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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2026-05-01 |
Integrated Genomic and Single-Cell Analysis Identifies Notch1 as a Metastasis Suppressor in Nasopharyngeal Carcinoma Targeted by the AKT/Smad3 Axis
2026-Apr-29, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00341-5
PMID:42056895
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研究论文 | 本研究系统探讨Notch1作为鼻咽癌转移抑制因子的功能及其通过AKT/Smad3轴调控上皮间质转化和转移的分子机制 | 首次通过整合基因组与单细胞分析揭示Notch1经AKT/Smad3轴抑制鼻咽癌转移的新型分子机制,并基于Notch1相关基因建立三种分子亚型(C1、C2、C3)用于预后分层 | 未明确提及具体局限性,但部分分析基于公共数据库(TCGA/GEO)及小样本临床验证,需进一步扩大样本验证 | 阐明Notch1在鼻咽癌侵袭转移中的抑癌功能及其分子机制 | 鼻咽癌临床组织样本、细胞系及裸鼠模型 | 机器学习和数字病理 | 鼻咽癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序、TCGA/GEO数据整合分析、Western blot、co-IP、体内外功能实验 | 共识聚类、分子分型(C1/C2/C3) | 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床组织微阵列数据 | 鼻咽癌组织微阵列(样本数未明确)、单细胞RNA测序临床样本(数量未明确)、多个细胞系及裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2422 | 2026-05-01 |
Therapeutic effects of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles from different tissue sources on diminished ovarian reserve and the related mechanisms
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04403-4
PMID:42057118
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研究论文 | 该论文比较了脂肪组织和脐带来源的间充质干细胞外泌体对环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型的治疗作用及机制 | 首次系统比较不同组织来源的间充质干细胞外泌体在卵巢储备功能减退治疗中的效果差异,并揭示脐带来源外泌体具有更广泛调控作用 | 研究对象为小鼠模型,缺乏临床样本验证;外泌体长期疗效和安全性需进一步评估 | 探讨不同组织来源的间充质干细胞外泌体对卵巢储备功能减退的治疗效果及机制 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2423 | 2026-05-01 |
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00908-25
PMID:41930954
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序,探讨帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示CHI3L1在星形胶质细胞中的表达增加是连接COVID-19与帕金森病的关键分子机制,并发现星形胶质细胞通过多种信号分子与神经细胞活跃通讯 | 研究基于公开数据库,样本量有限,且缺乏进一步的实验验证 | 揭示帕金森病与COVID-19共享的分子机制,为治疗靶点提供新见解 | 帕金森病和COVID-19患者的基因表达数据及脑组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病,新冠肺炎 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | 差异表达分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络,细胞通讯分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公开数据库中COVID-19和帕金森病患者的样本 | 不适用 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 2424 | 2026-05-01 |
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02641-4
PMID:42045172
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 | 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 | 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2425 | 2026-05-01 |
The emergence of neurogenic lineage motifs in building the vertebrate retina
2026-Apr-28, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102479
PMID:42054855
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综述 | 该综述综合了分子和谱系逻辑,探讨脊椎动物视网膜单个祖细胞池如何产生神经元的多样性 | 发现并强调了神经源性谱系基序——跨物种的神经源性视网膜祖细胞可重复的神经元输出,揭示了兄弟细胞命运协调的基本约束,并作为理解细胞类型特化的基本单元 | 主要基于现有单细胞测序研究的整合,可能受限于不同研究间的技术差异和样本覆盖度 | 解析视网膜神经元多样性产生的分子和谱系逻辑 | 脊椎动物视网膜祖细胞及其产生的神经元类型 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和表观遗传数据 | 多发育阶段的多种脊椎动物视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2426 | 2026-05-01 |
Deep profiling of lupus nephritis kidneys reveals dynamic changes in myeloid cells associated with disease progression
2026-Apr-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.004
PMID:42055919
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学深度分析狼疮性肾炎肾脏,揭示与疾病进展相关的髓系细胞动态变化 | 首次大规模结合scRNA-seq和空间转录组学,系统描绘狼疮性肾炎肾脏中髓系细胞亚群的动态变化及其与组织损伤和炎症的关系 | 未明确说明,但样本量有限(6例LN患者和2例对照用于空间转录组学) | 探究狼疮性肾炎中髓系细胞介导的免疫反应及其与组织学异质性的关联 | 狼疮性肾炎患者的肾脏样本(156例患者和30例健康对照用于scRNA-seq;6例患者和2例对照用于空间转录组学) | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 156例LN患者和30例健康对照(scRNA-seq),6例LN患者和2例对照(空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2427 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
|
综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 2428 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
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评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2429 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2430 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
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研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用,并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型,并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物,并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2431 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2432 | 2026-05-01 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-Apr-16, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
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研究论文 | 本研究探讨了T-2毒素诱导的H型血管增殖与炎症在大骨节病(KBD)发病机制中的作用,并验证了其形成自循环驱动KBD进展 | 首次发现H型血管在大骨节病发病中的关键中介作用,揭示了T-2毒素运输、炎症与软骨损伤之间的恶性循环机制 | 未明确说明 | 探究H型血管在大骨节病(KBD)发病机制中的作用 | 大鼠KBD模型、H型血管 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、免疫荧光、组织病理学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 大鼠分为四组:对照组、低硒+T-2组、低硒+T-2+Roxadustat组、低硒+T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2433 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
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研究论文 | 提出一种名为Locat的框架,通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失,识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集,Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失,并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架,以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2434 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
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研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术,揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学,解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征,以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2435 | 2026-05-01 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
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研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR干扰技术,揭示了衰老通过限制CXCL13+滤泡辅助性T细胞的成熟来影响人类体液免疫 | 首次在人类特异性免疫衰老研究中发现衰老导致CXCL13 GC-Tfh细胞选择性缺失,并鉴定BACH2和SOX4为与年龄相关的分化转录调控因子 | 未明确说明限制条件 | 探究衰老对滤泡辅助性T细胞(Tfh)成熟的影响及其在抗体反应下降中的作用 | T滤泡辅助细胞(Tfh细胞)和B细胞 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序、CRISPR干扰 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 来自年轻和年长供体的人类扁桃体类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2436 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
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研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序,定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观,并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱,发现了超过15000个m6A位点,并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |
| 2437 | 2026-05-01 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
|
研究论文 | 本研究揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的机制 | 首次阐明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡从而加重脓毒症的机制,为脓毒症的病理机制研究和临床治疗提供新的潜在靶点和理论支持 | 未明确提及具体局限性 | 探究RETN在脓毒症病理生理过程中的具体作用机制 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型中的巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序、RNA-seq | NA | 单细胞测序和RNA-seq数据 | 脓毒症患者样本及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2438 | 2026-05-01 |
The AICL-KLRF1 axis supports CD4-CD8 T cell communication and cytokine competence in pre-exhausted CD8+ T cells
2026-Apr, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00732-5
PMID:41851343
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研究论文 | 该研究揭示了AICL-KLRF1轴在晚期分化CD8 T细胞中支持细胞因子产生,并促进CD4-CD8 T细胞通讯 | 首次发现KLRF1作为CD4-CD8通讯轴的一部分,通过识别其配体AICL来支持晚期分化CD8 T细胞的细胞因子产生能力 | 未详细说明研究的具体局限性 | 探究在慢性感染和癌症中,维持前体耗竭CD8 T细胞细胞因子产生的信号机制 | 人类CD8 T细胞、CD4 T细胞、肺腺癌组织及邻近组织 | 免疫学 | 肺癌 | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传组数据 | 肺腺癌和邻近组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序 |
| 2439 | 2026-03-21 |
scZiva: imputation method for single-cell RNA-seq data with zero-inflated variational autoencoder
2026-Mar-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06422-2
PMID:41857511
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2440 | 2026-03-20 |
Lactylation-related gene signature for prognosis prediction and immune infiltration assessment in lung adenocarcinoma via bulk and single-cell RNA sequencing
2026-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04845-0
PMID:41851557
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |