单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 29785 篇文献，本页显示第 24241 - 24260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24241 | 2024-08-08 |
Convergent clonal selection of donor- and recipient-derived CMV-specific T cells in hematopoietic stem cell transplant patients
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2117031119
PMID:35105810
|
研究论文 | 研究在非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中，供体和受体来源的CMV特异性T细胞的克隆选择和竞争 | 首次在人类感染背景下评估T细胞竞争对CMV再激活的响应，并使用单细胞转录组学追踪供体和受体来源的T细胞克隆 | 研究仅限于特定的造血干细胞移植患者群体，且仅关注CMV再激活的情况 | 探讨T细胞竞争在人类CMV感染中的作用及其对T细胞响应的影响 | 非骨髓抑制性造血干细胞移植患者中的CMV特异性T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 90天的供体和受体来源的T细胞克隆数据 |
| 24242 | 2024-08-08 |
Epigenetic state determines inflammatory sensing in neuroblastoma
2022-02-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2102358119
PMID:35121657
|
研究论文 | 研究探讨了神经母细胞瘤中炎症信号通路的响应情况，并发现表观遗传状态对炎症感知有决定性影响 | 发现神经母细胞瘤细胞系中表观遗传状态与对双链RNA的响应能力相关，为免疫治疗策略提供了新视角 | NA | 研究神经母细胞瘤中炎症信号通路及其与表观遗传状态的关系 | 神经母细胞瘤细胞系及其对炎症刺激的响应 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 20种不同的神经母细胞瘤细胞系 |
| 24243 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of mouse uterus at the invasion phase of embryo implantation
2022-Feb-05, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00749-y
PMID:35123575
|
研究论文 | 本研究利用小鼠作为动物模型，生成了一份单细胞转录组图谱，揭示了胚胎植入期小鼠子宫的23个不同细胞集群 | 首次在小鼠子宫胚胎植入期的入侵阶段生成单细胞转录组图谱，并揭示了多种细胞类型的差异表达变化 | NA | 探究胚胎植入的分子机制 | 小鼠子宫在胚胎植入期的细胞类型和分子机制 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠子宫在妊娠第6天的胚胎植入部位 |
| 24244 | 2024-08-08 |
CRISPR activation and interference screens decode stimulation responses in primary human T cells
2022-02-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj4008
PMID:35113687
|
研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi）筛选，在人原代T细胞中识别控制白细胞介素-2（IL-2）和干扰素-γ（IFN-γ）产生的基因网络 | 首次在人原代T细胞中进行全基因组CRISPRa和CRISPRi筛选，揭示了调控细胞因子产生的关键基因网络 | NA | 系统发现依赖刺激的细胞因子调控因子，以了解其在自身免疫、免疫缺陷和癌症中的作用 | 人原代T细胞中的细胞因子调控基因 | 免疫学 | 自身免疫病 | CRISPR激活（CRISPRa）和干扰（CRISPRi） | NA | 基因组数据 | 全基因组 |
| 24245 | 2024-08-08 |
Novel insights from a multiomics dissection of the Hayflick limit
2022-02-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70283
PMID:35119359
|
研究论文 | 本文通过多种组学技术重新研究了WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老过程 | 发现衰老状态的转变早期显现并逐渐增加，与核仁和核纤层相关域的DNA可及性全局增加相对应；揭示了衰老的WI-38细胞在基因表达上与肌成纤维细胞的相似性 | NA | 深入理解细胞复制性衰老的过程和机制 | WI-38人肺成纤维细胞的复制性衰老 | 生物学 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢数据, DNA可及性数据 | NA |
| 24246 | 2024-08-08 |
TNF antagonist sensitizes synovial fibroblasts to ferroptotic cell death in collagen-induced arthritis mouse models
2022-02-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27948-4
PMID:35115492
|
研究论文 | 本研究利用胶原诱导的关节炎（CIA）小鼠模型，探讨了铁死亡诱导剂伊米他酮（IKE）和TNF拮抗剂依那西普联合使用对滑膜成纤维细胞铁死亡及关节炎进展的影响。 | 首次展示了TNF拮抗剂与铁死亡诱导剂联合使用在胶原诱导的关节炎小鼠模型中诱导滑膜成纤维细胞铁死亡并减缓关节炎进展的效果。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证其疗效和安全性。 | 探索铁死亡在类风湿性关节炎治疗中的潜在应用。 | 滑膜成纤维细胞及胶原诱导的关节炎小鼠模型。 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 24247 | 2024-08-08 |
Single cell RNA sequencing reveals differentiation related genes with drawing implications in predicting prognosis and immunotherapy response in gliomas
2022-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-05686-x
PMID:35115572
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，用于预测患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞转录组学分析识别出胶质瘤细胞的三种分化状态及其相关基因，并构建了基于这些基因的预后模型和诺模图模型 | 研究仅限于胶质瘤患者，且样本量未具体说明，可能影响模型的泛化能力 | 旨在识别与胶质瘤细胞分化相关的基因，以预测患者的预后和免疫治疗反应 | 胶质瘤细胞的分化状态及其相关基因 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图模型 | RNA序列数据 | NA |
