单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 24181 - 24200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24181 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics: Molecular Maps of the Mammalian Brain
2021-07-08, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在神经解剖学中的应用及其对大脑分子图谱构建的影响 | 空间转录组学开启了神经解剖学的新时代，通过无监督和无偏见地探索组织结构的分子特征，推动新一代大脑图谱的产生 | NA | 探讨空间转录组学如何通过基因表达谱对大脑区域进行分子分类，从而超越主观的神经解剖学定义 | 哺乳动物大脑的分子图谱 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24182 | 2024-08-09 |
Expression map of entry receptors and infectivity factors for pan-coronaviruses in preimplantation and implantation stage human embryos
2021-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-021-02192-3
PMID:33913101
|
研究论文 | 本文分析了公开的单细胞RNA测序数据，研究了人类胚胎在植入前和植入阶段对多种冠状病毒的易感性 | 首次分析了人类胚胎中多种冠状病毒的进入受体和感染因子的表达图谱 | NA | 预测发育中的人类胚胎是否对多种冠状病毒易感 | 人类胚胎在植入前和植入阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同发育阶段的人类胚胎细胞 |
| 24183 | 2024-08-09 |
ChrNet: A re-trainable chromosome-based 1D convolutional neural network for predicting immune cell types
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.037
PMID:33932523
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于染色体的可重训练一维卷积神经网络（ChrNet），用于预测免疫细胞类型 | ChrNet利用基因在染色体上的位置信息，提高了细胞类型分类的性能 | NA | 提高肿瘤微环境中免疫细胞类型的识别准确性，以改善癌症的临床预后和治疗管理 | 免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 一维卷积神经网络（1D-CNN） | CNN | 基因数据 | NA |
| 24184 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analyses of dairy cattle ruminal epithelial cells during weaning
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.039
PMID:33933592
|
研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium Controller获取了断奶前后两个荷斯坦小牛瘤胃上皮组织的单细胞RNA测序数据，并分析了细胞类型及其标记基因 | 首次在牛中实施单细胞转录组分析，揭示了瘤胃上皮细胞类型及其在断奶期间的发展 | NA | 研究断奶期间瘤胃上皮细胞的类型及其发展 | 荷斯坦小牛瘤胃上皮细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 5064个断奶前细胞和1372个断奶后细胞 |
| 24185 | 2024-08-09 |
Heterozygous ANKRD17 loss-of-function variants cause a syndrome with intellectual disability, speech delay, and dysmorphism
2021-06-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2021.04.007
PMID:33909992
|
研究论文 | 本文描述了由杂合ANKRD17功能丧失变异引起的神经发育障碍综合征，表现为智力障碍、语言延迟和畸形 | 首次详细描述了ANKRD17变异引起的神经发育障碍，并提供了蛋白质模型和单细胞RNA测序数据支持其致病机制 | 研究样本仅限于34名个体，可能存在样本量不足的问题 | 阐明ANKRD17变异在神经发育障碍中的作用及其分子机制 | ANKRD17基因变异及其对神经发育的影响 | NA | 智力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 34名个体 |
| 24186 | 2024-08-09 |
Single-cell molecular and developmental perspectives of sexually dimorphic circuits underlying innate social behaviors
2021-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2021.03.010
PMID:33915498
|
综述 | 本文综述了在小鼠中，单细胞转录组学在揭示社会行为相关的神经回路中细胞类型的分子特征方面的应用 | 提出了使用多模态标准（包括基因表达、生理学和发育起源）来定义细胞类型，以深化对这些神经回路的理解 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解神经回路及其在行为中的功能角色的应用 | 小鼠中与社会行为相关的神经回路中的细胞类型 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24187 | 2024-08-09 |
Evolutionary genetic algorithm identifies IL2RB as a potential predictive biomarker for immune-checkpoint therapy in colorectal cancer
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab016
PMID:33928242
|
研究论文 | 本文利用进化算法Atlas Correlation Explorer (ACE)分析TCGA数据，识别出IL2RB作为结直肠癌免疫检查点治疗潜在的预测性生物标志物。 | 首次采用ACE算法挖掘TCGA数据，发现IL2RB与免疫检查点基因在结直肠癌中的关联。 | NA | 旨在发现结直肠癌患者对免疫检查点治疗反应的预测性生物标志物。 | 结直肠癌患者的免疫检查点治疗反应。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 进化遗传算法 | 基因表达数据 | 115个MSI-H结直肠癌组织微阵列样本 |
| 24188 | 2024-08-09 |
