单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 24481 - 24500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24481 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes display distinct transcriptional and phenotypic properties
2020-12-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002843
PMID:33351116
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、组织学、倍性分析和流式细胞术研究了来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞的转录组和表型特征 | 发现肺巨核细胞具有独特的转录特征，富集了成熟标志物，可能表明其具有更高效的血小板生产能力，并且表现出免疫和炎症相关的富集特征 | NA | 探讨肺巨核细胞的转录和表型特性 | 肺巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞 |
| 24482 | 2024-08-09 |
Pulmonary neuroendocrine cells: physiology, tissue homeostasis and disease
2020-12-21, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.046920
PMID:33355253
|
综述 | 本文综述了肺神经内分泌细胞（PNECs）的生理功能、组织稳态及其在疾病中的作用 | 介绍了PNECs在肺通气动力学、机械感应和类型2免疫反应中的作用，以及单细胞RNA测序揭示的PNECs基因表达异质性和再生过程中的重编程 | NA | 深入理解PNECs的基本特性在肺生物学和病理学中的重要性 | 肺神经内分泌细胞（PNECs）及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24483 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对人类寄生虫曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段进行了细胞图谱分析 | 首次为曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段提供了全面的细胞类型图谱 | NA | 揭示驱动曼氏血吸虫在哺乳动物体内发育的机制 | 曼氏血吸虫的早期发育阶段，特别是称为血吸虫幼虫的阶段 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两天的曼氏血吸虫幼虫样本 |
| 24484 | 2024-08-09 |
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01499-8
PMID:33339962
|
research paper | 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统，用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 | 开发了一种新的测序系统，能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息，并提出了名为“分子足迹”的新方法 | NA | 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 | DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 | NA | NA | 单分子测序 | NA | DNA条形码分子 | 30种DNA条形码分子 |
| 24485 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10120513
PMID:33353164
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响，并识别了不同β细胞群的基因表达模式 | 研究仅限于一周的高脂饮食干预，可能无法完全反映长期饮食干预的影响 | 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 | 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本 |
| 24486 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01476-1
PMID:33328604
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞，揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型，并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞，并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 | 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌，可能影响结果的普遍性。 | 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 | 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本 |
| 24487 | 2024-08-09 |
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Kidney Organoids with Improved Collecting Duct Maturation and Injury Modeling
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108514
PMID:33326782
|
研究论文 | 本文通过独立生成两种肾前体细胞群——间充质和尿管芽样细胞，成功生成了具有收集系统的肾类器官，并探讨了激素在收集管细胞分化中的作用。 | 本文首次通过独立生成两种肾前体细胞群，实现了肾类器官中收集系统的形成，并利用单细胞RNA测序技术展示了近端小管成熟度的提高和非目标细胞群的减少。 | NA | 探索人类多能干细胞衍生的肾类器官在药物测试和再生医学中的应用，以及疾病模型的建立。 | 人类多能干细胞衍生的肾类器官及其收集管成熟和损伤模型的建立。 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 24488 | 2024-08-09 |
GAS2L1 Is a Potential Biomarker of Circulating Tumor Cells in Pancreatic Cancer
2020-Dec-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123774
PMID:33333841
|
研究论文 | 本研究分析了胰腺癌循环肿瘤细胞（CTC）的单细胞RNA测序数据，并提出GAS2L1作为胰腺癌CTC的新型生物标志物 | 本研究通过组合使用GAS2L1和其他标志物，提高了胰腺癌CTC的检测率 | NA | 探索胰腺癌循环肿瘤细胞的生物标志物 | 胰腺癌循环肿瘤细胞及其生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括遗传工程小鼠模型（GEMM）和胰腺癌患者样本 |
| 24489 | 2024-08-09 |
The Evolving Knowledge on T and NK Cells in Classic Hodgkin Lymphoma: Insights into Novel Subsets Populating the Immune Microenvironment
2020-Dec-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123757
PMID:33327433
|
综述 | 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中T细胞和NK细胞的最新研究进展，特别是通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等高维度分析技术揭示的免疫微环境中T细胞和NK细胞亚群的新发现 | 利用高维度分析技术揭示了cHL中T细胞和NK细胞亚群的新组成，并识别出具有耗竭表型的新型细胞毒性亚群，这些发现有助于理解先前未被认识的免疫逃逸机制 | NA | 探讨cHL微环境中最近识别的T细胞和NK细胞亚群的免疫学特征和功能属性，并讨论如何利用这些知识预测免疫治疗反应及设计提高PD-1阻断疗效的新策略 | 经典霍奇金淋巴瘤中的T细胞和NK细胞亚群 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 24490 | 2024-08-09 |
Elevated TUBA1A Might Indicate the Clinical Outcomes of Patients with Gastric Cancer, Being Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment
2020-Dec-12, Journal of gastrointestinal and liver diseases : JGLD
IF:2.1Q3
DOI:10.15403/jgld-2834
PMID:33331338
|
研究论文 | 本研究评估了TUBA1A在胃癌中的表达及其对临床结果的影响，特别是与肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的关联 | 首次探讨了TUBA1A与胃癌患者生存和临床病理特征的关系，以及其在肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的作用 | NA | 探究TUBA1A在胃癌中的表达及其对患者生存和临床病理特征的影响 | 胃癌患者及正常样本中的TUBA1A表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 基因集富集分析(GSEA) | NA | RNA测序数据 | 1881个样本，包括1618名胃癌患者和263个正常样本 |
| 24491 | 2024-08-09 |
Creation of bladder assembloids mimicking tissue regeneration and cancer
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-3034-x
PMID:33328632
|
研究论文 | 本文通过重组组织干细胞与基质成分，创建了多层膀胱'装配体'，模拟成熟器官结构和相关组织微环境，并开发了恶性肿瘤装配体以重现体内尿路上皮癌的病理生理特征。 | 本文创新性地创建了模拟成熟膀胱结构和功能的膀胱装配体，并开发了恶性肿瘤装配体，揭示了FOXA1-BMP-hedgehog信号反馈轴在肿瘤可塑性控制中的重要性。 | NA | 研究旨在开发新型组织模型，以更好地模拟成熟器官结构和功能，并探索肿瘤发展的分子机制。 | 膀胱组织装配体及其恶性肿瘤对应物。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 24492 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
|
研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集，并与肿瘤免疫微环境密切相关，可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析，单细胞测序 | NA | 转录组数据，单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本，6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 24493 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
|
研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱，并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例，对照组6例 |
| 24494 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
|
研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR，用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目，并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响，实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果，且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法，以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集，单细胞数量从822到5,132 |
| 24495 | 2024-08-09 |
Dysfunction of VIPR2 leads to myopia in humans and mice
2022-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2020-107220
PMID:33318135
|
研究论文 | 研究VIP-VIPR2信号通路在调控近视发展中的作用 | 首次揭示了VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用，并验证了VIPR2基因敲除小鼠的近视表型 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类中验证 | 探究VIP-VIPR2信号通路在近视发展中的作用 | VIP-VIPR2信号通路及其在近视发展中的影响 | NA | 近视 | 单细胞转录组测序，批量RNA测序，药理学操作，基因敲除研究 | NA | RNA | 中国汉族人群中的高近视关联分析，VIPR2基因敲除小鼠 |
| 24496 | 2024-08-09 |
Circulating tumor cell detection and single-cell analysis using an integrated workflow based on ChimeraX® -i120 Platform: A prospective study
2021-09, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12876
PMID:33301640
|
研究论文 | 本文开发了一种基于ChimeraX -i120平台的综合工作流程，用于循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，并通过477名参与者的前瞻性研究验证了其临床可行性。 | 该研究首次整合了CTC检测和单细胞分子分析，使用ChimeraX -i120平台进行负富集、免疫荧光标记和基于机器学习的CTC识别，具有高灵敏度、准确性和可重复性。 | NA | 开发和验证一种新的综合工作流程，用于非侵入性临床癌症管理中的循环肿瘤细胞检测和单细胞分子分析。 | 循环肿瘤细胞（CTC）的检测和单细胞分子分析，以及其在临床癌症管理中的应用。 | 数字病理学 | 肝癌、胆管癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌 | 免疫荧光标记、机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞测序数据 | 477名参与者 |
| 24497 | 2024-08-09 |
scGMAI: a Gaussian mixture model for clustering single-cell RNA-Seq data based on deep autoencoder
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa316
PMID:33300547
|
研究论文 | 提出了一种基于自动编码器和高斯混合模型的单细胞RNA测序数据聚类方法scGMAI | scGMAI结合了自动编码器网络和快速独立成分分析(FastICA)，在17个公共单细胞RNA测序数据集上优于现有工具，如Seurat | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据聚类和细胞类型识别工具 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 高斯混合模型 | 基因表达数据 | 17个公共单细胞RNA测序数据集 |
| 24498 | 2024-08-09 |
ColorCells: a database of expression, classification and functions of lncRNAs in single cells
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa325
PMID:33313674
|
研究论文 | 本文开发了ColorCells数据库，用于比较分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNA的表达、分类和功能 | 首次识别出一批细胞特异性的lncRNA，并验证了其在细胞分类中的能力与已知标记基因相当 | NA | 揭示lncRNA在单细胞水平上的表达特异性和功能 | lncRNA在单细胞中的表达和功能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-Seq数据 | 167,913个来自六种物种的公开单细胞RNA-Seq数据集 |
| 24499 | 2024-08-09 |
Goals and approaches for each processing step for single-cell RNA sequencing data
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa314
PMID:33316046
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据处理各步骤的目标和最流行的计算分析工具 | 提供了对单细胞RNA测序数据质量控制、归一化、插补、特征选择和降维等步骤的全面概述 | 尚未形成适用于所有数据集的金标准分析流程 | 帮助研究者根据特定数据集选择合适的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24500 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of psoriatic skin identifies pathogenic Tc17 cell subsets and reveals distinctions between CD8+ T cells in autoimmunity and cancer
2021-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.028
PMID:33309739
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了银屑病皮肤病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 发现了11种转录上多样化的CD8+ T细胞亚群，其中包括两种与疾病严重程度相关的非耗竭性Tc17细胞亚群 | NA | 旨在全面表征银屑病病变中CD8+ T细胞的表型变异 | 银屑病和健康皮肤的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机分类器 | 转录组 | 银屑病和健康皮肤的多个样本 |