| 24248 | 2024-08-08 |
Lung cancer scRNA-seq and lipidomics reveal aberrant lipid metabolism for early-stage diagnosis
2022-02-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abk2756
PMID:35108060
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和脂质组学分析，揭示了早期肺癌中脂质代谢的异常，并开发了一种基于液相色谱-质谱法的检测方法，用于早期肺癌的诊断。 | 本文首次结合单细胞RNA测序和脂质组学技术，识别出与早期肺癌诊断相关的关键脂质标志物，并开发了一种高灵敏度和特异性的检测方法。 | NA | 开发一种新的血液检测方法，用于早期肺癌的诊断和大规模高风险人群的筛查。 | 早期肺癌患者的脂质代谢异常及其在诊断中的应用。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、脂质组学、液相色谱-质谱法 | 支持向量机算法 | RNA序列、脂质组数据、质谱数据 | 探索性队列311名参与者，独立验证队列1036名参与者，前瞻性临床队列109名参与者 |
| 24249 | 2024-08-08 |
NF-κB perturbation reveals unique immunomodulatory functions in Prx1+ fibroblasts that promote development of atopic dermatitis
2022-02-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abj0324
PMID:35108061
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下对特应性皮炎发展的独特免疫调节作用 | 发现Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下能诱导皮肤炎症，这一发现为特应性皮炎的病理机制提供了新的见解 | 研究主要基于小鼠模型和人类特应性皮炎皮肤样本，未来需在更广泛的人群中验证这些发现 | 探讨NF-κB通路在特应性皮炎发展中的作用及其潜在的免疫调节机制 | Prx1+成纤维细胞在NF-κB通路扰动下的免疫调节功能 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 包括小鼠模型和人类特应性皮炎皮肤样本 |
| 24250 | 2024-08-08 |
Prdm6 controls heart development by regulating neural crest cell differentiation and migration
2022-02-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.156046
PMID:35108221
|
研究论文 | 本文通过转录组分析和遗传命运图谱方法，揭示了Prdm6作为表观遗传修饰因子在调控心脏神经嵴细胞（CNCCs）分化和迁移中的关键作用 | 首次识别Prdm6作为调控CNCCs命运的决定因子，并揭示其通过调节CNCCs特异性基因网络影响心脏发育 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能需要进一步在其他模型或人类样本中验证 | 探讨Prdm6在心脏神经嵴细胞分化和迁移中的分子机制及其在先天性心脏病治疗中的潜在应用 | Prdm6基因在心脏神经嵴细胞分化和迁移中的作用及其调控的基因网络 | NA | 先天性心脏病 | 转录组分析, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 转基因小鼠样本 |
| 24251 | 2024-08-08 |
Spatial maps of hepatocellular carcinoma transcriptomes highlight an unexplored landscape of heterogeneity and a novel gene signature for survival
2022-Feb-02, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02430-9
PMID:35109839
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析了肝细胞癌肿瘤及其邻近非肿瘤组织的基因表达异质性，并构建了一个新的6基因标志物模型用于肝细胞癌的预后预测 | 本研究首次利用空间转录组学技术揭示了肝细胞癌的基因表达异质性，并构建了一个新的6基因标志物模型，为肝细胞癌的预后预测提供了新的工具 | 本研究主要依赖于空间转录组学技术，可能存在技术本身的局限性；此外，研究结果需要在更大规模和更多样化的患者群体中进行验证 | 揭示肝细胞癌的基因表达异质性，并开发新的预后预测工具 | 肝细胞癌肿瘤及其邻近非肿瘤组织的基因表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 近10,820个组织区域 |
| 24252 | 2024-08-08 |
Cyclic multiplex fluorescent immunohistochemistry and machine learning reveal distinct states of astrocytes and microglia in normal aging and Alzheimer's disease
2022-Feb-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02383-4
PMID:35109872
|
研究论文 | 本文开发了一种循环多重荧光免疫组织化学方法，结合机器学习，对阿尔茨海默病（AD）患者死后人脑中的星形胶质细胞和微胶质细胞进行形态学定量表征，并分析它们与斑块和缠结的空间关系。 | 本文创新性地结合了循环多重荧光免疫组织化学和机器学习方法，揭示了星形胶质细胞和微胶质细胞的三种不同表型，并扩展了传统的“稳态与反应性”二分类。 | NA | 研究目的是深入理解胶质细胞反应的复杂性和异质性，并为转录组学研究提供信息。 | 研究对象是阿尔茨海默病患者死后人脑中的星形胶质细胞和微胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 循环多重荧光免疫组织化学 | 卷积神经网络 | 图像 | 5172个ALDH1L1+星形胶质细胞和6226个IBA1+微胶质细胞 |
| 24253 | 2024-08-08 |
Time-resolved single-cell sequencing identifies multiple waves of mRNA decay during the mitosis-to-G1 phase transition
2022-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71356
PMID:35103592
|
研究论文 | 研究揭示了在人类细胞从有丝分裂到G1期过渡期间，通过广泛且时间控制的mRNA降解作为基因表达调控的额外机制 | 发现了在细胞周期中，mRNA降解作为基因表达调控的新机制，并识别了参与此过程的deadenylase CNOT1 | NA | 探讨细胞周期中基因表达调控的新机制 | 人类细胞中的mRNA降解及其在细胞周期中的作用 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA | 未具体说明样本数量 |
| 24254 | 2024-08-08 |
Diagnostic Evidence GAuge of Single cells (DEGAS): a flexible deep transfer learning framework for prioritizing cells in relation to disease
2022-02-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01012-2
PMID:35105355
|
研究论文 | 提出了一种名为DEGAS的深度迁移学习框架，用于将疾病信息从患者转移到单个细胞 | DEGAS框架能够将疾病信息（称为“印象”）转移到单个细胞，使细胞与疾病属性如诊断、预后和治疗反应相关联 | NA | 开发一种新的深度迁移学习框架，用于优先考虑与疾病相关的细胞 | 单细胞和患者大量组织转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度迁移学习 | 深度学习框架 | 转录组数据 | 使用模拟数据和来自胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病和多发性骨髓瘤的十个不同单细胞和患者大量组织转录组数据集 |
| 24255 | 2024-08-08 |
PD-1 blockade therapy promotes infiltration of tumor-attacking exhausted T cell clonotypes
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110331
PMID:35108529
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了PD-1阻断疗法对肿瘤微环境中肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的影响，特别是对具有耗竭表型的T细胞克隆型的影响 | 首次展示了PD-1阻断疗法能够促进肿瘤微环境中非预存的肿瘤特异性T细胞克隆型的出现，这些克隆型主要来源于肿瘤引流淋巴结 | NA | 研究PD-1阻断疗法如何影响肿瘤微环境中的T细胞克隆型，特别是具有耗竭表型的T细胞 | 肿瘤微环境中的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和肿瘤特异性T细胞克隆型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 24256 | 2024-08-08 |
Diversity of satellite glia in sympathetic and sensory ganglia
2022-02-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110328
PMID:35108545
|
research paper | 本研究利用单细胞RNA测序分析，识别了交感神经和感觉神经节中五种不同的卫星胶质细胞群体 | 首次揭示了交感神经和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性及其在免疫反应、早期基因反应和离子通道/细胞外基质相互作用中的富集情况 | NA | 探究交感神经和感觉神经节中卫星胶质细胞的分子多样性 | 交感神经和感觉神经节中的卫星胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24257 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a low CD8+ T cell infiltrating state mediated by fibroblasts in recurrent renal cell carcinoma
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004206
PMID:35121646
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了复发性肾细胞癌中由成纤维细胞介导的低CD8+ T细胞浸润状态 | 首次在复发性肾细胞癌中应用单细胞转录组学技术，揭示了成纤维细胞通过Gal1抑制CD8+ T细胞的新机制 | NA | 探索复发性肾细胞癌与原发性肾细胞癌在肿瘤微环境和基因表达模式上的差异 | 复发性肾细胞癌和原发性肾细胞癌的肿瘤微环境及基因表达模式 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 32,073个细胞来自2个原发性肾细胞癌、2个复发性肾细胞癌和3个邻近正常肾样本，以及41对原发性肾细胞癌和复发性肾细胞癌样本作为验证队列 |
| 24258 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomic Analysis Reveals the Cellular Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2022-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.01.005
PMID:35123072
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析骨髓和脐带华通胶来源的61,296个间充质干细胞，揭示了五个不同的亚群及其发育轨迹 | 首次揭示了间充质干细胞的五个不同亚群及其从干细胞样活跃增殖细胞到多能祖细胞的分化路径，并发现了具有自我更新和免疫调节潜力的亚群 | NA | 揭示间充质干细胞的细胞异质性及其功能 | 间充质干细胞的亚群及其功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 61,296个间充质干细胞 |
| 24259 | 2024-08-08 |
Inter-tissue convergence of gene expression during ageing suggests age-related loss of tissue and cellular identity
2022-01-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68048
PMID:35098922
|
研究论文 | 研究分析了小鼠大脑皮层、肺、肝和肌肉在发育和衰老过程中的基因表达变化，发现衰老过程中基因表达出现逆转现象，导致不同组织间的基因表达趋向一致 | 首次提出并验证了衰老过程中不同组织基因表达趋向一致的现象，即DiCo（divergence followed by convergence） | NA | 探讨衰老过程中基因表达的变化及其对组织和细胞身份的影响 | 小鼠的大脑皮层、肺、肝和肌肉组织 | 基因表达 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16只小鼠 |
| 24260 | 2024-08-08 |
A Rapid Adaptable Method for Isolation of Endothelial Cells from Human Adipose Tissue
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_18
PMID:35099741
|
research paper | 本文介绍了一种从人类脂肪组织中快速分离内皮细胞的可靠且灵活的方法 | 该方法可以用于各种分析，包括单细胞RNA测序、体外培养和下游应用 | NA | 研究旨在开发一种有效的方法来分离和研究脂肪组织中的内皮细胞 | 人类脂肪组织中的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |