单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 24501 - 24520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24501 | 2024-08-09 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞的转录组，揭示了ARDS患者中免疫调节失调的细胞类型特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者中ARDS相关的免疫失调机制 | 健康个体和不同程度COVID-19患者的外周血单个核细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康个体3例，中度COVID-19患者5例，ARDS患者6例，恢复期ARDS患者6例 |
| 24502 | 2024-08-09 |
QRICH1 dictates the outcome of ER stress through transcriptional control of proteostasis
2021-01-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb6896
PMID:33384352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和基因组规模的CRISPR筛选，研究了QRICH1在ER应激反应中的作用及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了QRICH1作为PERK-eIF2α轴的关键效应因子，调控ER应激下的转录程序 | NA | 探讨QRICH1在ER应激反应中的功能及其对细胞命运的影响 | QRICH1在ER应激反应中的作用 | NA | 炎症病理 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | RNA | 小鼠肠道上皮细胞 |
| 24503 | 2024-08-09 |
SCHNEL: scalable clustering of high dimensional single-cell data
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa816
PMID:33381821
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研究论文 | 本文介绍了SCHNEL，一种用于高维单细胞数据的可扩展、可靠且自动化的聚类工具 | SCHNEL通过将数据的层次表示与图聚类相结合，使图聚类可扩展到数百万个细胞 | NA | 开发一种可扩展的聚类工具，用于处理大规模的高维单细胞数据 | 单细胞数据，包括细胞计数数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 图聚类 | NA | 高维数据 | 涉及3.5百万和17.2百万个细胞的数据集 |
| 24504 | 2024-08-09 |
Conditional out-of-distribution generation for unpaired data using transfer VAE
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa800
PMID:33381839
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研究论文 | 本文提出了一种新的条件变分自编码器（trVAE），通过在解码器层使用最大均值差异来匹配不同条件下的分布，从而提高了模型在未配对数据上的泛化能力和准确性 | 引入最大均值差异在解码器层进行分布匹配，增强了模型在同一条件内重建样本和跨条件转换样本的能力 | NA | 克服条件变分自编码器在未配对数据上生成分布的局限性 | 高维图像和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 条件变分自编码器（CVAE） | 变分自编码器（VAE） | 高维数据 | NA |
| 24505 | 2024-08-09 |
Comprehensive network modeling from single cell RNA sequencing of human and mouse reveals well conserved transcription regulation of hematopoiesis
2020-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07241-2
PMID:33372598
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类和小鼠骨髓中的转录调控网络，揭示了血液生成过程中转录调控的保守性 | 设计了一种网络重建算法，用于比较人类和小鼠骨髓细胞中血液生成相关基因的共表达和转录调控 | NA | 研究血液生成过程中的转录调控网络的保守性 | 人类和小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的骨髓细胞 |
| 24506 | 2024-08-09 |
Airway-Associated Macrophages in Homeostasis and Repair
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108553
PMID:33378665
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，研究了小鼠气管在稳态和上皮损伤/修复过程中的髓系细胞特征 | 本文首次详细描述了与气道相关的亚粘膜巨噬细胞和上皮内巨噬细胞，并探讨了它们在损伤后的动态变化及其对修复过程的影响 | NA | 研究气道相关巨噬细胞在稳态和修复过程中的作用 | 小鼠气管的髓系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 细胞 | 小鼠气管样本 |
| 24507 | 2024-08-09 |
Aging-Associated Alterations in Mammary Epithelia and Stroma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108566
PMID:33378681
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细分析了年轻和老年小鼠乳腺组织的转录组图谱，揭示了与年龄相关的乳腺上皮和基质细胞的改变 | 首次系统地研究了年龄诱导的乳腺上皮和基质细胞的改变，并揭示了潜在的促肿瘤发生机制 | NA | 探究年龄对乳腺生理的影响及其与乳腺癌风险的关系 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织样本 |
| 24508 | 2024-08-09 |
Feature Selection for Topological Proximity Prediction of Single-Cell Transcriptomic Profiles in Drosophila Embryo Using Genetic Algorithm
2020-12-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12010028
PMID:33379262
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研究论文 | 本文使用遗传算法（GA）和DistMap算法来预测果蝇胚胎中单细胞转录组特征的拓扑邻近性，并选择最重要的基因 | 本文详细讨论了遗传算法的实现及其在挑战后的参数化，旨在改进基于GA的基因集选择方法，以更有效地预测拓扑关联 | 由于复杂的聚合排名，该方法的详细信息未能在主要挑战出版物中发表 | 旨在改进基于遗传算法的基因集选择方法，以更有效地预测单细胞相似性 | 果蝇胚胎中的单细胞转录组特征 | 基因组学 | NA | 遗传算法（GA） | DistMap算法 | 转录组数据 | 从84个已知的原位基因模式中选择了60、40和20个基因的单细胞数据集 |
| 24509 | 2024-08-09 |
Constitutive activation of cellular immunity underlies the evolution of resistance to infection in Drosophila
2020-12-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59095
PMID:33357377
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研究论文 | 本文研究了果蝇在高度寄生虫寄生下通过增强细胞免疫反应来发展抗性的机制 | 通过单细胞RNA测序发现，抗性果蝇的免疫诱导基因被持续上调，这是由于抗性幼虫分化出之前仅在感染后产生的特殊免疫细胞的前体细胞 | NA | 探讨果蝇在高度寄生环境下如何通过增强细胞免疫反应来发展抗性 | 果蝇及其对寄生虫的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24510 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Immune Mechanisms of the Onset and Progression of IgA Nephropathy
2020-12-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108525
PMID:33357427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞，揭示了IgA肾病的免疫机制及其发病和进展过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了IgA肾病中免疫细胞和肾细胞的分子事件，特别是JCHAIN在系膜细胞中的上调机制 | NA | 揭示IgA肾病的发病和进展的免疫机制 | IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgA肾病和正常样本 |
| 24511 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals that the Switching of the Transcriptional Profiles of Cysteine-Related Genes Alters the Virulence of Entamoeba histolytica
2020-Dec-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.01095-20
PMID:33361325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究了阿米巴原虫的转录组特征，揭示了硫代谢和蛋白酶体途径在病原性中的重要性，并探讨了在胱氨酸缺乏条件下，阿米巴原虫如何调节胱氨酸相关基因的表达以影响其毒力和吞噬作用。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了阿米巴原虫在胱氨酸缺乏条件下的转录组变化，以及这种变化如何影响其毒力和细胞毒性。 | 研究主要集中在单个阿米巴原虫的转录组分析，未涉及更广泛的细胞群体或其他相关病原体的比较研究。 | 探讨阿米巴原虫的转录组特征及其在胱氨酸缺乏条件下的调节机制，以理解其毒力变化的生物学特性。 | 阿米巴原虫的单个原虫及其后代 | 数字病理学 | 阿米巴病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个阿米巴原虫及其后代 |
| 24512 | 2024-08-09 |
Modulation of Immune Checkpoints by Chemotherapy in Human Colorectal Liver Metastases
2020-12-22, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100160
PMID:33377131
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研究论文 | 本研究探讨了化疗对人类结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 发现了两种对化疗反应不同的细胞亚型，并揭示了化疗与免疫检查点抑制剂联合使用的潜在协同效应 | NA | 研究化疗对结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 人类结直肠癌肝转移瘤切片 | NA | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8例 |
| 24513 | 2024-08-09 |
[Research advances on application of single-cell RNA sequencing in islet cell biology]
2020-Dec-20, Zhonghua shao shang za zhi = Zhonghua shaoshang zazhi = Chinese journal of burns
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学研究中的应用进展 | 单细胞RNA测序技术能够表征稀有类型的内分泌细胞，发现典型内分泌细胞的细胞异质性和新的细胞亚型，分析不同物种间内分泌细胞的差异，并更准确地描述各种类型胰岛细胞在发育过程和代谢疾病中的不同状态 | 目前单细胞RNA测序对低丰度转录本的检测效率相对较低 | 探讨单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学中的应用 | 胰岛细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及人类和鼠类的胰岛细胞 |
| 24514 | 2024-08-09 |
Preparing Highly Viable Single-Cell Suspensions from Mouse Pancreatic Islets for Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100144
PMID:33377038
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研究论文 | 本文描述了一种从鼠胰腺胰岛中制备高存活率单细胞悬液的方法，用于单细胞RNA测序 | 提供了一种有效的鼠胰腺胰岛单细胞悬液制备协议，适用于单细胞RNA测序 | NA | 研究胰腺胰岛的细胞异质性和亚群 | 鼠胰腺胰岛的单细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 24515 | 2024-08-09 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
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研究论文 | 本文介绍了一种针对包括COVID-19在内的传染病进行单细胞转录组学研究的完整且安全的实验流程 | 提出了一个针对新病原体SARS-CoV-2的安全实验流程，用于从细胞分离到数据分析的scRNA-seq实验 | NA | 开发一种安全的工作流程，用于研究包括COVID-19在内的传染病的单细胞转录组学 | 感染患者的血液样本 | 单细胞测序 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 感染患者的血液样本 |
| 24516 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of mouse preimplantation embryos by third-generation sequencing
2020-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001017
PMID:33378329
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研究论文 | 本文开发了一种基于第三代测序平台的新型单细胞RNA测序技术SCAN-seq，并应用于小鼠植入前胚胎的分析 | SCAN-seq技术具有高灵敏度和准确性，能够捕获大量未注释的转录本，并展示出高验证率 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序技术，并应用于小鼠植入前胚胎的转录组分析 | 小鼠植入前胚胎 | 基因组学 | NA | 第三代测序（TGS） | NA | RNA序列 | 9,338个基因中的27,250个未注释转录本 |
| 24517 | 2024-08-09 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Heterogeneities of Non-cardiomyocytes in Healthy and Ischemic Hearts
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.615161
PMID:33365332
|
研究论文 | 本研究通过整合三个代表性的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，探讨了在心肌梗死或假手术后3天和7天分离的27,349个非心肌细胞的异质性 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，揭示了健康和非健康心脏中非心肌细胞的不同动态和功能特性 | NA | 旨在探讨是否可以通过整合多个相似的scRNA-seq数据集，更全面地理解疾病 | 非心肌细胞在健康和心肌缺血心脏中的异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 27,349个非心肌细胞 |
| 24518 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into retinal endothelial barrier properties
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33380778
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研究论文 | 通过分析牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组，深入了解视网膜内皮屏障特性 | 开发了一种单细胞转录组学工作流程，并揭示了视网膜微血管屏障中先前未报道的连接蛋白 | NA | 更好地表征视网膜内皮屏障特性 | 牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个RMECs |
| 24519 | 2024-08-09 |
Identification of Pro-Fibrotic Macrophage Populations by Single-Cell Transcriptomic Analysis in West Highland White Terriers Affected With Canine Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.611749
PMID:33384697
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞群体，以识别与疾病相关的细胞异质性 | 首次在犬类特发性肺纤维化模型中使用单细胞RNA测序技术，识别出具有促纤维化能力的巨噬细胞/单核细胞群体 | 需要进一步研究以理解这些巨噬细胞/单核细胞群体在疾病发病机制中的具体作用 | 识别和分析患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬肺部中的促纤维化巨噬细胞群体 | 患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 犬类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5只患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬和3只健康西高地白梗犬 |
| 24520 | 2024-08-09 |
Sc-GPE: A Graph Partitioning-Based Cluster Ensemble Method for Single-Cell
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.604790
PMID:33384718
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图划分聚类集成的单细胞RNA测序数据分析方法Sc-GPE | Sc-GPE结合了五种基于图划分的单细胞聚类方法，并通过构建加权共识矩阵来区分各方法的重要性 | NA | 开发一种有效的聚类集成策略，用于解决不同单细胞聚类方法结果不一致的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图划分聚类方法 | 数据矩阵 | 12个单细胞RNA测序数据集 |