单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28749 篇文献，本页显示第 24381 - 24400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24381 | 2024-08-08 |
Systematic screening identifies a TEAD4-S100A13 axis modulating cisplatin sensitivity of oral squamous cell carcinoma cells
2021-Oct, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13224
PMID:34358353
|
研究论文 | 本研究旨在筛选与人类乳头瘤病毒（HPV）阴性的口腔鳞状细胞癌（OSCC）预后相关的S100蛋白家族成员及其分子调控机制 | 发现了新的TEAD4-S100A13轴，可能调节OSCC肿瘤细胞对顺铂的敏感性 | NA | 筛选与OSCC预后相关的S100蛋白家族成员及其分子调控机制 | HPV阴性的口腔鳞状细胞癌（OSCC）细胞系CAL-27和SCC-4 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及21个S100蛋白家族成员基因，以及OSCC患者的生存数据 |
| 24382 | 2024-08-08 |
Integrating readout of somatic mutations in individual cells with single-cell transcriptional profiling
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100673
PMID:34337442
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合单细胞转录组测序和单细胞扩增子测序的技术，用于在单细胞水平上检测体细胞突变 | 提出了一种新的技术协议，能够同时进行单细胞RNA测序和单细胞扩增子测序，以检测单个细胞中的体细胞突变 | NA | 开发一种新的技术方法，用于在单细胞水平上检测体细胞突变 | CD34+骨髓祖细胞 | 数字病理学 | NA | 10X Chromium技术 | NA | 转录组数据和扩增子数据 | 从人类骨髓抽吸物中分离的CD34+祖细胞 |
| 24383 | 2024-08-08 |
Quantification of Age-Related Decline in Transcriptional Homeostasis
2021-09-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2021.167179
PMID:34339725
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Homeostatic Divergence Score (HDS)的计算方法，用于量化单细胞中剪接和未剪接mRNA库之间的平衡，从而评估mRNA稳态的程度 | 提出了一种新的计算方法HDS，用于量化mRNA稳态，并通过单细胞RNA测序数据分析年龄相关的转录稳态破坏 | NA | 开发新的计算方法来通过转录组学视角观察衰老过程 | 年龄相关的转录调控机制和mRNA稳态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 两个独立的衰老数据集和人类胚胎干细胞的亚群 |
| 24384 | 2024-08-08 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
|
研究论文 | 本研究探讨了高血压条件下，心脏驻留巨噬细胞（RMs）及其产生的胰岛素样生长因子-1（Igf1）在适应性心脏生长中的作用 | 首次揭示了心脏驻留巨噬细胞及其产生的Igf1在高血压适应性心脏生长中的绝对必要性 | NA | 研究免疫细胞在高血压适应性心脏保护过程中的作用 | 心脏驻留巨噬细胞及其产生的胰岛素样生长因子-1 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24385 | 2024-08-08 |
A technology of a different sort: microraft arrays
2021-09-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00506e
PMID:34346456
|
综述 | 本文综述了微浮板阵列的发展及其在生物实体选择和分离中的应用 | 微浮板阵列技术简单优雅，可用于从数十到数百万个对象的样本，提供了一个灵活的平台，支持单细胞RNA测序、亚细胞器捕获和检测、高通量筛选、CRISPR基因编辑细胞系开发以及类器官操作和选择等多种应用 | NA | 探讨微浮板阵列在生物医学研究中的应用 | 生物实体如细胞器、细胞和类器官的选择与分离 | 生物医学研究 | NA | 微浮板阵列 | NA | 图像 | 数十到数百万个对象 |
| 24386 | 2024-08-08 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-09-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.07.023
PMID:34352228
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和COVID-19患者的鼻咽拭子样本，揭示了SARS-CoV-2感染对呼吸道上皮细胞的影响及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染的宿主细胞类型和基因表达特征，并指出了不同严重程度COVID-19患者免疫反应的差异 | 研究样本量有限，且仅包括鼻咽拭子样本，可能无法全面反映所有受影响的细胞类型和组织 | 探讨SARS-CoV-2感染对呼吸道上皮细胞的影响及其与COVID-19严重程度的关系 | 健康和COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 58名健康和COVID-19参与者 |
| 24387 | 2024-08-08 |
MP44-09 UNDERSTANDING PRUNE BELLY SYNDROME AT SINGLE CELL RESOLUTION
2021-09, The Journal of urology
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/JU.0000000000002065.09
PMID:34346772
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了普鲁恩贝尔综合征（PBS）患者的膀胱细胞类型组成和转录活性 | 首次在单细胞分辨率下解析了PBS患者的膀胱细胞异质性和基因表达网络 | NA | 揭示PBS患者膀胱细胞的异质性和基因表达网络 | PBS患者的膀胱细胞 | 数字病理学 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 2名PBS患者和6名非PBS对照患者的膀胱细胞 |
| 24388 | 2024-08-08 |