Human Adult Fibroblast-like Synoviocytes and Articular Chondrocytes Exhibit Prominent Overlap in Their Transcriptomic Signatures
2021-Jun, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11255
PMID:33931959
|
研究论文 | 本研究通过深度分析和比较人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞的转录组特征，揭示了它们之间显著的转录组信号重叠 | 本研究首次揭示了人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞之间显著的转录组信号重叠，并提供了数据资源以帮助进一步解析关节稳态和退化的机制 | NA | 测试纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞是否参与完全不同的分化程序以构建滑膜和关节软骨，并维持健康组织 | 人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞的转录组特征 | NA | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新鲜分离的人成体关节软骨细胞、滑膜、初级纤维样滑膜细胞和皮肤成纤维细胞 |
| 24189 | 2024-08-09 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
|
研究论文 | 本文利用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告基因等位基因，研究了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用 | 首次揭示了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的关键作用，并提出在缺乏性别分化的情况下，发育中的睾丸内的信号驱动生殖细胞转化 | NA | 探讨NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用及其机制 | 睾丸生殖细胞肿瘤的发生机制 | NA | 睾丸肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型进行研究 |
| 24190 | 2024-08-09 |
Hierarchicell: an R-package for estimating power for tests of differential expression with single-cell data
2021-May-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07635-w
PMID:33932993
|
研究论文 | Hierarchicell是一个R包，用于估计单细胞数据中差异表达测试的统计功效 | Hierarchicell是首个明确模拟并考虑单细胞RNA-seq数据中层级相关结构（即样本内相关性）的单细胞功率计算器 | NA | 开发一个工具，用于准确估计单细胞RNA-seq数据中差异表达测试的统计功效 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 用户指定的独立实验单位数量（如个体）和实验单位内的细胞数量 |
| 24191 | 2024-08-09 |
Synthetic single cell RNA sequencing data from small pilot studies using deep generative models
2021-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88875-4
PMID:33931726
|
研究论文 | 本文探讨了使用深度生成模型（如变分自编码器VAEs和深度玻尔兹曼机DBMs）从小型试点研究中生成合成单细胞RNA测序数据的可行性 | 本文提出了两种深度生成模型方法：单细胞变分推理scVI和单细胞深度玻尔兹曼机scDBMs，并探讨了它们在不同样本大小下的表现 | 所有方法在处理不同丰度的细胞类型时，存在过度表示高丰度细胞类型和遗漏低丰度细胞类型的问题，并且在处理双峰性问题时遇到困难 | 研究深度生成模型在单细胞转录组学中的应用，以支持scRNA-seq实验的设计 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAEs, DBMs | 数据 | 小型试点研究数据集 |
| 24192 | 2024-08-09 |
miRNA activity inferred from single cell mRNA expression
2021-04-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88480-5
PMID:33911110
|
研究论文 | 本文通过利用miRNA结合已定义的序列基序并通常下调目标基因的特性，展示了从单细胞RNA测序数据中通过基序富集分析推导miRNA活性的方法 | 本文创新地反向利用基序富集分析，从miRNA种子站点推导单细胞中miRNA的活性测量 | NA | 展示如何从单细胞RNA测序数据中推导miRNA活性 | miRNA活性在单细胞水平上的估计 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 9679个TCGA癌症样本，以及人类和小鼠的单细胞RNA测序数据集 |
| 24193 | 2024-08-09 |
Differentiation reveals latent features of aging and an energy barrier in murine myogenesis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109046
PMID:33910007
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠肌肉单核细胞的肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs）在分化过程中的变化 | 研究发现分化过程揭示了衰老的潜在特征，并发现老年MuSCs在分化过程中接近命运决定时停滞 | NA | 探究年龄相关变化在分化轨迹中的表现 | 肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉单核细胞 |
| 24194 | 2024-08-09 |
Investigating Cellular Trajectories in the Severity of COVID-19 and Their Transcriptional Programs Using Machine Learning Approaches
2021-04-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12050635
PMID:33923155
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本，通过机器学习算法推断细胞变化轨迹并识别其转录程序 | 本研究首次应用深度学习算法DrivAER识别COVID-19发病机制中的潜在驱动通路和转录因子，并发现巨噬细胞相关的功能与疾病严重程度的相关性更高 | NA | 探究COVID-19发病机制在单细胞层面的转录驱动因素及其动态变化 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的细胞变化轨迹及其转录程序 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习算法DrivAER | 基因表达数据 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 24195 | 2024-08-09 |
Retinal glial remodeling by FGF21 preserves retinal function during photoreceptor degeneration
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102376
PMID:33937726
|
研究论文 | 本研究探讨了纤维母细胞生长因子21（FGF21）在视网膜色素变性（RP）模型小鼠中对视网膜功能的保护作用 | 首次发现FGF21能通过调节Müller胶质细胞的形态和功能，保护视网膜在光感受器退化过程中的功能 | NA | 探索FGF21在视网膜退化疾病中的治疗潜力 | 视网膜色素变性（RP）模型小鼠 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | P23H小鼠 |
| 24196 | 2024-08-09 |
Connectivity Map Analysis of a Single-Cell RNA-Sequencing -Derived Transcriptional Signature of mTOR Signaling
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094371
PMID:33922083
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据构建疾病转录组特征，并应用于连接图（CMaP）分析，以识别mTOR信号通路的抑制剂 | 开发了使用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析的新方法 | 传统的CMaP分析使用来自大量疾病组织的特征，缺乏分辨率以有效识别有效的治疗药物 | 开发和应用新的方法，利用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析，以识别有效的治疗药物 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）患者的肺组织scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自未经治疗和西罗莫司治疗的LAM患者的肺组织样本 |
| 24197 | 2024-08-09 |
Single Cell Gene Expression Analysis in a 3D Microtissue Liver Model Reveals Cell Type-Specific Responses to Pro-Fibrotic TGF-β1 Stimulation
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094372
PMID:33922101
|
研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | 本文首次应用单细胞测序技术揭示了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对TGF-β1刺激的分子反应，并识别了新的细胞特异性潜在纤维化标志物 | NA | 研究3D细胞培养系统中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | HepaRG、hTERT-HSC和THP-1细胞组成的肝脏微组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三种细胞类型的单细胞 |
| 24198 | 2024-08-09 |
Intratumoral Cellular Heterogeneity: Implications for Drug Resistance in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2021-Apr-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13092023
PMID:33922215
|
综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）患者中肿瘤内异质性的生物学作用及其对获得性耐药发展的影响 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤，揭示了肿瘤内异质性由遗传、表观遗传和蛋白质修饰驱动的多样性 | NA | 探讨肿瘤内异质性在非小细胞肺癌患者治疗中的作用及其对耐药性的影响 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤内异质性及其对药物耐药性的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 24199 | 2024-08-09 |
Activation of Blood Vessel Development in Endometrial Stromal Cells In Vitro Cocultured with Human Peri-Implantation Embryos Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2021-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11050367
PMID:33919335
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外共培养的人胚胎和子宫内膜基质细胞中血管发育的激活 | 首次揭示了子宫内膜基质细胞在植入阶段启动血管发育的分子机制 | 研究仅限于体外共培养模型，未涉及体内环境 | 探讨子宫内膜基质细胞与胚胎共培养后的转录组变化及其在植入过程中的作用 | 子宫内膜基质细胞和胚胎共培养后的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24个非共培养的子宫内膜基质细胞和57个共培养后的子宫内膜基质细胞 |
| 24200 | 2024-08-09 |
[Research Progress of Single Cell Sequencing in Lung Cancer]
2021-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的进展，重点关注其在肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性方面的应用 | 单细胞测序技术能够解决传统测序技术在分辨个体细胞差异方面的不足，有助于深入理解肿瘤微环境中的细胞类型、状态及细胞间通信行为 | NA | 进一步理解肺癌的发生发展机制，发现新的诊断标志物和治疗靶点，为未来肺癌患者的精准治疗提供理论依据 | 肺癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |