单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 24381 - 24400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24381 | 2024-08-09 |
Single-cell TCR repertoire analysis reveals highly polyclonal composition of human intraepithelial CD8+ αβ T lymphocytes in untreated celiac disease
2021-06, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202048974
PMID:33559929
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研究论文 | 通过单细胞测序比较了乳糜泻患者和健康个体的CD8 αβ上皮内淋巴细胞的αβ T细胞受体库 | 发现未治疗的乳糜泻患者的T细胞受体库比治疗患者和健康个体的更具有多克隆性和多样性 | NA | 研究乳糜泻患者与健康个体间CD8 αβ上皮内淋巴细胞的T细胞受体库差异 | 乳糜泻患者和健康个体的CD8 αβ上皮内淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳糜泻 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 24382 | 2024-08-09 |
SPOTlight: seeded NMF regression to deconvolute spatial transcriptomics spots with single-cell transcriptomes
2021-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab043
PMID:33544846
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研究论文 | 开发了一种名为SPOTlight的计算工具，用于整合空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，以推断复杂组织中细胞类型和状态的位置 | SPOTlight采用种子非负矩阵分解（NMF）回归方法，利用细胞类型标记基因和非负最小二乘（NNLS）来解卷积ST捕获位置（spots），即使在浅序列或小规模的scRNA-seq参考数据集上也能保持高预测准确性 | NA | 旨在通过整合ST和scRNA-seq数据，推断组织中细胞类型和状态的空间分布 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 非负矩阵分解（NMF）回归 | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 涉及小鼠大脑和人类胰腺癌的多个样本 |
| 24383 | 2024-08-09 |
RUNX-1 haploinsufficiency causes a marked deficiency of megakaryocyte-biased hematopoietic progenitor cells
2021-05-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006389
PMID:33569577
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研究论文 | 研究了RUNX-1单倍体不足对造血祖细胞和随后的巨核细胞生成的影响 | 通过单细胞RNA测序和免疫印迹分析，揭示了RUNX-1单倍体不足导致的巨核细胞偏向的造血祖细胞亚群的减少和基因表达变化 | NA | 探讨RUNX-1单倍体不足对造血祖细胞和巨核细胞生成的影响，并寻找可能的治疗干预措施 | 从患者和野生型细胞系中衍生的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的造血祖细胞（iHPCs）和巨核细胞（iMks） | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括患者衍生的和野生型细胞系衍生的iHPCs和iMks |
| 24384 | 2024-08-09 |
Integrative analyses of scRNA-seq and scATAC-seq reveal CXCL14 as a key regulator of lymph node metastasis in breast cancer
2021-04-27, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab042
PMID:33564857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，分析了乳腺癌原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的转录组和染色质可及性，揭示了CXCL14在乳腺癌淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现CXCL14在乳腺癌阳性淋巴结中异常高表达，并验证了其在淋巴结转移中的重要作用 | 样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 揭示乳腺癌淋巴结转移的细胞和分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤、阴性淋巴结和阳性淋巴结的单细胞转录组和染色质可及性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据、染色质可及性数据 | 55名乳腺癌患者 |
| 24385 | 2024-08-09 |
MicroRNA-21-Dependent Macrophage-to-Fibroblast Signaling Determines the Cardiac Response to Pressure Overload
2021-04-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了微小RNA-21（miR-21）在心脏巨噬细胞中的作用及其对心脏重塑的影响 | 首次揭示了miR-21在心脏巨噬细胞中的高表达及其在心脏重塑中的关键作用 | NA | 确定心脏巨噬细胞中miR-21在心肌稳态和疾病相关重塑中的功能 | 心脏巨噬细胞和心脏纤维母细胞 | NA | 心血管疾病 | 小RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 使用Cx3cr1-Cre驱动的miR-21特异性敲除小鼠进行研究 |
| 24386 | 2024-08-09 |
Analysis of classical neutrophils and polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells in cancer patients and tumor-bearing mice
2021-04-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201803
PMID:33566112
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、细胞质谱、流式细胞术和功能分析，研究了癌症中多形核中性粒细胞（PMNs）的异质性，并描述了肿瘤携带小鼠中的三种PMN群体：经典PMNs、多形核髓源性抑制细胞（PMN-MDSCs）和具有强大免疫抑制活性的活化PMN-MDSCs。 | 首次详细描述了肿瘤携带小鼠中PMN-MDSCs的动态变化及其在癌症患者中的基因特征，并提供了PMN-MDSCs作为独特PMN群体的证据。 | NA | 研究癌症中多形核中性粒细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用。 | 肿瘤携带小鼠和癌症患者中的多形核中性粒细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、细胞质谱、流式细胞术 | NA | 细胞 | 肿瘤携带小鼠和癌症患者的外周血样本 |
| 24387 | 2024-08-09 |
Single Cell Omics for Musculoskeletal Research
2021-04, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-021-00662-2
PMID:33559841
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肌肉骨骼组织发育和疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)和飞行时间流式细胞术(CyTOF)等新兴技术 | 数据收集相对容易，但如何获取和解读数据对许多科学家来说仍是一个挑战 | 教育肌肉骨骼研究社区如何利用单细胞技术解答研究问题并推动转化研究 | 肌肉骨骼组织的发育和疾病 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)、飞行时间流式细胞术(CyTOF) | NA | 转录组、表观基因组和蛋白质组 | NA |
| 24388 | 2024-08-09 |
Endothelium-derived stromal cells contribute to hematopoietic bone marrow niche formation
2021-04-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.01.006
PMID:33561425
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研究论文 | 本文揭示了来源于内皮细胞的骨髓基质细胞在骨髓微环境形成中的作用 | 首次鉴定出在人类胎儿和再生骨髓中表达内皮和基质标记物的稀有LNGFR细胞，并证明这些细胞通过内皮间质转化（EndoMT）产生多能基质细胞，这些细胞在移植后能够重建骨髓微环境 | NA | 探讨骨髓基质细胞的起源及其在骨髓微环境形成中的作用 | 人类胎儿和再生骨髓中的LNGFR细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学和谱系追踪 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24389 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional analysis reveals developmental stage-dependent changes in retinal progenitors in the murine early optic vesicle
2021-03-05, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2021.01.043
PMID:33548738
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期视泡中视网膜前体细胞在不同发育阶段转录组的变化 | 首次报道了在单细胞分辨率下，视网膜初始分化阶段依赖性的转录组特征，并揭示了小鼠视泡结构在发育过程中的意外异质性 | NA | 研究早期视泡中细胞类型的多样性及其在视杯区域化之前的转录组变化 | 小鼠早期视泡中的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7989个细胞 |
| 24390 | 2024-08-09 |
Gene expression pattern of trophoblast-specific transcription factors in trophectoderm by analysis of single-cell RNA-seq data of human blastocyst
2021-Mar, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-021-00770-3
PMID:33543402
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研究论文 | 本研究通过重新分析来自两个独立组的植入后胚胎的单细胞RNA测序数据，鉴定了不同类型的滋养层细胞及其标记物，并关注了滋养层特异性转录因子在不同模型中的基因表达模式。 | 本研究利用单细胞测序技术，首次在人类胚胎植入后阶段对滋养层细胞的转录调控机制进行了深入分析。 | 研究主要依赖于体外培养的滋养层细胞模型，可能与体内实际情况存在差异。 | 揭示人类妊娠早期滋养层细胞分化的转录调控机制。 | 人类植入后胚胎的滋养层细胞及其特异性转录因子。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自两个独立组的植入后胚胎样本 |
| 24391 | 2024-08-09 |
Exploring the secrets of brain transcriptional regulation: developing methodologies, recent significant findings, and perspectives
2021-Mar, Brain structure & function
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00429-021-02230-x
PMID:33547496
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综述 | 本文综述了大脑转录调控的分子多样性，并讨论了非编码DNA/RNA在转录/后转录水平的分子机制，以及时空和单细胞转录组学在脑发育和疾病进展中的应用 | 利用最新的技术进步，深入探讨了大脑中复杂的转录网络，并尝试通过时空和单细胞转录组学获得对脑发育和疾病进展的新见解 | 尽管取得了显著进展，但该领域仍面临许多挑战需要解决 | 探索和揭示人类大脑功能的秘密，特别是大脑转录调控的分子机制 | 大脑的转录调控机制，包括基因表达的空间和时间变化与大脑结构和功能的关系 | NA | NA | 时空和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及啮齿动物、非人类灵长类和人类的大脑 |
| 24392 | 2024-08-09 |
Activin A promotes the development of acquired heterotopic ossification and is an effective target for disease attenuation in mice
2021-02-09, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.abd0536
PMID:33563697
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研究论文 | 本文研究了激活素A在异位骨化（HO）发展中的作用，并探讨了其作为治疗靶点的潜力。 | 发现激活素A是异位骨化的关键上游信号刺激因子，并证明了通过中和抗体阻断激活素A可以减少HO的发展和骨积累。 | NA | 探讨激活素A在异位骨化中的作用及其作为治疗靶点的有效性。 | 异位骨化的发展和激活素A的作用。 | NA | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行研究 |
| 24393 | 2024-08-09 |
Atypical B cells are part of an alternative lineage of B cells that participates in responses to vaccination and infection in humans
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108684
PMID:33567273
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了健康个体和疟疾暴露个体中抗原特异性B细胞和总B细胞的多样性 | 揭示了两种B细胞谱系：经典的激活和静息记忆B细胞谱系以及包括先前描述的非典型B细胞在内的替代谱系 | NA | 研究人类B细胞的多样性及其在疫苗接种和感染反应中的作用 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞样本 |
| 24394 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling identifies pre-existing CD19-negative subclones in a B-ALL patient with CD19-negative relapse after CAR-T therapy
2021-02-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21168-6
PMID:33558546
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了在接受CAR-T治疗后复发的B-ALL患者中，存在预先存在的CD19阴性亚克隆 | 首次通过单细胞RNA测序技术证明CAR-T治疗前已存在CD19阴性白血病细胞，这些细胞在治疗后被选择性扩增导致复发 | 研究样本仅为单一病例，可能限制了结果的普遍性 | 探究CAR-T治疗后B-ALL患者复发的原因，并评估单细胞RNA测序技术在预测靶向治疗失败风险中的应用 | B-ALL患者的白血病细胞及其在CAR-T治疗前后的变化 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一B-ALL患者 |
| 24395 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of neutrophil heterogeneity in sepsis
2021-02-06, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-021-03481-0
PMID:33549126
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研究论文 | 本研究通过小鼠CLP模型和单细胞基因测序技术，探讨了脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 首次揭示了脓毒症晚期中性粒细胞的多种功能障碍，并通过单细胞RNA测序技术发现了中性粒细胞的多个亚群 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类脓毒症的实际情况存在差异 | 探讨脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 中性粒细胞在脓毒症中的异质性和功能 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞基因测序技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的中性粒细胞 |
| 24396 | 2024-08-09 |
Follicular Lymphoma Microenvironment: An Intricate Network Ready for Therapeutic Intervention
2021-Feb-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13040641
PMID:33562694
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综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤（FL）微环境的复杂网络及其在疾病发生、进展和异质性中的作用，并探讨了针对该微环境的新型治疗策略。 | 利用最新的技术如全外显子测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，精确解析了FL微环境中特定细胞表型及其在疾病中的作用。 | NA | 探讨滤泡性淋巴瘤微环境的主要参与者及其当前和未来的治疗策略。 | 滤泡性淋巴瘤的微环境及其在疾病中的作用。 | NA | 淋巴瘤 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 24397 | 2024-08-09 |
Tumor Evolution and Therapeutic Choice Seen through a Prism of Circulating Tumor Cell Genomic Instability
2021-02-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10020337
PMID:33562741
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综述 | 本文综述了通过循环肿瘤细胞（CTCs）的单细胞分析来探讨基因组不稳定性（GI）的分子机制及其对肿瘤演化和耐药克隆出现的影响 | 介绍了通过分子和功能特性监测CTCs以理解基因组不稳定性的分子机制，并强调了染色体不稳定性（CIN）在CTCs驱动转移进展和获得性耐药中的作用 | 讨论了单CTC分析中遇到的技术障碍和挑战 | 探讨CTCs中的基因组异常与预后之间的关系，并支持在临床风险评估和治疗选择中监测CTCs中的基因组不稳定性的潜在用途 | 不同类型肿瘤中的循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交（FISH），单细胞测序 | NA | 细胞 | 极低数量的循环肿瘤细胞（CTCs） |
| 24398 | 2024-08-09 |
Nitric oxide prevents aortic valve calcification by S-nitrosylation of USP9X to activate NOTCH signaling
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3706
PMID:33547080
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研究论文 | 本文研究了硝酸氧化物（NO）通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化的机制 | 发现了一种新的机制，即通过S-亚硝基化依赖的泛素相关通路调节来预防钙化性主动脉瓣疾病（CAVD） | NA | 探讨NO如何通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化 | 猪主动脉瓣间质细胞和单细胞RNA测序 | NA | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 24399 | 2024-08-09 |
Implications of liver injury in risk-stratification and management of patients with COVID-19
2021-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-020-10123-0
PMID:33548030
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研究论文 | 本研究评估了COVID-19患者中肝脏损伤对临床结果的影响 | 提供了预测COVID-19患者住院期间肝脏损伤风险和严重程度的模型 | NA | 评估肝脏损伤对COVID-19患者临床结果的影响 | COVID-19患者的肝脏损伤及其对临床结果的影响 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 基因表达谱分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 1520名严重或危重的COVID-19患者 |
| 24400 | 2024-08-09 |
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.01.020
PMID:33545427
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞，识别出新的特定人群细胞亚群 | 本研究首次在中国汉族溃疡性结肠炎患者中识别出两个新的浆细胞亚群，并发现Th17激活在溃疡性结肠炎患者中表现为系统性免疫活动变化 | 研究样本仅来自中国汉族人群，可能限制了结果的普遍性 | 旨在识别溃疡性结肠炎患者结肠黏膜中的关键基因和细胞类型 | 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个溃疡性结肠炎患者和健康对照的结肠活检样本 |