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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2025-11-17 |
The role of liquid-liquid phase separation in hepatocellular carcinoma: single-cell analysis and identification of prognostic biomarkers
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-726
PMID:41234822
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了液-液相分离相关特征(LLPSRS)模型,用于预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平系统研究液-液相分离在肝细胞癌中的作用,并构建了9基因预后特征模型 | NA | 评估液-液相分离相关特征在肝细胞癌中的预测价值和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,LASSO Cox回归 | 风险预测评分模型,列线图 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2422 | 2025-11-17 |
Bulk and single-cell transcriptomics of stomach adenocarcinoma provide prognostic insights via the application of a novel gene signature associated with manganese metabolism
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1826
PMID:41234821
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库的RNA测序数据和临床信息,开发了一个基于锰代谢相关基因的胃腺癌预后特征模型 | 首次将锰代谢相关基因应用于胃腺癌的预后预测,并通过单细胞RNA测序验证了关键基因在特定细胞亚型中的表达模式 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索锰代谢相关基因在胃腺癌预后评估中的作用 | 胃腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后评分模型, 聚类分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的胃腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2423 | 2025-11-17 |
Prognostic significance of key immune cell functional alterations in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-971
PMID:41234823
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别透明细胞肾细胞癌中的关键免疫细胞并构建预后模型 | 首次系统揭示CD8+ T细胞和NK细胞在ccRCC中的功能极化状态,并建立基于10个免疫相关基因的预后特征 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要前瞻性临床研究进一步验证 | 阐明关键免疫细胞功能状态及其在透明细胞肾细胞癌预后中的作用 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 支持向量机, LASSO, 随机森林, Cox回归 | 基因表达数据 | 训练集511例(TCGA-KIRC), 验证集101例(E-MTAB-1980) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2424 | 2025-11-17 |
Single-cell analysis revealed a diagnostic model of hepatocellular carcinoma based on cancer stem cell-related gene
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-606
PMID:41234843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了基于癌症干细胞相关基因的肝细胞癌诊断模型 | 整合单细胞RNA测序数据与DDRTree算法识别肝细胞癌中的癌症干细胞,并构建4基因预后特征模型 | 模型验证仅限于两个独立数据集,需要更大样本量的外部验证 | 建立可靠的基于癌症干细胞的肝细胞癌预后特征模型 | 肝细胞癌患者和癌症干细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 多变量Cox回归 | 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-LIHC队列训练集和两个独立验证数据集(GSE14520-GPL571, GSE14520-GPL3921) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2425 | 2025-11-17 |
Bioinformatics analysis identifies ULK3 as a novel prognostic and immune-related biomarker in esophageal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-989
PMID:41234868
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析发现ULK3是食管癌的新型预后和免疫相关生物标志物 | 首次系统研究ULK3在食管癌中的表达模式、预后价值和免疫调节功能 | 主要基于生物信息学分析,需要实验验证 | 探讨ULK3在食管癌预后和肿瘤免疫中的作用 | 食管癌患者组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 食管癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 | Cox回归模型,孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 多个GEO数据集和TCGA队列(包括96例ESCC,88例EAC等) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2426 | 2025-11-17 |
A novel manganese metabolism- and immune-related prognostic risk model for acute myeloid leukemia
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-933
PMID:41234859
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于锰代谢和免疫相关基因的急性髓系白血病预后风险模型 | 首次结合锰代谢相关基因和免疫相关基因构建AML预后模型,并验证了其预测效能 | NA | 建立急性髓系白血病的预后风险预测模型 | 急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,Cox回归分析,KEGG/GO富集分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2427 | 2025-11-17 |
Identification of cancer-associated fibroblast subpopulation and construction of an immunotherapy signature for gastric cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-996
PMID:41234876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别胃癌微环境中癌症相关成纤维细胞的四个亚群,并构建与免疫治疗反应相关的预后特征 | 首次系统识别胃癌微环境中CAFs的四个异质性亚群,并发现基于Cluster3的评分系统能显著区分患者预后和免疫治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 识别胃癌中癌症相关成纤维细胞亚群并评估其预后和免疫治疗相关性 | 胃癌患者和相关的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序,基因表达谱分析,KEGG通路富集分析,CIBERSORT算法 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2428 | 2025-11-17 |
