单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 24241 - 24260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24241 | 2024-08-09 |
Atypical B cells are part of an alternative lineage of B cells that participates in responses to vaccination and infection in humans
2021-02-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108684
PMID:33567273
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了健康个体和疟疾暴露个体中抗原特异性B细胞和总B细胞的多样性 | 揭示了两种B细胞谱系：经典的激活和静息记忆B细胞谱系以及包括先前描述的非典型B细胞在内的替代谱系 | NA | 研究人类B细胞的多样性及其在疫苗接种和感染反应中的作用 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 健康个体和疟疾暴露个体的B细胞样本 |
| 24242 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling identifies pre-existing CD19-negative subclones in a B-ALL patient with CD19-negative relapse after CAR-T therapy
2021-02-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21168-6
PMID:33558546
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了在接受CAR-T治疗后复发的B-ALL患者中，存在预先存在的CD19阴性亚克隆 | 首次通过单细胞RNA测序技术证明CAR-T治疗前已存在CD19阴性白血病细胞，这些细胞在治疗后被选择性扩增导致复发 | 研究样本仅为单一病例，可能限制了结果的普遍性 | 探究CAR-T治疗后B-ALL患者复发的原因，并评估单细胞RNA测序技术在预测靶向治疗失败风险中的应用 | B-ALL患者的白血病细胞及其在CAR-T治疗前后的变化 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一B-ALL患者 |
| 24243 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of neutrophil heterogeneity in sepsis
2021-02-06, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-021-03481-0
PMID:33549126
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研究论文 | 本研究通过小鼠CLP模型和单细胞基因测序技术，探讨了脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 首次揭示了脓毒症晚期中性粒细胞的多种功能障碍，并通过单细胞RNA测序技术发现了中性粒细胞的多个亚群 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类脓毒症的实际情况存在差异 | 探讨脓毒症过程中中性粒细胞的异质性及其免疫功能 | 中性粒细胞在脓毒症中的异质性和功能 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞基因测序技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的中性粒细胞 |
| 24244 | 2024-08-09 |
Follicular Lymphoma Microenvironment: An Intricate Network Ready for Therapeutic Intervention
2021-Feb-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13040641
PMID:33562694
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综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤（FL）微环境的复杂网络及其在疾病发生、进展和异质性中的作用，并探讨了针对该微环境的新型治疗策略。 | 利用最新的技术如全外显子测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，精确解析了FL微环境中特定细胞表型及其在疾病中的作用。 | NA | 探讨滤泡性淋巴瘤微环境的主要参与者及其当前和未来的治疗策略。 | 滤泡性淋巴瘤的微环境及其在疾病中的作用。 | NA | 淋巴瘤 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 24245 | 2024-08-09 |
Tumor Evolution and Therapeutic Choice Seen through a Prism of Circulating Tumor Cell Genomic Instability
2021-02-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10020337
PMID:33562741
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综述 | 本文综述了通过循环肿瘤细胞（CTCs）的单细胞分析来探讨基因组不稳定性（GI）的分子机制及其对肿瘤演化和耐药克隆出现的影响 | 介绍了通过分子和功能特性监测CTCs以理解基因组不稳定性的分子机制，并强调了染色体不稳定性（CIN）在CTCs驱动转移进展和获得性耐药中的作用 | 讨论了单CTC分析中遇到的技术障碍和挑战 | 探讨CTCs中的基因组异常与预后之间的关系，并支持在临床风险评估和治疗选择中监测CTCs中的基因组不稳定性的潜在用途 | 不同类型肿瘤中的循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | NA | 荧光原位杂交（FISH），单细胞测序 | NA | 细胞 | 极低数量的循环肿瘤细胞（CTCs） |
| 24246 | 2024-08-09 |
Nitric oxide prevents aortic valve calcification by S-nitrosylation of USP9X to activate NOTCH signaling
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abe3706
PMID:33547080
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研究论文 | 本文研究了硝酸氧化物（NO）通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化的机制 | 发现了一种新的机制，即通过S-亚硝基化依赖的泛素相关通路调节来预防钙化性主动脉瓣疾病（CAVD） | NA | 探讨NO如何通过S-亚硝基化USP9X激活NOTCH信号通路来预防主动脉瓣钙化 | 猪主动脉瓣间质细胞和单细胞RNA测序 | NA | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 24247 | 2024-08-09 |
Implications of liver injury in risk-stratification and management of patients with COVID-19
2021-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-020-10123-0
PMID:33548030
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研究论文 | 本研究评估了COVID-19患者中肝脏损伤对临床结果的影响 | 提供了预测COVID-19患者住院期间肝脏损伤风险和严重程度的模型 | NA | 评估肝脏损伤对COVID-19患者临床结果的影响 | COVID-19患者的肝脏损伤及其对临床结果的影响 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 基因表达谱分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 1520名严重或危重的COVID-19患者 |
| 24248 | 2024-08-09 |
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.01.020
PMID:33545427
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞，识别出新的特定人群细胞亚群 | 本研究首次在中国汉族溃疡性结肠炎患者中识别出两个新的浆细胞亚群，并发现Th17激活在溃疡性结肠炎患者中表现为系统性免疫活动变化 | 研究样本仅来自中国汉族人群，可能限制了结果的普遍性 | 旨在识别溃疡性结肠炎患者结肠黏膜中的关键基因和细胞类型 | 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12个溃疡性结肠炎患者和健康对照的结肠活检样本 |
| 24249 | 2024-08-09 |
Hematopoietic Stem Cell Niche During Homeostasis, Malignancy, and Bone Marrow Transplantation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.621214
PMID:33553181
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综述 | 本文综述了骨髓微环境中造血干细胞（HSC）的自我更新和多向分化如何受到严格调控，并探讨了骨髓微环境在白血病和造血干细胞移植（HSCT）后的变化 | 利用单细胞测序和成像技术研究骨髓微环境在血液恶性肿瘤和HSCT后的情况 | NA | 探讨骨髓微环境的不同组成部分如何调节正常造血，以及在白血病和HSCT后的变化 | 骨髓微环境中的造血干细胞及其在白血病和HSCT后的调控机制 | NA | 白血病 | 单细胞测序和成像 | NA | NA | NA |
| 24250 | 2024-08-09 |
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.626541
PMID:33553166
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 | 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识，并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 | NA | 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 | 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | NA |
| 24251 | 2024-08-09 |
Shades of white: new insights into tissue-resident leukocyte heterogeneity
2022-01, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15737
PMID:33513286
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研究论文 | 本文讨论了组织驻留白细胞的异质性及其在健康和疾病状态下的功能多样性 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了组织驻留白细胞前所未有的异质性水平 | NA | 探讨组织驻留白细胞的异质性及其在不同器官中的多样性 | 组织驻留白细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24252 | 2024-08-09 |
Longitudinal single-cell RNA-seq of hESCs-derived retinal organoids
2021-Oct, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-020-1836-7
PMID:33521856
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对由人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官在五个不同时间点进行分析，揭示了视网膜发育过程中细胞类型和分子特征的动态变化 | 首次在视网膜类器官发育过程中识别出九种不同的细胞群体，并发现胰岛素受体（INSR）在光感受器生成中的特定表达作用，以及pleiothropin（PTN）-蛋白酪氨酸磷酸酶受体类型Z1（PTPRZ1）在Müller细胞和视网膜前体细胞间的新型相互作用 | NA | 研究人视网膜发育过程并模拟视网膜类器官中的发育障碍 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 五个时间点的视网膜类器官样本 |
| 24253 | 2024-08-09 |
jSRC: a flexible and accurate joint learning algorithm for clustering of single-cell RNA-sequencing data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa433
PMID:33535230
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研究论文 | 本文提出了一种名为jSRC的联合学习算法，用于单细胞RNA测序数据的聚类 | jSRC算法将降维和聚类集成在一起，提高了算法的准确性、可扩展性和可解释性 | NA | 解决现有单细胞RNA测序数据聚类算法在准确性、可扩展性和可解释性方面的不足 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq | 联合学习算法 | 基因表达数据 | 涉及15个不同组织和生物的单细胞RNA测序数据集，细胞数量从49到110,824不等 |
| 24254 | 2024-08-09 |
Space: the final frontier - achieving single-cell, spatially resolved transcriptomics in plants
2021-05-21, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20200274
PMID:33522561
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research paper | 本文综述了空间转录组学方法的发展，并强调了在实现植物组织单细胞分辨率3D空间转录组学方面的最新进展和当前挑战 | 本文提出了在植物中实现单细胞分辨率的空间转录组学的新方法和技术 | 当前方法通常需要细胞分选、转基因植物、原生质体化或其他耗时或破坏性的过程，且大多数技术在实施过程中会失去大部分或全部空间分辨率 | 实现植物组织中单细胞分辨率的3D空间转录组学 | 植物组织的空间转录组学 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 24255 | 2024-08-09 |
PPARs in liver physiology
2021-05-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2021.166097
PMID:33524529
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综述 | 本文综述了过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）在肝脏生理中的最新研究进展，特别关注了PPAR调控中先前被忽视的方面 | 利用单细胞RNA测序等技术揭示了PPAR表达、活性和下游信号调控的复杂性 | NA | 探讨PPARs在肝脏生理中的作用及其调控机制 | 过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24256 | 2024-08-09 |
Flexible comparison of batch correction methods for single-cell RNA-seq using BatchBench
2021-04-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab004
PMID:33524142
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研究论文 | 本文介绍了一种用于比较单细胞RNA测序数据批次校正方法的模块化和灵活的管道BatchBench | BatchBench提供了一种系统的方法来比较不同批次校正方法的性能和计算需求 | NA | 评估和比较不同批次校正方法的性能 | 单细胞RNA测序数据的批次校正方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个经过充分研究的数据集 |
| 24257 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal the intratumoral landscape of infiltrated T-cell subpopulations in oral squamous cell carcinoma
2021-04, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12910
PMID:33513276
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞亚群的内在景观 | 首次揭示了口腔鳞状细胞癌中14种不同的T细胞亚群及其发育轨迹，并发现了与肿瘤免疫抑制相关的标志基因 | 研究样本仅来自三位患者，可能影响结果的普遍性 | 深入了解口腔鳞状细胞癌中T细胞的功能状态和异质性，以推动新型治疗策略的发展 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,866个单个T细胞样本来自三位患者 |
| 24258 | 2024-08-09 |
Characteristics of B lymphocyte infiltration in HPV+ head and neck squamous cell carcinoma
2021-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.14834
PMID:33529452
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研究论文 | 本研究旨在检测人乳头瘤病毒（HPV）相关头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中B淋巴细胞亚群的浸润及其与预后的相关性 | 首次详细分析了HPV阳性HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润情况及其与预后的关系，并探讨了CD4 T淋巴细胞通过CXCL13/CXCR5轴对B淋巴细胞及其亚群的影响 | 研究样本量相对较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨HPV相关HNSCC中B淋巴细胞亚群的浸润与患者预后的关系 | HPV阳性的头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 124个HPV阳性和513个HPV阴性的HNSCC样本 |
| 24259 | 2024-08-09 |
Skin-resident innate lymphoid cells converge on a pathogenic effector state
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03188-w
PMID:33536623
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研究论文 | 本文研究了皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）在银屑病中的作用，发现IL-23或imiquimod诱导的小鼠银屑病模型中，皮肤ILCs会转变为类似病原性ILC3的状态。 | 首次展示了皮肤ILCs在银屑病诱导下会转变为病原性ILC3样状态，并通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序验证了这一转变。 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨皮肤驻留的先天淋巴细胞在银屑病中的作用及其细胞状态的转变。 | 皮肤驻留的先天淋巴细胞（ILCs）及其在银屑病中的作用。 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠皮肤ILCs样本 |
| 24260 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of mouse bladder urothelium uncover novel cell type markers and urothelial differentiation characteristics
2021-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13007
PMID:33538002
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术全面表征了小鼠膀胱上皮细胞，揭示了新的细胞类型标记和上皮细胞分化特征 | 发现了由Plxna4标记的新型膀胱上皮细胞类型，可能与宿主反应和伤口愈合有关；识别出ASPM标记的基底样细胞，可能是成年膀胱上皮的祖细胞 | NA | 全面绘制膀胱上皮细胞的细胞解剖图谱 | 小鼠膀胱上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,917个单细胞 |