单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 24421 - 24440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24421 | 2024-08-09 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术，对患有胆汁淤积性肝病的儿童肝脏中的巨噬细胞进行了转录组特征分析，并识别出三种不同的巨噬细胞亚群 | 首次在人类儿童胆汁淤积性肝病中进行单细胞RNA测序，并识别出三种具有独特转录特征的巨噬细胞亚群 | NA | 进一步阐明儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录组特征 | 儿童胆汁淤积性肝病中的巨噬细胞 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胆道闭锁（BA）患者6例，Alagille综合征（ALGS）患者6例 |
| 24422 | 2024-08-09 |
Differences in TCR repertoire and T cell activation underlie the divergent outcomes of antitumor immune responses in tumor-eradicating versus tumor-progressing hosts
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001615
PMID:33414263
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研究论文 | 本文开发了一种独特的HNSCC小鼠模型，通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序，研究了TCR谱和T细胞活化状态在肿瘤清除与肿瘤进展宿主中的差异，揭示了异质性抗肿瘤免疫反应的潜在机制。 | 首次通过单细胞TCR测序和单细胞RNA测序技术，揭示了TCR谱和T细胞活化状态在不同宿主抗肿瘤免疫反应中的差异。 | NA | 研究抗肿瘤免疫反应在不同宿主中的异质性机制，为个性化癌症免疫治疗提供理论基础。 | HNSCC小鼠模型中的TCR谱和T细胞活化状态。 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞TCR测序，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 100%的受体小鼠中肿瘤初始生长，约25%的小鼠无干预下肿瘤清除 |
| 24423 | 2024-08-09 |
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 | 提出将单细胞mRNA测序（scRNA-seq）与其他测序方法（如CITE-seq）结合使用，以提高结果的精确性和可信度 | 未提及具体限制 | 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 | 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA与蛋白质表达数据 | 未提及具体样本数量 |
| 24424 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 | 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 | NA | 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 | 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 单个细胞 |
| 24425 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing: In-depth Decoding of Heart Biology and Cardiovascular Diseases
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的最新进展，并总结了该技术在心脏发育科学、干细胞研究以及正常或疾病相关工作机制方面提供的新见解 | 单细胞RNA测序技术在解码细胞异质性、表型转变和发育动力学方面取得了突破 | NA | 综述单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用 | 心血管系统及其相关疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24426 | 2024-08-09 |
The Comparison of Two Single-cell Sequencing Platforms: BD Rhapsody and 10x Genomics Chromium
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 本文比较了两种单细胞测序平台BD Rhapsody和10x Genomics Chromium的机制和scRNA-seq结果 | 本文提供了对两种常用单细胞测序平台的系统比较 | 目前对这些常用平台的系统比较较少 | 比较两种单细胞测序平台的优势和局限性 | BD Rhapsody和10x Genomics Chromium单细胞测序平台 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | NA |
| 24427 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals compromised immune microenvironment in precursor stages of multiple myeloma
2020-05, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-0053-3
PMID:33409501
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤前驱阶段（MGUS和SMM）及健康捐赠者的骨髓细胞，揭示了早期免疫微环境的变化 | 首次展示了多发性骨髓瘤前驱阶段免疫细胞的早期变化，包括NK细胞的增加和GrK记忆性细胞毒性T细胞的丢失 | NA | 深入了解多发性骨髓瘤前驱阶段的分子特征，以更好地对高风险患者进行分层和治疗 | 多发性骨髓瘤的前驱阶段（MGUS和SMM）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括多发性骨髓瘤前驱阶段（MGUS和SMM）患者及健康捐赠者的骨髓细胞 |
| 24428 | 2024-08-09 |
The T Cell Receptor Immune Repertoire Protects the Liver From Reconsitution
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.584979
PMID:33391261
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝脏内CD45免疫细胞在纤维化发病过程中的转录组，揭示了免疫细胞在肝脏纤维化中的变化及其保护作用 | 发现了与纤维化相关的新的CD8 T和CD4 T细胞亚群，并揭示了T细胞受体（TCR）在纤维化肝脏中的明显下降 | NA | 理解肝脏纤维化发病过程中肝脏内免疫细胞的景观 | 小鼠肝脏内的CD45免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 约10,000个单细胞转录组 |
| 24429 | 2024-08-09 |
Six Immune Associated Genes Construct Prognostic Model Evaluate Low-Grade Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.606164
PMID:33408717
|
研究论文 | 本文通过分析NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，筛选出六个与免疫相关的基因，构建了一个预测低级别胶质瘤预后的风险评分模型 | 首次利用六个特定基因构建风险评分模型，用于评估低级别胶质瘤的预后 | NA | 研究如何通过特定基因评估胶质瘤的预后 | 胶质瘤及其相关的肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因表达分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 包括20个胶质瘤样本和15个对照样本，以及669名患者的生存率数据 |
| 24430 | 2024-08-09 |
Improving gene network inference with graph wavelets and making insights about ageing-associated regulatory changes in lungs
2021-07-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa360
PMID:33381809
|
研究论文 | 本文提出了一种使用图小波滤波器的方法，用于改进基于基因网络（GWNet）的转录组分析，特别是在单细胞表达谱中提高基因网络推断的性能和一致性 | 本文创新性地使用了图小波滤波器来改进基因网络推断方法，特别是在处理含有批次效应的稀疏单细胞表达谱时，提高了预测基因调控网络的一致性 | NA | 旨在改进基因网络推断方法，并探索肺部细胞老化相关的调控变化 | 单细胞转录组表达谱和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 图小波滤波器 | 基因网络（GWNet） | 单细胞转录组表达谱 | NA |
| 24431 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals that maternal obesity affects DNA repair, histone methylation, and autophagy level in mouse embryos
2021-07, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30201
PMID:33368268
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA转录组测序技术，探讨了母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其潜在机制 | 首次揭示了母体肥胖通过影响DNA修复、组蛋白甲基化和自噬水平，从而影响小鼠胚胎早期发育 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类胚胎中验证这些发现 | 探究母体肥胖对小鼠胚胎发育的影响及其分子机制 | 小鼠胚胎在母体肥胖条件下的发育情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及肥胖小鼠的2细胞胚胎及其他发育阶段的胚胎 |
| 24432 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in vision research: Insights into human retinal health and disease
2021-07, Progress in retinal and eye research
IF:18.6Q1
DOI:10.1016/j.preteyeres.2020.100934
PMID:33383180
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在视觉研究中的应用，特别是在人类视网膜健康和疾病研究中的进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的信息分辨率，能够将RNA映射到单个细胞，从而促进视网膜和脉络膜细胞类型的分组和进一步研究 | NA | 总结单细胞RNA测序在视觉研究领域的应用，并探讨其在视网膜疾病研究中的未来方向 | 视网膜、视网膜色素上皮、脉络膜以及视网膜类器官的生物学特性 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及动物模型、视网膜类器官和人类原代视网膜、视网膜色素上皮及脉络膜样本 |
| 24433 | 2024-08-09 |
Niche-specific functional heterogeneity of intestinal resident macrophages
2021-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-323121
PMID:33384336
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综述 | 本文综述了肠道常驻巨噬细胞在黏膜屏障中的特定功能异质性 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了肠道各部位常驻巨噬细胞的功能特化，增进了对这些细胞异质性和潜在生物学功能的理解 | NA | 整合新发现与现有知识，更新对胃肠道巨噬细胞功能的理解，并推测特定亚群在稳态和疾病中的作用 | 肠道常驻巨噬细胞的功能特化和生物学作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24434 | 2024-08-09 |
Human Dermal Fibroblast Subpopulations Are Conserved across Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021-07, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2020.11.028
PMID:33385399
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研究论文 | 本文通过对13,823个人类成年皮肤成纤维细胞的转录组数据进行重新评估，展示了成纤维细胞可以被分为三个主要类型及其下的十个亚型，这些类型和亚型在不同数据集中具有一致性 | 本文通过重新评估单细胞RNA测序数据，揭示了成纤维细胞的三个主要类型及其下的十个亚型，这些类型和亚型在不同数据集中具有一致性 | 目前单细胞RNA测序研究的结果尚不明确，成纤维细胞亚群在不同数据集中的重叠性很低，数量和组成也各不相同 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，提高对皮肤稳态和细胞功能的转录组水平理解 | 人类皮肤成纤维细胞的转录组异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13,823个人类成年皮肤成纤维细胞 |
| 24435 | 2024-08-09 |
Hypertension delays viral clearance and exacerbates airway hyperinflammation in patients with COVID-19
2021-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00796-1
PMID:33361824
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研究论文 | 研究探讨了高血压对COVID-19患者病毒清除和气道过度炎症的影响，以及ACEI和ARB治疗的效果 | 首次结合临床数据和单细胞测序数据，探讨高血压患者在COVID-19中的免疫细胞炎症倾向及其与治疗药物的关系 | 研究样本量有限，无法确定临床疗效 | 探究高血压对COVID-19患者病情进展的影响及抗高血压药物的治疗效果 | COVID-19患者中的高血压患者及其免疫细胞 | NA | 高血压 | 单细胞测序 | NA | 临床数据 | 144名临床数据样本和48个气道样本 |
| 24436 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Survey of Ileal-Anal Pouch Immune Cells From Ulcerative Colitis Patients
2021-04, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.12.030
PMID:33359089
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞，以探讨储袋炎的免疫组织特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了储袋炎和溃疡性结肠炎中肠道炎症的相似性，并识别了特定的免疫细胞亚群及其转录标志物 | 原始序列数据未公开，受患者隐私保护限制 | 探讨回肠储袋-肛管吻合术后储袋炎的免疫组织特征，并寻找个性化治疗溃疡性结肠炎的生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者回肠储袋-肛管吻合术后的免疫细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15名有回肠储袋-肛管吻合术的溃疡性结肠炎患者和11名无此手术的患者 |
| 24437 | 2024-08-09 |
scLM: Automatic Detection of Consensus Gene Clusters Across Multiple Single-cell Datasets
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.09.002
PMID:33359676
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scLM的单细胞隐变量模型算法，用于在多个单细胞数据集中自动检测共识基因簇 | scLM算法能够同时对多个单细胞数据集进行共识聚类，提高了检测基因簇的准确性，并能有效避免批次效应的影响 | NA | 开发一种新的算法来提高单细胞RNA测序数据中基因共表达聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达簇 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 隐变量模型 | 单细胞数据 | 多个单细胞数据集 |
| 24438 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Heterogeneous Cellular Response to BK Virus Infection
2021-02-24, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.02237-20
PMID:33361432
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应 | 首次通过单细胞转录组学揭示了BK病毒感染后细胞的异质性反应，并发现了先前未被识别的被BK病毒下调的通路 | 研究主要集中在体外培养的肾近端小管上皮细胞，可能与体内实际情况存在差异 | 探究BK病毒感染后细胞的异质性反应及其对细胞基因表达模式的影响 | BK病毒感染的肾近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 数千个细胞 |
| 24439 | 2024-08-09 |
Cross-Comparison of Human iPSC Motor Neuron Models of Familial and Sporadic ALS Reveals Early and Convergent Transcriptomic Disease Signatures
2021-02-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.10.010
PMID:33382996
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，研究了来自健康、家族性和散发性肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的运动神经元（MNs），以识别统一的、可重复的ALS特征 | 本文采用单细胞RNA测序技术，通过多次分化和跨平台分析，考虑了遗传和实验变异性，以识别早期、汇聚和运动神经元解析的ALS特征 | 文章指出，遗传和实验变异性限制了iPSC衍生神经培养物的实用性，影响可重复性和追踪发病机制的细胞起源 | 研究目的是通过iPSC衍生的神经培养物模型，识别肌萎缩侧索硬化症（ALS）的早期和汇聚的转录组疾病特征 | 研究对象包括健康、家族性和散发性ALS患者的iPSC衍生的运动神经元 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个患者的iPSC衍生的运动神经元 |
| 24440 | 2024-08-09 |
Cetuximab enhances the anti-tumor function of macrophages in an IL-6 dependent manner
2021-Feb-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2020.118953
PMID:33359746
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研究论文 | 本研究探讨了西妥昔单抗通过抑制EGFR/IL-6通路抑制肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促肿瘤功能 | 发现西妥昔单抗通过抑制IL-6表达，将TAMs从M2样表型转变为M1样表型，从而减轻肿瘤负担 | NA | 研究西妥昔单抗对肿瘤微环境的影响及其分子机制 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和结直肠癌（CRC）患者 | NA | 结直肠癌 | 流式细胞术，Western blotting，RT-qPCR，ELISA | NA | scRNA-seq数据，转录组数据 | 使用AOM/DSS和肿瘤异种移植小鼠模型进行实验，分析公共CRC患者数据集 |