Single-cell analysis of tumor microenvironment immune homeostasis and identification of prognostic biomarkers in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-999
PMID:41234874
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫稳态并鉴定预后生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下揭示HNSCC中T细胞从初始状态到耗竭状态的分化轨迹,并构建基于六个关键基因的预后风险模型 | 预后风险模型的曲线下面积仅为0.66,预测性能有待提高 | 阐明头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的免疫稳态机制并开发预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 单细胞分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 来自GEO和TCGA-HNSC项目的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2429 | 2025-11-17 |
CC/CXC chemokine risk signature at single-cell resolution: a machine learning model for precision stratification in cervical cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1137
PMID:41234865
|
研究论文 | 本研究开发了基于趋化因子相关基因的宫颈癌预后风险特征,并在单细胞分辨率下探索了其在肿瘤微环境中的作用 | 首次构建趋化因子相关基因风险特征,在单细胞分辨率下揭示肿瘤-免疫-基质相互作用网络 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证 | 开发宫颈癌预后风险分层模型并探索其临床效用 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习算法 | Cox风险模型, 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA-CESC队列和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | 使用Seurat进行单细胞数据分析,CellChat分析细胞间通讯 |
| 2430 | 2025-11-17 |
Molecular dynamics simulation and single-cell and spatial transcriptomics validate immune and prognostic biomarkers in colorectal cancer and construct a clinical prognostic model
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-918
PMID:41234880
|
研究论文 | 本研究通过整合分子动力学模拟、单细胞和空间转录组学技术,验证了结直肠癌中的免疫和预后生物标志物,并构建了临床预后模型 | 首次结合分子动力学模拟与单细胞和空间转录组学验证结直肠癌生物标志物,并构建多基因预后模型 | 研究样本主要来自公共数据库,缺乏前瞻性临床验证 | 系统识别结直肠癌中与免疫和预后相关的差异表达基因,验证其临床意义并构建可靠预后模型 | 698例结直肠癌患者的临床和RNA测序数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | LASSO, Cox回归, 五种机器学习算法 | 基因表达数据, 临床数据 | 698例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2431 | 2025-11-17 |
CCT4 as a prognostic biomarker correlated with immune infiltration and hepatocyte dedifferentiation in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1277
PMID:41234881
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,探讨CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其与免疫浸润和肝细胞去分化的关联 | 首次在单细胞水平揭示CCT4通过促进肝细胞去分化和改变免疫微环境驱动肝癌进展的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证CCT4的具体分子机制 | 探究CCT4在肝细胞癌中的生物学功能及其预后价值 | 肝细胞癌患者组织和相关数据库数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 生物信息学分析 | Cox回归模型, 列线图模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2432 | 2025-11-17 |
The role of cancer stem cells in the progression of colorectal cancer and the tumor microenvironment: new perspectives from single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analyses
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-586
PMID:41234894
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结直肠癌干细胞亚型在肿瘤微环境中的作用及预后标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析结直肠癌干细胞亚型的空间分布特征及其与肿瘤微环境的相互作用机制 | 未明确说明样本规模及实验验证的局限性 | 阐明结直肠癌干细胞在肿瘤进展中的作用机制并发现新的预后标志物 | 结直肠癌干细胞亚型(Co-CSS)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CytoTRACE干细胞特性分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2433 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomes analyses reveal T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in colorectal cancer
2025-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1104
PMID:41234898
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析,构建了结直肠癌中T细胞相关的预后风险模型并研究肿瘤免疫微环境调控 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,识别T细胞特征基因并构建三基因预后模型 | 使用公共数据库数据,缺乏实验验证和前瞻性临床验证 | 探索T细胞异质性,识别特征基因并开发可靠的预后模型以预测患者结局和免疫治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,Cox回归,LASSO回归 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2434 | 2025-11-17 |
Novel Taxol-Derivative, STO-1, Induces Selective Anti-Tumor Immunity and Sustained Remission of Glioblastoma Without Triggering Autoimmune Reactions
2025-Oct-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211703
PMID:41227348
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研究论文 | 本研究开发了一种新型前药STO-1,通过选择性重编程肿瘤相关巨噬细胞实现胶质母细胞瘤的持续缓解且不引发自身免疫反应 | 通过紫杉醇与姜黄素的可裂解共价连接创建新型前药STO-1,实现选择性肿瘤相关巨噬细胞重编程而不引发系统性自身免疫反应 | 研究样本量较小(仅6只原位胶质母细胞瘤小鼠),缺乏人类临床试验验证 | 开发安全有效的胶质母细胞瘤免疫治疗方法 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤相关微glia及巨噬细胞 | 癌症免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,高分辨率离体T2加权MRI | NA | 基因表达数据,医学影像数据 | 6只原位胶质母细胞瘤荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2435 | 2025-11-17 |
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies SRI as a Critical Target Promoting Gastric Cancer Progression and Associated with Poor Prognosis
2025-Oct-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213483
PMID:41228276
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研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证,识别了促进胃癌进展并与不良预后相关的关键分子靶点SRI | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合,识别出胃癌恶性上皮亚群C5和五基因预后特征,并实验验证SRI的关键功能 | 研究样本量有限,需要在更多独立队列中验证预后特征的普适性 | 识别胃癌进展和不良预后的关键分子驱动因素 | 胃癌患者样本和肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,功能验证实验 | LASSO Cox回归模型,多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床数据 | 多个队列的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2436 | 2025-11-17 |
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110467
PMID:41226506
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类骨髓造血干细胞和祖细胞,揭示衰老过程中淋巴系发育轨迹的异常变化 | 首次发现衰老人类骨髓中积累具有B细胞分化缺陷的淋巴祖细胞和记忆样自然杀伤细胞祖细胞群 | 样本量相对有限(15例),年龄跨度较大(19-74岁) | 探究人类骨髓造血系统衰老过程中淋巴系发育轨迹的变化特征 | 人类骨髓造血干细胞和祖细胞(HSPCs, CD34+) | 单细胞基因组学 | 衰老相关血液系统变化 | 单细胞RNA测序, 功能转录组分析, 发育轨迹研究 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名健康人类受试者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2437 | 2025-11-17 |
CD5 Expression in CTCL and Its Implications for Anti-CD5 CAR T-Cell Therapy
2025-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110411
PMID:41226451
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析蕈样肉芽肿中CD5表达模式,评估其作为CAR-T细胞治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平揭示CTCL中CD5表达的动态变化及其与病变类型的关联 | 样本量有限,需要更多研究阐明临床意义 | 评估CD5在皮肤T细胞淋巴瘤中的表达特征及其治疗靶点价值 | 蕈样肉芽肿患者皮肤活检组织中的CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例斑片/斑块期MF活检、8例肿瘤期MF活检、8例健康对照活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2438 | 2025-11-17 |
The Anti-Cancer Potential of Genistein: Single-Cell RNA Sequencing Analysis and Spatial Transcriptome Reveal That Genistein Targets HSD17B1 to Inhibit the Progression of Gastric Adenocarcinoma
2025-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110369
PMID:41226409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示金雀异黄素通过靶向HSD17B1抑制胃腺癌进展的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术系统解析金雀异黄素在胃腺癌中的'药物-基因-细胞'互作网络 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接验证,缺乏体内外实验进一步验证机制 | 探究金雀异黄素在胃腺癌治疗中的分子靶点及作用机制 | 胃腺癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2439 | 2025-11-17 |
Single-Cell Heterogeneity of Epigenetic Factor Regulation Deciphers Alteration of RNA Metabolism During Proliferative SHH-Medulloblastoma
2025-Oct-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213424
PMID:41228218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤中表观遗传调控因子的表达异质性,揭示其在RNA代谢和肿瘤进展中的作用 | 首次在单细胞水平系统分析髓母细胞瘤表观遗传调控因子的表达异质性,并开发与预后相关的表观遗传评分 | 研究基于现有数据库和两个独立队列,样本来源有限 | 探究表观遗传调控在髓母细胞瘤分子异质性和临床预后中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据 | 两个独立队列(PBTA和Williamson队列) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2440 | 2025-11-17 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Immune Remodeling in Lungs of β-Carotene Oxygenase 2 Knockout Mice with Improved Antiviral Response
2025-Oct-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213329
PMID:41228402
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现β-胡萝卜素加氧酶2敲除小鼠肺部免疫重塑并增强抗病毒反应 | 首次揭示BCO2在肺部免疫架构和抗病毒反应中的调控作用,发现其缺失导致免疫细胞组成改变和细胞状态重编程 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究BCO2缺失对肺部免疫细胞组成和抗病毒反应的影响 | BCO2敲除小鼠和C57BL/6J野生型小鼠的肺部组织 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,免疫印迹,基因集变异分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质数据 | BCO2敲除和野生型小鼠肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |