单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28482 篇文献，本页显示第 24441 - 24460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24441 | 2024-08-08 |
Adaptive Total-Variation Regularized Low-Rank Representation for Analyzing Single-Cell RNA-seq Data
2021-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00444-5
PMID:34076860
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研究论文 | 本文介绍了一种名为自适应总变差正则化低秩表示（ATV-LRR）的新模型，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，以识别细胞亚型和功能 | ATV-LRR模型能够重建低秩子空间结构，学习细胞间的相似性，并能分割多个线性子空间，提取重要信息。此外，自适应总变差还能通过学习数据的梯度信息去除细胞噪声并保留细胞特征细节 | NA | 分析单细胞RNA测序数据，识别细胞亚型和功能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 自适应总变差正则化低秩表示（ATV-LRR） | 基因表达数据 | NA |
| 24442 | 2024-08-08 |
Cell-type diversity in the bed nucleus of the stria terminalis to regulate motivated behaviors
2021-08-06, Behavioural brain research
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.bbr.2021.113401
PMID:34090941
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综述 | 本文综述了终纹床核（BNST）中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据揭示了BNST中多种遗传可识别的细胞类型簇 | 由于BNST神经元内高度分子异质性，该区域如何精确调节不同动机状态的机制仍不清楚 | 探讨BNST中不同神经元亚群的多样性及其在调节动机行为中的功能角色 | 终纹床核（BNST）中的神经元亚群及其在调节动机行为中的作用 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24443 | 2024-08-08 |
SARS-CoV-2 infection induces beta cell transdifferentiation
2021-08-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.05.015
PMID:34081913
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研究论文 | 本文描述了SARS-CoV-2病毒抗原在COVID-19患者胰腺beta细胞中的检测，并通过单细胞RNA测序和免疫染色证实了SARS-CoV-2感染引起的细胞应激反应和趋化因子诱导，以及beta细胞向alpha和腺泡细胞的转分化现象。 | 首次展示了SARS-CoV-2感染导致胰腺beta细胞转分化的现象，并发现这一过程可以通过trans-ISRIB抑制剂逆转。 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染与糖尿病之间的关联及其潜在的病理机制。 | COVID-19患者的胰腺beta细胞及SARS-CoV-2感染的影响。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的胰腺组织样本 |
| 24444 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing detects persistent cell type- and methylmercury exposure paradigm-specific effects in a human cortical neurodevelopmental model
2021-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2021.112288
PMID:34089799
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序（scRNAseq）评估了发育期甲基汞暴露在人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型中的持久效应 | 首次展示了甲基汞在人发育皮质神经元中引起的基因表达变化，这些变化在暴露停止后仍然存在，并且这些变化是细胞类型、发育阶段和暴露范式特异性的 | NA | 评估发育期甲基汞暴露对人类皮质神经发育的持久影响 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 暴露于0.1和1.0 μM甲基汞浓度的人诱导多能干细胞（hiPSC）分化皮质模型 |
| 24445 | 2024-08-08 |
Endogenous neural stem cells modulate microglia and protect against demyelination
2021-07-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.05.002
PMID:34087164
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研究论文 | 本文研究了内源性神经干细胞在脱髓鞘过程中的免疫调节作用 | 首次提出内源性神经干细胞通过调节小胶质细胞和免疫反应，促进髓鞘再生 | NA | 探讨内源性神经干细胞在脱髓鞘过程中的免疫调节作用 | 内源性神经干细胞和小胶质细胞在脱髓鞘过程中的相互作用 | 神经科学 | 脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24446 | 2024-08-08 |
The molecular and epigenetic mechanisms of innate lymphoid cell (ILC) memory and its relevance for asthma
2021-07-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201354
PMID:34076685
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研究论文 | 研究探讨了先天淋巴细胞（ILC）记忆的分子和表观遗传机制及其与哮喘的关系 | 首次揭示了ILC2s在记忆驱动哮喘中的关键作用，并通过ATAC-seq和scRNA-seq技术识别了记忆ILC2s的独特表观遗传景观和基因调控网络 | 研究主要基于Rag1-/-小鼠模型，可能需要进一步在其他模型或人类样本中验证结果 | 阐明ILC记忆的分子和表观遗传机制及其在哮喘中的作用 | 先天淋巴细胞（ILC）记忆及其在哮喘中的作用 | 数字病理学 | 哮喘 | ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | Rag1-/-小鼠 |
| 24447 | 2024-08-08 |
The effect of methanol fixation on single-cell RNA sequencing data
2021-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07744-6
PMID:34090348
|
研究论文 | 本文研究了甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 首次深入分析了甲醇固定对样本RNA完整性的影响，并阐明了在不同单细胞RNA测序实验设计中使用固定的潜在后果 | NA | 探讨甲醇固定对单细胞RNA测序数据的影响 | 甲醇固定的细胞与活细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24448 | 2024-08-08 |
PIKE-R2P: Protein-protein interaction network-based knowledge embedding with graph neural network for single-cell RNA to protein prediction
2021-Jun-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04022-w
PMID:34078261
|
研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质-蛋白质相互作用网络和图神经网络的知识嵌入方法PIKE-R2P，用于单细胞RNA到蛋白质的预测 | PIKE-R2P方法结合了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）和先验知识嵌入到图神经网络中，显著提高了预测性能 | NA | 开发一种新的机器学习模型，用于从单细胞RNA测序数据预测蛋白质丰度 | 单细胞RNA到蛋白质的预测 | 机器学习 | NA | 图神经网络 | 图神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 24449 | 2024-08-08 |
The immune modulatory effects of umbilical cord-derived mesenchymal stromal cells in severe COVID-19 pneumonia
2021-06-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02376-9
PMID:34078447
|
研究论文 | 研究脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节作用 | 首次提供了脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19背景下可能相关的免疫学数据 | 研究仅基于单个患者的数据，可能缺乏广泛的代表性 | 探讨脐带源性间充质基质细胞在严重COVID-19肺炎中的免疫调节效果 | 严重COVID-19肺炎患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA和功能性检测 | NA | 血液和支气管肺泡灌洗液样本 | 单个患者 |
| 24450 | 2024-08-08 |
Mammary cell gene expression atlas links epithelial cell remodeling events to breast carcinogenesis
2021-06-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02201-2
PMID:34079055
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了50K小鼠和24K人类乳腺上皮细胞图谱，涵盖了大部分生命阶段，以表征乳腺上皮细胞在发育、妊娠和绝经期间的复杂重塑过程 | 首次整合了小鼠和人类乳腺上皮细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了乳腺上皮细胞重塑与乳腺癌发展之间的关系 | NA | 研究乳腺上皮细胞在不同生命阶段的重塑过程及其与乳腺癌发展的关联 | 小鼠和人类的乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 50K小鼠乳腺上皮细胞和24K人类乳腺上皮细胞 |
| 24451 | 2024-08-08 |
Targeting of the CD80/86 proinflammatory axis as a therapeutic strategy to prevent severe COVID-19
2021-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90797-0
PMID:34075090
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研究论文 | 本文探讨了通过阻断CD80/86促炎轴作为治疗策略来预防严重COVID-19的可能性 | 提出了使用abatacept药物阻断CD80/86共刺激信号作为治疗严重COVID-19的新策略 | 研究样本量较小，且仅限于特定患者群体 | 验证阻断CD80/86促炎轴作为治疗严重COVID-19的有效性 | COVID-19患者的免疫反应和治疗效果 | 免疫学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 共涉及86名患者，包括38名风湿病患者和48名COVID-19患者 |
| 24452 | 2024-08-08 |
coupleCoC+: An information-theoretic co-clustering-based transfer learning framework for the integrative analysis of single-cell genomic data
2021-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009064
PMID:34077420
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研究论文 | 本文提出了一种基于信息论的共聚类转移学习框架coupleCoC+，用于单细胞基因组数据的整合分析 | coupleCoC+利用源数据中的信息辅助目标数据的分析，通过链接特征实现有效知识转移，并匹配源数据和目标数据中的相似细胞类型 | NA | 提高多模态单细胞基因组数据的整体聚类性能 | 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据和单细胞甲基化数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, sc-methylation | 共聚类框架 | 基因组数据 | 包括小鼠皮质scATAC-seq和scRNA-seq数据、小鼠和人类scRNA-seq数据、小鼠皮质sc-methylation和scRNA-seq数据，以及来自两个批次的人类血液树突细胞scRNA-seq数据 |
| 24453 | 2024-08-08 |
Direct and indirect immune effects of CMP-001, a virus-like particle containing a TLR9 agonist
2021-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-002484
PMID:34083419
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研究论文 | 本文探讨了含有TLR9激动剂的病毒样颗粒CMP-001对树突状细胞和单核细胞的免疫刺激作用及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 研究揭示了CMP-001通过抗Qβ抗体反应激活树突状细胞和单核细胞，进而增强肿瘤T细胞反应的复杂机制 | NA | 探索CMP-001对树突状细胞和单核细胞的初始效应如何激活其他细胞，从而促进肿瘤T细胞反应的发展 | CMP-001对不同外周血单个核细胞（PBMC）群体的摄取及其对肿瘤T细胞反应的影响 | 免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种外周血单个核细胞（PBMC）群体 |
| 24454 | 2024-08-08 |
Stromal Heterogeneity in the Human Proliferative Endometrium-A Single-Cell RNA Sequencing Study
2021-May-22, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11060448
PMID:34067358
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨人类增殖期子宫内膜中的基质细胞异质性 | 通过单细胞RNA测序技术发现了多种基质细胞群体，这些群体可能具有控制炎症和细胞外基质组成的能力 | NA | 旨在理解健康再生过程中的细胞相互作用，并为良性妇科疾病的治疗开发新疗法 | 人类增殖期子宫内膜的基质细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自健康生育期女性的增殖期子宫内膜活检样本 |
| 24455 | 2024-08-08 |
Dysregulation of Pulmonary Responses in Severe COVID-19
2021-05-21, Viruses
DOI:10.3390/v13060957
PMID:34064104
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研究论文 | 本研究重新分析了已发表的单细胞RNA测序数据，探讨了严重COVID-19患者与轻症患者在支气管肺泡灌洗液中细胞类型的差异及其对肺部病理的影响。 | 发现了严重COVID-19患者中TH17型细胞减少、IFNA1表达细胞减少且TLR7和TLR8表达降低，以及IgA表达B细胞和超活化上皮细胞（或巨噬细胞）增加等现象，并提出IFN-I和PAI-1作为预测严重COVID-19的潜在生物标志物。 | NA | 探讨严重COVID-19患者的肺部反应失调机制，并寻找潜在的生物标志物。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞类型及其表达特征。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 24456 | 2024-08-08 |
Regulation and Role of Transcription Factors in Osteogenesis
2021-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115445
PMID:34064134
|
综述 | 本文综述了转录因子在成骨过程中的调控作用及其机制 | 介绍了通过谱系追踪、细胞分选和单细胞转录组研究在骨骼干细胞和基因调控方面的新发现 | NA | 探讨转录因子在成骨过程中的调控作用 | 成骨细胞的分化及其调控机制 | NA | NA | 谱系追踪、细胞分选、单细胞转录组 | NA | NA | NA |
| 24457 | 2024-08-08 |
Characterization of Alternative Splicing (AS) Events during Chicken (Gallus gallus) Male Germ-Line Stem Cell Differentiation with Single-Cell RNA-seq
2021-May-20, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani11051469
PMID:34065391
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了鸡雄性生殖干细胞分化过程中的可变剪接事件 | 首次在全基因组范围内提供了鸡雄性生殖干细胞可变剪接事件的综合图谱 | NA | 深入理解生殖细胞分化过程，为家禽繁殖、干细胞生物学及人类药物研发开辟新途径 | 鸡的胚胎干细胞、性腺原始生殖细胞和精原干细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共检测了来自15,338个基因的38,494个可变剪接事件，以及来自14,783个基因的48,955个事件和来自15,089个基因的49,900个事件 |
| 24458 | 2024-08-08 |
Fabrication of Microfluidic Devices for Emulsion Formation by Microstereolithography
2021-May-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26092817
PMID:34068649
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综述 | 本文综述了使用微立体光刻技术制造用于乳液形成的微流控设备的基本原理和最新创新 | 微立体光刻技术简化了设备制造过程，提供了真正的三维几何形状，成本效益高，并支持多材料加工 | NA | 支持研究人员建立自己的微立体光刻系统以制造定制的微流控设备 | 微立体光刻技术及其在微流控设备制造中的应用 | 微流控技术 | NA | 微立体光刻（PµSL） | NA | NA | NA |
| 24459 | 2024-08-08 |
The Cellular Composition of Bovine Coccygeal Intervertebral Discs: A Comprehensive Single-Cell RNAseq Analysis
2021-May-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094917
PMID:34066404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNAseq）和批量RNA测序（RNAseq）分析了牛尾椎间盘的细胞组成，揭示了核软骨（NP）和纤维环（AF）中的细胞群及其发育变化。 | 本文首次整合scRNAseq和RNAseq数据，稳定了聚类结果，并鉴定了NP和AF结构/组织特异性基因，揭示了年轻牛椎间盘中NP和AF的细胞表型复杂性。 | NA | 支持退化椎间盘再生治疗的研究 | 牛尾椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），批量RNA测序（RNAseq） | NA | RNA序列 | NA |
| 24460 | 2024-08-08 |
The Transcriptome of SH-SY5Y at Single-Cell Resolution: A CITE-Seq Data Analysis Workflow
2021-May-06, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps4020028
PMID:34066513
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研究论文 | 本文介绍了一种CITE-seq数据分析流程，用于分析SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | CITE-seq技术结合了抗体标记和细胞分选的免疫表型能力与单细胞RNA测序的分辨率，通过添加12-bp核苷酸条形码到抗体上，可以在同一运行中对多个条形码样本进行测序，从而降低scRNA-seq的成本 | NA | 展示理想的CITE-seq数据分析流程，并探索细胞异质性 | SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞系的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | CITE-seq | NA | 转录组数据 | 2879个单细胞 |