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当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 2401 - 2420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2401 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异，特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异，并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小（4名男性和5名女性患者），且仅关注了前交叉韧带，未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织切片图像 | 9名患者（4名男性，5名女性）的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2402 | 2026-04-02 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了在闭合性头部损伤模型中，炎症小体适配蛋白ASC如何促进持续的神经炎症和轻度认知障碍 | 首次在单细胞水平揭示ASC在闭合性头部损伤后微胶质细胞中的选择性表达，并证明其在维持神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；长期效应和具体分子机制需进一步探索 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠模型中的皮质组织，特别是微胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2403 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2404 | 2026-04-02 |
In vivo CRISPR screens identify CBX4 as an epigenetic regulator for cancer immunotherapy
2026-Mar-31, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200564
PMID:41915438
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现CBX4是癌症免疫治疗的关键表观遗传调控因子 | 首次通过体内CRISPR筛选鉴定出CBX4作为表观遗传免疫检查点，揭示了其通过沉默逆转录转座子调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肝癌患者数据，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探索表观遗传调控因子在肿瘤免疫治疗耐药中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型、接受新辅助抗PD-1治疗的肝癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 体内CRISPR-Cas9筛选、单细胞RNA测序、空间转录组学 | CRISPR筛选模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2405 | 2026-04-02 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析，揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 | 首次在CTEPH中整合多组学数据（单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化）进行互补分析，并识别出具有遗传支持的新型候选基因（如ETS1和FGR）及其诊断潜力 | 样本量相对有限，且为观察性研究，需进一步功能验证和更大队列验证 | 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 | 未明确具体样本数，涉及CTEPH患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |
| 2406 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
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研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架，用于空间转录组学数据插补，并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略，利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域；2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示；3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN)，在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战，实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据，自然图像 | 多种组织类型（包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2407 | 2026-04-02 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间转录组数据的生成式AI模型，用于预测大脑血管系统的空间组织结构 | 利用空间mRNA引导的生成模型Tera-MIND，通过Cldn5和Acta2基因的共表达模式及其学习到的注意力图，在细胞级别分辨率上预测大脑血管空间组织 | NA | 探索大脑血管系统的结构变异性和区域特异性功能，以解释疾病模型中的神经学改变 | 小鼠大脑血管系统 | 数字病理学 | 神经疾病 | 空间转录组学 | 生成式AI模型，基于patch和边界感知的扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2408 | 2026-04-02 |
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01394-1
PMID:41917254
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，系统性地揭示了VDAC2在泛癌中的致癌作用及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路影响肿瘤进展和免疫逃逸的机制 | 首次在泛癌层面系统性地整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据来研究VDAC2，并识别了VDAC2-BAK1-IFNγ这一在消化系统癌症中重要的新通路 | 体外实验验证主要集中于胃癌细胞，需要在更多癌症类型和体内模型中进行进一步验证 | 系统性地挖掘VDAC2在泛癌中的作用，探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 泛癌数据集、胃癌细胞系 | 机器学习 | 泛癌（重点关注消化系统癌症） | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-PCR, 细胞共培养, CCK-8检测, Transwell侵袭实验, ELISA | NA | 转录组数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2409 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of urothelial carcinoma with basal/squamous differentiation identifies Galectin-7 as a specific marker of squamous lineage commitment
2026-Mar-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04927-z
PMID:41917522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2410 | 2026-04-02 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
|
研究论文 | 提出了一种名为scMIB的掩码信息瓶颈框架，用于从单细胞RNA测序数据中学习紧凑且信息丰富的表示，以提升细胞聚类的准确性和鲁棒性 | 结合了基于掩码的去噪策略与信息瓶颈目标，通过扰动基因表达模式并训练模型恢复信息结构，同时压缩冗余信号并保留对聚类最相关的信息，还引入了掩码一致性学习机制以捕获稳定的基因水平模式 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中高稀疏性、噪声和冗余性对细胞聚类准确性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码信息瓶颈框架 | 基因表达数据 | 多个公共scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2411 | 2026-04-02 |
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120083
PMID:41916120
|
研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法，探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 | 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合，系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 | 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用，需进一步实验验证；单细胞数据未明确说明样本来源和数量 | 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 | 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 | NA | 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 | 基于NHANES数据库的流行病学队列（具体样本数未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2412 | 2026-04-02 |
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101191
PMID:41916275
|
研究论文 | 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 | 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程，并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态，特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 | 研究主要基于体外实验模型，尚未在临床样本中得到充分验证 | 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | DNA条形码技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2413 | 2026-04-02 |
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.006
PMID:41916284
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研究论文 | 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍，发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂，其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 | 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台，首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍，揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 | 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据，体内实验验证可能受模型特异性限制，未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 | 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍，以提高心肌细胞诱导效率，促进心脏再生 | 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程，特别是在心肌梗死后的病理微环境中 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及140个潜在障碍的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制化Perturb-seq平台，适用于复杂病理环境 |
| 2414 | 2026-04-02 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-Mar-27, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠ICI相关心肌炎模型，发现内皮细胞通过App-Cd74轴招募促炎性巨噬细胞簇，揭示了ICI心肌炎的新免疫病理机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出ICI心肌炎中由Cxcl9和Cxcl10共表达的巨噬细胞亚群，并发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴驱动其聚集，为靶向治疗提供了新方向 | 研究基于小鼠模型，人类临床样本验证尚缺；单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和基因检测灵敏度 | 探究免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制，寻找潜在治疗靶点 | 小鼠心脏组织中的免疫细胞，特别是巨噬细胞亚群和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架scTenifoldXct | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2415 | 2026-04-02 |
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.053
PMID:41895464
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术，构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱，揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术，高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态，明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉，并发现CD4谱系是转录默认程序，而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；空间转录组学分辨率有限，可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 | 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱，以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 | 小鼠胸腺中的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2416 | 2026-04-02 |
Immune gene MMP9 as a potential key mediator in TCDD exposure-associated atherosclerosis: An integrated study based on network toxicology and experimental validation
2026-Mar-25, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116073
PMID:41895505
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学与实验验证，探索了环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化之间的潜在分子机制，并识别出核心免疫基因MMP9作为关键介质 | 首次通过整合网络毒理学、机器学习筛选与分子模拟，系统性地识别并验证了MMP9作为TCDD暴露相关动脉粥样硬化的核心免疫介质，并揭示了其通过结合TCDD调控炎症反应和血管基质重塑的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞模型，缺乏体内动物实验或临床样本的直接验证；分子对接和动力学模拟的结果需要进一步的实验证实 | 探索环境污染物TCDD暴露与动脉粥样硬化发生发展的分子联系，识别关键免疫基因及其调控通路 | 动脉粥样硬化相关转录组数据集、TCDD暴露相关基因表达谱、人脐静脉内皮细胞(HUVEC) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blot、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习诊断模型（结合多种基础算法）、SHAP分析、WGCNA | 转录组数据、基因表达谱、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2417 | 2026-04-02 |
High-Fidelity Long-term Whole-embryo Lineage and Fate Reconstruction by Iterative Tracking with Error Correction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711203
PMID:41889864
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ITEC的无监督方法，用于高保真地自动重建胚胎中每个细胞的完整谱系和命运图 | 提出ITEC方法，通过迭代追踪与错误校正实现无监督的细胞谱系重建，在斑马鱼胚胎数据中达到超过99.7%的准确率 | NA | 重建活体胚胎的完整细胞谱系和命运图，以探索发育生物学中的关键形态发生过程 | 斑马鱼、小鼠等胚胎的细胞 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 四个跨物种数据集，包括斑马鱼和小鼠胚胎，总计1850万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 2418 | 2026-04-02 |
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711362
PMID:41889901
|
研究论文 | 本文提出了一个名为UniST的统一生成式人工智能框架，用于从稀疏的连续切片中计算重建密集且连续的三维空间转录组学景观 | 提出了一个统一的生成式AI框架，整合了核点卷积与交叉注意力层、基于光流的插值以及图自编码器与隐式神经表示三个互补模块，以解决稀疏、异质的三维ST数据重建问题，而无需改变底层实验技术 | 未明确提及该计算框架在处理极低质量或高度降解组织样本时的性能，也未讨论其计算资源需求或在不同物种间的普适性限制 | 开发一个通用的计算解决方案，以经济高效且可扩展的方式重建三维空间转录组学景观，从而更真实地研究组织结构和疾病生物学 | 小鼠胚胎数据集和三维人类癌症组织 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 生成式AI框架（整合核点卷积、交叉注意力层、光流插值、图自编码器、隐式神经表示） | 三维空间转录组学数据（点云、连续切片） | 未明确指定具体样本数量，涉及小鼠胚胎数据集和两种三维人类癌症组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2419 | 2026-04-02 |
Predicting targeted- and immunotherapeutic response outcomes in melanoma with single-cell Raman spectroscopy and AI
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654612
PMID:41889902
|
研究论文 | 本文提出了一种结合单细胞拉曼光谱和机器学习的方法，用于快速分析黑色素瘤细胞并预测其对靶向和免疫疗法的反应 | 开发了一种非破坏性、单细胞水平的拉曼光谱结合机器学习方法，用于预测黑色素瘤的靶向和免疫治疗反应，该方法成本较低且能反映影响肿瘤行为的生化改变 | 研究样本量有限（9例患者来源样本），且方法在更广泛临床环境中的验证仍需进一步研究 | 预测黑色素瘤对靶向和免疫治疗的反应，以改善精准医疗中的治疗选择评估 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例已知对靶向和免疫治疗抑制剂（如bemcentinib、cabozantinib、dabrafenib、nivolumab等）具有耐药性特征的黑色素瘤患者来源样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 光谱数据 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例患者来源样本 | NA | 单细胞拉曼光谱 | NA | NA |
| 2420 | 2026-04-02 |
In Vivo CRISPR Screening Identifies the Glutamate Receptor GRIA2 as Promoting Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer via Calcium-Dependent β-Catenin Activation
2026-Mar-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521746
PMID:41806318
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研究论文 | 本研究通过体内CRISPR筛选发现谷氨酸受体GRIA2通过钙依赖性β-连环蛋白激活促进胃癌腹膜转移 | 首次通过体内全基因组CRISPR/Cas9筛选鉴定出GRIA2作为胃癌腹膜转移的关键驱动因子，并揭示了癌症相关成纤维细胞通过谷氨酸旁分泌轴促进转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，尚未在人体中进行直接干预验证 | 探索胃癌腹膜转移的新治疗靶点 | 胃癌细胞、腹膜转移灶、癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床病理数据 | 细胞系来源和患者来源的类器官异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |