单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 24401 - 24420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24401 | 2024-08-09 |
Hematopoietic Stem Cell Niche During Homeostasis, Malignancy, and Bone Marrow Transplantation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.621214
PMID:33553181
|
综述 | 本文综述了骨髓微环境中造血干细胞（HSC）的自我更新和多向分化如何受到严格调控，并探讨了骨髓微环境在白血病和造血干细胞移植（HSCT）后的变化 | 利用单细胞测序和成像技术研究骨髓微环境在血液恶性肿瘤和HSCT后的情况 | NA | 探讨骨髓微环境的不同组成部分如何调节正常造血，以及在白血病和HSCT后的变化 | 骨髓微环境中的造血干细胞及其在白血病和HSCT后的调控机制 | NA | 白血病 | 单细胞测序和成像 | NA | NA | NA |
| 24402 | 2024-08-09 |
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.626541
PMID:33553166
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 | 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识，并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 | NA | 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 | 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | NA |
| 24403 | 2024-08-09 |
Shades of white: new insights into tissue-resident leukocyte heterogeneity
2022-01, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15737
PMID:33513286
|
研究论文 | 本文讨论了组织驻留白细胞的异质性及其在健康和疾病状态下的功能多样性 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了组织驻留白细胞前所未有的异质性水平 | NA | 探讨组织驻留白细胞的异质性及其在不同器官中的多样性 | 组织驻留白细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24404 | 2024-08-09 |
Longitudinal single-cell RNA-seq of hESCs-derived retinal organoids
2021-Oct, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1836-7
PMID:33521856
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对由人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官在五个不同时间点进行分析，揭示了视网膜发育过程中细胞类型和分子特征的动态变化 | 首次在视网膜类器官发育过程中识别出九种不同的细胞群体，并发现胰岛素受体（INSR）在光感受器生成中的特定表达作用，以及pleiothropin（PTN）-蛋白酪氨酸磷酸酶受体类型Z1（PTPRZ1）在Müller细胞和视网膜前体细胞间的新型相互作用 | NA | 研究人视网膜发育过程并模拟视网膜类器官中的发育障碍 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 五个时间点的视网膜类器官样本 |
| 24405 | 2024-08-09 |
jSRC: a flexible and accurate joint learning algorithm for clustering of single-cell RNA-sequencing data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa433
PMID:33535230
|
研究论文 | 本文提出了一种名为jSRC的联合学习算法，用于单细胞RNA测序数据的聚类 | jSRC算法将降维和聚类集成在一起，提高了算法的准确性、可扩展性和可解释性 | NA | 解决现有单细胞RNA测序数据聚类算法在准确性、可扩展性和可解释性方面的不足 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq | 联合学习算法 | 基因表达数据 | 涉及15个不同组织和生物的单细胞RNA测序数据集，细胞数量从49到110,824不等 |
| 24406 | 2024-08-09 |
Space: the final frontier - achieving single-cell, spatially resolved transcriptomics in plants
2021-05-21, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20200274
PMID:33522561
|
research paper | 本文综述了空间转录组学方法的发展，并强调了在实现植物组织单细胞分辨率3D空间转录组学方面的最新进展和当前挑战 | 本文提出了在植物中实现单细胞分辨率的空间转录组学的新方法和技术 | 当前方法通常需要细胞分选、转基因植物、原生质体化或其他耗时或破坏性的过程，且大多数技术在实施过程中会失去大部分或全部空间分辨率 | 实现植物组织中单细胞分辨率的3D空间转录组学 | 植物组织的空间转录组学 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 24407 | 2024-08-09 |
PPARs in liver physiology
2021-05-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2021.166097
PMID:33524529
|
综述 | 本文综述了过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）在肝脏生理中的最新研究进展，特别关注了PPAR调控中先前被忽视的方面 | 利用单细胞RNA测序等技术揭示了PPAR表达、活性和下游信号调控的复杂性 | NA | 探讨PPARs在肝脏生理中的作用及其调控机制 | 过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24408 | 2024-08-09 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于比较单细胞RNA测序数据批次校正方法的模块化和灵活的管道BatchBench | BatchBench提供了一种系统的方法来比较不同批次校正方法的性能和计算需求 | NA | 评估和比较不同批次校正方法的性能 | 单细胞RNA测序数据的批次校正方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个经过充分研究的数据集 |
| 24409 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal the intratumoral landscape of infiltrated T-cell subpopulations in oral squamous cell carcinoma
2021-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12910
PMID:33513276
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞亚群的内在景观 | 首次揭示了口腔鳞状细胞癌中14种不同的T细胞亚群及其发育轨迹，并发现了与肿瘤免疫抑制相关的标志基因 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解口腔鳞状细胞癌中T细胞的功能状态和异质性，以推动新型治疗策略的发展 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,866个单个T细胞样本来自三位患者 |
| 24410 | 2024-08-09 |
Characteristics of B lymphocyte infiltration in HPV+ head and neck squamous cell carcinoma
2021-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14834
PMID:33529452
|
研究论文 | 本研究旨在检测人乳头瘤病毒（HPV）相关头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B淋巴细胞亚群的浸润及其与预后的相关性 | 首次详细分析了HPV阳性HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润情况及其与预后的关系，并探讨了CD4 T淋巴细胞通过CXCL13/CXCR5轴对B淋巴细胞及其亚群的影响 | 研究样本量相对较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨HPV相关HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润与患者预后的关系 | HPV阳性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 124个HPV阳性和513个HPV阴性的HNSCC样本 |
| 24411 | 2024-08-09 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
|
研究论文 | 本文研究了皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）在银屑病中的作用，发现IL-23或imiquimod诱导的小鼠银屑病模型中，皮肤ILCs会转变为类似病原性ILC3的状态。 | 首次展示了皮肤ILCs在银屑病诱导下会转变为病原性ILC3样状态，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序验证了这一转变。 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨皮肤驻留的先天淋巴细胞在银屑病中的作用及其细胞状态的转变。 | 皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）及其在银屑病中的作用。 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮肤ILCs样本 |
| 24412 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of mouse bladder urothelium uncover novel cell type markers and urothelial differentiation characteristics
2021-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13007
PMID:33538002
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面表征了小鼠膀胱上皮细胞，揭示了新的细胞类型标记和上皮细胞分化特征 | 发现了由Plxna4标记的新型膀胱上皮细胞类型，可能与宿主反应和伤口愈合有关；识别出ASPM标记的基底样细胞，可能是成年膀胱上皮的祖细胞 | NA | 全面绘制膀胱上皮细胞的细胞解剖图谱 | 小鼠膀胱上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,917个单细胞 |
| 24413 | 2024-08-09 |
A novel CD4+ CTL subtype characterized by chemotaxis and inflammation is involved in the pathogenesis of Graves' orbitopathy
2021-03, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-00615-2
PMID:33514849
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应等方法，鉴定出一种新的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并参与了Graves眼病的病理过程 | 发现了一种新的Graves眼病特异性的CD4+细胞毒性T淋巴细胞亚型，该亚型具有趋化性和炎症特征，并通过克隆扩增和强细胞毒性反应证实其在疾病中的致病作用 | NA | 探索驱动Graves眼病进展的致病性CD4+ T细胞类型 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、T细胞受体测序（TCR-Seq）、流式细胞术、免疫荧光和混合淋巴细胞反应（MLR） | NA | 细胞 | Graves眼病和Graves甲状腺功能亢进症患者的CD4+ T细胞 |
| 24414 | 2024-08-09 |
Study Offers Insights into Gastric Cancer
2021-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2021-0305
PMID:33526445
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了转移到腹膜腔的胃癌异质性，并识别出两种与患者生存差异相关的细胞类型 | 首次通过单细胞测序技术详细描述了胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性，并开发了新的预后基因表达特征 | NA | 探索胃癌转移至腹膜腔的细胞异质性及其对患者生存的影响 | 胃癌转移至腹膜腔的细胞类型及其对患者生存的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 24415 | 2024-08-09 |
The Roles of T cells in Bladder Pathologies
2021-03, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2021.01.003
PMID:33536141
|
研究论文 | 本文探讨了T淋巴细胞在膀胱疾病中的作用，包括细菌感染、膀胱癌和慢性炎症 | 利用单细胞RNA测序和报告小鼠等新技术，揭示了T细胞在膀胱免疫中的新角色 | NA | 研究T细胞在膀胱疾病中的作用及其潜在的免疫治疗价值 | T细胞在膀胱疾病中的作用 | 免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 24416 | 2024-08-09 |
SiglecF(HI) Marks Late-Stage Neutrophils of the Infarcted Heart: A Single-Cell Transcriptomic Analysis of Neutrophil Diversification
2021-02-16, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.019019
PMID:33525909
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了心肌梗死（MI）后中性粒细胞的分化和动态变化 | 首次揭示了心肌梗死后中性粒细胞的多样化，特别是SiglecF标记的晚期中性粒细胞的发现和特性 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究心肌梗死后中性粒细胞的分化和动态变化 | 心肌梗死后的中性粒细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过28,000个中性粒细胞转录组 |
| 24417 | 2024-08-09 |
SATB2 induction of a neural crest mesenchyme-like program drives melanoma invasion and drug resistance
2021-02-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64370
PMID:33527896
|
研究论文 | 本文通过过表达筛选80种表观遗传/转录调节因子，发现神经嵴间质发育调节因子SATB2能加速黑色素瘤的侵袭性发展，并诱导zebrafish肿瘤和人类黑色素瘤细胞系的侵袭和药物抗性 | 首次发现SATB2通过诱导神经嵴间质样程序，驱动黑色素瘤的侵袭和药物抗性 | NA | 测试转录适应是否能驱动黑色素瘤的进展 | SATB2在黑色素瘤侵袭和药物抗性中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 80种表观遗传/转录调节因子 |
| 24418 | 2024-08-09 |
CNS fibroblasts form a fibrotic scar in response to immune cell infiltration
2021-02, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-00770-9
PMID:33526922
|
研究论文 | 本文研究了中枢神经系统（CNS）纤维母细胞在免疫细胞浸润后形成纤维化瘢痕的过程 | 首次确定CNS纤维化瘢痕主要来源于增殖的CNS纤维母细胞，而非周细胞或浸润的骨髓来源细胞，并通过特定细胞表达的疱疹胸苷激酶敲除增殖的纤维化细胞，观察到运动障碍的减少 | NA | 探讨CNS在免疫细胞浸润后的纤维化反应机制 | CNS纤维母细胞、纤维化瘢痕、免疫细胞浸润 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 实验使用了实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型 |
| 24419 | 2024-08-09 |
UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00810-6
PMID:33526946
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24420 | 2024-08-09 |
Reply to: UMI or not UMI, that is the question for scRNA-seq zero-inflation
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00811-5
PMID:33526947
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |