单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2401 - 2420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2401 | 2025-10-06 |
TRANSCRIPTOMIC DIFFERENCES IN PERIPHERAL MONOCYTE POPULATIONS IN SEPTIC PATIENTS BASED ON OUTCOME
2024-08-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002379
PMID:38713581
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者外周血单核细胞亚群的转录组差异与临床结局的关系 | 首次在单细胞水平揭示不同临床结局脓毒症患者的经典与非经典单核细胞转录组差异，发现TNF-α产生相关的基因表达模式 | 样本量未明确说明，研究结果需要更大规模验证 | 阐明决定脓毒症患者不同临床轨迹的免疫学机制 | 脓毒症患者的外周血经典和非经典单核细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，通路分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2402 | 2025-10-06 |
Scanorama: integrating large and diverse single-cell transcriptomic datasets
2024-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-00991-3
PMID:38844552
|
研究论文 | 介绍用于整合大型多样化单细胞转录组数据集的Scanorama工具及其使用流程 | 开发了能够有效整合来自不同实验、实验室和技术的单细胞RNA测序数据的工具，解决了数据集间技术变异问题 | 需要用户具备细胞生物学、转录组技术和生物信息学的基础知识 | 提高异质性单细胞RNA测序数据的质量和解释能力 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2403 | 2025-10-06 |
Dynamic intrauterine crosstalk promotes porcine embryo implantation during early pregnancy
2024-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2557-x
PMID:38748354
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示猪胚胎着床过程中母胎对话的动态机制 | 开发了新型工具ExtraCellTalk构建母胎对话动态图谱，并发现保守的RBP4/STRA6信号通路 | 研究局限于猪模型，人类临床适用性需进一步验证 | 探究胚胎着床过程中的母胎对话机制 | 猪围植入期胚胎和对应母体子宫内膜 | 单细胞组学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2404 | 2025-10-06 |
DIMINISHED EXPRESSION OF GLS IN CD4 + T CELLS SERVES AS A PROGNOSTIC INDICATOR ASSOCIATED WITH CUPROPTOSIS IN SEPTIC PATIENTS
2024-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002370
PMID:38662604
|
研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者铜死亡相关基因表达，发现CD4+T细胞中GLS表达降低可作为预后指标 | 首次将铜死亡相关基因表达与脓毒症患者免疫细胞亚群分类和预后关联，并发现GLS表达变化与铜螯合治疗的独特响应模式 | GLS表达变化与铜关联机制尚未完全阐明，需要进一步研究 | 探索脓毒症患者铜死亡相关分子标志物以辅助分层和改善预后 | 脓毒症患者外周血样本和Jurkat细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | scRNA-seq, WGCNA, 免疫印迹, 流式细胞术, 免疫荧光, CFSE分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 脓毒症患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2405 | 2025-10-06 |
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2300012120
PMID:37307473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老如何通过影响微glia/巨噬细胞与内皮细胞/少突胶质前体细胞间的相互作用来损害中风后脑修复机制 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老对中风后脑修复机制的影响，并证明年轻来源的MG/MΦ移植可部分恢复老年小鼠的脑修复功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中得到验证；机制研究仍需要进一步深入 | 探究衰老对中风后脑组织修复机制的影响 | 年轻和老年小鼠的中风后脑组织 | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠在急性期（3天）和慢性期（14天）的中风后脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2406 | 2025-10-06 |
Integrating multiomics longitudinal data to reconstruct networks underlying lung development
2019-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00554.2018
PMID:31432713
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学纵向数据重建了肺发育调控网络 | 开发了首个结合mRNA、microRNA、DNA甲基化和蛋白质组学的肺泡发育动态调控网络模型，并首次将模型与单细胞RNA-Seq数据交叉验证 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 揭示出生后肺泡肺发育的动态调控机制 | 小鼠和人类肺泡组织 | 生物信息学 | 肺发育相关疾病 | 激光捕获显微切割, mRNA测序, microRNA测序, DNA甲基化测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA-Seq | 网络重建模型 | 多组学数据, 时间序列数据 | 14个预定时间点的小鼠肺泡样本和人类时间序列组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 2407 | 2025-10-06 |
Identification and Construction of a R-loop Mediated Diagnostic Model and Associated Immune Microenvironment of COPD through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02232-x
PMID:39798034
|
研究论文 | 通过机器学习和单细胞转录组学构建R-loop介导的COPD诊断模型并分析其免疫微环境特征 | 首次系统研究R-loop调节因子在COPD中的作用，利用12种机器学习算法识别关键R-loop调节因子，建立基于14个R-loop调节因子的风险评分模型并发现两种不同COPD亚型 | 研究样本量未明确说明，部分发现仅在动物模型中验证 | 探索R-loop调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用并构建诊断模型 | COPD患者肺组织、小鼠肺组织 | 机器学习, 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-PCR | 机器学习算法(12种算法150种组合) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2408 | 2025-10-06 |
PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration
2025-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70007
PMID:39953740
|
研究论文 | 本研究探讨PD-L1过表达在改善人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞移植治疗年龄相关性黄斑变性中的免疫保护作用 | 提出无需删除MHC基因仅通过PD-L1过表达即可增强hESC-RPE移植物存活和视觉保护的新策略 | 研究主要聚焦于PD-L1的免疫调节作用，未全面评估其他免疫检查点的潜在影响 | 探索PD-L1过表达对hESC-RPE移植免疫耐受和视觉功能保护的作用机制 | 人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞和视网膜退行性病变模型 | 细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2409 | 2025-10-06 |
Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70012
PMID:40018995
|
研究论文 | 本研究通过整合分析肝细胞癌的单细胞RNA测序数据，揭示了复发肿瘤的异质性特征并构建了复发预后模型 | 首次系统揭示肝细胞癌复发过程中的细胞异质性变化，识别MIF-(CD74+CXCR4)信号通路的关键作用，并开发了基于机器学习的新型复发风险评分模型 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证模型的普适性 | 探索肝细胞癌复发异质性特征并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和小鼠移植模型 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2410 | 2025-10-06 |
Time, the final frontier
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70025
PMID:40126098
|
评论 | 本文主张将时间动态维度整合到癌症研究中，强调从传统终点实验向数据驱动的连续方法转变 | 提出将时间动态分析作为癌症研究的新前沿，强调开发活体成像技术、时间组学方法和计算工具来探索肿瘤演化过程 | NA | 推动癌症研究从静态分析向动态时间维度整合的范式转变 | 肿瘤生态系统及其时间演化过程 | 数字病理学 | 癌症 | 活体成像技术、时间组学方法、计算分析 | NA | 时间序列数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2411 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09010-1
PMID:40369074
|
研究论文 | 通过空间转录组技术揭示人类胎儿大脑皮层分层和区域特化的分子机制 | 首次结合MERFISH技术和深度学习核分割，在空间单细胞分辨率下系统绘制人类胎儿皮层发育图谱，发现皮层区域特化的两种不同模式 | 研究仅聚焦胎儿发育阶段，未涵盖出生后皮层发育过程 | 解析人类大脑皮层分层和区域特化的空间分子机制 | 人类胎儿大脑皮层组织 | 空间转录组学 | NA | MERFISH, 单核RNA测序, 深度学习核分割 | 深度学习 | 空间转录组数据, 图像数据 | 超过1800万个单细胞，涵盖7个发育时间点和8个皮层区域 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) |
| 2412 | 2025-10-06 |
Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis
2025-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09018-7
PMID:40369079
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现肿瘤微环境中的牛磺酸通过驱动糖酵解促进白血病发生 | 首次系统描绘白血病进展过程中基质信号的动态变化，鉴定牛磺酸-TAUT轴作为侵袭性髓系白血病的关键依赖性通路 | 研究主要聚焦于髓系白血病，对其他类型白血病的适用性需进一步验证 | 探索肿瘤微环境对白血病干细胞的支持机制 | 白血病干细胞、骨髓基质细胞、小鼠模型和患者来源的急性髓系白血病细胞 | 单细胞生物学 | 白血病 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2413 | 2025-10-06 |
Exploiting the endothelial-immune axis to improve radiotherapy efficacy
2025-Aug-01, The British journal of radiology
DOI:10.1093/bjr/tqaf114
PMID:40419861
|
综述 | 探讨放射治疗中内皮细胞与免疫系统的相互作用机制及其对治疗效果的影响 | 提出通过靶向内皮-免疫轴来增强放射治疗疗效的新策略 | NA | 改善放射治疗的疗效并减少副作用 | 血管内皮细胞与免疫细胞在放射治疗中的相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2414 | 2025-10-06 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115909
PMID:40570367
|
研究论文 | 研究细胞因子混合物对人THP-1巨噬细胞向阿尔茨海默病相关表型重编程的作用 | 首次使用特定细胞因子组合（IL-4、CSF1、IL-34和TGF-β）在体外将人巨噬细胞重编程为AD相关表型 | 研究仅限于体外THP-1巨噬细胞模型，未在体内验证 | 开发阿尔茨海默病相关的体外巨噬细胞模型 | 人THP-1巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，功能测定 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | THP-1巨噬细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2415 | 2025-10-06 |
Generation and long-term culture of human cerebellar organoids from pluripotent stem cells
2025-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01093-w
PMID:39623220
|
研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成和长期培养人类小脑类器官的方案 | 首次建立了能够复制胎儿小脑细胞多样性和独特细胞结构特征的人类小脑类器官模型 | NA | 研究人类小脑发育和疾病 | 人类小脑类器官 | 发育神经生物学 | 小脑疾病 | 单细胞转录组学、免疫组织化学、钙动力学、电生理学 | NA | 转录组数据、图像数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2416 | 2025-10-06 |
Targeting of arachidonic acid-modulated autophagy to enhance the sensitivity of ROS1 + or ALK + non-small cell lung cancer to crizotinib therapy
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-105
PMID:40248722
|
研究论文 | 本研究揭示了花生四烯酸通过调节自噬流促进ROS1+或ALK+非小细胞肺癌对克唑替尼耐药的机制 | 首次发现STAT3磷酸化失活和PTGS2下调导致花生四烯酸积累，进而通过促进自噬流驱动克唑替尼耐药的新机制 | 研究主要基于细胞系模型，尚未进行体内动物实验验证 | 阐明克唑替尼耐药机制并寻找克服耐药的新治疗策略 | ROS1+或ALK+非小细胞肺癌细胞系(HCC78和H3122) | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 细胞耐药模型 | 基因表达数据,代谢物数据 | 2种细胞系,3个类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2417 | 2025-10-06 |
Osteocyte connexin hemichannels and prostaglandin E2 release dictate bone marrow mesenchymal stromal cell commitment
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412144122
PMID:39937859
|
研究论文 | 本研究揭示了骨细胞连接蛋白43半通道通过释放前列腺素E2调控骨髓间充质干细胞谱系分化的关键机制 | 首次发现骨细胞Cx43半通道通过PGE2释放调控BM-MSPC命运决定，揭示了骨细胞与间充质干细胞间的新型通讯机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型，人类组织验证尚不充分 | 探究骨细胞如何通过Cx43半通道调控骨髓间充质干细胞的谱系定向分化 | 转基因小鼠模型的骨髓间充质干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据，细胞表型数据 | 两种Cx43突变转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2418 | 2025-10-06 |
Divergent Clinical and Immunologic Outcomes Based on STK11 Co-mutation Status in Resectable KRAS-Mutant Lung Cancers Following Neoadjuvant Immune Checkpoint Blockade
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2983
PMID:39545922
|
研究论文 | 本研究探讨了可切除KRAS突变肺癌中STK11共突变状态对新辅助免疫检查点阻断治疗后临床和免疫学结果的影响 | 首次在可切除NSCLC新辅助免疫治疗背景下揭示KRAS/STK11共突变的临床意义，并通过单细胞转录组学发现T细胞转录命运的差异 | 样本量有限（7个KRASmut/STK11wt肿瘤和6个KRASmut/STK11mut肿瘤），需要更大规模研究验证 | 评估KRAS和STK11共突变对可切除非小细胞肺癌新辅助免疫治疗疗效的影响 | 可切除的KRAS突变非小细胞肺癌患者 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13个肿瘤样本（7个KRASmut/STK11wt，6个KRASmut/STK11mut） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2419 | 2025-10-06 |
Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages
2024-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00773-6
PMID:39478117
|
研究论文 | 通过多组学技术分析乳腺癌亚型及其谱系的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合配对转录组和染色质可及性分析，揭示乳腺癌亚型特异性谱系的调控网络 | 样本量相对有限（37例患者），需要更大规模验证 | 研究乳腺癌亚型特异性肿瘤-正常谱系的转录调控网络 | 乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像 | 调控网络分析 | 基因组, 转录组, 表观基因组, 图像 | 37例患者的61个样本 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2420 | 2025-10-06 |
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5045715/v1
PMID:39483903
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据，构建了阿尔茨海默病大脑和小胶质细胞的详细图谱 | 首次整合多个队列和脑区的单细胞与空间转录组数据，揭示了小胶质细胞状态的区域和病理特异性 | NA | 阐明阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和空间分布特征 | 实验模型和人类大脑中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 多个队列和脑区域样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |