨了哺乳动物发育中的下丘脑神经前体细胞的细胞和分子特性 | 首次发现下丘脑放射状胶质(hRG)和下丘脑髓区放射状胶质(hmRG)细胞作为神经前体细胞,并使用单细胞RNA测序揭示人类发育中下丘脑的前体细胞亚型及其特定基因 | NA | 研究下丘脑神经前体细胞的细胞和分子特性,以增进对神经发生和非分层下丘脑区域形成的理解 | 下丘脑的神经前体细胞及其在发育中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |