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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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24401 | 2024-08-09 |
Macrophages in SHH subgroup medulloblastoma display dynamic heterogeneity that varies with treatment modality
2021-03-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108917
PMID:33789113
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研究论文 | 研究探讨了SHH亚组髓母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的动态异质性及其在不同治疗方式下的变化 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示了TAM在不同治疗方式下的显著异质性,并识别了不同TAM亚群的标志物 | NA | 研究SHH亚组髓母细胞瘤中TAM的异质性及其对治疗方式的响应 | SHH亚组髓母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 儿童脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 自发性小鼠SHH亚组髓母细胞瘤样本 |
24402 | 2024-08-09 |
Dynamic Expression of Imprinted Genes in the Developing and Postnatal Pituitary Gland
2021-03-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040509
PMID:33808370
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研究论文 | 研究了印记基因在发育和产后垂体中的动态表达 | 首次尝试将印记基因的表达与垂体的形成和功能联系起来,并利用高灵敏度RNA测序和单细胞RNA测序数据描述了垂体的印记转录组 | 由于垂体在发育期间的小尺寸和成熟细胞的复杂性,获取有用的转录组数据存在技术困难 | 探讨印记基因在垂体发育和功能中的作用及其与印记疾病的关联 | 印记基因在垂体中的表达及其对垂体发育和功能的影响 | NA | 印记疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
24403 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Confirms Transcripts and VHDJH Rearrangements of Immunoglobulin Genes in Human Podocytes
2021-03-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12040472
PMID:33806147
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和嵌套PCR结合Sanger测序,证实了人类足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和VHDJH重排 | 首次在单细胞水平上证实了足细胞中免疫球蛋白基因的转录本和重排,并揭示了在病理情况下足细胞表达的免疫球蛋白多样性增加 | NA | 确认足细胞中免疫球蛋白基因的转录本并表征其重排谱 | 人类足细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,嵌套PCR,Sanger测序 | NA | RNA序列 | 360个足细胞用于单细胞RNA测序,48个单足细胞用于嵌套PCR和Sanger测序 |
24404 | 2024-08-09 |
Novel Gene Regulation in Normal and Abnormal Spermatogenesis
2021-03-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10030666
PMID:33802813
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综述 | 本文综述了新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 | 利用单细胞RNA测序等新技术,识别了更多与精子发生相关的调控基因 | NA | 探讨新型基因在正常与异常精子发生中的调控作用及其机制 | 啮齿动物和人类精原干细胞的增殖、分化和凋亡,以及精母细胞和其他生殖细胞的减数分裂 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
24405 | 2024-08-09 |
Single-Cell Expression Landscape of SARS-CoV-2 Receptor ACE2 and Host Proteases in Normal and Malignant Lung Tissues from Pulmonary Adenocarcinoma Patients
2021-Mar-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13061250
PMID:33809063
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研究论文 | 本研究探讨了肺腺癌患者正常和恶性肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | 首次揭示了肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | NA | 阐明肺腺癌患者肺组织中SARS-CoV-2受体ACE2及相关基因的单细胞表达谱 | 肺腺癌患者的正常和恶性肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5个肺腺癌组织和14个匹配的正常组织,共186,916个细胞 |
24406 | 2024-08-09 |
Advancing Drug Discovery for Neurological Disorders Using iPSC-Derived Neural Organoids
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052659
PMID:33800815
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研究论文 | 本文探讨了利用诱导多能干细胞衍生的神经类器官在神经退行性疾病药物发现中的应用 | 文章介绍了使用CRISPR创建同基因模型、单细胞RNA测序和机器学习分析复杂数据集等技术解决方案,以扩大类器官在药物发现中的应用 | 类器官技术在工业界大规模药物筛选中的应用受到可重复性、可扩展性和向人类疾病转化的挑战 | 推动类器官技术在神经退行性疾病大规模药物筛选中的应用 | 诱导多能干细胞衍生的神经类器官及其在神经退行性疾病模型中的应用 | 生物技术 | 神经退行性疾病 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 图像, 文本 | NA |
24407 | 2024-08-09 |
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052667
PMID:33800863
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综述 | 本文综述了脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的作用及其在脊髓微环路中的组织和功能 | 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法,识别出表达一系列遗传和/或神经化学标记的抑制性中间神经元群体,构成功能性微环路 | NA | 探讨抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式及其在感觉运动通路中的调控作用,为治疗与抑制功能缺陷相关的病理状况提供潜在的治疗靶点 | 脊髓抑制性中间神经元及其在感觉运动通路中的作用 | 神经科学 | 感觉和运动障碍 | 转基因操作、神经化学分析、单细胞转录组学 | NA | 基因和神经化学标记 | NA |
24408 | 2024-08-09 |
The transcriptional landscape of Venezuelan equine encephalitis virus (TC-83) infection
2021-03, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0009306
PMID:33788849
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了委内瑞拉马脑炎病毒(TC-83株)感染人星形胶质细胞后的宿主转录组和病毒RNA | 首次在单细胞水平上同时分析宿主转录组和病毒RNA,揭示了病毒感染过程中的细胞间异质性,并识别了抗病毒治疗的潜在靶点 | NA | 研究委内瑞拉马脑炎病毒与宿主细胞的相互作用,寻找抗病毒治疗的潜在靶点 | 委内瑞拉马脑炎病毒(TC-83株)感染的人星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单细胞 |
24409 | 2024-08-09 |
The Role of Diagnostic Biomarkers, Omics Strategies, and Single-Cell Sequencing for Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Severely Obese Patients
2021-Mar-01, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm10050930
PMID:33804302
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研究论文 | 本文探讨了诊断生物标志物、组学策略和单细胞测序在严重肥胖患者非酒精性脂肪肝病中的作用 | 文章介绍了组学技术和单细胞测序在发现生物标志物和增加对非酒精性肝病及脂肪性肝炎病理生理学理解方面的最新进展 | 当前诊断工具如弹性成像在设备和测量质量方面存在局限,尤其是在腹部周长大和皮下脂肪多的患者中 | 旨在发现新的生物标志物,并加深对健康和受损肝脏中个体细胞类型生物学功能的理解 | 严重肥胖患者的非酒精性脂肪肝病 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学和蛋白质组学数据 | NA |
24410 | 2024-08-09 |
A Novel Method to Identify the Differences Between Two Single Cell Groups at Single Gene, Gene Pair, and Gene Module Levels
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.648898
PMID:33790951
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法来比较两个单细胞群在单基因、基因对和基因模块水平上的差异 | 提出了一种新的流程来比较两个单细胞群,包括差异基因表达调用和共表达网络模块等 | NA | 揭示细胞群和细胞类型之间生物学差异的机制,并识别细胞类型特异的分子机制 | 单细胞群在分子水平上的差异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 622个来自小鼠脑部的细胞和1,600个来自人类胰腺的细胞 |
24411 | 2024-08-09 |
Study on the Reparative Effect of PEGylated Growth Hormone on Ovarian Parameters and Mitochondrial Function of Oocytes From Rats With Premature Ovarian Insufficiency
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.649005
PMID:33791307
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研究论文 | 研究聚乙二醇化生长激素对化疗诱导的早发性卵巢功能不全大鼠卵母细胞的修复作用及其对卵巢参数和线粒体功能的影响 | 本研究首次揭示了重组人聚乙二醇化生长激素在提高卵母细胞数量、减轻颗粒细胞凋亡和氧化应激反应方面的潜在作用,并通过单细胞转录组分析确定了与修复过程相关的关键基因 | 高剂量的重组人聚乙二醇化生长激素未能完全恢复受干扰的发情周期和性激素水平 | 探讨重组人聚乙二醇化生长激素对早发性卵巢功能不全大鼠卵泡发育和线粒体功能的潜在影响 | 早发性卵巢功能不全大鼠的卵母细胞、卵巢参数和线粒体功能 | NA | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
24412 | 2024-08-09 |
Transcriptional Profiling Reveals Kidney Neutrophil Heterogeneity in Both Healthy People and ccRCC Patients
2021, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2021/5598627
PMID:33791390
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康人群和ccRCC患者肾脏中的中性粒细胞异质性 | 首次揭示了ccRCC患者肾脏中中性粒细胞的六个亚群,并探讨了其在肿瘤病理和自身免疫中的作用 | NA | 探讨中性粒细胞在肾脏疾病中的异质性和病理意义 | 健康人群和ccRCC患者的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康捐赠者和ccRCC患者的肾脏活检组织 |
24413 | 2024-08-09 |
A Role for Vasoactive Intestinal Peptide Interneurons in Neurodevelopmental Disorders
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000515264
PMID:33794534
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综述 | 本文综述了表达血管活性肠肽(VIP-INs)的大脑皮质GABA能抑制性中间神经元在神经发育障碍(NDDs)中的作用 | 强调了VIP-INs在多个大脑皮质区域的重复电路模式,并探讨了它们如何影响感觉输入、发育和行为 | NA | 探讨VIP-INs在神经发育障碍中的作用机制 | VIP-INs及其相关基因在神经发育障碍中的作用 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
24414 | 2024-08-09 |
Bioconductor toolchain for reproducible bioinformatics pipelines using Rcwl and RcwlPipelines
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab208
PMID:33772584
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研究论文 | 本文介绍了Rcwl和RcwlPipelines工具链,用于在R环境中开发、使用和维护基于Common Workflow Language (CWL)的可重复生物信息学工作流程 | 开发了Rcwl,一个连接R与CWL的接口,并收集了超过100个预构建的工具和管道在RcwlPipelines中,便于研究人员查询和使用 | NA | 提供便携和可重复的数据分析工作流程 | 生物信息学工具和管道 | 生物信息学 | NA | Common Workflow Language (CWL) | NA | NA | NA |
24415 | 2024-08-09 |
ShinyCell: simple and sharable visualization of single-cell gene expression data
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab209
PMID:33774659
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研究论文 | 本文介绍了ShinyCell,一个用于将单细胞RNA测序数据转换为可探索和可共享的交互界面的R包 | ShinyCell提供了一个简单易用的工具,使非计算生物学研究人员也能轻松探索和共享单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个工具,使单细胞RNA测序数据更易于非专业人士探索和共享 | 单细胞RNA测序数据的可视化和共享 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
24416 | 2024-08-09 |
Macrophage phenotypes in tissue repair and the foreign body response: Implications for biomaterial-based regenerative medicine strategies
2021-10-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2021.03.038
PMID:33775905
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综述 | 本文综述了巨噬细胞表型在组织修复和异物反应中的作用,以及对基于生物材料的再生医学策略的潜在影响 | 本文总结了近期关于髓系细胞在生物材料微环境中的异质性的新见解,并讨论了单细胞水平上解析细胞异质性的新工具 | NA | 探讨巨噬细胞异质性对组织修复和异物反应过程的影响,以及对生物材料导向的再生医学应用的潜在意义 | 巨噬细胞表型及其在组织修复和异物反应中的功能特性 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
24417 | 2024-08-09 |
Advances in bulk and single-cell multi-omics approaches for systems biology and precision medicine
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab024
PMID:33778867
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综述 | 本文综述了批量和单细胞多组学方法在系统生物学和精准医学中的进展 | 单细胞方法能够解析细胞动态和异质性,而传统的批量技术则局限于个体/群体层面的研究 | 文章讨论了多组学发展面临的挑战和展望 | 总结批量和单细胞多组学数据生成技术,调查批量和单细胞多模态数据的综合分析方法,并讨论多组学在精准医学中的应用 | 批量和单细胞多组学技术及其在系统生物学和精准医学中的应用 | 系统生物学 | NA | 多组学技术 | NA | 多模态数据 | NA |
24418 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals molecular heterogeneity in human umbilical cord tissue and culture-expanded mesenchymal stem cells
2021-09, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15834
PMID:33763993
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了人类脐带组织及其体外培养的间充质干细胞的分子异质性 | 首次在单细胞分辨率下分析了脐带组织和培养扩增的间充质干细胞的转录组特征,并识别了可能的新转录因子及细胞间相互作用 | NA | 深入理解脐带组织及其培养扩增的间充质干细胞的细胞异质性,为基于间充质干细胞的细胞疗法提供基础生物学见解 | 人类脐带组织及其体外培养的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
24419 | 2024-08-09 |
A Beautiful Day in the Neighborhood: Application of Single-Cell Transcriptomics to Unravel Liver Cell Heterogeneity in Diseased Human Livers
2021-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31827
PMID:33756021
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
24420 | 2024-08-09 |
From Bite to Byte: Dental Structures Resolved at a Single-Cell Resolution
2021-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211001848
PMID:33764175
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)解析哺乳动物牙齿细胞组成的最新研究成果 | 揭示了小鼠门齿中前所未有的细胞类型目录,并发现了牙齿上皮和间质中的新型细胞类型及已知细胞类型的新标记物 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在牙科研究和牙科学中的潜在未来应用 | 哺乳动物牙齿的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 数千个单个细胞 |