单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 24301 - 24320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24301 | 2024-08-09 |
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.597967
PMID:33521016
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素，并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 | 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素，并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的易感性因素 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 | SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者 |
| 24302 | 2024-08-09 |
Disrupted spermatogenesis in a metabolic syndrome model: the role of vitamin A metabolism in the gut-testis axis
2022-01, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2020-323347
PMID:33504491
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研究论文 | 本研究探讨了饮食诱导的肠道微生物失调对睾丸轴的影响，特别是在代谢综合征模型中对精子发生的影响 | 通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，揭示了维生素A代谢在肠道-睾丸轴中的作用，以及肠道微生物与精子发生之间的直接联系 | NA | 旨在揭示肠道-睾丸轴在精子发生障碍中的作用机制 | 代谢综合征模型中的睾丸样本、宿主代谢组和肠道微生物群 | NA | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析、16S rDNA测序 | NA | RNA、代谢物、微生物序列 | NA |
| 24303 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomic analysis identifies novel vascular smooth muscle subsets under high hydrostatic pressure
2021-Oct, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1852-x
PMID:33486587
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研究论文 | 本研究构建了一个高静水压细胞培养系统，模拟持续高血压环境，并通过单细胞转录组分析鉴定了人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）的新型分子分类 | 发现了两种新型HASMC亚群，即炎症亚群和内皮功能抑制亚群，这些亚群在高静水压下表现出不同的基因表达模式，并参与调节内皮功能 | NA | 探究高血压进展中直接的生物力学效应 | 人类主动脉平滑肌细胞（HASMCs）在高静水压下的分子分类 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 在100-mmHg和200-mmHg静水压下培养的HASMCs，以及来自高血压患者和实验动物模型高血压的动脉中膜样本 |
| 24304 | 2024-08-09 |
DSTG: deconvoluting spatial transcriptomics data through graph-based artificial intelligence
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa414
PMID:33480403
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研究论文 | 本文提出了一种名为DSTG的新方法，通过基于图的卷积网络对空间转录组数据进行解卷积，以揭示组织内细胞异质性的空间结构 | DSTG方法能够准确地解卷积每个spot的观察基因表达并恢复其细胞组成，实现了高水平的分割 | NA | 研究旨在通过解卷积空间转录组数据来揭示组织细胞异质性的空间结构 | 研究对象包括小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络 | 转录组数据 | 涉及小鼠大脑皮层层、海马切片和胰腺肿瘤组织 |
| 24305 | 2024-08-09 |
Elucidating the cellular dynamics of the brain with single-cell RNA sequencing
2021-07, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2020.1870362
PMID:33499699
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在过去十年的发展及其在神经科学领域的应用 | 介绍了多组学适应和空间转录组学工作流程的最新进展，这些技术能够从单个细胞中收集更全面的信息 | NA | 探讨scRNA-seq技术的发展及其在神经科学中的应用，特别是在健康和疾病状态下对神经系统基本细胞动态和分子机制的理解 | 单细胞RNA测序技术及其在神经科学中的应用 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24306 | 2024-08-09 |
Chemotherapy Induces Senescence-Like Resilient Cells Capable of Initiating AML Recurrence
2021-06, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1375
PMID:33500244
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研究论文 | 本文研究了急性髓系白血病（AML）患者化疗后复发的原因，发现化疗诱导AML细胞进入一种衰老样表型，这种表型具有再增殖和植入潜力，与AML复发有关。 | 本文首次揭示了化疗诱导的衰老样表型在AML复发中的作用，并发现ATR抑制剂可以有效抑制这种表型的持久性。 | NA | 探讨急性髓系白血病化疗后复发机制，并寻找针对性的治疗策略。 | 急性髓系白血病细胞及其化疗后的生物学行为。 | NA | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24307 | 2024-08-09 |
Development of an optimal protocol for molecular profiling of tumor cells in pleural effusions at single-cell level
2021-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14821
PMID:33484069
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研究论文 | 本文旨在开发一种优化的实验室测试协议，用于对胸腔积液中的游离肿瘤细胞（FTCs）进行单细胞测序 | 开发了一种精确的单细胞突变检测器（ASMD），用于识别FTCs中的体细胞突变，并改进了全基因组扩增（WGA）协议以减少相关错误 | NA | 开发一种优化的单细胞测序协议，用于分析胸腔积液中的游离肿瘤细胞 | 胸腔积液中的游离肿瘤细胞（FTCs） | 数字病理学 | NA | 全基因组扩增（WGA），基因组测序 | NA | 基因组数据 | 案例1：19个细胞，案例2：20个细胞 |
| 24308 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling for advancing birth defects research and prevention
2021-04-15, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.1870
PMID:33496083
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在揭示发育途径和过程中前所未有的分辨率，以及其在实验胚胎学和人类胚胎发育中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了对不同细胞类型基因表达集的全面表征，并揭示了细胞类型从早期细胞状态的演变 | NA | 探讨单细胞技术在推进出生缺陷研究和预防中的应用 | 发育过程中的细胞分析和毒性研究 | 基因组学 | 出生缺陷 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24309 | 2024-08-09 |
Single-cell Immune Landscape of Human Recurrent Miscarriage
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.002
PMID:33482359
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术比较分析了正常和不明原因复发性流产妊娠早期绒毛和外周白细胞的细胞和分子特征 | 揭示了复发性流产患者绒毛和外周白细胞的细胞和分子图谱，特别是发现了一种独特的促炎性CD56CD16 dNK亚群在复发性流产绒毛中大量积累 | NA | 深入理解复发性流产中的系统性和绒毛免疫环境 | 复发性流产患者的绒毛和外周白细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及正常和不明原因复发性流产妊娠早期的绒毛和外周白细胞样本 |
| 24310 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing Deciphers Immune Landscape of Human Recurrent Miscarriage
2021-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.12.005
PMID:33482360
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24311 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals mRNAs and lncRNAs important for oocytes in vitro matured in pigs
2021-Apr, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.13901
PMID:33496347
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了猪体内成熟卵母细胞的转录组，以揭示mRNA和lncRNA在卵母细胞体外减数分裂成熟过程中的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究猪卵母细胞体外减数分裂成熟过程中的mRNA和lncRNA的表达变化 | NA | 探索卵母细胞减数分裂过程中分子电路和模块的组织和原理 | 猪卵母细胞的mRNA和lncRNA在体外减数分裂成熟过程中的表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | GV和MII阶段的卵母细胞 |
| 24312 | 2024-08-09 |
Dysregulation of the NRG1/ERBB pathway causes a developmental disorder with gastrointestinal dysmotility in humans
2021-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI145837
PMID:33497358
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研究论文 | 本文通过三重外显子测序和分子生物学分析，揭示了ERBB3和ERBB2基因的双等位变异在导致包括胃肠动力障碍在内的发育障碍中的作用 | 首次详细描述了ERBB3和ERBB2基因变异在人类发育障碍中的作用，并揭示了这些变异在肠道神经系统和肌肉异常中的具体机制 | 研究主要基于病例系列和实验室模型，需要进一步的临床验证和更广泛的样本量来确认结果的普遍性 | 探讨ERBB3和ERBB2基因变异在人类发育障碍中的分子基础及其对胃肠道动力的影响 | 患有胃肠动力障碍及相关发育障碍的患者 | 遗传学 | 发育障碍 | 外显子测序，单细胞RNA测序，定量实时PCR，免疫印迹 | NA | 基因数据，细胞数据 | 8名患者 |
| 24313 | 2024-08-09 |
Oncolytic virotherapy-mediated anti-tumor response: a single-cell perspective
2021-03-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.12.022
PMID:33482123
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研究论文 | 研究了Talimogene laherparepvec（T-VEC）这种经过基因改造的单纯疱疹病毒1型（HSV-1）在皮肤原发性B细胞淋巴瘤（pCBCL）中的抗肿瘤效应，通过单细胞转录组学和免疫组库分析其临床和组织学效应。 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了T-VEC治疗后肿瘤细胞和非肿瘤细胞的转录组变化，并识别了三种pCBCL亚型。 | 研究仅限于皮肤原发性B细胞淋巴瘤，且样本量相对较小。 | 探讨T-VEC在皮肤原发性B细胞淋巴瘤中的抗肿瘤效应及其分子机制。 | 皮肤原发性B细胞淋巴瘤患者及其肿瘤组织。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 13名患者，其中11名显示出注射部位肿瘤反应。 |
| 24314 | 2024-08-09 |
Roles of TGF-β Superfamily Proteins in Extravillous Trophoblast Invasion
2021-03, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2020.12.005
PMID:33478870
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综述 | 本文综述了TGF-β超家族蛋白在调控人类早期妊娠中滋养外胚层细胞（EVT）侵袭过程中的作用及其机制 | 介绍了3D培养滋养层类器官、单细胞测序和微流控技术在EVT侵袭研究中的应用 | NA | 探讨TGF-β超家族成员及其受体、信号通路和下游分子靶点在调控EVT侵袭中的功能，并总结这些发现对不良妊娠结局的相关性 | TGF-β超家族蛋白及其在EVT侵袭中的作用 | NA | 妊娠相关疾病 | 3D培养、单细胞测序、微流控技术 | NA | 细胞 | NA |
| 24315 | 2024-08-09 |
A hitchhiker's guide to single-cell transcriptomics and data analysis pipelines
2021-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.01.007
PMID:33485955
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学（SCT）技术及其数据分析流程 | SCT技术提供了前所未有的单细胞分辨率，揭示了细胞异质性和罕见细胞群 | SCT数据高度复杂，需要先进的统计和计算方法进行分析 | 探讨SCT技术的最新趋势、挑战、数据分析的机器学习方法及未来展望 | 单细胞转录组数据及其在细胞生物学和疾病研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学（SCT） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24316 | 2024-08-09 |
Derivation of snake venom gland organoids for in vitro venom production
2021-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-00463-4
PMID:33504990
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研究论文 | 本文描述了如何生成、维护和应用蛇毒腺器官，以实现体外蛇毒生产 | 首次提出使用蛇毒腺器官作为体外生产蛇毒的安全替代方法 | NA | 开发一种安全的方法来生产蛇毒，以促进抗蛇毒和新型治疗药物的开发 | 蛇毒腺器官的生成、维护及其在蛇毒生产中的应用 | NA | NA | 组织培养技术 | 3D 培养模型 | 细胞 | 从胚胎晚期和最近死亡的成年蛇的毒腺组织中提取 |
| 24317 | 2024-08-09 |
Sex-Stratified Gene Regulatory Networks Reveal Female Key Driver Genes of Atherosclerosis Involved in Smooth Muscle Cell Phenotype Switching
2021-02-16, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过生成性别特异性的基因调控网络（GRNs），揭示了女性在动脉粥样硬化中平滑肌细胞表型转换的关键驱动基因。 | 首次在女性中识别出动脉粥样硬化的关键驱动基因，并展示了这些基因在平滑肌细胞表型转换中的作用。 | 研究样本仅包括160名女性和年龄匹配的男性，可能限制了结果的普遍性。 | 探索性别差异在动脉粥样硬化中的分子机制，并寻找性别特异性的治疗靶点。 | 动脉粥样硬化患者的动脉壁组织和平滑肌细胞。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因调控网络数据 | 160名女性和年龄匹配的男性 |
| 24318 | 2024-08-09 |
Changes in genome architecture and transcriptional dynamics progress independently of sensory experience during post-natal brain development
2021-02-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.12.032
PMID:33484631
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研究论文 | 本研究通过高分辨率的多重退火和循环扩增环技术（MALBAC-DT）和二倍体染色质构象捕获（Dip-C）方法，生成了发育中的小鼠大脑皮层和海马体的转录组和三维基因组图谱。 | 首次揭示了单个脑细胞的三维基因组结构，并展示了转录组和三维基因组在出生后的动态变化，这些变化与感觉经验无关。 | 研究主要集中在小鼠大脑皮层和海马体，可能不适用于其他物种或大脑区域。 | 探索哺乳动物大脑发育过程中基因组结构和转录动态的独立变化。 | 小鼠大脑皮层和海马体的转录组和三维基因组。 | 基因组学 | NA | 多重退火和循环扩增环技术（MALBAC-DT），二倍体染色质构象捕获（Dip-C） | NA | 转录组数据，三维基因组数据 | 3,517个细胞的转录组，3,646个细胞的三维基因组 |
| 24319 | 2024-08-09 |
Targeting the tumor microenvironment in cholangiocarcinoma: implications for therapy
2021-02, Expert opinion on therapeutic targets
IF:4.6Q1
DOI:10.1080/14728222.2021.1882998
PMID:33502260
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综述 | 本文综述了胆管癌（CCA）中肿瘤微环境（TME）的作用，并探讨了针对TME的潜在治疗策略 | 利用单细胞RNA测序技术对CCA中的TME进行功能性表征，为免疫疗法和癌症相关成纤维细胞及细胞外基质导向治疗铺平道路 | 文章指出手术和细胞毒性化疗的低效性，强调需要新的治疗策略和伴随生物标志物 | 探讨胆管癌中肿瘤微环境的作用，并开发新的治疗策略 | 胆管癌及其肿瘤微环境 | NA | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24320 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals transcriptomic heterogeneity mediated by host-pathogen dynamics in lymphoblastoid cell lines
2021-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.62586
PMID:33501914
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了五个淋巴母细胞样细胞系的转录组特征，并使用离散时间模拟探索了随机性对细胞克隆进化的影响 | 首次揭示了淋巴母细胞样细胞系中由宿主-病原体动态介导的转录组异质性，并通过模拟展示了初始细胞异质性、随机抽样等因素对细胞群体动态多样性的影响 | NA | 探索淋巴母细胞样细胞系中的转录组异质性及其影响因素 | 淋巴母细胞样细胞系及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个淋巴母细胞样细胞系 |