单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 24381 - 24400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24381 | 2024-08-09 |
Evolutionary Genetics of Mycobacterium tuberculosis and HIV-1: "The Tortoise and the Hare"
2021-Jan-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms9010147
PMID:33440808
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研究论文 | 本文探讨了结核分枝杆菌和HIV-1的进化遗传学，特别是它们在共感染情况下的进化动力学 | 提出了单细胞测序在研究单核细胞/巨噬细胞内结核分枝杆菌和HIV-1相互作用中的应用 | 结核分枝杆菌和HIV-1在宿主细胞中共殖民的进化影响尚未完全理解 | 研究结核分枝杆菌和HIV-1的进化动力学及其在共感染中的相互作用 | 结核分枝杆菌和HIV-1的遗传多样性及其对宿主免疫系统、毒力和药物抗性的影响 | 进化遗传学 | 结核病和HIV/AIDS | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 文中未明确提及具体样本数量 |
| 24382 | 2024-08-09 |
Phenotyping of immune and endometrial epithelial cells in endometrial carcinomas revealed by single-cell RNA sequencing
2021-01-10, Aging
DOI:10.18632/aging.202288
PMID:33429363
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对来自五名患者的肿瘤和邻近肿瘤组织中的30,780个细胞进行了分析，生成了子宫内膜癌的细胞图谱 | 首次详细描述了子宫内膜癌中子宫内膜上皮细胞和免疫细胞的类型及其特征，并发现了特定的CD8 T细胞和单核-巨噬细胞群 | 研究样本仅来自五名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示子宫内膜癌中子宫内膜上皮细胞和免疫微环境的特征 | 子宫内膜癌中的子宫内膜上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 30,780个细胞，来自五名患者 |
| 24383 | 2024-08-09 |
scReQTL: an approach to correlate SNVs to gene expression from individual scRNA-seq datasets
2021-Jan-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07334-y
PMID:33419390
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scReQTL的方法，用于从单细胞RNA测序数据中关联单核苷酸变异（SNVs）与基因表达 | scReQTL方法利用表达位点的变体等位基因分数（VAFRNA），并将其与相应细胞的基因表达相关联，能够在相同基因型的背景下捕捉到细胞特异性和短暂性的RNA介导的遗传相互作用 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中识别和描述可能参与细胞类型特异性或动态遗传相互作用的SNVs | 从三个健康女性捐赠者获得的脂肪组织中提取的26,640个间充质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 26,640个间充质细胞 |
| 24384 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing uncovers cellular developmental sequences and novel potential intercellular communications in embryonic kidney
2021-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-80154-y
PMID:33420268
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术重新分析了胚胎小鼠肾脏的数据，揭示了细胞发育序列和潜在的细胞间通讯 | 本研究利用流形学习基于分区图抽象协调细胞，结合ForceAtlas2推断出鲍曼囊壁上皮细胞和从S形体到每个肾单位的发育过程中的细胞。RNA速度与马尔可夫链算法结合，揭示了肾单位前体细胞的自更新过程。NicheNet分析表明，不仅属于输尿管芽和间质的细胞，还有内皮细胞、巨噬细胞和周细胞可能参与肾单位前体细胞的分化 | NA | 探索肾脏发育的细胞机制 | 胚胎小鼠肾脏的细胞发育和细胞间通讯 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 流形学习，ForceAtlas2，RNA速度，马尔可夫链算法，NicheNet分析 | RNA测序数据 | 胚胎小鼠肾脏样本 |
| 24385 | 2024-08-09 |
The spatial RNA integrity number assay for in situ evaluation of transcriptome quality
2021-01-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01573-1
PMID:33420318
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研究论文 | 本文介绍了一种新的工具——空间RNA完整性数（sRIN）检测方法，用于在细胞水平上评估组织中rRNA的完整性 | 提出了一种新的空间RNA完整性数（sRIN）检测方法，能够在细胞水平上评估组织中rRNA的完整性，克服了传统批量rRNA测量方法的局限性 | NA | 开发一种新的方法来评估组织中rRNA的完整性，并将其应用于空间转录组学工作流程中 | 组织中rRNA的完整性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24386 | 2024-08-09 |
Self-organized stem cell-derived human lung buds with proximo-distal patterning and novel targets of SARS-CoV-2
2021-Jan-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.06.425622
PMID:33442697
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研究论文 | 本文介绍了一种高通量平台，用于生成数万个自组织的、几乎相同且基因匹配的人类肺芽，这些肺芽源自人类多能干细胞（hPSCs）在微图案基质上的培养 | 该平台能够模拟人类肺部发育的关键特征，并用于追踪SARS-CoV-2感染和识别候选治疗药物 | NA | 研究SARS-CoV-2如何在肺部引起组织病理变化，并开发针对COVID-19的治疗方法 | 人类肺芽、SARS-CoV-2感染、候选治疗药物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 数万个自组织的人类肺芽 |
| 24387 | 2024-08-09 |
B cell-specific XIST complex enforces X-inactivation and restrains atypical B cells
2021-Jan-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.03.425167
PMID:33442682
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研究论文 | 本文研究了长非编码RNA XIST在成人B细胞中持续维持X染色体失活的作用及其机制 | 揭示了XIST在成人B细胞中对X连锁免疫基因的持续沉默作用，并发现了特定的体细胞特异性XIST复合物及TRIM28在B细胞中的作用 | NA | 探讨XIST在成人B细胞中的持续作用及其在性别差异生物学和医学中的扩展角色 | XIST在成人B细胞中的作用及其机制 | NA | NA | CRISPRi筛选 | NA | 转录组数据 | 涉及女性偏向自身免疫和COVID-19感染患者的单细胞转录组数据 |
| 24388 | 2024-08-09 |
Space-time logic of liver gene expression at sub-lobular scale
2021-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-00323-1
PMID:33432202
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了肝脏基因表达在时间和空间上的调控 | 首次在亚小叶尺度上揭示了肝脏基因表达的时空逻辑，发现许多基因既具有区域性也具有节律性，并且大多数基因显示出乘法时空效应 | NA | 研究肝脏基因表达的时空调控机制 | 肝脏基因表达的时空特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单分子荧光原位杂交 (smFISH) | 混合效应模型 | RNA表达数据 | NA |
| 24389 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.568805
PMID:33424779
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 | 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 | NA | 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 | Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 | 代谢综合征 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本 |
| 24390 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.603302
PMID:33424903
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研究论文 | 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法，在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子（TF）目标 | 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标，并提供了一种新的应用 | NA | 探索转录因子目标，以研究调控途径 | 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 涉及多个单细胞的转录组 |
| 24391 | 2024-08-09 |
Distinct Disease Severity Between Children and Older Adults With Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): Impacts of ACE2 Expression, Distribution, and Lung Progenitor Cells
2021-12-06, Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America
IF:8.2Q1
DOI:10.1093/cid/ciaa1911
PMID:33388749
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研究论文 | 本文研究了儿童和老年COVID-19患者之间疾病严重程度的差异，并探讨了ACE2表达、分布及肺祖细胞的作用。 | 首次系统分析了儿童和老年COVID-19患者中ACE2表达和肺祖细胞的差异及其对疾病严重程度的影响。 | 研究为回顾性分析，样本量有限，可能影响结果的普遍性。 | 探讨儿童和老年COVID-19患者疾病严重程度的差异及其相关风险因素。 | 儿童和老年COVID-19患者，以及他们的ACE2表达、分布和肺祖细胞。 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、肺活检和体外肺组织感染 | NA | RNA-seq数据、肺组织 | 299名COVID-19患者 |
| 24392 | 2024-08-09 |
Overlapping Protein Accumulation Profiles of CADASIL and CAA: Is There a Common Mechanism Driving Cerebral Small-Vessel Disease?
2021-11, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2020.11.015
PMID:33387456
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研究论文 | 本文探讨了CADASIL和CAA两种血管病变在蛋白质积累层面的共同机制 | 发现了CADASIL和CAA中共同调控的19种蛋白质，并预测这些蛋白质在细胞外基质结构和重塑中发挥作用 | NA | 探索CADASIL和CAA之间可能的共同疾病机制 | CADASIL和CAA的蛋白质积累模式 | NA | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | 小鼠血管细胞 |
| 24393 | 2024-08-09 |
Sequential fate-switches in stem-like cells drive the tumorigenic trajectory from human neural stem cells to malignant glioma
2021-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-00451-z
PMID:33390587
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研究论文 | 本文建立了两个高渗透性的人神经干细胞衍生恶性胶质瘤模型，并通过时间序列分析揭示了从人神经干细胞到恶性胶质瘤的肿瘤发生轨迹 | 首次重建了从人神经干细胞到恶性胶质瘤的肿瘤发生轨迹，并揭示了NSC样细胞中的多步转录重编程和命运转换是肿瘤进展的主要驱动力 | 由于早期阶段采样和临床前模型的技术困难，对从人神经干细胞到恶性胶质瘤的肿瘤发生路径了解仍然有限 | 揭示从人神经干细胞到恶性胶质瘤的肿瘤发生过程中的分子动力学和命运选择 | 人神经干细胞（hNSCs）和恶性胶质瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全外显子测序、bulk和单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | 两个高渗透性的人神经干细胞衍生恶性胶质瘤模型 |
| 24394 | 2024-08-09 |
FOXP1 negatively regulates intrinsic excitability in D2 striatal projection neurons by promoting inwardly rectifying and leak potassium currents
2021-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-00995-x
PMID:33402705
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研究论文 | 本文研究了转录因子FOXP1通过促进内向整流和泄漏钾电流，负向调节D2纹状体投射神经元的内在兴奋性 | 本文揭示了FOXP1通过转录激活相应转录本，负向调节D2纹状体投射神经元的兴奋性，为转录因子如何调控多个基因以影响依赖于多种电流类型整合的神经电生理功能提供了新例证 | NA | 探究FOXP1在D2纹状体投射神经元中调节内在兴奋性的机制 | D2纹状体投射神经元及其在FOXP1缺失下的电生理变化 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | FOXP1缺失的D2纹状体投射神经元 |
| 24395 | 2024-08-09 |
Exploring the Genetic Association of the ABAT Gene with Alzheimer's Disease
2021-May, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-020-02271-z
PMID:33404980
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研究论文 | 本研究通过遗传和表达水平上的综合分析，探讨了ABAT基因与阿尔茨海默病之间的潜在遗传关联 | 首次在阿尔茨海默病中识别出ABAT基因3'-UTR区域的遗传变异，并发现这些变异与ABAT mRNA表达降低相关 | NA | 研究ABAT基因与阿尔茨海默病的遗传关联 | ABAT基因及其在阿尔茨海默病中的作用 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联研究(GWAS) | NA | 遗传变异数据、mRNA表达数据 | 使用目前最大的阿尔茨海默病全基因组关联研究(GWAS)的元分析数据 |
| 24396 | 2024-08-09 |
Molecular determinants and heterogeneity underlying host response to EV-A71 infection at single-cell resolution
2021-05, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2021.1872976
PMID:33406999
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了EV-A71感染后的分化肠上皮细胞（C2BBe1）的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了EV-A71感染引起的细胞间变异和转录组差异，并发现了与病毒RNA表达密切相关的ANXA2蛋白以及lncRNA CYTOR在促进EV-A71复制中的功能 | 研究仅限于细胞培养模型，未涉及体内环境 | 探讨EV-A71感染后宿主反应的分子决定因素和异质性 | EV-A71感染的分化肠上皮细胞（C2BBe1） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 感染EV-A71的分化肠上皮细胞（C2BBe1） |
| 24397 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies limbal stem cell population and cell types mapping its differentiation trajectory in limbal basal epithelium of human cornea
2021-04, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2020.12.004
PMID:33388438
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在人类角膜缘基底层中识别出角膜缘干细胞群体及其分化轨迹 | 发现了新的角膜缘干细胞标记物TSPAN7和SOX17，并揭示了维持角膜缘干细胞特性的转录因子网络和信号通路 | NA | 旨在揭示人类角膜异质性基底层中的新型细胞类型，以单细胞分辨率识别角膜缘干细胞 | 人类角膜缘基底层的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 16,360个角膜缘基底细胞 |
| 24398 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis revealed the heterogeneity and microenvironment of gastrointestinal stromal tumors
2021-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14795
PMID:33393143
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胃肠道间质瘤（GIST）的细胞异质性和微环境 | 揭示了GIST中肿瘤细胞的异质性及其与其他细胞的相互作用，为GIST的研究和治疗提供了新的理论基础 | NA | 旨在发现GIST中肿瘤细胞的异质性及其与其他细胞的相互作用 | GIST患者的肿瘤内和肿瘤周围组织 | 数字病理学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 65个GIST样本 |
| 24399 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of developing maize ears facilitates functional analysis and trait candidate gene discovery
2021-02-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.12.015
PMID:33400914
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术分析了发育中的玉米穗的转录组，构建了一个发育图谱，并验证了结果，展示了这些数据如何促进遗传研究，整合转录网络，并识别与作物产量性状相关的候选基因。 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了玉米穗发育过程中的细胞类型多样性和发育域，克服了传统遗传学方法因遗传冗余和多效性带来的限制。 | NA | 深入理解玉米穗发育过程中的细胞类型多样性和发育域，以及相关的基因网络。 | 发育中的玉米穗的单细胞转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12,525个单细胞 |
| 24400 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.016
PMID:33406409
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对人类肠道发育进行了时空分析 | 首次详细描述了肠道发育过程中的细胞状态和形态发生里程碑，并提供了公开的在线资源以促进进一步研究 | NA | 深入理解人类肠道发育的机制 | 人类肠道发育过程中的细胞状态和形态发生 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 101种细胞状态 |