NovoSpaRc: flexible spatial reconstruction of single-cell gene expression with optimal transport
2021-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-021-00573-7
PMID:34349282
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为novoSpaRc的计算框架，用于基于单细胞RNA测序数据进行空间重构，以研究组织结构和空间基因表达模式 | novoSpaRc框架通过概率性地将细胞分配到组织位置，利用结构对应假设，即物理上接近的细胞共享相似的基因表达谱，进行空间重构 | NA | 开发一种新的计算框架，用于单细胞RNA测序数据的空间重构 | 单细胞RNA测序数据的空间重构 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 10,000个细胞映射到1,000个位置 |
| 24389 | 2024-08-08 |
A preliminary investigation into the immune cell landscape of schistosome-associated liver fibrosis in humans
2021-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12490
PMID:34355810
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术初步分析了血吸虫相关肝纤维化患者的免疫细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了血吸虫相关肝纤维化中特定免疫细胞类型及其相关信号通路 | 样本量较小，仅包括三个患者组，可能影响结果的普遍性 | 探索血吸虫相关肝纤维化的免疫细胞组成及其在疾病发展中的作用 | 血吸虫相关肝纤维化患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括一个血吸虫病日本株组（n=1），一个慢性肝衰竭组（n=3）和一个健康对照组（n=2），共20,093个细胞 |
| 24390 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing (scRNA-Seq) deciphering pathological alterations in streptozotocin-induced diabetic retinas
2021-09, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108718
PMID:34364890
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜的转录组图谱，以解析糖尿病视网膜病变的病理改变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了糖尿病视网膜病变的细胞和分子层面的病理改变 | NA | 解析糖尿病视网膜病变的病理改变，并为糖尿病视网膜病变的治疗提供潜在靶点 | 健康和链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜的单细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 超过14,000个单细胞 |
| 24391 | 2024-08-08 |
Memory and naïve gamma delta regulatory T-cell gene expression in the first 24-weeks of peanut oral immunotherapy
2021-09, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2021.108820
PMID:34365017
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接受花生口服免疫疗法的儿童在治疗前24周内调节性T细胞的基因表达变化 | 首次详细描述了花生口服免疫疗法前24周内调节性T细胞的免疫学变化，揭示了gdTreg细胞在维持免疫稳态中的作用 | 研究样本仅限于参与花生口服免疫疗法研究的5至12岁儿童，可能限制了结果的普遍性 | 阐明花生口服免疫疗法在早期诱导免疫变化的机制，以帮助理解其作用机理 | 接受花生口服免疫疗法的儿童的调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 参与研究的儿童样本在治疗开始后的0、6和24周进行收集，并与健康非花生过敏对照组进行比较 |
| 24392 | 2024-08-08 |
Sc-compReg enables the comparison of gene regulatory networks between conditions using single-cell data
2021-08-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25089-2
PMID:34362918
|
研究论文 | 提出了一种名为sc-compReg的方法，用于比较两种条件下使用单细胞基因表达和染色质可及性数据构建的基因调控网络 | 开发了sc-compReg软件，能够联合聚类和嵌入来自scRNA-seq和scATAC-seq的细胞，并构建两种条件下的差异调控网络 | NA | 比较疾病与健康个体或两种不同治疗之间的基因调控网络 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者与健康对照的基因调控网络 | 生物信息学 | 白血病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 单个CLL患者与健康对照 |
| 24393 | 2024-08-08 |
Viral vector-mediated reprogramming of the fibroblastic tumor stroma sustains curative melanoma treatment
2021-08-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25057-w
PMID:34354077
|
研究论文 | 研究通过病毒载体介导的纤维母细胞瘤基质重编程，探讨其在黑色素瘤治疗中的作用 | 首次展示了通过病毒载体表达黑色素细胞分化抗原，实现对黑色素瘤的长期控制，并揭示了特定纤维母细胞亚群在肿瘤微环境中的免疫刺激作用 | NA | 探讨病毒载体介导的纤维母细胞瘤基质重编程在黑色素瘤治疗中的作用 | 纤维母细胞瘤基质细胞和黑色素瘤 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 24394 | 2024-08-08 |
Dysregulated hematopoiesis in bone marrow marks severe COVID-19
2021-Aug-04, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00296-9
PMID:34349096
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19患者骨髓单个核细胞，发现严重病例中存在造血干细胞G1期占优势且易凋亡，以及未成熟髓系祖细胞积累和淋巴系祖细胞显著减少的现象。 | 首次揭示了严重COVID-19患者骨髓中造血干细胞的异常状态及其对下游祖细胞分化的影响。 | 研究样本仅包括COVID-19患者，未涉及健康对照组的骨髓细胞分析。 | 探讨严重COVID-19患者中造血干细胞如何影响外周淋巴和髓系细胞的功能障碍。 | COVID-19患者的骨髓单个核细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24395 | 2024-08-08 |
Development and validation of an intra-tumor heterogeneity-related signature to predict prognosis of bladder cancer: a study based on single-cell RNA-seq
2021-08-02, Aging
DOI:10.18632/aging.203353
PMID:34339395
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，开发并验证了一种与膀胱癌内肿瘤异质性相关的预后标志物 | 首次基于单细胞RNA测序数据构建了与膀胱癌内肿瘤异质性相关的预后模型 | NA | 开发和验证一种新的预后标志物，用于预测膀胱癌的预后 | 膀胱癌的内肿瘤异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Lasso和多元Cox回归模型 | 基因数据 | 分析了2075个细胞，评估了396个病例，并在训练和外部验证数据集中进行了验证 |
| 24396 | 2024-08-08 |
Differential gene regulation in DAPT-treated Hydra reveals candidate direct Notch signalling targets
2021-08-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.258768
PMID:34346482
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和启动子分析，探讨了在Hydra中使用Notch抑制剂DAPT处理后基因表达的变化，以及Notch信号通路在头部模式形成和间质细胞分化中的分子机制 | 本研究首次在Hydra中识别出Notch信号通路的直接调控基因，并提出了Sp5和HyAlx作为潜在的直接Notch目标基因 | NA | 理解Notch信号通路在Hydra头部模式形成和间质细胞分化中的分子机制 | Hydra中的Notch信号通路及其调控基因 | 分子生物学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24397 | 2024-08-08 |
SCITO-seq: single-cell combinatorial indexed cytometry sequencing
2021-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01222-3
PMID:34354295
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCITO-seq的工作流程，该流程利用splint寡核苷酸实现对DNA条形码抗体的组合索引单细胞测序 | SCITO-seq通过编码样品条形码到splint寡核苷酸中，实现了与质谱流式细胞术相当的细胞组成和表面蛋白表达的可靠估计，并扩展了其与商业DNA条形码抗体的兼容性以及同一细胞中转录组和表面蛋白的同时表达分析 | NA | 开发一种灵活且超高吞吐量的基于测序的单细胞蛋白和多模态分析平台 | 单细胞表面分子标记的蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序 | NA | 蛋白质表达数据 | 每个反应超过10个细胞 |
| 24398 | 2024-08-08 |
Keratin Profiling by Single-Cell RNA-Sequencing Identifies Human Prostate Stem Cell Lineage Hierarchy and Cancer Stem-Like Cells
2021-Jul-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22158109
PMID:34360875
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了前列腺球中的上皮细胞谱系层次结构，并通过角蛋白分析识别了人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术对前列腺干细胞及其后代祖细胞进行角蛋白分析，揭示了干细胞和癌症相关通路的富集 | NA | 阐明人类前列腺干细胞谱系层次和癌症干细胞样细胞的角蛋白特征，以促进前列腺癌症干细胞样细胞的鉴定和治疗靶向 | 人类前列腺干细胞及其后代祖细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个前列腺干细胞和祖细胞集群 |
| 24399 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Simulation Reveals the Impact of Sequencing Parameters and Algorithms on Clustering
2021-Jul-19, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11070716
PMID:34357088
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序数据模拟，评估了测序参数和算法对细胞聚类的影响 | 开发了一种模拟程序SSCRNA，用于生成原始数据，并评估了不同算法和测序深度对聚类准确性的影响 | NA | 研究单细胞RNA测序中的参数和算法对细胞聚类的影响 | 单细胞转录组测序数据及其分析算法 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | K-means, Louvain | 转录组数据 | NA |
| 24400 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Mouse Brain Vasculature
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/7643209
PMID:34337051
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据构建了小鼠脑血管细胞的转录调控网络 | 利用改进的SCENIC方法构建基因调控网络，并通过单细胞RNA测序数据分析小鼠脑血管细胞的异质性 | NA | 研究小鼠脑部血管健康与功能的关系，并探索脑血管细胞的发育过程 | 小鼠脑部血管细胞的转录调控特征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC方法 | 转录组数据 | 小鼠脑部血管细胞的单细胞RNA测序数据集 |