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当前共找到 40356 篇文献，本页显示第 2421 - 2440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2026-05-19 |
Islet inflammatory macrophages drive MSC loss and multiple interactions involved in β-cell adaptation during diabetes
2026-May-16, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156636
PMID:42144182
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示2型糖尿病进展中胰岛炎症巨噬细胞导致间充质干细胞丢失及β细胞适应过程中的多重相互作用 | 首次在糖尿病小鼠模型中揭示巨噬细胞与间充质干细胞之间的旁分泌串扰共同调控β细胞适应，并阐明了TNF-α介导的Wntless下调在其中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结论在人类中的适用性尚需验证 | 探究2型糖尿病进展中非β胰岛细胞（尤其是巨噬细胞和间充质干细胞）在β细胞功能适应中的作用 | 糖尿病小鼠胰岛中的巨噬细胞、间充质干细胞和β细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2422 | 2026-05-19 |
Predicting gene-specific regulation with transcriptomic and epigenetic single-cell data
2026-May-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag299
PMID:42143610
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研究论文 | 提出MetaFR方法，利用单细胞ATAC-seq和RNA-seq数据学习基因特异性调控模型 | 提出MetaFR方法，通过高效回归树在单细胞或元细胞水平建立基因表达预测模型，运行时间和预测性能优于现有方法SCARlink | 单细胞数据固有的稀疏性使分析具有挑战性 | 研究基因特异性调控机制，利用转录组和表观遗传组单细胞数据预测基因表达 | 基因表达预测模型及调控区域 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | 回归树 | 表观遗传数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2423 | 2026-05-19 |
A CSF disease-associated macrophage signature defines progressive multiple sclerosis
2026-May-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03861-9
PMID:42129775
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研究论文 | 本研究结合流式细胞术和单细胞转录组学，揭示了进行性多发性硬化症患者脑脊液中CD14+单核细胞增多，这些细胞呈现边界相关巨噬细胞样特征并与疾病进展相关 | 首次在脑脊液中定义与进行性多发性硬化症相关的疾病相关巨噬细胞特征，并发现这些细胞与神经退行性病变中发现的疾病相关小胶质细胞/巨噬细胞共享部分特性 | 研究为回顾性与前瞻性结合设计，样本量相对有限，且未探讨脑脊液细胞变化的因果关系 | 探究进行性多发性硬化症患者脑脊液中的细胞变化及其作为生物标志物的潜力 | 多发性硬化症患者（包括复发-缓解型和进行性型）及非炎症性对照的脑脊液细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 流式细胞术、单细胞转录组学、ELISA | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISA数据 | 回顾性流式细胞术：299例（169例RRMS，56例PMS，74例对照）；前瞻性单细胞转录组学：35人（11例对照，12例RRMS，12例PMS）；额外阿尔茨海默病对照数据来自公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、流式细胞术 | NA | NA |
| 2424 | 2026-05-19 |
A Spatial Atlas of Muscle-Invasive Bladder Cancer Reveals Lineage-Specific Vulnerabilities and Immune Architecture
2026-May-13, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0099
PMID:42126225
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、批量RNA和全外显子测序数据，构建了肌层浸润性膀胱癌的空间图谱，揭示了肿瘤内部的管腔-基底轴、谱系特异性脆弱性和免疫结构 | 首次通过空间转录组学揭示MIBC肿瘤内连续有序的管腔-基底轴及其与染色体不稳定性、转录可塑性和治疗敏感性的关联 | 未提及，可能包括样本量限制和空间转录组技术的分辨率局限性 | 构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱，以理解其谱系状态、免疫结构和治疗脆弱性 | 22个肌层浸润性膀胱癌肿瘤样本 | 计算病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学、批量RNA测序、全外显子测序 | NA | 空间基因表达数据、RNA测序数据、全外显子测序数据 | 22个肿瘤样本（空间转录组学），超过3000个肿瘤样本（泛队列分析） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2425 | 2026-05-19 |
Maternal immune activation perturbs the brain epitranscriptome
2026-May-12, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106804
PMID:42128069
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研究论文 | 本研究揭示了母体免疫激活如何扰动大脑表观转录组，并鉴定出脱甲基酶FTO可作为改善MIA后代行为表型的治疗靶点 | 首次通过空间转录组学和直接RNA测序技术，系统地描述了发育中小鼠大脑中表观转录组调控因子的细胞类型和脑区特异性分布，并阐明了MIA如何改变大脑表观转录组图谱 | 未明确提及研究限制 | 阐明母体免疫激活导致的RNA代谢紊乱的精确机制，并寻找潜在治疗靶点 | 母体免疫激活小鼠模型及其后代 | 机器学习, 数字病理学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学, 直接RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 直接RNA测序数据 | 使用MIA小鼠模型及其后代，具体样本量未说明 | NA | 空间转录组学, 直接RNA测序 | NA | NA |
| 2426 | 2026-05-19 |
A Perturb-seq screen guided by species divergence uncovers pathways for collateral artery formation
2026-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721711
PMID:42146601
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研究论文 | 通过物种分化引导的 Perturb-seq 筛选，揭示侧支动脉形成的通路 | 结合豚鼠和小鼠的单细胞 RNA 测序数据，开发 Perturb-seq 平台以发现调控动脉内皮细胞特化的基因，并识别出抑制侧支动脉形成的通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探索侧支动脉形成的发育机制，鉴定能够促进其生长的治疗靶点 | 豚鼠和小鼠的组织内皮细胞，特别是与侧支动脉发育相关的基因表达模式 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞 RNA 测序, Perturb-seq | NA | 基因表达数据 | 来自豚鼠和小鼠组织的内皮细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞 3' 测序平台 |
| 2427 | 2026-05-19 |
The abscopal effect of IRE combined with anti-PD-1 achieves local ablation and systemic control of PDAC
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722535
PMID:42146443
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研究论文 | 探讨不可逆电穿孔（IRE）联合抗PD-1疗法对胰腺导管腺癌（PDAC）的局部消融及全身性控制效果 | 首次证明IRE联合抗PD-1抗体可在转移性PDAC临床前模型中诱导远隔效应，并揭示B细胞在IRE介导的全身抗肿瘤免疫中发挥重要作用 | NA | 研究IRE联合抗PD-1疗法能否诱导远隔效应以实现局部消融和全身性控制PDAC | 转移性胰腺导管腺癌（PDAC）临床前模型 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间免疫荧光 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间成像数据 | 多个小鼠模型，包含原位PDAC肿瘤和B细胞敲除小鼠 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 2428 | 2026-05-19 |
Macrophage metabolism directs regenerative versus fibrotic healing through BMP signaling in the mouse digit tip
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722661
PMID:42146602
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研究论文 | 利用小鼠指尖截肢模型，发现一依赖于脂肪酸氧化和糖酵解代谢转换的巨噬细胞亚群通过BMP信号驱动再生性愈合，而该亚群在纤维化愈合中缺失 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组学和代谢组学分析，发现再生特异性巨噬细胞通过BMP信号促进骨再生，并揭示其由脂肪酸氧化增强和糖酵解活性降低的代谢开关调控 | 未明确解释再生指尖独特的微环境条件如何诱导该巨噬细胞亚群出现，以及其在人类再生中的适用性 | 探究巨噬细胞如何通过不同信号通路决定愈合结局为再生或纤维化 | 小鼠指尖截肢模型中再生性（P3截肢）和纤维化（P2截肢）愈合的巨噬细胞及其微环境 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、代谢组数据 | 小鼠指尖截肢模型（P3和P2截肢组） | 10x Genomics、Illumina | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium、Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA-seq捕获，10x Visium用于空间转录组分析，Illumina NovaSeq用于测序 |
| 2429 | 2026-05-19 |
Modeling human B cell development with pluripotent stem cells
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722674
PMID:42146710
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研究论文 | 建立一种从人类多能干细胞高效生成B细胞的方案，并验证其能准确再现成人骨髓B淋巴细胞生成过程 | 首次实现从不同人类多能干细胞系来源的定型造血祖细胞高效生成B细胞，并揭示IL-7对功能性IgH重排的抑制效应以及卵黄囊祖细胞与定型造血祖细胞均具有B细胞潜能 | 未提及临床转化验证或长期体内功能评估 | 开发基于人类多能干细胞的B细胞生成方案，用于研究早期B淋巴细胞生成及提供治疗性浆细胞来源 | 人类多能干细胞及其分化的B细胞（前B细胞、前体B细胞、幼稚B细胞、浆细胞） | 数字病理学 | NA | 多组学单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种人类多能干细胞系 | 10x Genomics, 其他未明确公司在文中未指定 | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2430 | 2026-05-19 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2026-May-05, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2026.101542
PMID:42090754
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学分析，发现白细胞介素-1β驱动致心律失常性心肌病的疾病进展 | 首次在人类ACM样本中结合单核RNA测序和空间转录组学，鉴定出与纤维化和炎症细胞类型共存的疾病相关空间生态位，并证明抗IL-1β中和抗体在Dsg2突变小鼠中可减轻纤维化、维持心脏功能并减少心律失常机制 | 研究主要基于有限的患者样本和动物模型，抗IL-1β治疗在人体中的安全性和有效性需要进一步临床试验验证 | 探索致心律失常性心肌病中疾病进展的分子机制及潜在治疗靶点 | 人类ACM患者的心肌样本和对照供体样本，以及Dsg2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | ACM患者和对照供体的心肌样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单核RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 2431 | 2026-05-19 |
Alzheimer's Disease and circadian disruption sex-specifically contribute to a loss of bone maintenance in APP/PS1 model mice
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.01.722089
PMID:42146604
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研究论文 | 本研究探索了阿尔茨海默病和昼夜节律紊乱对APP/PS1模型小鼠骨维持丧失的性别特异性影响 | 结合高分辨率微计算机断层扫描、拉曼光谱和单细胞RNA测序，首次揭示了昼夜节律紊乱与阿尔茨海默病在骨重塑中的协同机制 | 未阐述 | 探究遗传和环境因素（昼夜节律紊乱）对骨结构、骨髓祖细胞活性和单核细胞衍生巨噬细胞的影响 | APP/PS1转基因小鼠模型 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2432 | 2026-05-19 |
Clonal embeddings allow exploratory analysis of lineage-resolved single-cell data
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.30.720820
PMID:42146635
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研究论文 | 开发了一种名为clone2vec的机器学习方法，用于从谱系解析的单细胞数据中学习克隆嵌入，实现可扩展的探索性分析 | 直接利用细胞表达流形学习克隆嵌入，无需离散细胞类型标签，对少细胞克隆保持稳定，并支持跨数据集对齐 | 未提及 | 解决稀疏克隆数据和注释依赖带来的分析挑战，提供谱系耦合单细胞数据的探索性分析通用方案 | 胚胎发生、肿瘤发生和造血过程中的前瞻性条形码数据集，以及TCR测序分析的肿瘤微环境 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序，TCR测序 | clone2vec（嵌入学习模型） | 单细胞转录组数据 | 涉及多个数据集，包括胚胎发生、肿瘤发生、造血过程及肿瘤微环境样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2433 | 2026-05-19 |
Histone deacetylases and cell-cycle regulators orchestrate cell-identity transitions during Arabidopsis root regeneration
2026-05-04, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.03.013
PMID:41889170
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、ATAC测序、成像和突变体分析，描绘拟南芥根再生过程中细胞重编程的轨迹，揭示组蛋白去乙酰化酶和细胞周期调控因子在细胞身份转变中的作用 | 首次在单细胞水平揭示拟南芥根再生过程中细胞重编程的连续状态，发现I类组蛋白去乙酰化酶HDA9和HDA19在早期关闭旧身份和防止应激反应中的作用，以及DOF转录因子OBP1和SMR蛋白调控细胞分裂速率以促进新身份获取的机制 | 未提及 | 揭示拟南芥根再生过程中细胞重编程的分子机制 | 拟南芥根再生细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 成像, 突变体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 图像数据 | 未明确提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序和ATAC测序 |
| 2434 | 2026-05-19 |
Robust identification of cell-cell communication heterogeneity in single cells
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721691
PMID:42146454
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研究论文 | 提出scRICH框架，整合机制性多尺度数学模型与学习策略，从单细胞和空间转录组数据中捕获细胞间通讯的复杂性，并揭示细胞类型内的通讯行为异质性 | 首次将机制性多尺度数学模型与学习策略相结合，利用RNA剪接的动态信息联系细胞间通讯与细胞命运决定，并通过构建多层调控网络连接细胞间相互作用与细胞内响应的尺度 | 研究未明确说明局限性 | 开发能够从单细胞转录组数据中稳健识别细胞间通讯异质性的计算框架 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据，以及EGF配体/受体在皮肤等效类器官角质形成细胞中的共表达 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2435 | 2026-05-19 |
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111231
PMID:41831621
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析类风湿性关节炎滑膜中的中性粒细胞异质性及其炎症重编程机制 | 首次在单细胞水平揭示RA滑膜中性粒细胞的NF-κB/STAT3轴驱动的炎症重编程，并鉴定C1和C3炎症表型以及M3/M4功能模块 | 验证仅基于bulk RNA-seq队列（n=19），缺乏功能实验的直接验证 | 阐明类风湿性关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性和炎症重编程机制 | 8名RA患者滑膜组织的66,539个细胞，包括中性粒细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 8名RA患者（66,539个细胞）和19名独立队列的bulk RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2436 | 2026-05-19 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴招募促炎性巨噬细胞簇，加剧ICI相关心肌炎 | 首次在单细胞水平揭示内皮细胞通过App-Cd74轴与Cxcl9+Cxcl10+巨噬细胞簇相互作用，加重ICI相关心肌炎的免疫病理机制，并利用深度学习框架scTenifoldXct验证该配体-受体相互作用 | 未提及具体局限性，但基于小鼠模型的研究结果可能需在人类样本中验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的免疫病理机制并探索潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架（scTenifoldXct） | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2437 | 2026-05-08 |
Abi3S212F Alzheimer's disease variant alters plaque structure and disrupts microglia
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71452
PMID:42092345
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研究论文 | 本研究通过构建Abi3S212F小鼠模型，发现该阿尔茨海默病风险变体会改变淀粉样斑块结构并导致小胶质细胞功能障碍 | 首次在体内揭示ABI3S209F/Abi3S212F变体通过破坏细胞骨架动力学导致小胶质细胞功能障碍和死亡，并证明这种损伤发生在斑块形成之前 | 未提及具体局限性 | 阐明ABI3S209F（Abi3S212F）阿尔茨海默病风险变体对小胶质细胞功能和淀粉样病理的影响机制 | Abi3S212F基因敲入小鼠与两种人源化β-淀粉样蛋白（Aβ）模型杂交的后代 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学， 单细胞分析， 共聚焦成像 | NA | 图像， 转录组数据 | 不同年龄段的小鼠样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 空间转录组学， 单细胞RNA测序 | 10x Visium， 10x Chromium | 空间转录组学使用10x Visium平台，单细胞分析使用10x Chromium平台 |
| 2438 | 2026-05-19 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals APOE genotype-dependent sex differences in Alzheimer's disease
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71463
PMID:42108391
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示APOE基因型依赖性性别差异在阿尔茨海默病中的作用 | 首次在单细胞水平全面研究性别与APOE基因型之间的相互作用 | 未提供具体局限性信息 | 探索阿尔茨海默病中性别和APOE相关差异的单细胞转录组学变化 | 阿尔茨海默病患者的脑细胞类型（54种高分辨率细胞类型） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2439 | 2026-05-19 |
Integrin β3 Promotes Retinal Neovascularization via Endoplasmic Reticulum Stress-Mediated Endothelial Cell Senescence
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.40
PMID:42149032
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研究论文 | 本研究探索整合素β3通过内质网应激介导的内皮细胞衰老促进视网膜新生血管形成的机制 | 首次揭示整合素β3通过PERK/eIF2α/ATF4通路激活内质网应激，驱动内皮细胞衰老，进而促进视网膜新生血管形成 | 主要基于体外细胞实验和动物模型，缺乏临床样本验证 | 阐明整合素β3驱动视网膜新生血管形成的分子机制 | 视网膜血管内皮细胞，特别是氧诱导视网膜病变模型中的内皮细胞亚群 | 机器学习 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型及人视网膜微血管内皮细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2440 | 2026-05-19 |
Myeloid Cell States in Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Are Shaped by Iron Overload and Metabolic Reprogramming
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720189
PMID:42079193
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研究论文 | 通过整合小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示流感相关肺曲霉病中由铁过载和代谢重编程驱动的髓系细胞状态变化 | 首次利用单细胞转录组学结合小鼠模型阐明IAV感染后肺内铁积累如何通过免疫代谢重编程损害髓系细胞抗真菌功能，并验证与人类患者转录缺陷的相似性 | 未提及 | 探究流感A病毒感染后肺部微环境如何导致继发性曲霉感染的机制 | 小鼠肺单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺曲霉病，流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据（转录组） | 小鼠模型，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |